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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g076800.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199W533_ANACO)

Sequence

ATGGCTTCTCTGCCTTCAGTAGTTGTGGGCAACACCCTTAAGCTTGAAAATGAATTCAAG
AAAAACTCAGTAACTCCTTTGCCTTTCGAAAAGAAAAATCATAGTCCCATGAACTCGGAT
AAAGCATTGGAGCCATTGAATGTTGAATTCAGAGAGGCACTTTCACTGATCAAAGAAGGT
AGTGAAAAAGTGGAATCAGCTTCTTATGTTCCACTTCTGCAAGAATGTATCAAGAATAAT
TCTGTTTCAGAAGCTAAAGCTATTCATGGCCATATTATCAAAATGGGTATTCATGAAGAT
TTGTTCCTCATGACATTTCTTGTTAATGTTTATGCAAAATGTGGGATGATGGGAAACGCA
CGGAAGGTATTTGATAATTTGCCTAAAAGAAATGTTGTTACCTGGACATCCTTGATGTCT
GGCTATGTTCAGAATTCGCAGCCGGAGGTTGCTATTAGCGTATTCCAAGAAATGCTGGAA
GCGGGTGGATTTCCCACGAATTATACGTTAGGTGTTGCGTTCAATGCTTGTTCATTGTTG
GGTCATTTCGAGTTAGGAAAGCAGATTCATGCGTATGTTGTGAAGTATGAAATTGAGGAT
GACACAAGTATTGGCAATGCTCTCTGTAGCTTGTATTCCAAAAGTCACAATCTGGATTCT
GCAGTTAAAGCTTTTCGGATGATTGCTGATAAGAATGTTATCTCGTGGACAGCAGCTATA
TCTGCCTGTGGAGATAACGGGGATTCTGCAATGGGATTAAGCCTGTTTGTTGATATGCTT
AGTGCGGATGTGGAGCCTAATGAGTTCACATTTACAAGTGTACTAAGTTTGTGTTGCATA
ATGCAGGCTTTAAAGATAGGATCACAAATTCATTCTTTGAGCATTAAACTGGGGTATGGT
TCTAATCTAAGAGTAACAAATTCAATTATGTACTTATACTTGAAAAATGGATGGATTATA
GAGGCAAAGAAGCTGTTTGATGGAATGGAGTCAATTAGTTTGGTTACATGGAACGCGATG
ATTGCAGGTCTTGCTCAAATGATGGATCTTGGAGAGGACGGTATTGCTGCACATTCCAGC
GGTTTTGAGGCACTAAACACTTTTTTGAGACTGCATCATTCGGGGATGAAGCCTGATTTA
TTCACCTTCTCAAGTGTGTTATCTGTATGTAGTAGTTTGGTTGCTTTGGAACAAGGGGAA
CAAATTCATGCTCAGGTTATTAAGTCTGGGTTTTTGTCGGACGTTGTAGTGGGAACTGCC
CTAGTTAACATGTATAATAAATGTGGGAGCATTGATAGGGCAAGTAAAGCTTTTGTGGAG
ATGTCTACACGAACTTTGATATCTTGGACGTCTATGATTACAGCCTTCGCACAACATGGG
TACTCTAAACAAGCGTTGCAGCTCTTTGAGGATATGAGGTTCGTAGGAGTTAGACCAAAC
AAGGTTACATTCGTGGGAGTGCTCTCGGCTTGTAGCCATGCTGGACTGGTCAAAGAGGCA
TTGACATACTTTGACATGATGAAAAAAGAGTACAAAATTAAGCCCGTGATGGACCATTAT
GCATGCTTGATTGATATGTTTGTGAGGTTAGGTAGGATAGATGAGGCTTTTGATTTCGTC
AAGAAGATGGATTTTGAGCCTAACGAGTTTATATGGTCAATTCTAATAGCTGGCTGTAGA
AGCCATGGGAAGTTAGAACTAGGTTTTTATGCTGCTGAACAACTACTCAGCCTGAATCCG
AAAAATTCAGAAGCATACTTCCTGTTGTTAAACATGTACCTATCAGCTGAGAGATGGAAG
GATGTTTCCAGGTTGAGAAAGCTAATGAAAGATGAAAAAATCGGAAAGCTAAAGGATTGG
AGCTGGATCAGCATCAGGGACAAAGTTCATTCGTTTAGAACAGGTGATCAGTTGAATCCT
CCATACGAAAATATAGATATTTTCTTAAGTGATTTACATGACAAAGCAAGTACAATGGGA
TTTGAGTTGCACACAAGTTTGGAGCTCAAAAACGAAGAAGATAATGAAACAGCTTTTCCT
ATTGGTCGTCACAGTGAAAAACTGGCTGTTGCATTTGGATTGCTGAACATACCAAGTGCT
GCACCCATCCGAGTTATTAAGAGTATAAGCATGTGTAGAGATTGCCACAGCTTTATGAAA
TTCATCTCACAGCTAACTTCAAGAAAAATCATCATTAGAGATAGTAAAAGGCTTCACAAA
TTTGTGAATGGACATTGTTCTTGCGGCGATTTTGGTAGTCTTGTTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g076800.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199W533_ANACO)

