Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g076950.3.1
CDS Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4BUD2_SOLLC)
Sequence	ATGTGCAACCCTAAGCCTTCTTCTCCATCCTCCTTTGTCTCCAATGAAAAAGTCCATTTT GTGAACTCAAACAAACCAATTGATGTTCAAGTTGATGATGAAGAACAACTTCATAAATGG CCAACCCCATCTGAGGCTTTTGAAGAAATGAAAGAAATAGGTAAGATTGCCGGACCAACA GCAATAACAGGGCTGGTTCTTTATTCAAGATCGATGATCTCGATGCTATTTCTTGGATAT TTAGGTGAACTTGAGCTAGCTGGAGGATCTCTTTCAATTGGTTTTGCTAATATAACTGGT TACTCTGTAATCTCTGGTTTAGCTATGGGAATGGAACCAATTTGTGGACAAGCTTATGGT GCTAAACAAATGAAACTTCTTGGAATTACCCTTCAAAGAACAGTACTTCTTTTACTTTCA ACTTCAATCCCTATCTCTTTCATGTGGCTAAACATGAAAACAATACTTTTATGGTGTGGT CAAGATGAAGATATTTCAAATATGGCCCATACTTTCATTCTCTTTGCGATTCCTGATCTC TTTTTCCTATCTTTGCTCCATCCTCTTCGGATTTATCTTAGGACACAAAATATTACGTTG CCATTAACTTATTGTTCTGCTATTTCTGTACTCCTACATGTCCCACTCAACTTCCTCCTC GTGCGATACTGCGATTTGGGTATTGCTGGTGTTGCTCTAGCCATGGTCTTAACTAATTTG AACTTTTTTCTCTTGCTCTGCTCTTTTGTTTACTTTTCCGGTGTATATAAGGATTCATGG GTTGCCCCGAGCATGGATTGTGTTCGGGGATGGTCCTCATTGCTGGCGTTGGCCATTCCA ACGTGCGTTTCTGTTTGTCTAGAGTGGTGGTGGTATGAATTTATGATACTGTTATGTGGA CTATTGCCTAATCCTAAAGCTACAATTGCTTCTATGGGGATATTAATCCAAACTACTTCT TTAGTCTACGTCTTCCCATCTTCCCTAAGCCTTGGTGTTTCAACTCGAGTTGGAAATGAG CTGGGTGCTAACCGGCCTGGTAGGGCCCGGGTATCGATGATCGTTTCCCTTGTTTGTGCA ATGGCATTGGGACTAGGGGCAATGTTGTTTGCAACATTGATGAGGCATAAATGGGGTGGT CTTTTCACAAAGGATGTTGAGATACTTAAATTGACTTCAATTGCATTGCCAATTGTAGGG CTTTGTGAATTGGGAAATTGTCCACAAACAACAGGTTGTGGTGTGTTGAGAGGAAGTGCA AGGCCTACAATTGGTGCGAATATTAATTTGGGCTCATTTTATTTAGTTGGAATGCCAGTA GCTATACTTGTTGGATTTATATTGAAAAAGGGGTTTGGTGGATTATGGATTGGGTTACTT GCAGCACAGGCATCATGTGCAATACTAATGCTTTATGTATTGTGCAAAACTGATTGGAAA GTTCAAGTGGAAAGATCAAAACAGTTAACACAACCAACTTCCTTGCCAGTCACAATGCCT AATTTGGACAAGAAAAAGATCAAGAAAAAAAACAATAATAATATTATTAGTAATAATCTT GAAGAGATTTTGTGCAATAAAGAGGAAGATGATTTGATGAAATCAGAAGATGCTTCACTT GATACAGACCCTCTTATATCTTCAACTACTTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g076950.3.1
PEP Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4BUD2_SOLLC)
Sequence	MCNPKPSSPSSFVSNEKVHFVNSNKPIDVQVDDEEQLHKWPTPSEAFEEMKEIGKIAGPT AITGLVLYSRSMISMLFLGYLGELELAGGSLSIGFANITGYSVISGLAMGMEPICGQAYG AKQMKLLGITLQRTVLLLLSTSIPISFMWLNMKTILLWCGQDEDISNMAHTFILFAIPDL FFLSLLHPLRIYLRTQNITLPLTYCSAISVLLHVPLNFLLVRYCDLGIAGVALAMVLTNL NFFLLLCSFVYFSGVYKDSWVAPSMDCVRGWSSLLALAIPTCVSVCLEWWWYEFMILLCG LLPNPKATIASMGILIQTTSLVYVFPSSLSLGVSTRVGNELGANRPGRARVSMIVSLVCA MALGLGAMLFATLMRHKWGGLFTKDVEILKLTSIALPIVGLCELGNCPQTTGCGVLRGSA RPTIGANINLGSFYLVGMPVAILVGFILKKGFGGLWIGLLAAQASCAILMLYVLCKTDWK VQVERSKQLTQPTSLPVTMPNLDKKKIKKKNNNNIISNNLEEILCNKEEDDLMKSEDASL DTDPLISSTT*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g076950.3.1
