Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g007630.3.1
CDS Infomation	Late blight resistance protein, putative (AHRD V3.3 *** Q6L421_SOLDE)
Sequence	ATGAACCATAATATTCTTCAATCTCTGCAACATCTTGAAGATCAATGGGGTTTAGATATG CCGGAGAGTTTAGAGGATGTAATAAAGTTCCTTAAAAGAGAGTTTACGTTTCTTGATTTT TTTCTCAGCTTACAGAGCTTCGTAGATTTATCATACATGCTTGAAATCGTACACAAAGTT CAAGCTCTGTTTCATGATGCTGCTGTTAAACTTACAGAAATCAGCGAGATGGATCATGTT GATGGCGTTACCAATCAATTGCAAGTCAACATTCAGAAGACTAAGTTGGAAATAAAATGT GAATACTTATTTCCAAAAGTCAACAATGATGGTATTGTTGATGTTACTCCCAAAGTTGTA ATCGATCTCATCGATACTGTTGTAGTGAATCTGGGTGATTTATTGAAGGTTTCTTGTTCT AGTTCACTACTTTTTGTTCGTGGACCTAACAAAGAGATCGGAGATGTTTTTAAGGAGTTG AAGTTATTGAGAAATTTTGTATGCTATGTTTCGGACAGATTCATAGAGATGAAAAGTCAA TATATTGATTTCTTCATTCATGTTTTAGAGGTGACCAACCACGCTGCAATGGTTGCCTGG TTGTATCTCCCAAGAAATGACAACGAAAATCAGGAAACAAACTGTTTACTTTCTGATCAT TTGAACATGAAGATTAAGCCCATTGACCCAAGCATCCGCAAGATCTATATTGATGTGTTG CAAGCTCTACGATCAGAATGGCGTCCGATTATTCCAATTGATCATGTAGCTAATTGTGTA GCTGACTTTGTCGAGACTCTCCGGCACAACTTGAAGGCAATATCGGTTAGTAATCCCAAA ACTCATCAAATAGCAGACCTTCAGGAGATGCTCAACCTCTTAATTGCTAATCTCTCCATT CAAGATCTTGAAATTCACCTTCAAGATATCGATACTGTGATGATTGATTCCGGAATACTT GTCTACTCGTTGTGTGAAAATGTGGTGTTAGGGGAAGTGACTATTGATTTACCAGTTATG ATTGAGCACATCAAGATATTGATCTACCACATCATCCGGAAGGAGTTCCAATCTAGTTTG CCAAGGATTCATGGACTAGGCTATGTTGATTTCGTCTTAAGCAATTTGAAGGAGTTTCAA GACCGTTATCCAGATTCGCTTGCTTTTATGAAGACTCAACTTCAAATAATTCAAGCAGAA CTGGAGAGCGTCCAGCCTTTTCTGAGGTTTGTTGCAAAAAAACAATACAATATTCACAAC GAACTTCAGAATAGTGTGGCTCTACTGATTGGCAAAGCATATGAGGTAGAATATATAGTT GATGCTTGTGTGAGCAAAAGAGTTCCGGACTGGTGTCTCATGCTTTGGCTCTTGGACATT AGCACAGAGGTTGCAGAGATGCAACAAAAGAAAATGTTTGAGGTTGACTTAGTGTCACCA TACACCATTGATACTGACACTTCCAGCAAGTGGTCAGAACTGAAAAAAAGGCCAGGGATC AACGGAAAAACTATAGGTTTTGAAGATGAGATCGAAAAATTGATACATCGACTAACAGGA GGATTCGAAGGACTGGATATTATCTCCATTGTTGGTATGCCTGGAGCAGGAAAGACAACT TTGGCCAACAGACTCTATTCTTATCATCCAGTTGTCTATCGTTTTGATATTCTTGGATAT TGTCATGTGTCTCCAGTATATTCGAAGCGGGGCGTATTATTGTCTCTTCTGGCGACCCTA