Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc05g005100.3.1

CDS Infomation

Trichome birefringence (AHRD V3.3 *** A0A0K9NN56_ZOSMR)

Sequence

ATGGACTTGACGAAACTGCCATTTTCTGATTCTTCTCCAAGAAGAAAGGTAGTTGTTTCT
GGCTTTGGTTTGGGTGTTGCTGCTTCTTTAACTTTTGTTTGTATTCTATTGTTGAAGTAT
TCATCAAAATCTCCATTTTTAATCCCTGTTTTTAGTTACAGTGATAATAATAATAATAAC
AACAGTAATAGTACCCTCATTTCTTGGCCTTTCGCTTTCTCTAATGCTAGTGTTAGTTTG
AGTTCCAAAGCTTCACACAGTGGAAACTTTAGTACCAATAAAATTGATGAAAGTGGGATA
TTTTCCAATTTTGGGGAAATTTTAGGAAATCCCCATGTCTCTGAAAAGGTAAAAAATGAA
AGCTTTCTTGTTCAAGAATCAGGGAATGGAACTGTTTTGAGTATCCAAGATTCCACAAAC
TATAATGTGACCTCAACTTATATTGAGGATGTTGTGGGATTAAGTGGTGGTGATAGAAAA
AAAGTTGCAGTGGGTGAGGGTAAAGGGAGTTTGCCTGTGGAGAAGAATGCTGTGTTGTTT
AAAAGTGATGGAGAATCATTGATTAGACGCCACAGGGATTTTTATGGGGATTGTGATGTA
TATGATGGTGAATGGGTTAGAGATGACACGAAGCCGTATTATCCTCCGGGTTCTTGCCCT
ATGATTGATAGGGATTTTGATTGTCACCTTAATAAGAGGCCAGATGATGAGTATATCAAG
TGGAGATGGCAACCATATGCATGTGACATACCGAGCCTCAATGCAACTGATTTTCTGGAG
AGATTGAGAGGGCAAAAGCTTGTTTTTGTGGGGGACTCATTGAATAGGAACATGTGGGAG
TCCCTTGTTTGCATTCTTCGCCACAGTATCCGAGACAAAAGGCGAGTTTATGAGATATCA
GGAAGGCATGAATTCAAAAAGAAGGGCTTCTATGCATTCAGATTTGAGGATTATAACTGT
TCTGTGGATTTTGTTAGCTCTCCATTTCTTGTCAGACAATCAACTTTTAAAGGGAAAAAT
GGTTCTTTCGAGACGCTAAGATTGGATTTGATGGACAAGACGACTTCAATGTATAGTGAT
GCTGATATTGTAATTTTCAACACTGGTCATTGGTGGACTCATGAGAAAACCTCCAGAGGG
GAAGACTACTACCAGGAAGGTAATCATGTGCATGGAAGGCTCAAGGTTTTAGAGGCGTAT
AAGAGAGCGATTTCCACTTGGGCAAGGTGGGTGGATCAGAACTTTGACGGAAGCAGAAGT
CAAGTTATTTTTAGAGGATATTCGGTCACACACTTCAGGGGAGGTCCATGGAACTCAGGG
GGGCAGTGCCATAAAGAAAGGGAACCAATATTCAACAAGTCTTATTTAGCAAAATACCCT
TCAAAAATGAAAGTGCTACATCACGTCCTTCATAATATGACTACCCCTGTCATTTATATG
AACATTAGTAGGCTTACAGACTATCGTAAAGATGGTCATCCATCGATATACAGAAAGGAG
TACAAGAGAGTAGAAGAAGCAATACACTCTCAGGATTGCAGTCATTGGTGCTTACCAGGT
GTACCCGACACTTGGAACGAGTTGTTATATGCGTCTCTCCTGAAAACCAGAAAAGGCTCT
TGGAACAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc05g005100.3.1

PEP Infomation

Trichome birefringence (AHRD V3.3 *** A0A0K9NN56_ZOSMR)

