Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc05g006990.3.1
CDS Infomation	nitrate transporter 1:2 (AHRD V3.3 *** AT1G69850.1)
Sequence	TATATCATTCTTCTTAAATTCCTCTACAATCTTAACCCTCTCAATTTAAACCTCTACAAA TTTTTAATTTTCTTTCATATTTTCATAATTAAACTCTGTTTTGTATTACAGGACACAGAG AACCAAAGCCAATTAAGCACTTGGCCTGGTTATGTTGATTGGAAAAATAAGCCTGCACTT ACTAATAAACATGGTGGCTTAATTCCTGCCTCCTTTGTCTTAGTTGTGGAGGTGTTGGAA AATTTGGCATATTTGGCTAATGCAAGTAATTTGGTGTTGTATATGTCTGAGTACATGCAT TTTTCACCATCAAAATCAGCAAATTCTGTGACTAATTTTATGGGCACAGCATTTTTATTG GCACTTCTTGGTGGATTCTTATCTGATGCCTTTGTCACTACTTATTACATCTATCTCATC AGTGCACTCATTGAATTTCTGGGGCTAGTGGTGCTCACCATACAGGCTCGTTCGGGGTCG TTGAAGCCACCAACGTGCGACCTTCAAGCAACTCCGAACGTGCCTTGTGAACAAGTTCAT GGTGCACAAGCTGCAATGTTGTTCATAGGACTCTACCTAGTGGCGTTAGGCGTTGGAGGT ATAAAGGGATCGCTGCCACCCCACGGTGCTGAACAGTTTGATGAATCAACACCACAAGGA AGAAAACAAAGATCAAGTTTCTTCAATTACTTTGTGTTCTGTCTCTCCTTTGGAGCTCTC ATTGCTGTCACATTCGTCGTTTGGGTGGAAGACAATAAGGGTTGGCAATGGGGATTCGGA ATATCAACGTTAGCTATATTCTTATCGATCCCAATCTTCCTTGCTGGTTCGTCGTTCTAT AGGAACAAGATACCTAGTGGAAGCCCTCTCACAACAATCAGCAAGGTTCTTATTGCTGCC TTGGTGAATTCGGGTGCATCAAGAAACTCAACTAGTGCTATAGTAAGTATGACTTCAAGC CCTTCTCCTCCAATTCCAACGGGCAAGGAAAATGGCGAAGATTCAAATAGAAAAGACGTT GGATCAATGCACACTCCATCGACAAGTCTTAGCTTTCTTAATCGAGCTGTTTCAGATACA CCAGCTTGTAGTAGTAGTGCATTTGAATGCACAGTGCAACAAGTGGAAGAAGTTAAGATT GTGATGAAAATCCTCCCGATTTTCGCTTGCACCATCATGCTCAACTGTTGTCTAGCTCAA CTCTCAACATTCTCAGTCCAACAAGCAGCCTCGATGAACACAAAGGTCGGTTCTTTAAAA GTCCCTCCGGCTTCCCTCCCTGTTTTCCCCGTAGTATTCATCATGATCTTAGCTCCAGTT TACGATCACTTCATCATCCCATTTGCTCGTAGAGTAACCAAAACAGAAATGGGAATCTCA CACCTCCAACGTATTGGTATCGGGCTGTTCCTATCCATCGTGGCAATGGCAATCGCAGCC CTAGTTGAAATCAAACGTAAGAGAGTAGCTACTGATTCAGGACTCATCGACTCTGCTCAA CCATTGCCTATAACATTCTTTTGGATCGCGTTTCAGTACTTATTTCTCGGGTCAGCTGAT CTTTTCGTTCTAGCAGGACTACTAGAATTCTGTTTCTCAGAAGCACCAGTGAGTATGAGA TCATTGGCAACATCTCTCTCGTGGGCTTCTTTAGCCATCGGATACTACCTCAGCTCGGCG ATTGTGTCTATTGTCAACCGTGTAACAGGCATTTCAACGAACAAGCCATGGCTCGCGGGT AGCAGCTTGAATCACTATCATTTGGACAGGTTCTACTGGCTAATGTGCATACTCAGTGCA TTAAACTTTATGCACTACTTATTCTGGGCTACAAAATACAAGTATACATCACTCAAATCT AGCAAGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc05g006990.3.1
