Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g079330.2.1
CDS Infomation

Carboxypeptidase (AHRD V3.3 *** K4BV17_SOLLC)
Sequence

ATGGTTAAAACACCATATTTCCACTTGTTTTTCCTAACCTTGTTAGCTTTATCTAATTTA
GTGCATTGTTATAAACCTAAAAGCCTAAAACCAATTTCTCATTATTTCAAAATAAACATA
GAAAAAACTACTAGTAGTAGAAGTGTGTCACAAAGGACTTCACCAGTACATCAAAATTCA
CTCAAAGAGAGTAATAAAATTGAAAAATTGCCTGGTGAACCTGAAGATGTAGATTTTAAC
CAGTATTCAGGATATGTTACAGTTGATTCAAGTGCTGGAAGAGCTTTGTTTTATTATTTC
ACCGAATCGCCTACACATTCTGCTTCTAAGCCTCTTGTCTTATGGCTCAATGGAGGGCCA
GGTTGTTCCTCACTTGGAGGAGGAGCATTTGGTGAACTTGGTCCATTTAGAGTTAACAAA
GATGGAACTCTACAGAGGAATCAATTTTCATGGATTTCTGAGGCCAACATAATATTTCTC
GAATCACCTGCTGGCGTTGGATTTTCATATACAAACACAAGTTCTGACTTCAATTTTAGC
GGAGACAGAACAACAGCTCATGATTCTTACACCTTTCTAGTCAATTGGCTCGAACGTTTT
CCAGAATATAAACCTAATGACTTTTACCTTATTGGAGAGAGCTACGCGGGACATTACATC
CCTCAACTTGCTCAGCTTATACTTCTTCACAACAGCAACTCAGACGAGACGATTAGTACT
ATAAACTTGAAAGGAATTGCTATTGGCAATGCCTATGTTGATTTCGAAGCCAACATGAAA
GGAACAACAGAGTATTACTGGTCTCATGCACTAATTTCAGAGGAATTATACAACAAAATC
ATATTAACCTGTAATTTTTCTACTCCATCATCTGTCTCCAAGAAATGCAACGCGTATTTG
GATCAAATCGATGAAGAAATTGGAAATATCTTCATCTACAACGTCTACGCGCCATTGTGC
ACCAACAGATCACCCTCAAGTACCTCAACATCGGATGTTGATCCATGCCTTCCGAGTTAT
ATTCAGTCTTACTTCAACATACCAGAAGTTCAGAAGGCGATGCACGCGAATGTTACAAAT
CTTCCTTATCCATGGGAAAGTTGCAATAACACACTTAATCTCAACTGGAAAGATAGACCA
TTGAGTGTTTTGCCACTTTTACATCAGTTGATGAAGAGTGGATTAAGGATATGGCTGTAT
AGTGGTGACATGGATGTTGTAGTGCCAGTGACAGATACAAGATATGCTATTAAGAAGTTA
AATTTATCAGTTAAGACATCTTGGTACCCTTGGTACTTACAAGGAGAGGTTGGTGGATAT
GTAGAGGAGTATGAAAACTTGACATTTGTGACAATAAGAGGAGCAGGTCATTTTGTTCCA
ACATATCAACCAAATCGAGCTTTGGCTTTTTTCTCCCAATTTCTTAGTGGAAAGCCTCCC
CCTAAAAAGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g079330.2.1
PEP Infomation

Carboxypeptidase (AHRD V3.3 *** K4BV17_SOLLC)
Sequence

MVKTPYFHLFFLTLLALSNLVHCYKPKSLKPISHYFKINIEKTTSSRSVSQRTSPVHQNS
LKESNKIEKLPGEPEDVDFNQYSGYVTVDSSAGRALFYYFTESPTHSASKPLVLWLNGGP
GCSSLGGGAFGELGPFRVNKDGTLQRNQFSWISEANIIFLESPAGVGFSYTNTSSDFNFS
GDRTTAHDSYTFLVNWLERFPEYKPNDFYLIGESYAGHYIPQLAQLILLHNSNSDETIST
INLKGIAIGNAYVDFEANMKGTTEYYWSHALISEELYNKIILTCNFSTPSSVSKKCNAYL
DQIDEEIGNIFIYNVYAPLCTNRSPSSTSTSDVDPCLPSYIQSYFNIPEVQKAMHANVTN
LPYPWESCNNTLNLNWKDRPLSVLPLLHQLMKSGLRIWLYSGDMDVVVPVTDTRYAIKKL
NLSVKTSWYPWYLQGEVGGYVEEYENLTFVTIRGAGHFVPTYQPNRALAFFSQFLSGKPP
PKK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g079330.2.1
Transcript Infomation