Sequence

MDLTKLPFSDSSPRRKVVVSGFGLGVAASLTFVCILLLKYSSKSPFLIPVFSYSDNNNNN
NSNSTLISWPFAFSNASVSLSSKASHSGNFSTNKIDESGIFSNFGEILGNPHVSEKVKNE
SFLVQESGNGTVLSIQDSTNYNVTSTYIEDVVGLSGGDRKKVAVGEGKGSLPVEKNAVLF
KSDGESLIRRHRDFYGDCDVYDGEWVRDDTKPYYPPGSCPMIDRDFDCHLNKRPDDEYIK
WRWQPYACDIPSLNATDFLERLRGQKLVFVGDSLNRNMWESLVCILRHSIRDKRRVYEIS
GRHEFKKKGFYAFRFEDYNCSVDFVSSPFLVRQSTFKGKNGSFETLRLDLMDKTTSMYSD
ADIVIFNTGHWWTHEKTSRGEDYYQEGNHVHGRLKVLEAYKRAISTWARWVDQNFDGSRS
QVIFRGYSVTHFRGGPWNSGGQCHKEREPIFNKSYLAKYPSKMKVLHHVLHNMTTPVIYM
NISRLTDYRKDGHPSIYRKEYKRVEEAIHSQDCSHWCLPGVPDTWNELLYASLLKTRKGS
WNN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc05g005100.3.1

Transcript Infomation

Trichome birefringence (AHRD V3.3 *** A0A0K9NN56_ZOSMR)

