Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g080990.2.1
CDS Infomation	S-type anion channel SLAH1 (AHRD V3.3 *** SLAH1_ARATH)
Sequence	ATGTCGATGAGAATCACCCCAACATTCGATGAAATAACCGTCACACCTAATACTCACGAG TCCGAAAACCAAAATACTTTACCAGATATTGATATTACTATCGATGATTCCTCTCTCAAT TCATCAGAAAATCATAGTCTACGATTCTTCGTATTTTCAATGCTAACGAGGATTCATGCA GGCTATTTTAGAATAAGCCTATCTTTGTGTTGGGAAACTTTGTTATGGAAAACACTTCTC GATCCAAATAATAACGAAACAAAATTCTTACATCGCGTCCCTCAAATAATCTATCGTCCT ATTTTAATTTTCTTATGGTCGTTTGCTTTATTGATTTTAGTTCTACTCTCTTTACTCTAC CTCTTGAAATGCGTCTTTCGATTTAATTTAGTCAAAAGGGAGTTTCTACACCATGTTGGT GTAAATTACCTTTTTGCCCCTTGGATTTCTTGGCTTATTTTACTCGAATCCTACCCGTTT ATTATAGCTCCAAAACACCTTGTTTACAAAGCTCTTTGGTGGGTTTTTGCTGTTCCGGTT TTAATTTTGGATGTGAAAATTTATGGACAATGGTTCACTAAGGGGAAAAGGTTCTTAACA GCCGTGGCTAACCCTACGAGCCATTTATCGGTCATTGGGAACTTAGTCGGGGCTCGAGCC GCGGCTAAAATGGGCTGGCAAGAGGTTTCCGTTTGCTTGTTTTCACTAGGCATGGTTCAT TATTTGGTCCTTTTTGTTACGTTGTATCAGCGGCTATCGGGAAGTGACCGGCTACCGGCT ATGTTACGGCCCGTTTTCTTCTTGTTCTCGGCTGCTCCGAGTATGGCTAGCTTGGCTTGG GCATCAATAACCGGAACCTTTGATACGGCTTCAAAAATGTTTTTCTATCTCTCGTTATTT CTCTTTACATCACTGATATGCAGGCCAAGTCTTTTCAAGAAATCAATGAGAAAATTCAAT GTGGCATGGTGGGCATATTCCTATCCAGTAACACTATTAGCATTGGCATCTACAAGATAT GCAAAAGAGGTTAAAGGAAAAGTTCCACACACCATAATGCTAACTCTATCCTCTCTCTCA GTTTTGGTCATCATTGCTTTATTGCTCTCCACTGCTCTTTACTCGAAAATCCTCTTACGT GACGATGATCCTTCTCTCAAGCATTCCTGTTTATCAGAGACACATTCAGAATATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g080990.2.1
PEP Infomation	S-type anion channel SLAH1 (AHRD V3.3 *** SLAH1_ARATH)
Sequence	MSMRITPTFDEITVTPNTHESENQNTLPDIDITIDDSSLNSSENHSLRFFVFSMLTRIHA GYFRISLSLCWETLLWKTLLDPNNNETKFLHRVPQIIYRPILIFLWSFALLILVLLSLLY LLKCVFRFNLVKREFLHHVGVNYLFAPWISWLILLESYPFIIAPKHLVYKALWWVFAVPV LILDVKIYGQWFTKGKRFLTAVANPTSHLSVIGNLVGARAAAKMGWQEVSVCLFSLGMVH YLVLFVTLYQRLSGSDRLPAMLRPVFFLFSAAPSMASLAWASITGTFDTASKMFFYLSLF LFTSLICRPSLFKKSMRKFNVAWWAYSYPVTLLALASTRYAKEVKGKVPHTIMLTLSSLS VLVIIALLLSTALYSKILLRDDDPSLKHSCLSETHSEY*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g080990.2.1