PEP Infomation	nitrate transporter 1:2 (AHRD V3.3 *** AT1G69850.1)
Sequence	YIILLKFLYNLNPLNLNLYKFLIFFHIFIIKLCFVLQDTENQSQLSTWPGYVDWKNKPAL TNKHGGLIPASFVLVVEVLENLAYLANASNLVLYMSEYMHFSPSKSANSVTNFMGTAFLL ALLGGFLSDAFVTTYYIYLISALIEFLGLVVLTIQARSGSLKPPTCDLQATPNVPCEQVH GAQAAMLFIGLYLVALGVGGIKGSLPPHGAEQFDESTPQGRKQRSSFFNYFVFCLSFGAL IAVTFVVWVEDNKGWQWGFGISTLAIFLSIPIFLAGSSFYRNKIPSGSPLTTISKVLIAA LVNSGASRNSTSAIVSMTSSPSPPIPTGKENGEDSNRKDVGSMHTPSTSLSFLNRAVSDT PACSSSAFECTVQQVEEVKIVMKILPIFACTIMLNCCLAQLSTFSVQQAASMNTKVGSLK VPPASLPVFPVVFIMILAPVYDHFIIPFARRVTKTEMGISHLQRIGIGLFLSIVAMAIAA LVEIKRKRVATDSGLIDSAQPLPITFFWIAFQYLFLGSADLFVLAGLLEFCFSEAPVSMR SLATSLSWASLAIGYYLSSAIVSIVNRVTGISTNKPWLAGSSLNHYHLDRFYWLMCILSA LNFMHYLFWATKYKYTSLKSSK*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc05g006990.3.1
Transcript Infomation	nitrate transporter 1:2 (AHRD V3.3 *** AT1G69850.1)
Sequence	TATATCATTCTTCTTAAATTCCTCTACAATCTTAACCCTCTCAATTTAAACCTCTACAAA TTTTTAATTTTCTTTCATATTTTCATAATTAAACTCTGTTTTGTATTACAGGACACAGAG AACCAAAGCCAATTAAGCACTTGGCCTGGTTATGTTGATTGGAAAAATAAGCCTGCACTT ACTAATAAACATGGTGGCTTAATTCCTGCCTCCTTTGTCTTAGTTGTGGAGGTGTTGGAA AATTTGGCATATTTGGCTAATGCAAGTAATTTGGTGTTGTATATGTCTGAGTACATGCAT TTTTCACCATCAAAATCAGCAAATTCTGTGACTAATTTTATGGGCACAGCATTTTTATTG GCACTTCTTGGTGGATTCTTATCTGATGCCTTTGTCACTACTTATTACATCTATCTCATC AGTGCACTCATTGAATTTCTGGGGCTAGTGGTGCTCACCATACAGGCTCGTTCGGGGTCG TTGAAGCCACCAACGTGCGACCTTCAAGCAACTCCGAACGTGCCTTGTGAACAAGTTCAT GGTGCACAAGCTGCAATGTTGTTCATAGGACTCTACCTAGTGGCGTTAGGCGTTGGAGGT ATAAAGGGATCGCTGCCACCCCACGGTGCTGAACAGTTTGATGAATCAACACCACAAGGA AGAAAACAAAGATCAAGTTTCTTCAATTACTTTGTGTTCTGTCTCTCCTTTGGAGCTCTC