Sequence

AAATAATGTAATTGAAGTCCCCCACAGTCCACCACGAGTCCTTCCTTAGAAGAGATCTAC
AAAAAAAAACTTTTTCTTTTTTGCCTCTTCCACATTGTAATTGCCAAAAGAACAAACTTT
GTTCATAAAAATTGGTGTATATTACAAAGAAAATCATTGATTTTTTTGTTTTCCATTGAT
GAGGTTTTGAGATTTAGAATGGACTTGACGAAACTGCCATTTTCTGATTCTTCTCCAAGA
AGAAAGGTAGTTGTTTCTGGCTTTGGTTTGGGTGTTGCTGCTTCTTTAACTTTTGTTTGT
ATTCTATTGTTGAAGTATTCATCAAAATCTCCATTTTTAATCCCTGTTTTTAGTTACAGT
GATAATAATAATAATAACAACAGTAATAGTACCCTCATTTCTTGGCCTTTCGCTTTCTCT
AATGCTAGTGTTAGTTTGAGTTCCAAAGCTTCACACAGTGGAAACTTTAGTACCAATAAA
ATTGATGAAAGTGGGATATTTTCCAATTTTGGGGAAATTTTAGGAAATCCCCATGTCTCT
GAAAAGGTAAAAAATGAAAGCTTTCTTGTTCAAGAATCAGGGAATGGAACTGTTTTGAGT
ATCCAAGATTCCACAAACTATAATGTGACCTCAACTTATATTGAGGATGTTGTGGGATTA
AGTGGTGGTGATAGAAAAAAAGTTGCAGTGGGTGAGGGTAAAGGGAGTTTGCCTGTGGAG
AAGAATGCTGTGTTGTTTAAAAGTGATGGAGAATCATTGATTAGACGCCACAGGGATTTT
TATGGGGATTGTGATGTATATGATGGTGAATGGGTTAGAGATGACACGAAGCCGTATTAT
CCTCCGGGTTCTTGCCCTATGATTGATAGGGATTTTGATTGTCACCTTAATAAGAGGCCA
GATGATGAGTATATCAAGTGGAGATGGCAACCATATGCATGTGACATACCGAGCCTCAAT
GCAACTGATTTTCTGGAGAGATTGAGAGGGCAAAAGCTTGTTTTTGTGGGGGACTCATTG
AATAGGAACATGTGGGAGTCCCTTGTTTGCATTCTTCGCCACAGTATCCGAGACAAAAGG
CGAGTTTATGAGATATCAGGAAGGCATGAATTCAAAAAGAAGGGCTTCTATGCATTCAGA
TTTGAGGATTATAACTGTTCTGTGGATTTTGTTAGCTCTCCATTTCTTGTCAGACAATCA
ACTTTTAAAGGGAAAAATGGTTCTTTCGAGACGCTAAGATTGGATTTGATGGACAAGACG
ACTTCAATGTATAGTGATGCTGATATTGTAATTTTCAACACTGGTCATTGGTGGACTCAT
GAGAAAACCTCCAGAGGGGAAGACTACTACCAGGAAGGTAATCATGTGCATGGAAGGCTC
AAGGTTTTAGAGGCGTATAAGAGAGCGATTTCCACTTGGGCAAGGTGGGTGGATCAGAAC
TTTGACGGAAGCAGAAGTCAAGTTATTTTTAGAGGATATTCGGTCACACACTTCAGGGGA
GGTCCATGGAACTCAGGGGGGCAGTGCCATAAAGAAAGGGAACCAATATTCAACAAGTCT
TATTTAGCAAAATACCCTTCAAAAATGAAAGTGCTACATCACGTCCTTCATAATATGACT
ACCCCTGTCATTTATATGAACATTAGTAGGCTTACAGACTATCGTAAAGATGGTCATCCA
TCGATATACAGAAAGGAGTACAAGAGAGTAGAAGAAGCAATACACTCTCAGGATTGCAGT
CATTGGTGCTTACCAGGTGTACCCGACACTTGGAACGAGTTGTTATATGCGTCTCTCCTG
AAAACCAGAAAAGGCTCTTGGAACAACTGAACTTTTTCTTTATTGCTCATTCTTGTCAAT
GCAAAAAAGAAGCTGGGGATGTTCGTGTGTATTAGATAGATCAGTATTGGAGATGAGAAT
ATTGAGCTAATCACACTATTTTTCATTATCTAACAATGTGATATCTTGTATTTAAGTAAC
AATCAAAGCATAAACACAAAATTTATACTCATGATATTCAAGTTATATATATTCCAACAT
AGGACTAGAGAAGGAATGTACTACAATCTTACCAAAATCCATTAGAACATACACACTTGC
ATGTAACCTTACACAAGAGTGGATATCATATAATAATATACTTAAAGGGTACAACATTAA
GTTGAAAGCCAAGAAAGACTCCAAAACGGAGTCCACAATTGCCGTTTTGTGACTTGCCGG
TTTGCCATCCTTTTGCCATATATCCACACATAATTTGGCTAAGTATGAGCAAACTTGAAA
TTGTATAGGGAGGAATTATGTTTGCTCGGACTCTCCAGAGATGTTGTTATAATCACGTTG
AATTTGGAGAATCCAACATGTATTTGTCGATATTTTTGAACAAATTCGAGCAACATAACT
GCCCTGCAGTTTAAAACTCCTCCACTCCAACTTGCCTATCTTTTCTAAGACCCGTGGATT
GCTTCATCCCACTGCATTTTTTTTTTCTCTCACTTAATAATGTATAGGTTTCAAGAAGGG
AAACTGAATAGTGTTATTTTCTTTAATTGTATCCAATAGGCTCTTGAGACAAAGCTAGTG
GTAAGTTAGCCCATAGATTGTGGCCTTAAATAGAAGAACTCAACAAATCATTACATCATA
AACCACTACTATATGTATTATGCTTTACCTTTTTCTTTTTCACTATTGCTCCCCACACAA
ATCTCTTTATATTTCACATCAAGTGTTTGGTGATTCACAAAATCCTTTTTTTAATGAAAA
TCTGGAAAAAGTATAAATACACAAACTAATTAAAGAGAATGTAACATTTACTATATATAA
AAATATTAAATAATATAATTTTTTGTCTAAGCTGGCTAATAGCACTTAAATTCTTTGAGA
GCGAAATTAGAAATTCATCCTAAGTTAGGCATGTGCCTATTTTTGTGTGGAAAATGAATA
AAACGTAGACAAATATTAAATTCATAATTCATAATTTAAAAAATGCAATATCCTCAGTCT
TAGAATCAGTGGTGAAGATCTATCGAGTTCGTTTTAAGTACGCTCAAGATTTAATATATA
TGGTTATAAAAATAACTTTTTAAACTGTATAAAATATATATACATTTTTAATAAAGGTCA
TTCAAATATCTATTCTTCAAGCTATTTGAATAGTGAGCAGCCATTAAAGCTTAGTGGAAT
CAATAAAATAATATGAATGACTAGCTAGCTTGTAAGTTTACTATATTCTTGCCAAATGGT
GCATTACTTTAGTCCTTTTTTTTTCTCTTTACTAGTGAATCGACTCACTCATCCACCATC
TTCCCCTTTATAACTCCATGTATGTATCAACTCAGTATTTCACTAATTAATCCCATAATA
CTTGTCGGCCAATTACAAAAAAACAAAAAGAAAAAAAATAGTATTTTTTCTCTTTTCATT
CATTAATAATTGGCTGGCTACGTG