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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g006800.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YAN3_CYNCS)

Sequence

ATGATTCTATCAACAACACCAACAAGGCCAACAACAACTCTCACCATCAACACCAATACT
AGTGAGCATCGACGCCATATCCTCCAAATCTTGACACAATGCACTTCAATTTCTCAGCTC
AAACAAGTACATGCTTATACTCTTCGAACAACTCCATTGGACCACCCAGATGCCCTTTTC
CTCTACAGTAGAATTCTCCATTTTGCTTCAATGAATGATCTTGATTATAGTTTTAAACTC
TTTGGTAATTTGGAAAATCCCAATTCCTTCATCTGGAATACTCTTATTAGAGGTTGTGCT
CATAGTAATGATCGTAAAGGTGAAGCCTTTATGCTTTTTCAAAGAATGGTTGAGAGTGTT
GAGCCTGATAAACATACTTTCCCATTTGTGCTCAAGGGTTGTGCTTATCTTTTTGCTCTT
TCTGAAGGGAAACAAGCACATGGGGTTGCGTTGAAACTTGGGTTTGATTCAGATGTGTAT
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GTTCAATCGGGTGAGTTTGAAAATGCGTTGAGAATGTTTTCGGAGATGCAGAAAGTGTTT
GAGCCTGATGGGTATACGATGCAGAGTGTTCTTGATGCTTGTGCTGGTTTGGGTGCGTTA
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AGTAAAAGAGTAATGCCTGACTCGATCACATTTGTTGGTATTTTGAGTGCTTGTAATCAT
AGGGGCTTCGTTGATGAGGGTCGTAGCTATTTTGATAAAATGGTTTCTGAGTATAAGATT
AGGCCTGTTTTAGAGCACTATGGTTGTCTAGTTGACCTTTTGGCACGTGCGGGGTGTATT
GACAAAGCTCTTGATGTTGTATCAAACATGCCAATGAAACCTGATGCAGCAATATGGAGG
AGTCTTCTTGATGGTTGCTGCAAGAAAAATGCTGACATAGAGTTCAGTGAAGAAGTGGCT
AGGAAAATAATGGAGTCTGACGGAAGTGACACTAGCGGTGTATATGTTCTGTTGTCAAGA
GTGTATGCAACTGCTAACCGATGGGACGAGGCTGGAATGATTAGGACACTGATGACCGAT
AAGGGTATTAGAAAAGATCCGGGTTGTAGTTTAATTGAAATTAATGGGGTTTTCCATGAG
TTTTTCGCTGGAGATACATCTCATTTGCATACTAGAGAAATTTATGAGTTTTTGGATGTT
ATAGACAAAAGACTCCTAGCAGCAGGGTATGTTCCTGATCTGTCACACGCATCAACCGTT
GATGAACTTGATAATGGGAAGAGACAGTCGCTTAAACTGCACAGTGAGAGACTTGCCATT
GCTTATGGACTTCTGAAACTAAAACCAGGTACTCCTTTACGCATTTTCAAGAATTTGCGC
ATATGCAGTGATTGTCACAATGTAACCAAATTAATTTCGAAAGTCTTTGATGTTGAAATT
ATTGTTAGAGATCGTGTTCGGTTTCATCACTTTAGGAATGGGTCCTGTACCTGCAAAGAT
TATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g006800.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YAN3_CYNCS)