ATTGCTGTCACATTCGTCGTTTGGGTGGAAGACAATAAGGGTTGGCAATGGGGATTCGGA ATATCAACGTTAGCTATATTCTTATCGATCCCAATCTTCCTTGCTGGTTCGTCGTTCTAT AGGAACAAGATACCTAGTGGAAGCCCTCTCACAACAATCAGCAAGGTTCTTATTGCTGCC TTGGTGAATTCGGGTGCATCAAGAAACTCAACTAGTGCTATAGTAAGTATGACTTCAAGC CCTTCTCCTCCAATTCCAACGGGCAAGGAAAATGGCGAAGATTCAAATAGAAAAGACGTT GGATCAATGCACACTCCATCGACAAGTCTTAGCTTTCTTAATCGAGCTGTTTCAGATACA CCAGCTTGTAGTAGTAGTGCATTTGAATGCACAGTGCAACAAGTGGAAGAAGTTAAGATT GTGATGAAAATCCTCCCGATTTTCGCTTGCACCATCATGCTCAACTGTTGTCTAGCTCAA CTCTCAACATTCTCAGTCCAACAAGCAGCCTCGATGAACACAAAGGTCGGTTCTTTAAAA GTCCCTCCGGCTTCCCTCCCTGTTTTCCCCGTAGTATTCATCATGATCTTAGCTCCAGTT TACGATCACTTCATCATCCCATTTGCTCGTAGAGTAACCAAAACAGAAATGGGAATCTCA CACCTCCAACGTATTGGTATCGGGCTGTTCCTATCCATCGTGGCAATGGCAATCGCAGCC CTAGTTGAAATCAAACGTAAGAGAGTAGCTACTGATTCAGGACTCATCGACTCTGCTCAA CCATTGCCTATAACATTCTTTTGGATCGCGTTTCAGTACTTATTTCTCGGGTCAGCTGAT CTTTTCGTTCTAGCAGGACTACTAGAATTCTGTTTCTCAGAAGCACCAGTGAGTATGAGA TCATTGGCAACATCTCTCTCGTGGGCTTCTTTAGCCATCGGATACTACCTCAGCTCGGCG ATTGTGTCTATTGTCAACCGTGTAACAGGCATTTCAACGAACAAGCCATGGCTCGCGGGT AGCAGCTTGAATCACTATCATTTGGACAGGTTCTACTGGCTAATGTGCATACTCAGTGCA TTAAACTTTATGCACTACTTATTCTGGGCTACAAAATACAAGTATACATCACTCAAATCT AGCAAGTAACACATGTGAACAGAGTTGTGCTGAAGAAATTTTGGAATGTTAAAACAGACG AAATATATGCATAGAGGGACGGCCCGCGACTTATCGGACCCCCTCTTGTGTGACTCGAAG CAAGGGATTTCAACAAGGGAATTCGAAAAAAAATACAAGAATGTCATACCAATGAGTGAT CAAACGATGTTAAGCAATTTTATCGAGCCATCCTTTGTCGGTACACTTATATGTAAAGAA TGTTGAACAATATATAATATTTAACAAATTTTGTTTTACTATTTATACGGTATAATTTTC TGATGATATGTTTGATAGTGAAAATTTTGAAGGGTTTAAGTATAAGAGAATAAAAAGGGC TGCCCTTACATATTCCAACATTATTCCAACATTGCCCAAACGAATAATCTTTTAATGTAG ATAAAATTAATCATTTTTTTTTAATTCTACGTATGGTGGAAAAAGAATTTTTATAATTAT TTTTGAATAATCTTTTTGGTGTTACTTTTGCTAAATCCTTTCTCTTTTTTACTTTCCACT TGGTACTTGCTCTAAGTTTAGACAATATTTTTTTTTTCTTTTCTTAATTTTCAGCCACAA AATGGAAGAATAATTCTATTAATTCTATCTTTCAAAAATATTGTGCATCATCACCTTTTT TAAATCTCAACATTCATATTCTACATGTATTCT