Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g007675.1.1
CDS Infomation

GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein (AHRD V3.3 *** AT2G02970.1)
Sequence

ATGCGCCGATCCAATGCCCGTAAAATAAATCGTGTTGATAACAAGAGTAAGACAATGGAA
TCGGCTAATTTGCAATACCGACCAAGTAGATCTTCACATCGGAGTCCTAATCGGAATAGT
TCTAAATCGAAATCGAGAATCTTTTGTTACACTTCGATAATGTTTGTTATTGCTTTTTTA
TGTTATGTTTTTGTGTTTTCGAGTCATGTTAGGTTTTCTGTGAAGAGGAAATATGGGATT
GTGATTGATGGAGGAAGTACGGGGACGAGGATTCATGTGTTTGAGTATGAGGTTAGGAAT
GGGGTGCCGGTGTATGATTTTGGGGATAAGGGTTTGGTTTCGATGAGGGTGAATCCGGGG
TTATCGGCTTATGCTGAACAACCGGAGATGGCGAGTGAATCAGTGGGGAAGTTGGTGGAG
TTTGGGAAGCAAAATGTACCTCAGGAATATTGGAGTTCAACAGAGATTAGGTTGATGGCT
ACTGCTGGAATGAGGTTATTGGATTCGGGTGTACAGGAGAAGATTTTAGAAGTGTGTCGA
TGGGTACTGAGGGATTCGGGTTTAAAGTTTAGGGATGATTGGGCTTCTGTTATTTCAGGA
TCTGATGAGGGTTTATATGCCTGGGTTATTGCTAATTATGCCCTTGGTACTCTTGGTAGT
GATCCTTTGCAAACAACTGGGATAATTGAACTTGGTGGTGCATCTGCGCAGGTAACTTTT
GTTTCTGACGAGCCTATGCCCCCAGAATATTCTCGTACCATTAAATTCAGGAACTTTACC
TACAGGATCTACAGTCATAGCTTGCTTCAATTTGGTCAGAATGTTGCATTTGACTTACTC
CAGGAGTCCCTTGTAGCGAGAGGCCACCATCAAGCTCCTGAAAGTGTTAAGCTGATGGAT
CCTTGTTCTCCTAGAGGATACCCACAGAACTTAATGTCATTGAAGCTCTCCCCCAGTAGT
TTCTTAGATAGGACTAGGCACCTATCGTCTCTTTATCCCAGCGGTAACTTCTCAGAATGC
AGGTCTGCCTCACTATCATTGTTGCAGAAAGGCAAAGAGAGTTGCCCTTATAAAAGCTGC
TACATTGGGTCTACATTTATGCCAAAGCTCCAGGGGAATTTTTTAGCTACAGAAAATTTT
TTCTACACTTCCAGGTTTTTTGGTTTGCCCCCAAAAGCTTTTCTTTCTGATCTTATGGCG
GCTGGGAAAAGTTTTTGTGAAGAGGACTGGTCAAGTTTGAAAAGCAAATACCCCTCCCTT
CAAGAGGAGGACTTGCATCGTTATTGCTTCTCTTCAGCGTATATATTGGCATTACTTCAT
GATAGTCTTGGAATTGCTTTGGATGATGATAGGATTGGATATGCTAATCAAGTTGAAAAC
ATTCCACTTGATTGGGCATTGGGAGCATTCATCTTGCAGAGCACAGCTGAGTTGGACAAA
GAGCATTCTGGGTGGTTTGCAAATATGTTCAGTGAGGACTCTCTCATTTTGCTTCTCTTC
TTTGCCTTTTTCATTTTGGTGATGTTCACCGCATGGTATGTGTCAAAGTGGAGAAAGCCA
CAATTGAAGACTGTGTATGATCTAGAGAAAGGAAAGTACATAGTCACACGTGTTGGTAGA
TGTTCATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g007675.1.1
PEP Infomation

GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein (AHRD V3.3 *** AT2G02970.1)
Sequence

MRRSNARKINRVDNKSKTMESANLQYRPSRSSHRSPNRNSSKSKSRIFCYTSIMFVIAFL
CYVFVFSSHVRFSVKRKYGIVIDGGSTGTRIHVFEYEVRNGVPVYDFGDKGLVSMRVNPG
LSAYAEQPEMASESVGKLVEFGKQNVPQEYWSSTEIRLMATAGMRLLDSGVQEKILEVCR
WVLRDSGLKFRDDWASVISGSDEGLYAWVIANYALGTLGSDPLQTTGIIELGGASAQVTF
VSDEPMPPEYSRTIKFRNFTYRIYSHSLLQFGQNVAFDLLQESLVARGHHQAPESVKLMD
PCSPRGYPQNLMSLKLSPSSFLDRTRHLSSLYPSGNFSECRSASLSLLQKGKESCPYKSC
YIGSTFMPKLQGNFLATENFFYTSRFFGLPPKAFLSDLMAAGKSFCEEDWSSLKSKYPSL
QEEDLHRYCFSSAYILALLHDSLGIALDDDRIGYANQVENIPLDWALGAFILQSTAELDK
EHSGWFANMFSEDSLILLLFFAFFILVMFTAWYVSKWRKPQLKTVYDLEKGKYIVTRVGR
CS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g007675.1.1
Transcript Infomation

