Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g078740.2.1

CDS Infomation

Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9SHY0_9ROSA)

Sequence

ATGGCAAATTATATTGCCTTGTGTATTTGGTTGCTTTCTATAATTCAATTGGCAAAGTCA
GAAACTTATATCATTCATATGGATTTGTCAGCCATGCCAAAAGCTTTTTCTAGCCATTAT
AATTGGTACTTGACTACACTTTTTTCGGTGTCAGATAGCAAAGACTTGTTGTCCTCTAAA
CTAGTTTATACTTATACTAATGCCATCAATGGTTTCAGTGCAAGTCTTTCTCCTTCTGAG
ATAGAAGCTATTAAGAATTCTCCGGGTTATGTTTCTTCGATTAAGGATATGTCGGTTAAA
GTTGACACAACCCACACATCTCAATTCCTTGGCCTTAACTCTGAGTCTGGTGTATGGCCA
AAGTCGGATTATGGCAAAGATGTTATAGTTGGATTAGTTGACACTGGGATATGGCCAGAG
AGTAGAAGTTATAGTGATGATGGGATGAATGAAGTACCATCAAGATGGAAAGGAGAATGT
GAAAGTGGAACTCAGTTCAATACCTCTTTGTGCAATAAGAAACTCATTGGCGCTCGTTAC
TTCAATAAAGGCCTACTTGCTAACAACCCGAATCTTACCATTTCGATGGATTCTGCTCGT
GATACGGATGGACATGGGACTCACACTTCTTCCACGGCTGCTGGAAGTCGTGTAGAGGGT
GCATCTTTTTTTGGATATGCTGCTGGAACTGCTACAGGTGTAGCACCAAAGGCTCATGTG
GCCATGTACAAGGCTCTATGGGAAGAAGGTGTATTCTTGTCTGATATTCTTGCAGCAATT
GATCAAGCAATTGCAGATGGTGTAGATGTATTGTCCTTGTCATTAGGCATTGATGCGCTT
CCTTTATACGAAGATCCTGTTGCAATTGCCGCATTTGCTGCACTGGAGAAAGGCATATTT
GTTTCTACATCTGCAGGAAATGAAGGGCCTTTTTTGGAAACTTTGCACAATGGAACGCCT
TGGGTGCTCACTGTTGCTGCTGGCACAGTTGACCGGGAGTTTATTGGCACAGTAACACTT
GGAAATGGAGTTTCGGTCACTGGATTATCGCTCTACCCTGGGAACTCTAGTTCAAGTGAA
AGCTCCATTAGCTTCGTTGATTGCCAAGATGATAAGGAACTGCAGAAAAATGCACACAGA
ATAGTGGTCTGCATTGACAATAATGATTCAGTTAGCGAGGACGTCTACAATGTAAGAAAT
TCAAAAGTTTCTGGTGCAGTCTTCATAACTAATTCAACTGACTTGGAATTCTATCTCCAA
AGTGAATTTCCCGCGGTGTTTTTGAACATTCAAGAGGGTGATAAAGTTCTTGAGTACGTT
AGGAGTGACTCTGCACCTAACGCAAAGCTTGAATTCCAAGTGACGCGTATTGGTGCTAAA
CCAGCACCAAAAGTTGCTAGCTATAGCTCAAGAGGACCATCACCAAGCTGTCCTACAATT
CTAAAGCCTGACCTTATGGGTCCTGGTGCATTAATACTTGCTTCATGGCCACAACAAACA
CCAGTAACTGAAGTTACCTCGGGAAAACTTTATAGTAACTTCAACATTATATCAGGCACA
TCAATGTCTTGTCCACATGCTTCTGGTGTAGCAGCACTTCTAAAAAGTGCACACCCTGAA
TGGAGCCCTGCTGCTATCCGATCCGCCATGATGACCACAGCCTATGTATTGGACAACACA
CAAAGCCCCATCCAAGACGTAGGTCTGAAGAATGGTGTTGCTACTCCTCTAGCTATGGGA
GCTGGCCATATCGATCCAAACAAAGCGTTGGATCCCGGACTCATCTATGATGCAACACCA
CAAGATTATGTTAACCACCTCTGTGGTTTGAACTTCACATCCAAACAAATACAAACCATC
ACAAGATCCTCAACTTACACTTGCTCCAACCCATCATTAGACTTGAACTATCCATCATTC
ATTGGCTATTTCAACCGGAATAGCAGCGATTCGGATCCTAAAAGGATTCAAGAATTCAAA
AGAACAGTGACTAACTTACAAGATGGTACATCAGTATACACAGCAAAGCTCACTCCAATG
GGTAAATTTAAAGTTAGTGTTGTACCTAATAAGTTGACTTTCAAAGAAAAGTATGAAAAA
CAAAGCTATAAGCTAAGAATAGAAGGTCCAATAATTATGGATGATATTGTGGTTGATGGT
TCATTGAGCTGGATGGAAACTAGAGGAAAATACATAGTTAAAAGTCCAATTGTTGCAACA
AGTATAAGAGTGGATCCTTTGAGAGGACATAACTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g078740.2.1