CGTGTTTCTATTGATGAAAACTCTCTTCTTAGTAAAAGGACTAGTACATTAGAAGATATC CTTGTCAGAAATTTACGATCCCGGAGATATCTTATCCTACTTGATGACGTGTGGGATCGC AATGTGTGGGGTGATTTAAAACGTTACTTTCCTGATAGCAATAATGGAAGTAGAATTCTT CTTACAACAAGAAATGATGATGTTGCCTACTATGTTGAATCAGTTGGTAAACCTCATAAT CTTCGCTTGTTGACCTATGAAGAAAGTTGGGAGCTACTATGTATTGAAGTGTTTGGCAAC AAAAGTTGCTCTCCTCTCCTTGAAAAAGTTGGGCAAGAAATAGCGAGAAAGTGTGGAGGT TTGCCGCTATCAATTGTTTTGGTGGCTGGTATTCTGTCAAAGATGGAGAAGACAGAAGAA TGTTGGAGTCGAGTGGCTAAGGACTTAGGTTCCTACATGGCCAGCGACGCAAAGGCTATT ATTGAACCAAGTTTTCAGCATTTGCCCTATTATCTAAAGCCTTGCTTTCTATATTTTGGA ACATTTTTAGAGGACGAAGAAATCAATGTTTCAAAGTTAACATGGATGTGGATTGCAGAA GGCTTTGTTAGCAATCTTGAAGGAAAGAGTTTGCAGGACATAGCGAAAGGTTACTTGGAT ATTCTTATAAGAAGAAACCTAGTGATGAATGCTAAGCGGAGTTCTGACGGTAACGTCAAA GCATGCCGTGTTCATGATCTATTGCTTGATTTCTGCAAGAAAAAAGGAGGGGAAGAGCAT TTTCTATCATGGACAAAATGCAACAGGGACCAAAACGACAAATCTTTGTCAGCTACATCC TCTCAGAAGAAGCTCACTCAACGTCGTCCAGTGTTCATTGAAGAGGAGAATCTTGTAGAA TGGAGTTTGTCTAGCTGTCTTGTTGACTCTGTACTTTTCAAAAGATTAGATGTTTCTAGT CACCAAATCTACTACTTCAAGTTTCTTAAAGTGTTGAATTTGGAGTCCACTGTTATCAAT TCTTTCCCAACGGTGCTAGTTTACCTGAGGTATTTTGCTGCACAAACTGATAAGGATTCA ATTACATCGCTCATAGACAATCTTTGGAACCTTGAAACGTTGATACTCAAGCCAACAAAA GGAAAGTTGAAACTACCCGTTACAATTCGGAAGATGGTTAGACTGAGGTATTTGTGCATT GATAACGCTTATTTCACTTTAAATGATGTAGAAGGATTACTTGAGAAGTTGGAAATTCTT TCCACTCCATGCTTTTCATGTGCAAAGGATGTGGAATTGCTAGTGCAAAAAACACCAAAT CTTCGGGAGCTGAGATGCTCATTTGTTGATTTTAGACAAGAATATTTCCCTGAATTGTAT TTCCTAACACGGCTTGAGACACTCCAGATTCATTTAGCGGCAAATTCAATGGCGGCTGGT CCATACAACTTCCCACCAACTCTCAGAAATTTGACACTATCCAACTTTTTCATAGACAGT TGTCTTGAATCCAAAATTTCATCACTTCCCATTCTTTGCGTACTGAAACTGGTATCAGTT TTCTTTGATAATGACGAGTGGGAAGTGAGAGATGGCGAGTTCTCTGGACTCAGGGTGTTG AAGCTAGTAAAATGTGAATTTTTTGATGAATGGAAAGCTTCAGATCATGCCTTTCCTATA CTTGAACATTTAGTTTTGCGTGAATGTCCATATCTTATGGAGATTCCTTCTTCTTTTCAA GACATCCCTACTCTAAATTCCATCAAGGTAAAGTCGTGCAGTGAATCTGTTGAGCAGTCA GCCATAAAAATGAAAAGAGAGCTAGAAGATATTTATGGGAGTGACCATCTCATGGTCTTC ATCCAGAGGGAGCTGAACAAGGACAGTTTATCAGGAGCTCCAAAACTGAGAATGGCAGAG CACTTTGAGAATTCGGTTCCTAAAGGGGAGTCGTTGATGGGGAAGATCGCCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g007630.3.1