Transcript Infomation	Protein DETOXIFICATION (AHRD V3.3 *** K4BUD2_SOLLC)
Sequence	TTATTTCTTTCTTTTTTTCTCCTTGTGTTGCCCACAAAACCATAATATTTATTATCTCTA CTAGTCTACTATTTGCATCTTCAAGCTTACCAAAGCAAGAAAGAACTAGGATAGAAATAT AGATAGAGAAAACTATGTGCAACCCTAAGCCTTCTTCTCCATCCTCCTTTGTCTCCAATG AAAAAGTCCATTTTGTGAACTCAAACAAACCAATTGATGTTCAAGTTGATGATGAAGAAC AACTTCATAAATGGCCAACCCCATCTGAGGCTTTTGAAGAAATGAAAGAAATAGGTAAGA TTGCCGGACCAACAGCAATAACAGGGCTGGTTCTTTATTCAAGATCGATGATCTCGATGC TATTTCTTGGATATTTAGGTGAACTTGAGCTAGCTGGAGGATCTCTTTCAATTGGTTTTG CTAATATAACTGGTTACTCTGTAATCTCTGGTTTAGCTATGGGAATGGAACCAATTTGTG GACAAGCTTATGGTGCTAAACAAATGAAACTTCTTGGAATTACCCTTCAAAGAACAGTAC TTCTTTTACTTTCAACTTCAATCCCTATCTCTTTCATGTGGCTAAACATGAAAACAATAC TTTTATGGTGTGGTCAAGATGAAGATATTTCAAATATGGCCCATACTTTCATTCTCTTTG CGATTCCTGATCTCTTTTTCCTATCTTTGCTCCATCCTCTTCGGATTTATCTTAGGACAC AAAATATTACGTTGCCATTAACTTATTGTTCTGCTATTTCTGTACTCCTACATGTCCCAC TCAACTTCCTCCTCGTGCGATACTGCGATTTGGGTATTGCTGGTGTTGCTCTAGCCATGG TCTTAACTAATTTGAACTTTTTTCTCTTGCTCTGCTCTTTTGTTTACTTTTCCGGTGTAT ATAAGGATTCATGGGTTGCCCCGAGCATGGATTGTGTTCGGGGATGGTCCTCATTGCTGG CGTTGGCCATTCCAACGTGCGTTTCTGTTTGTCTAGAGTGGTGGTGGTATGAATTTATGA TACTGTTATGTGGACTATTGCCTAATCCTAAAGCTACAATTGCTTCTATGGGGATATTAA TCCAAACTACTTCTTTAGTCTACGTCTTCCCATCTTCCCTAAGCCTTGGTGTTTCAACTC GAGTTGGAAATGAGCTGGGTGCTAACCGGCCTGGTAGGGCCCGGGTATCGATGATCGTTT CCCTTGTTTGTGCAATGGCATTGGGACTAGGGGCAATGTTGTTTGCAACATTGATGAGGC ATAAATGGGGTGGTCTTTTCACAAAGGATGTTGAGATACTTAAATTGACTTCAATTGCAT TGCCAATTGTAGGGCTTTGTGAATTGGGAAATTGTCCACAAACAACAGGTTGTGGTGTGT TGAGAGGAAGTGCAAGGCCTACAATTGGTGCGAATATTAATTTGGGCTCATTTTATTTAG TTGGAATGCCAGTAGCTATACTTGTTGGATTTATATTGAAAAAGGGGTTTGGTGGATTAT GGATTGGGTTACTTGCAGCACAGGCATCATGTGCAATACTAATGCTTTATGTATTGTGCA AAACTGATTGGAAAGTTCAAGTGGAAAGATCAAAACAGTTAACACAACCAACTTCCTTGC CAGTCACAATGCCTAATTTGGACAAGAAAAAGATCAAGAAAAAAAACAATAATAATATTA TTAGTAATAATCTTGAAGAGATTTTGTGCAATAAAGAGGAAGATGATTTGATGAAATCAG AAGATGCTTCACTTGATACAGACCCTCTTATATCTTCAACTACTTAATTAATTCAGAGAT TATTGTGCATTGATTGGATTAACTCTCTCCATTTCTATTTTTACTTTTTTTTTTTTTGGG TCCCTCTTAATACCCTTGGATGGGTTGATGTGAAAAATTGTTCATTGGGATTTTATAGAC TAATCATGTTAACATTTGATGATCAAAAGAGTGTATTTGATGATCATGAGGATATA