Carboxypeptidase (AHRD V3.3 *** K4BV17_SOLLC)
Sequence

TTTTGTTATTTAAAAACAATAAAAATCATGGCGAGTACTGCACGCTAACAGTAGTGTGTT
AATATTAATTTATTGTTTGTTTGGTCTGCATCCCCATGCCAATTTATTCTTTGTAGGTTG
AAATTCTTCTTGAGCTAGAATTGGGCTACTTTAATTGTTGGTGGGGTGGGAGAGTGTGAG
ATTTGTTTAGCTCCAAATTGCTCTAATTCCCTCTACTTGTGAGTATAATATTTCGTAATT
AGTTGAAATCATATTAAAATGATAATTAGTGGTACTAAATCCACATAGAGTGAAGCATCG
TCCTTCACTTTCTCAGTTACTGTTTTTATATACTGAGATTCAAAGCACAAGGGTTAAACT
ATCTTGTTTTCAATGTTGATTCAGACATAATATTCAACTTTTTGGAGAATAAAAAAATAG
TGTGTATTAAATTATACAAAACTTTATTAATAATAATTAAATTCAAAATATGGAGACAGA
TTATCCAAAACTACGCATCATCAAACTCCATATTGAGATGATAAACTCCTTCCAAACAAC
AAACATACTAATTACAAAGACGTTTTCCACTTTTTACGTCGATAACCAAAAAGAAATATG
GCTTACAAAAAAAATGACAAAGTTTACAGACTGATTACAGGGAATATACCTGCCTTCAAA
AAAGATATACTACAAAAAAAAAAATTGAATAACTATTTTTAGTAATATGGATAATTAATA
TTAGACAAATGCCTCGGGGGATATTTGACTGGTTTAGAACGGACGATATATCATTGTAAT
TCTAACACTAGAAAAAATTATTGAGCCGTCCACTGCGTCAAAAGGCCTAAGAAATATTCA
ACTAATTTAGGGAGTTCATTATAAACAAAACAAAATAGTGAGCTTAGAGATTTCCAAATA
AACAAGAACAAAACGATCATTAATATTAATATTTAATAATATTGGCCGGACACAAAATTT
GAAAACCTTATTCATTTATTTAAATGTGTCAATATGAATATTTATACTTGTTATCAATCA
TTTCTCACACAAATTAAAAATGGTTAAAACACCATATTTCCACTTGTTTTTCCTAACCTT
GTTAGCTTTATCTAATTTAGTGCATTGTTATAAACCTAAAAGCCTAAAACCAATTTCTCA
TTATTTCAAAATAAACATAGAAAAAACTACTAGTAGTAGAAGTGTGTCACAAAGGACTTC
ACCAGTACATCAAAATTCACTCAAAGAGAGTAATAAAATTGAAAAATTGCCTGGTGAACC
TGAAGATGTAGATTTTAACCAGTATTCAGGATATGTTACAGTTGATTCAAGTGCTGGAAG
AGCTTTGTTTTATTATTTCACCGAATCGCCTACACATTCTGCTTCTAAGCCTCTTGTCTT
ATGGCTCAATGGAGGGCCAGGTTGTTCCTCACTTGGAGGAGGAGCATTTGGTGAACTTGG
TCCATTTAGAGTTAACAAAGATGGAACTCTACAGAGGAATCAATTTTCATGGATTTCTGA
GGCCAACATAATATTTCTCGAATCACCTGCTGGCGTTGGATTTTCATATACAAACACAAG
TTCTGACTTCAATTTTAGCGGAGACAGAACAACAGCTCATGATTCTTACACCTTTCTAGT
CAATTGGCTCGAACGTTTTCCAGAATATAAACCTAATGACTTTTACCTTATTGGAGAGAG
CTACGCGGGACATTACATCCCTCAACTTGCTCAGCTTATACTTCTTCACAACAGCAACTC
AGACGAGACGATTAGTACTATAAACTTGAAAGGAATTGCTATTGGCAATGCCTATGTTGA
TTTCGAAGCCAACATGAAAGGAACAACAGAGTATTACTGGTCTCATGCACTAATTTCAGA
GGAATTATACAACAAAATCATATTAACCTGTAATTTTTCTACTCCATCATCTGTCTCCAA
GAAATGCAACGCGTATTTGGATCAAATCGATGAAGAAATTGGAAATATCTTCATCTACAA
CGTCTACGCGCCATTGTGCACCAACAGATCACCCTCAAGTACCTCAACATCGGATGTTGA
TCCATGCCTTCCGAGTTATATTCAGTCTTACTTCAACATACCAGAAGTTCAGAAGGCGAT
GCACGCGAATGTTACAAATCTTCCTTATCCATGGGAAAGTTGCAATAACACACTTAATCT
CAACTGGAAAGATAGACCATTGAGTGTTTTGCCACTTTTACATCAGTTGATGAAGAGTGG
ATTAAGGATATGGCTGTATAGTGGTGACATGGATGTTGTAGTGCCAGTGACAGATACAAG
ATATGCTATTAAGAAGTTAAATTTATCAGTTAAGACATCTTGGTACCCTTGGTACTTACA
AGGAGAGGTTGGTGGATATGTAGAGGAGTATGAAAACTTGACATTTGTGACAATAAGAGG
AGCAGGTCATTTTGTTCCAACATATCAACCAAATCGAGCTTTGGCTTTTTTCTCCCAATT
TCTTAGTGGAAAGCCTCCCCCTAAAAAGTAGTATAACAACATTATTACAATGGAAGAATA
TAATATATAT