Transcript Infomation	S-type anion channel SLAH1 (AHRD V3.3 *** SLAH1_ARATH)
Sequence	ATGTCGATGAGAATCACCCCAACATTCGATGAAATAACCGTCACACCTAATACTCACGAG TCCGAAAACCAAAATACTTTACCAGATATTGATATTACTATCGATGATTCCTCTCTCAAT TCATCAGAAAATCATAGTCTACGATTCTTCGTATTTTCAATGCTAACGAGGATTCATGCA GGCTATTTTAGAATAAGCCTATCTTTGTGTTGGGAAACTTTGTTATGGAAAACACTTCTC GATCCAAATAATAACGAAACAAAATTCTTACATCGCGTCCCTCAAATAATCTATCGTCCT ATTTTAATTTTCTTATGGTCGTTTGCTTTATTGATTTTAGTTCTACTCTCTTTACTCTAC CTCTTGAAATGCGTCTTTCGATTTAATTTAGTCAAAAGGGAGTTTCTACACCATGTTGGT GTAAATTACCTTTTTGCCCCTTGGATTTCTTGGCTTATTTTACTCGAATCCTACCCGTTT ATTATAGCTCCAAAACACCTTGTTTACAAAGCTCTTTGGTGGGTTTTTGCTGTTCCGGTT TTAATTTTGGATGTGAAAATTTATGGACAATGGTTCACTAAGGGGAAAAGGTTCTTAACA GCCGTGGCTAACCCTACGAGCCATTTATCGGTCATTGGGAACTTAGTCGGGGCTCGAGCC GCGGCTAAAATGGGCTGGCAAGAGGTTTCCGTTTGCTTGTTTTCACTAGGCATGGTTCAT TATTTGGTCCTTTTTGTTACGTTGTATCAGCGGCTATCGGGAAGTGACCGGCTACCGGCT ATGTTACGGCCCGTTTTCTTCTTGTTCTCGGCTGCTCCGAGTATGGCTAGCTTGGCTTGG GCATCAATAACCGGAACCTTTGATACGGCTTCAAAAATGTTTTTCTATCTCTCGTTATTT CTCTTTACATCACTGATATGCAGGCCAAGTCTTTTCAAGAAATCAATGAGAAAATTCAAT GTGGCATGGTGGGCATATTCCTATCCAGTAACACTATTAGCATTGGCATCTACAAGATAT GCAAAAGAGGTTAAAGGAAAAGTTCCACACACCATAATGCTAACTCTATCCTCTCTCTCA GTTTTGGTCATCATTGCTTTATTGCTCTCCACTGCTCTTTACTCGAAAATCCTCTTACGT GACGATGATCCTTCTCTCAAGCATTCCTGTTTATCAGAGACACATTCAGAATATTAAATA CGTGTATTTTTTTCGCTTTTGCTATCGACTATGATTGAGTTTAGTAGTCTCCAGCTAGCG CATGAGTCTGCCCTATGTATTAATTAATTATTGTAATTGTAATTAGTTAAGAGCTTAGGG CTGGTAGCTACAAGTCATTATCGTTCCTAAAGTATTAATTAATGTATGTTATTGTATGGA AATATCGTCTACTTGCCATAACTAGTCTTTACTCTTTGGGTTCTATCTGTATTACTTAAT TTATATGAATTTAATAAAGTAGAACTTTTTTTTATATATATAAATATTTTTGGGGTTTTT TTTAATCATATTTTTTGTCACATATATGACGATGTTTCAAATATGCCCATGTTCAAGTGA CCAACTTTTTGTCTATAGATAAATGACAAATCATTTTTTATATATATATATATATAGACA GCTAATTAGATGCCTAAGTTTGATGAACTATATATATACACTCTACGTACGTAGTACACA TTTATGATCTTCATCAGATATGGGAAGATCAGAATAAATATAAAACTTTCGATAATTTCA ACGATAAT