Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g077040.3.1
CDS Infomation	Xylulose kinase, putative (AHRD V3.3 *** A0A061FE36_THECC)
Sequence	ATGGCGGATTCATCACTCCCACAAGATGCTCTTTTTCTTGGCTTTGACAGTTCTACTCAA TCACTGAAGGCTACTGTGCTTGATGCCAATCTGAATATTGTGGCTGCTGAACTGATAAAT TTTGATTCAGAGTTATCCCATTACAAAACTGAAGGGGGTGTTTATCGTGACGCATTAGTA AATGGGAGAATTGTCTCACCCACATTGATGTGGGTAGAGGCATTTGAATTGATTCTTCAG AGACTTGAAAAATCATCAAAATTCGATTTTGGGAAGATTGCGGCTGTTTCAGGTAGTGGA CAGCAGCATGGTAGTGTGTTTTGGAAGAAAGAGAGTGCAGCGATATTGTCGTCCTTAGAT GCTAAGAGATCGTTGTTAGAGCAGCTAAATGATGCTTTTTCGACTAAAGAATCTCCGATA TGGATGGACAACAGCACAACAGAACAATGCAAGGCGATAGAGAAGGCTGTTGGAGGGGCA ATGGAGTTGTCTAGACTTACTGGTTCTCGCGCATACGAGAGATTTACTGGTCCGCAGATC CGGAGATTGTTTGAGACACAACCGGAGGTTTATAATAATACTGAGAGGATCTCCCTTGTT AGCTCCTTCATGGCATCTTTGCTTATTGGGGGCTATGCCAGCATTGATCACACGGATGGT GCAGGGATGAATTTGATGGACATTAAGCAAAGAGCGTGGTCCGAAATCATTTTGAAGGCC ACAGCTCCTGGTTTGGAGGAAAAACTTGGAAAATTAGCTCCGGCACATGCTGTTGCTGGA TCTATTGCTGCCTATTTTGTGGAGAGGTATCACTTCAACAAAGACTGTTTGATCATTCAA TGGTCTGGAGACAATCCCAACAGCTTGGCAGGGTTGACTTTAAATACTCCAGGGGATCTG GCGATTAGCCTTGGCACTAGTGATACAGTTTTCGGAATAACAAAGGATCATAATCCAAGC ATGGAAGGGCATGTTTTCCCTAATCCCGTCGATACTGAAAGCTACATGGTAATGTTGTGC TATAAAAATGGATCACTGGCTCGTGAAGATATACGCAACCATTATGCTGAAAAGTCTTGG GACGTTTTTAACAAATATTTGCAGCAAACTCCTCCTCTAAATGGTGGTAGATTAGGATTT TACTATAAGGATTTTGAGATACTGCCACCCCTCCCAGTTGGTTTCCACCGCTATATCCTT GAGAACTTCACTGGAGATTCTCTTGATGGAATAAAAGAGCAGGAAGTGGGAGAGTTTGAT CCCCCTTCCGAGGTTCGAGCCATCGTAGAGGGACAACTTCTTTCCAAGAGAGCTCATGCT GAAAGATTTGGAATGCCTTCTCCTCCAAAGCGAATAATTGCCACTGGAGGTGCTTCTGCT AACAATTCCATTCTAAGCTTGATAGCTTCCATCTTTGGATGTGATGTTTACACAGTTCAA CAGTCAGACTCGGCTTCCCTAGGTGCTGCTTTGAGGGCTGCTCATGGTTGGTTATGCAAC AAGAAGGGCAGTTTTGTGCCGATCTCATCCATGTACATGGACAAGATGGAGAAGACATCA CTCAACTGCAAGCTCGCAGCAACAGCAGGAGACCAGAAGCTTGTCGCCAAGTATGCTACG TTGATGAAGAAGAGAACTGAAATTGAGAATCGCCTCATTGAAAAGCTGGGGCGTTTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g077040.3.1
PEP Infomation	Xylulose kinase, putative (AHRD V3.3 *** A0A061FE36_THECC)
Sequence	MADSSLPQDALFLGFDSSTQSLKATVLDANLNIVAAELINFDSELSHYKTEGGVYRDALV NGRIVSPTLMWVEAFELILQRLEKSSKFDFGKIAAVSGSGQQHGSVFWKKESAAILSSLD AKRSLLEQLNDAFSTKESPIWMDNSTTEQCKAIEKAVGGAMELSRLTGSRAYERFTGPQI RRLFETQPEVYNNTERISLVSSFMASLLIGGYASIDHTDGAGMNLMDIKQRAWSEIILKA TAPGLEEKLGKLAPAHAVAGSIAAYFVERYHFNKDCLIIQWSGDNPNSLAGLTLNTPGDL AISLGTSDTVFGITKDHNPSMEGHVFPNPVDTESYMVMLCYKNGSLAREDIRNHYAEKSW DVFNKYLQQTPPLNGGRLGFYYKDFEILPPLPVGFHRYILENFTGDSLDGIKEQEVGEFD PPSEVRAIVEGQLLSKRAHAERFGMPSPPKRIIATGGASANNSILSLIASIFGCDVYTVQ QSDSASLGAALRAAHGWLCNKKGSFVPISSMYMDKMEKTSLNCKLAATAGDQKLVAKYAT LMKKRTEIENRLIEKLGRL*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g077040.3.1
