Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g080050.3.1

CDS Infomation

EXS family protein (AHRD V3.3 *** B9MXW8_POPTR)

Sequence

ATGTTTGGGAGTCTTGTGGATGCTCCTGTTAACAGTCCACATCTACGAAGGTCTGGAAGT
CGAGCGGTTGTTTCTGATATTGGTACGGTTGAGCTTGGAGGGAGTCCTGTAGAAGCCCTA
TTGCACAGCATAGAGGTCAATGAAATGAAGGGTGTAACTGCACCTTTGAGCACCGCGGCC
ATAATGCCATCTCCTGTTCTTTTGTGGAGATTTAAGGTACTTCTGTTCCTCATTTGGGGT
GTCAGTTGTTGCAAGATCAGCTGGGATTCAGTCATGAGAATGAGCGCAAACCTTCGCGAT
CTATTCCTATATGAGGCTTTTCTCTATTACAATCCTCTTCTCCTTATGACCATGATGGTT
TGGTTTTGGGGCATAAACCTATGGGTTTTTGCACAGGCTAATGTCAACTACTCTAAAATT
TTTGACCTTGATCAGAATCATCTCTCTCACAGAGAAATTTGGAAGGTGCTTTTGTATGCT
GCTTTTGCCATGGCTCTGATTTTTCCATTTGATATATTCTATTTGTCATCTCGCTACTTT
TTTTTAAGGACTGTTTGGCGGATAGTTTTCCCATTCCAGGCAATATCATTTCCTGACTTC
TTTCTGGCTGATATATTCACTTCTATGTCCAAGGTATTTTCAGATTTGGAGCGTTCAGTT
TGTAGAATGGTTCATCGCCAGGTTGCTACCATTGCATGGTTTGAAGCCGATTCTGTATGT
GGAAGTCATGCTGTTGCAATTCCCATTGTTCTTGTATTGCCTTATCTTTTCCGTCTGTTT
CAATGTCTTCGGCAATATAAGGACACTAAAGAGAAGACTACCCTGTTGAATGCGTTGAAA
TATTCGACTGCAGTACCTGTGATATTTCTCTCAGCCCTTAAGTATCACGTCTTCCCTGAC
AACTGGGTTAATATTTATCGTCCTTTATGGCTTCTGTCTGGTGTGGTGAACTCGCTCTAC
TCATTCTATTGGGATCTGACAAGAGATTGGGACTTGAGTTGCTTCACTCGGATTTTCAAG
TTCAGCAGACCAAATGCATTATCATACTTGTTATATGGGCGGAAATGGGTCTACTTTTGG
GTAATTGGAACCAACCTCATCCTCCGGTGCACGTGGACATACAAGCTTTCTTCCCATCTC
CGACACAATTATCTCACAGTGTTTGCAATAACCGCTCTTGAGATCTTCCGTCGTTTCCAG
TGGGCTTTCTTCCGTGTAGAGAATGAGTGGAATAAGATGAACTCTAAACAAAATATTCAA
CTCTCCACGATTGACAAGCCAAATGATGAACAAAAATTACTCGACCCAAATGGCTACAGT
GTATAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g080050.3.1

PEP Infomation

EXS family protein (AHRD V3.3 *** B9MXW8_POPTR)

Sequence

MFGSLVDAPVNSPHLRRSGSRAVVSDIGTVELGGSPVEALLHSIEVNEMKGVTAPLSTAA
IMPSPVLLWRFKVLLFLIWGVSCCKISWDSVMRMSANLRDLFLYEAFLYYNPLLLMTMMV
WFWGINLWVFAQANVNYSKIFDLDQNHLSHREIWKVLLYAAFAMALIFPFDIFYLSSRYF
FLRTVWRIVFPFQAISFPDFFLADIFTSMSKVFSDLERSVCRMVHRQVATIAWFEADSVC
GSHAVAIPIVLVLPYLFRLFQCLRQYKDTKEKTTLLNALKYSTAVPVIFLSALKYHVFPD
NWVNIYRPLWLLSGVVNSLYSFYWDLTRDWDLSCFTRIFKFSRPNALSYLLYGRKWVYFW
VIGTNLILRCTWTYKLSSHLRHNYLTVFAITALEIFRRFQWAFFRVENEWNKMNSKQNIQ
LSTIDKPNDEQKLLDPNGYSV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g080050.3.1

Transcript Infomation

EXS family protein (AHRD V3.3 *** B9MXW8_POPTR)