PEP Infomation

Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9SHY0_9ROSA)

Sequence

MANYIALCIWLLSIIQLAKSETYIIHMDLSAMPKAFSSHYNWYLTTLFSVSDSKDLLSSK
LVYTYTNAINGFSASLSPSEIEAIKNSPGYVSSIKDMSVKVDTTHTSQFLGLNSESGVWP
KSDYGKDVIVGLVDTGIWPESRSYSDDGMNEVPSRWKGECESGTQFNTSLCNKKLIGARY
FNKGLLANNPNLTISMDSARDTDGHGTHTSSTAAGSRVEGASFFGYAAGTATGVAPKAHV
AMYKALWEEGVFLSDILAAIDQAIADGVDVLSLSLGIDALPLYEDPVAIAAFAALEKGIF
VSTSAGNEGPFLETLHNGTPWVLTVAAGTVDREFIGTVTLGNGVSVTGLSLYPGNSSSSE
SSISFVDCQDDKELQKNAHRIVVCIDNNDSVSEDVYNVRNSKVSGAVFITNSTDLEFYLQ
SEFPAVFLNIQEGDKVLEYVRSDSAPNAKLEFQVTRIGAKPAPKVASYSSRGPSPSCPTI
LKPDLMGPGALILASWPQQTPVTEVTSGKLYSNFNIISGTSMSCPHASGVAALLKSAHPE
WSPAAIRSAMMTTAYVLDNTQSPIQDVGLKNGVATPLAMGAGHIDPNKALDPGLIYDATP
QDYVNHLCGLNFTSKQIQTITRSSTYTCSNPSLDLNYPSFIGYFNRNSSDSDPKRIQEFK
RTVTNLQDGTSVYTAKLTPMGKFKVSVVPNKLTFKEKYEKQSYKLRIEGPIIMDDIVVDG
SLSWMETRGKYIVKSPIVATSIRVDPLRGHN*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g078740.2.1

Transcript Infomation

Subtilisin-like protease (AHRD V3.3 *** W9SHY0_9ROSA)