PEP Infomation	Late blight resistance protein, putative (AHRD V3.3 *** Q6L421_SOLDE)
Sequence	MNHNILQSLQHLEDQWGLDMPESLEDVIKFLKREFTFLDFFLSLQSFVDLSYMLEIVHKV QALFHDAAVKLTEISEMDHVDGVTNQLQVNIQKTKLEIKCEYLFPKVNNDGIVDVTPKVV IDLIDTVVVNLGDLLKVSCSSSLLFVRGPNKEIGDVFKELKLLRNFVCYVSDRFIEMKSQ YIDFFIHVLEVTNHAAMVAWLYLPRNDNENQETNCLLSDHLNMKIKPIDPSIRKIYIDVL QALRSEWRPIIPIDHVANCVADFVETLRHNLKAISVSNPKTHQIADLQEMLNLLIANLSI QDLEIHLQDIDTVMIDSGILVYSLCENVVLGEVTIDLPVMIEHIKILIYHIIRKEFQSSL PRIHGLGYVDFVLSNLKEFQDRYPDSLAFMKTQLQIIQAELESVQPFLRFVAKKQYNIHN ELQNSVALLIGKAYEVEYIVDACVSKRVPDWCLMLWLLDISTEVAEMQQKKMFEVDLVSP YTIDTDTSSKWSELKKRPGINGKTIGFEDEIEKLIHRLTGGFEGLDIISIVGMPGAGKTT LANRLYSYHPVVYRFDILGYCHVSPVYSKRGVLLSLLATLRVSIDENSLLSKRTSTLEDI LVRNLRSRRYLILLDDVWDRNVWGDLKRYFPDSNNGSRILLTTRNDDVAYYVESVGKPHN LRLLTYEESWELLCIEVFGNKSCSPLLEKVGQEIARKCGGLPLSIVLVAGILSKMEKTEE CWSRVAKDLGSYMASDAKAIIEPSFQHLPYYLKPCFLYFGTFLEDEEINVSKLTWMWIAE GFVSNLEGKSLQDIAKGYLDILIRRNLVMNAKRSSDGNVKACRVHDLLLDFCKKKGGEEH FLSWTKCNRDQNDKSLSATSSQKKLTQRRPVFIEEENLVEWSLSSCLVDSVLFKRLDVSS HQIYYFKFLKVLNLESTVINSFPTVLVYLRYFAAQTDKDSITSLIDNLWNLETLILKPTK GKLKLPVTIRKMVRLRYLCIDNAYFTLNDVEGLLEKLEILSTPCFSCAKDVELLVQKTPN LRELRCSFVDFRQEYFPELYFLTRLETLQIHLAANSMAAGPYNFPPTLRNLTLSNFFIDS CLESKISSLPILCVLKLVSVFFDNDEWEVRDGEFSGLRVLKLVKCEFFDEWKASDHAFPI LEHLVLRECPYLMEIPSSFQDIPTLNSIKVKSCSESVEQSAIKMKRELEDIYGSDHLMVF IQRELNKDSLSGAPKLRMAEHFENSVPKGESLMGKIA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g007630.3.1
Transcript Infomation	Late blight resistance protein, putative (AHRD V3.3 *** Q6L421_SOLDE)
Sequence	CTAAATGTCGTTGGTGTTGAATTATTGCACAAGAGGGAATTTTTTAATAGACACACCCTA AATGTCGTTGGTGTTTGAATTATTGCATAAGAGGGAATTTTTTAATAGAAGTTGTAATTT TTTTATTTTTAATATTTAGAATATCGAGTACTGCCGAAAAGTCTCACCAAATTAATCTTG TTTAATAGTATCAATAATTTTGTTTATGATAACTTGTTGAGAATACAAAGAGAAAGAACC TTGTTGACTTTTAACAATTTCACAGCAATGAACCATAATATTCTTCAATCTCTGCAACAT CTTGAAGATCAATGGGGTTTAGATATGCCGGAGAGTTTAGAGGATGTAATAAAGTTCCTT