Transcript Infomation	Xylulose kinase, putative (AHRD V3.3 *** A0A061FE36_THECC)
Sequence	CCTTTTTCTAAGAGTGAATCGAATTGTTAATAACCAAAAATATGGTTGTTACAAAGTGCA TGGCAAGAGTGTTAACTCTAAAAAATCACCCTGTATCAATACATATCTTTTGCATAATAT ATAATGTGATCATATACTATTTATTTGTTATGAAAATTTCAAACATAATGTGTGATTTAC TAAAATTAGGTATATCTATTTTATATTTCATGGGTCAGTAGCTATAATATAGGGGATCCC TTATAATGTGTCACAATATTTGCTTTCCATTAATATTTTATGTCTATAATTATCCTATCT TTTCGTAAATCCCGTATATCAACTGATAATTACGTGTGTCAATTATCATAGATTATCTTT TTATTTGATTATATAATTTCAATAATGTTTCCTAGTTAAACTTAAATCCAAAGATTAATT CTCCTATAAAACGAACACTATAATCCTTTTTTTTTCACCTCGTACTATAAATCCCAAATT TCTTCATTGGATTTGGATATCTTTTTTTTGTTCTAATGGCGGATTCATCACTCCCACAAG ATGCTCTTTTTCTTGGCTTTGACAGTTCTACTCAATCACTGAAGGCTACTGTGCTTGATG CCAATCTGAATATTGTGGCTGCTGAACTGATAAATTTTGATTCAGAGTTATCCCATTACA AAACTGAAGGGGGTGTTTATCGTGACGCATTAGTAAATGGGAGAATTGTCTCACCCACAT TGATGTGGGTAGAGGCATTTGAATTGATTCTTCAGAGACTTGAAAAATCATCAAAATTCG ATTTTGGGAAGATTGCGGCTGTTTCAGGTAGTGGACAGCAGCATGGTAGTGTGTTTTGGA AGAAAGAGAGTGCAGCGATATTGTCGTCCTTAGATGCTAAGAGATCGTTGTTAGAGCAGC TAAATGATGCTTTTTCGACTAAAGAATCTCCGATATGGATGGACAACAGCACAACAGAAC AATGCAAGGCGATAGAGAAGGCTGTTGGAGGGGCAATGGAGTTGTCTAGACTTACTGGTT CTCGCGCATACGAGAGATTTACTGGTCCGCAGATCCGGAGATTGTTTGAGACACAACCGG AGGTTTATAATAATACTGAGAGGATCTCCCTTGTTAGCTCCTTCATGGCATCTTTGCTTA TTGGGGGCTATGCCAGCATTGATCACACGGATGGTGCAGGGATGAATTTGATGGACATTA AGCAAAGAGCGTGGTCCGAAATCATTTTGAAGGCCACAGCTCCTGGTTTGGAGGAAAAAC TTGGAAAATTAGCTCCGGCACATGCTGTTGCTGGATCTATTGCTGCCTATTTTGTGGAGA GGTATCACTTCAACAAAGACTGTTTGATCATTCAATGGTCTGGAGACAATCCCAACAGCT TGGCAGGGTTGACTTTAAATACTCCAGGGGATCTGGCGATTAGCCTTGGCACTAGTGATA CAGTTTTCGGAATAACAAAGGATCATAATCCAAGCATGGAAGGGCATGTTTTCCCTAATC CCGTCGATACTGAAAGCTACATGGTAATGTTGTGCTATAAAAATGGATCACTGGCTCGTG AAGATATACGCAACCATTATGCTGAAAAGTCTTGGGACGTTTTTAACAAATATTTGCAGC AAACTCCTCCTCTAAATGGTGGTAGATTAGGATTTTACTATAAGGATTTTGAGATACTGC CACCCCTCCCAGTTGGTTTCCACCGCTATATCCTTGAGAACTTCACTGGAGATTCTCTTG ATGGAATAAAAGAGCAGGAAGTGGGAGAGTTTGATCCCCCTTCCGAGGTTCGAGCCATCG TAGAGGGACAACTTCTTTCCAAGAGAGCTCATGCTGAAAGATTTGGAATGCCTTCTCCTC CAAAGCGAATAATTGCCACTGGAGGTGCTTCTGCTAACAATTCCATTCTAAGCTTGATAG CTTCCATCTTTGGATGTGATGTTTACACAGTTCAACAGTCAGACTCGGCTTCCCTAGGTG CTGCTTTGAGGGCTGCTCATGGTTGGTTATGCAACAAGAAGGGCAGTTTTGTGCCGATCT CATCCATGTACATGGACAAGATGGAGAAGACATCACTCAACTGCAAGCTCGCAGCAACAG CAGGAGACCAGAAGCTTGTCGCCAAGTATGCTACGTTGATGAAGAAGAGAACTGAAATTG AGAATCGCCTCATTGAAAAGCTGGGGCGTTTGTGATCTTGAGATTATTCTATGCACAGCC AGCTCCAAATAATTTGAGAGTAGCAAAGATGTCAGATCATTTGTCTCTTTATATATCCTT GAGCCTGATGAGAACTCTTGTTAAATTCTTTCTTCTTCTTTTTCAGTTAGAATAATCTTA TACTCTCTGTAAACAGATCCAACAACCCTATCAGATGATTGAATATTTGAATTCATGATG ATTTGCGCCTTAAGTTTTAGTGGTGATGCCATATGATATATATAAATGAATAAGAGATTA GTAAGATAGCCAGTGTAAATATAATTAGTTTGCACAACTTGAGAGAAGAACATAACTTTT TTTATGCATGATTTGCTCTCTAACAAGTTCTCAAATGCAACA