GDA1/CD39 nucleoside phosphatase family protein (AHRD V3.3 *** AT2G02970.1)
Sequence

ATCTTTCACTTTACATCAACTAAAATTAGAACATTTATTATTTTCTTTTTAGATTCAATT
TTCGTCTTTCTCAATTACATGCTTCTAAGTATTTTTCGATTTCAATTAAAACATGCTCAA
ATATCGAGATTAATATATATATTTAATTATATTTAATTTATTTATTTGATAATAACTATA
TATAAATATTTTTTTAAGATATTAAATCTATGTTAACAAAAATATTTTTATCATAAAATC
AAATGATCAAATGAAACAAACTTTTGAATTAAATGTCTCAATAAAATTCATTAACATATT
TAAATGCAATTAAGTTATATCACAATCTATTTTAATATCAATAATAAATAGATTGATAAA
ATTGTTTAAAAAAATAAAAAAAGACAAATATGATTTTATGGAAAAGATTTTTTACAAGTC
AATTCTATTTCACCCAAAAAAAGAATTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAGAAGAAGTCAATT
TAGTTTACTTTGTTTTCCATTTTCTTCTCCACAATCACACATCTCTGAAACAAACTCCTT
TAGCGTTATATTACCGGAACCAATTGAACCGGCACCGGAGAGAAACTAAAAAAACCGTTC
GCCGGAGAGAAGAGAGGGCGTTAATCGGAGAAGCCCTCTCAATCTCCGATCGCAAAGAAA
CCCCTAAAATTGCTATTGATTTCATCATCGCAATCGTTGAATCATATGGTTAACATATTT
TCAATTTTTGATGCGCCGATCCAATGCCCGTAAAATAAATCGTGTTGATAACAAGAGTAA
GACAATGGAATCGGCTAATTTGCAATACCGACCAAGTAGATCTTCACATCGGAGTCCTAA
TCGGAATAGTTCTAAATCGAAATCGAGAATCTTTTGTTACACTTCGATAATGTTTGTTAT
TGCTTTTTTATGTTATGTTTTTGTGTTTTCGAGTCATGTTAGGTTTTCTGTGAAGAGGAA
ATATGGGATTGTGATTGATGGAGGAAGTACGGGGACGAGGATTCATGTGTTTGAGTATGA
GGTTAGGAATGGGGTGCCGGTGTATGATTTTGGGGATAAGGGTTTGGTTTCGATGAGGGT
GAATCCGGGGTTATCGGCTTATGCTGAACAACCGGAGATGGCGAGTGAATCAGTGGGGAA
GTTGGTGGAGTTTGGGAAGCAAAATGTACCTCAGGAATATTGGAGTTCAACAGAGATTAG
GTTGATGGCTACTGCTGGAATGAGGTTATTGGATTCGGGTGTACAGGAGAAGATTTTAGA
AGTGTGTCGATGGGTACTGAGGGATTCGGGTTTAAAGTTTAGGGATGATTGGGCTTCTGT
TATTTCAGGATCTGATGAGGGTTTATATGCCTGGGTTATTGCTAATTATGCCCTTGGTAC
TCTTGGTAGTGATCCTTTGCAAACAACTGGGATAATTGAACTTGGTGGTGCATCTGCGCA
GGTAACTTTTGTTTCTGACGAGCCTATGCCCCCAGAATATTCTCGTACCATTAAATTCAG
GAACTTTACCTACAGGATCTACAGTCATAGCTTGCTTCAATTTGGTCAGAATGTTGCATT
TGACTTACTCCAGGAGTCCCTTGTAGCGAGAGGCCACCATCAAGCTCCTGAAAGTGTTAA
GCTGATGGATCCTTGTTCTCCTAGAGGATACCCACAGAACTTAATGTCATTGAAGCTCTC
CCCCAGTAGTTTCTTAGATAGGACTAGGCACCTATCGTCTCTTTATCCCAGCGGTAACTT
CTCAGAATGCAGGTCTGCCTCACTATCATTGTTGCAGAAAGGCAAAGAGAGTTGCCCTTA
TAAAAGCTGCTACATTGGGTCTACATTTATGCCAAAGCTCCAGGGGAATTTTTTAGCTAC
AGAAAATTTTTTCTACACTTCCAGGTTTTTTGGTTTGCCCCCAAAAGCTTTTCTTTCTGA
TCTTATGGCGGCTGGGAAAAGTTTTTGTGAAGAGGACTGGTCAAGTTTGAAAAGCAAATA
CCCCTCCCTTCAAGAGGAGGACTTGCATCGTTATTGCTTCTCTTCAGCGTATATATTGGC
ATTACTTCATGATAGTCTTGGAATTGCTTTGGATGATGATAGGATTGGATATGCTAATCA
AGTTGAAAACATTCCACTTGATTGGGCATTGGGAGCATTCATCTTGCAGAGCACAGCTGA
GTTGGACAAAGAGCATTCTGGGTGGTTTGCAAATATGTTCAGTGAGGACTCTCTCATTTT
GCTTCTCTTCTTTGCCTTTTTCATTTTGGTGATGTTCACCGCATGGTATGTGTCAAAGTG
GAGAAAGCCACAATTGAAGACTGTGTATGATCTAGAGAAAGGAAAGTACATAGTCACACG
TGTTGGTAGATGTTCATAG