AAAAGAGAGTTTACGTTTCTTGATTTTTTTCTCAGCTTACAGAGCTTCGTAGATTTATCA TACATGCTTGAAATCGTACACAAAGTTCAAGCTCTGTTTCATGATGCTGCTGTTAAACTT ACAGAAATCAGCGAGATGGATCATGTTGATGGCGTTACCAATCAATTGCAAGTCAACATT CAGAAGACTAAGTTGGAAATAAAATGTGAATACTTATTTCCAAAAGTCAACAATGATGGT ATTGTTGATGTTACTCCCAAAGTTGTAATCGATCTCATCGATACTGTTGTAGTGAATCTG GGTGATTTATTGAAGGTTTCTTGTTCTAGTTCACTACTTTTTGTTCGTGGACCTAACAAA GAGATCGGAGATGTTTTTAAGGAGTTGAAGTTATTGAGAAATTTTGTATGCTATGTTTCG GACAGATTCATAGAGATGAAAAGTCAATATATTGATTTCTTCATTCATGTTTTAGAGGTG ACCAACCACGCTGCAATGGTTGCCTGGTTGTATCTCCCAAGAAATGACAACGAAAATCAG GAAACAAACTGTTTACTTTCTGATCATTTGAACATGAAGATTAAGCCCATTGACCCAAGC ATCCGCAAGATCTATATTGATGTGTTGCAAGCTCTACGATCAGAATGGCGTCCGATTATT CCAATTGATCATGTAGCTAATTGTGTAGCTGACTTTGTCGAGACTCTCCGGCACAACTTG AAGGCAATATCGGTTAGTAATCCCAAAACTCATCAAATAGCAGACCTTCAGGAGATGCTC AACCTCTTAATTGCTAATCTCTCCATTCAAGATCTTGAAATTCACCTTCAAGATATCGAT ACTGTGATGATTGATTCCGGAATACTTGTCTACTCGTTGTGTGAAAATGTGGTGTTAGGG GAAGTGACTATTGATTTACCAGTTATGATTGAGCACATCAAGATATTGATCTACCACATC ATCCGGAAGGAGTTCCAATCTAGTTTGCCAAGGATTCATGGACTAGGCTATGTTGATTTC GTCTTAAGCAATTTGAAGGAGTTTCAAGACCGTTATCCAGATTCGCTTGCTTTTATGAAG ACTCAACTTCAAATAATTCAAGCAGAACTGGAGAGCGTCCAGCCTTTTCTGAGGTTTGTT GCAAAAAAACAATACAATATTCACAACGAACTTCAGAATAGTGTGGCTCTACTGATTGGC AAAGCATATGAGGTAGAATATATAGTTGATGCTTGTGTGAGCAAAAGAGTTCCGGACTGG TGTCTCATGCTTTGGCTCTTGGACATTAGCACAGAGGTTGCAGAGATGCAACAAAAGAAA ATGTTTGAGGTTGACTTAGTGTCACCATACACCATTGATACTGACACTTCCAGCAAGTGG TCAGAACTGAAAAAAAGGCCAGGGATCAACGGAAAAACTATAGGTTTTGAAGATGAGATC GAAAAATTGATACATCGACTAACAGGAGGATTCGAAGGACTGGATATTATCTCCATTGTT GGTATGCCTGGAGCAGGAAAGACAACTTTGGCCAACAGACTCTATTCTTATCATCCAGTT GTCTATCGTTTTGATATTCTTGGATATTGTCATGTGTCTCCAGTATATTCGAAGCGGGGC GTATTATTGTCTCTTCTGGCGACCCTACGTGTTTCTATTGATGAAAACTCTCTTCTTAGT AAAAGGACTAGTACATTAGAAGATATCCTTGTCAGAAATTTACGATCCCGGAGATATCTT ATCCTACTTGATGACGTGTGGGATCGCAATGTGTGGGGTGATTTAAAACGTTACTTTCCT GATAGCAATAATGGAAGTAGAATTCTTCTTACAACAAGAAATGATGATGTTGCCTACTAT GTTGAATCAGTTGGTAAACCTCATAATCTTCGCTTGTTGACCTATGAAGAAAGTTGGGAG