Sequence

MILSTTPTRPTTTLTINTNTSEHRRHILQILTQCTSISQLKQVHAYTLRTTPLDHPDALF
LYSRILHFASMNDLDYSFKLFGNLENPNSFIWNTLIRGCAHSNDRKGEAFMLFQRMVESV
EPDKHTFPFVLKGCAYLFALSEGKQAHGVALKLGFDSDVYVNNSLVHFYSSCGCLKDARK
VFDEMPERSLVSWNVMIDALVQSGEFENALRMFSEMQKVFEPDGYTMQSVLDACAGLGAL
SLGMWCHAYILRKCESFLDFELLVNNCLLNMYCKCGSVDIAVQVFERMSRHDLNSWNTMI
LGFAMHGEVEAAFHCFNQMVSKRVMPDSITFVGILSACNHRGFVDEGRSYFDKMVSEYKI
RPVLEHYGCLVDLLARAGCIDKALDVVSNMPMKPDAAIWRSLLDGCCKKNADIEFSEEVA
RKIMESDGSDTSGVYVLLSRVYATANRWDEAGMIRTLMTDKGIRKDPGCSLIEINGVFHE
FFAGDTSHLHTREIYEFLDVIDKRLLAAGYVPDLSHASTVDELDNGKRQSLKLHSERLAI
AYGLLKLKPGTPLRIFKNLRICSDCHNVTKLISKVFDVEIIVRDRVRFHHFRNGSCTCKD
YW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g006800.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A103YAN3_CYNCS)

Sequence

ATGATTCTATCAACAACACCAACAAGGCCAACAACAACTCTCACCATCAACACCAATACT
AGTGAGCATCGACGCCATATCCTCCAAATCTTGACACAATGCACTTCAATTTCTCAGCTC
AAACAAGTACATGCTTATACTCTTCGAACAACTCCATTGGACCACCCAGATGCCCTTTTC
CTCTACAGTAGAATTCTCCATTTTGCTTCAATGAATGATCTTGATTATAGTTTTAAACTC
TTTGGTAATTTGGAAAATCCCAATTCCTTCATCTGGAATACTCTTATTAGAGGTTGTGCT
CATAGTAATGATCGTAAAGGTGAAGCCTTTATGCTTTTTCAAAGAATGGTTGAGAGTGTT
GAGCCTGATAAACATACTTTCCCATTTGTGCTCAAGGGTTGTGCTTATCTTTTTGCTCTT
TCTGAAGGGAAACAAGCACATGGGGTTGCGTTGAAACTTGGGTTTGATTCAGATGTGTAT
GTGAATAATAGTTTGGTTCATTTTTATTCGTCTTGTGGGTGTTTGAAGGATGCGAGGAAG
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GTTCAATCGGGTGAGTTTGAAAATGCGTTGAGAATGTTTTCGGAGATGCAGAAAGTGTTT
GAGCCTGATGGGTATACGATGCAGAGTGTTCTTGATGCTTGTGCTGGTTTGGGTGCGTTA
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GAGTTGCTGGTGAATAATTGTTTACTGAACATGTATTGTAAATGTGGTTCGGTGGATATA
GCTGTTCAGGTTTTCGAGAGGATGAGTAGACATGATTTGAATTCTTGGAATACGATGATA
TTAGGATTTGCAATGCACGGGGAGGTTGAGGCAGCGTTTCATTGTTTTAACCAAATGGTT
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AGGGGCTTCGTTGATGAGGGTCGTAGCTATTTTGATAAAATGGTTTCTGAGTATAAGATT
AGGCCTGTTTTAGAGCACTATGGTTGTCTAGTTGACCTTTTGGCACGTGCGGGGTGTATT
GACAAAGCTCTTGATGTTGTATCAAACATGCCAATGAAACCTGATGCAGCAATATGGAGG
AGTCTTCTTGATGGTTGCTGCAAGAAAAATGCTGACATAGAGTTCAGTGAAGAAGTGGCT
AGGAAAATAATGGAGTCTGACGGAAGTGACACTAGCGGTGTATATGTTCTGTTGTCAAGA
GTGTATGCAACTGCTAACCGATGGGACGAGGCTGGAATGATTAGGACACTGATGACCGAT
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ATATGCAGTGATTGTCACAATGTAACCAAATTAATTTCGAAAGTCTTTGATGTTGAAATT
ATTGTTAGAGATCGTGTTCGGTTTCATCACTTTAGGAATGGGTCCTGTACCTGCAAAGAT
TATTGGTGA