Sequence

GCTAATTTAGAATTTTAGTATTTGTAATTGCTAGGCTAAAGAACTATAATTTTCCTTAGA
AGCAAATCCATATTCCCCTTTACTTCTATATCAAGTGTTCGTATCACAATCCGGATCTTG
TCTAACGCATCTGTCCTCTTTTATCCCTTCCTTTTTGGAATTTATTTTATGTTCTTGTTG
TCTATGTGTCTTCCTATTTGCATTCTTAAAGTGCTATCTTTATTGAAATTGCAGATTTCA
AGGTGATCCCGGTTGCTTAAATTATCATACTCATTCTCTGCTTCCGTTCATCTATGTTTG
GGAGTCTTGTGGATGCTCCTGTTAACAGTCCACATCTACGAAGGTCTGGAAGTCGAGCGG
TTGTTTCTGATATTGGTACGGTTGAGCTTGGAGGGAGTCCTGTAGAAGCCCTATTGCACA
GCATAGAGGTCAATGAAATGAAGGGTGTAACTGCACCTTTGAGCACCGCGGCCATAATGC
CATCTCCTGTTCTTTTGTGGAGATTTAAGGTACTTCTGTTCCTCATTTGGGGTGTCAGTT
GTTGCAAGATCAGCTGGGATTCAGTCATGAGAATGAGCGCAAACCTTCGCGATCTATTCC
TATATGAGGCTTTTCTCTATTACAATCCTCTTCTCCTTATGACCATGATGGTTTGGTTTT
GGGGCATAAACCTATGGGTTTTTGCACAGGCTAATGTCAACTACTCTAAAATTTTTGACC
TTGATCAGAATCATCTCTCTCACAGAGAAATTTGGAAGGTGCTTTTGTATGCTGCTTTTG
CCATGGCTCTGATTTTTCCATTTGATATATTCTATTTGTCATCTCGCTACTTTTTTTTAA
GGACTGTTTGGCGGATAGTTTTCCCATTCCAGGCAATATCATTTCCTGACTTCTTTCTGG
CTGATATATTCACTTCTATGTCCAAGGTATTTTCAGATTTGGAGCGTTCAGTTTGTAGAA
TGGTTCATCGCCAGGTTGCTACCATTGCATGGTTTGAAGCCGATTCTGTATGTGGAAGTC
ATGCTGTTGCAATTCCCATTGTTCTTGTATTGCCTTATCTTTTCCGTCTGTTTCAATGTC
TTCGGCAATATAAGGACACTAAAGAGAAGACTACCCTGTTGAATGCGTTGAAATATTCGA
CTGCAGTACCTGTGATATTTCTCTCAGCCCTTAAGTATCACGTCTTCCCTGACAACTGGG
TTAATATTTATCGTCCTTTATGGCTTCTGTCTGGTGTGGTGAACTCGCTCTACTCATTCT
ATTGGGATCTGACAAGAGATTGGGACTTGAGTTGCTTCACTCGGATTTTCAAGTTCAGCA
GACCAAATGCATTATCATACTTGTTATATGGGCGGAAATGGGTCTACTTTTGGGTAATTG
GAACCAACCTCATCCTCCGGTGCACGTGGACATACAAGCTTTCTTCCCATCTCCGACACA
ATTATCTCACAGTGTTTGCAATAACCGCTCTTGAGATCTTCCGTCGTTTCCAGTGGGCTT
TCTTCCGTGTAGAGAATGAGTGGAATAAGATGAACTCTAAACAAAATATTCAACTCTCCA
CGATTGACAAGCCAAATGATGAACAAAAATTACTCGACCCAAATGGCTACAGTGTATAGA
CTATGGAACATTACAGATCCTACCAACTTCATTGGAGTCAACTGAACAACTTTCTTCAAG
CCAGGCAGAAAGGTTTTATGGGATCCCATTTTTCCTCTTTATGATACCAGAATTTCTTGT
CAATAGTATAGTACGACCTTGCAGGTCAAGAGACATTAGATAAAATACAAGATTCAACCA
GCATTCCTTTTCGGGGAAACTAATCCCTCGTAGTTCTTTGTTGGGCATTTAAATCATTTT
TTTGTTAGATACTAATGCCTATTTTTGAGGTAAATGTTTTGAACTTTATGGTATCTCGAG
ATTATTTCATTTTTAGTACAGCAAATCATGCTGGAATTTATAGTTCATTAGTATTGATGA
GATCCTAGTATCAAGTGCTTGTGAAAATGACAGAACATCTGAATTTTTTGATAGATTGAC
ACTTGTGGGAATATTTATTAGTTGCTTTTGTACTTTCAGTTTCTCCTAAACATGATAATT
CACTCCTGTTGTGTCAGGTGCTAGTAGTGGTAGGGTTTTAGTGTCTTGAACTTCTTATGC
TATCACATACATTATTGATCACTTTATAAATATAGCATTTGTCCCTACTTTTATTCCAGC
ATTTGAAGAGTTAAAAAAAAAGATTCTTGAATTTCATGATCTTAAACTAAAAATCTGCAC
CAAAATGTTGACCTAATCATGCTATGTAAAACTTTGAAATTAGAGAGTTAT