CTACTATGTATTGAAGTGTTTGGCAACAAAAGTTGCTCTCCTCTCCTTGAAAAAGTTGGG CAAGAAATAGCGAGAAAGTGTGGAGGTTTGCCGCTATCAATTGTTTTGGTGGCTGGTATT CTGTCAAAGATGGAGAAGACAGAAGAATGTTGGAGTCGAGTGGCTAAGGACTTAGGTTCC TACATGGCCAGCGACGCAAAGGCTATTATTGAACCAAGTTTTCAGCATTTGCCCTATTAT CTAAAGCCTTGCTTTCTATATTTTGGAACATTTTTAGAGGACGAAGAAATCAATGTTTCA AAGTTAACATGGATGTGGATTGCAGAAGGCTTTGTTAGCAATCTTGAAGGAAAGAGTTTG CAGGACATAGCGAAAGGTTACTTGGATATTCTTATAAGAAGAAACCTAGTGATGAATGCT AAGCGGAGTTCTGACGGTAACGTCAAAGCATGCCGTGTTCATGATCTATTGCTTGATTTC TGCAAGAAAAAAGGAGGGGAAGAGCATTTTCTATCATGGACAAAATGCAACAGGGACCAA AACGACAAATCTTTGTCAGCTACATCCTCTCAGAAGAAGCTCACTCAACGTCGTCCAGTG TTCATTGAAGAGGAGAATCTTGTAGAATGGAGTTTGTCTAGCTGTCTTGTTGACTCTGTA CTTTTCAAAAGATTAGATGTTTCTAGTCACCAAATCTACTACTTCAAGTTTCTTAAAGTG TTGAATTTGGAGTCCACTGTTATCAATTCTTTCCCAACGGTGCTAGTTTACCTGAGGTAT TTTGCTGCACAAACTGATAAGGATTCAATTACATCGCTCATAGACAATCTTTGGAACCTT GAAACGTTGATACTCAAGCCAACAAAAGGAAAGTTGAAACTACCCGTTACAATTCGGAAG ATGGTTAGACTGAGGTATTTGTGCATTGATAACGCTTATTTCACTTTAAATGATGTAGAA GGATTACTTGAGAAGTTGGAAATTCTTTCCACTCCATGCTTTTCATGTGCAAAGGATGTG GAATTGCTAGTGCAAAAAACACCAAATCTTCGGGAGCTGAGATGCTCATTTGTTGATTTT AGACAAGAATATTTCCCTGAATTGTATTTCCTAACACGGCTTGAGACACTCCAGATTCAT TTAGCGGCAAATTCAATGGCGGCTGGTCCATACAACTTCCCACCAACTCTCAGAAATTTG ACACTATCCAACTTTTTCATAGACAGTTGTCTTGAATCCAAAATTTCATCACTTCCCATT CTTTGCGTACTGAAACTGGTATCAGTTTTCTTTGATAATGACGAGTGGGAAGTGAGAGAT GGCGAGTTCTCTGGACTCAGGGTGTTGAAGCTAGTAAAATGTGAATTTTTTGATGAATGG AAAGCTTCAGATCATGCCTTTCCTATACTTGAACATTTAGTTTTGCGTGAATGTCCATAT CTTATGGAGATTCCTTCTTCTTTTCAAGACATCCCTACTCTAAATTCCATCAAGGTAAAG TCGTGCAGTGAATCTGTTGAGCAGTCAGCCATAAAAATGAAAAGAGAGCTAGAAGATATT TATGGGAGTGACCATCTCATGGTCTTCATCCAGAGGGAGCTGAACAAGGACAGTTTATCA GGAGCTCCAAAACTGAGAATGGCAGAGCACTTTGAGAATTCGGTTCCTAAAGGGGAGTCG TTGATGGGGAAGATCGCCTAAGGTGACGATTACTCATCGTTATCGAAATGAGACGATAAC CAGACGAATAAGTCGGAGCAGCAGATTATGTAGGTATTCCGAAGGAAAAAAAAGATTCAA AAGATTTTAAGTGGAGGCAAACTTGCTGATAAGCAAAAGAGATATAACATGAATGATATT TAATTATCTTCTTTGTACAACTATAAGATTAGTTGTTGTATC