Sequence

TGAAATAGTTGCTAACTTCCAATAATATATAACATGTTTGGTACATAGTGGAATTATGGA
CAAAGTGATGGACAATTTGGAAGTAAAGGGAATACTTTGGCTTCCCATACCTCTCACTTG
TCTATATAAGTGAATTAGCTTATGTTCAAGAAAATATCCTTCTTGAGTAATATTACTCAA
CATGGCAAATTATATTGCCTTGTGTATTTGGTTGCTTTCTATAATTCAATTGGCAAAGTC
AGAAACTTATATCATTCATATGGATTTGTCAGCCATGCCAAAAGCTTTTTCTAGCCATTA
TAATTGGTACTTGACTACACTTTTTTCGGTGTCAGATAGCAAAGACTTGTTGTCCTCTAA
ACTAGTTTATACTTATACTAATGCCATCAATGGTTTCAGTGCAAGTCTTTCTCCTTCTGA
GATAGAAGCTATTAAGAATTCTCCGGGTTATGTTTCTTCGATTAAGGATATGTCGGTTAA
AGTTGACACAACCCACACATCTCAATTCCTTGGCCTTAACTCTGAGTCTGGTGTATGGCC
AAAGTCGGATTATGGCAAAGATGTTATAGTTGGATTAGTTGACACTGGGATATGGCCAGA
GAGTAGAAGTTATAGTGATGATGGGATGAATGAAGTACCATCAAGATGGAAAGGAGAATG
TGAAAGTGGAACTCAGTTCAATACCTCTTTGTGCAATAAGAAACTCATTGGCGCTCGTTA
CTTCAATAAAGGCCTACTTGCTAACAACCCGAATCTTACCATTTCGATGGATTCTGCTCG
TGATACGGATGGACATGGGACTCACACTTCTTCCACGGCTGCTGGAAGTCGTGTAGAGGG
TGCATCTTTTTTTGGATATGCTGCTGGAACTGCTACAGGTGTAGCACCAAAGGCTCATGT
GGCCATGTACAAGGCTCTATGGGAAGAAGGTGTATTCTTGTCTGATATTCTTGCAGCAAT
TGATCAAGCAATTGCAGATGGTGTAGATGTATTGTCCTTGTCATTAGGCATTGATGCGCT
TCCTTTATACGAAGATCCTGTTGCAATTGCCGCATTTGCTGCACTGGAGAAAGGCATATT
TGTTTCTACATCTGCAGGAAATGAAGGGCCTTTTTTGGAAACTTTGCACAATGGAACGCC
TTGGGTGCTCACTGTTGCTGCTGGCACAGTTGACCGGGAGTTTATTGGCACAGTAACACT
TGGAAATGGAGTTTCGGTCACTGGATTATCGCTCTACCCTGGGAACTCTAGTTCAAGTGA
AAGCTCCATTAGCTTCGTTGATTGCCAAGATGATAAGGAACTGCAGAAAAATGCACACAG
AATAGTGGTCTGCATTGACAATAATGATTCAGTTAGCGAGGACGTCTACAATGTAAGAAA
TTCAAAAGTTTCTGGTGCAGTCTTCATAACTAATTCAACTGACTTGGAATTCTATCTCCA
AAGTGAATTTCCCGCGGTGTTTTTGAACATTCAAGAGGGTGATAAAGTTCTTGAGTACGT
TAGGAGTGACTCTGCACCTAACGCAAAGCTTGAATTCCAAGTGACGCGTATTGGTGCTAA
ACCAGCACCAAAAGTTGCTAGCTATAGCTCAAGAGGACCATCACCAAGCTGTCCTACAAT
TCTAAAGCCTGACCTTATGGGTCCTGGTGCATTAATACTTGCTTCATGGCCACAACAAAC
ACCAGTAACTGAAGTTACCTCGGGAAAACTTTATAGTAACTTCAACATTATATCAGGCAC
ATCAATGTCTTGTCCACATGCTTCTGGTGTAGCAGCACTTCTAAAAAGTGCACACCCTGA
ATGGAGCCCTGCTGCTATCCGATCCGCCATGATGACCACAGCCTATGTATTGGACAACAC
ACAAAGCCCCATCCAAGACGTAGGTCTGAAGAATGGTGTTGCTACTCCTCTAGCTATGGG
AGCTGGCCATATCGATCCAAACAAAGCGTTGGATCCCGGACTCATCTATGATGCAACACC
ACAAGATTATGTTAACCACCTCTGTGGTTTGAACTTCACATCCAAACAAATACAAACCAT
CACAAGATCCTCAACTTACACTTGCTCCAACCCATCATTAGACTTGAACTATCCATCATT
CATTGGCTATTTCAACCGGAATAGCAGCGATTCGGATCCTAAAAGGATTCAAGAATTCAA
AAGAACAGTGACTAACTTACAAGATGGTACATCAGTATACACAGCAAAGCTCACTCCAAT
GGGTAAATTTAAAGTTAGTGTTGTACCTAATAAGTTGACTTTCAAAGAAAAGTATGAAAA
ACAAAGCTATAAGCTAAGAATAGAAGGTCCAATAATTATGGATGATATTGTGGTTGATGG
TTCATTGAGCTGGATGGAAACTAGAGGAAAATACATAGTTAAAAGTCCAATTGTTGCAAC
AAGTATAAGAGTGGATCCTTTGAGAGGACATAACTGATTTAGTGAAATGATCTTTTAACT
AATTTGTGCTCTAAATGTGAAATTGTAACACATAATTTATGTGAAATAAACTTATATATT
CTTC