Sequence

MASLPSVVVGNTLKLENEFKKNSVTPLPFEKKNHSPMNSDKALEPLNVEFREALSLIKEG
SEKVESASYVPLLQECIKNNSVSEAKAIHGHIIKMGIHEDLFLMTFLVNVYAKCGMMGNA
RKVFDNLPKRNVVTWTSLMSGYVQNSQPEVAISVFQEMLEAGGFPTNYTLGVAFNACSLL
GHFELGKQIHAYVVKYEIEDDTSIGNALCSLYSKSHNLDSAVKAFRMIADKNVISWTAAI
SACGDNGDSAMGLSLFVDMLSADVEPNEFTFTSVLSLCCIMQALKIGSQIHSLSIKLGYG
SNLRVTNSIMYLYLKNGWIIEAKKLFDGMESISLVTWNAMIAGLAQMMDLGEDGIAAHSS
GFEALNTFLRLHHSGMKPDLFTFSSVLSVCSSLVALEQGEQIHAQVIKSGFLSDVVVGTA
LVNMYNKCGSIDRASKAFVEMSTRTLISWTSMITAFAQHGYSKQALQLFEDMRFVGVRPN
KVTFVGVLSACSHAGLVKEALTYFDMMKKEYKIKPVMDHYACLIDMFVRLGRIDEAFDFV
KKMDFEPNEFIWSILIAGCRSHGKLELGFYAAEQLLSLNPKNSEAYFLLLNMYLSAERWK
DVSRLRKLMKDEKIGKLKDWSWISIRDKVHSFRTGDQLNPPYENIDIFLSDLHDKASTMG
FELHTSLELKNEEDNETAFPIGRHSEKLAVAFGLLNIPSAAPIRVIKSISMCRDCHSFMK
FISQLTSRKIIIRDSKRLHKFVNGHCSCGDFGSLV*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g076800.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199W533_ANACO)

Sequence

TAAGTACATCATATATATTTTTACAGAAATGAGTATATTCTTAGCGAATTGTCAATAGGG
ATTAGAAGGTAAAAACTATGAATCGTTGTTTTGATACGGAAGGTGGGATAAACAAAATTA
TATCGTGGACTTTGTAATTTATGAGATAAATAATTTCGAGACTACCGATACCAAACGAAC
GATTACTATCCATAATTTATTAGTTCCCGCTAAGATTAACGTCCTAATCCATTTTTCACA
TCTCCAGTGGGGTCCACGAAACTCAATCTCTACCGGTCTCCCCTGTTCGGATTTTCAGTT
CAATTTCATCCAAAGAGTAAAGATAACATTTTTCTTTTTTCAATTTCAATTTCAGATAAA
ATAAAACGGAAGAACAATGAAGTAATCTTTTCCCAGTTTTATACTGAGTGGCGAATTCAA
TGGCTTCTCTGCCTTCAGTAGTTGTGGGCAACACCCTTAAGCTTGAAAATGAATTCAAGA
AAAACTCAGTAACTCCTTTGCCTTTCGAAAAGAAAAATCATAGTCCCATGAACTCGGATA
AAGCATTGGAGCCATTGAATGTTGAATTCAGAGAGGCACTTTCACTGATCAAAGAAGGTA
GTGAAAAAGTGGAATCAGCTTCTTATGTTCCACTTCTGCAAGAATGTATCAAGAATAATT
CTGTTTCAGAAGCTAAAGCTATTCATGGCCATATTATCAAAATGGGTATTCATGAAGATT
TGTTCCTCATGACATTTCTTGTTAATGTTTATGCAAAATGTGGGATGATGGGAAACGCAC
GGAAGGTATTTGATAATTTGCCTAAAAGAAATGTTGTTACCTGGACATCCTTGATGTCTG
GCTATGTTCAGAATTCGCAGCCGGAGGTTGCTATTAGCGTATTCCAAGAAATGCTGGAAG
CGGGTGGATTTCCCACGAATTATACGTTAGGTGTTGCGTTCAATGCTTGTTCATTGTTGG
GTCATTTCGAGTTAGGAAAGCAGATTCATGCGTATGTTGTGAAGTATGAAATTGAGGATG
ACACAAGTATTGGCAATGCTCTCTGTAGCTTGTATTCCAAAAGTCACAATCTGGATTCTG
CAGTTAAAGCTTTTCGGATGATTGCTGATAAGAATGTTATCTCGTGGACAGCAGCTATAT
CTGCCTGTGGAGATAACGGGGATTCTGCAATGGGATTAAGCCTGTTTGTTGATATGCTTA
GTGCGGATGTGGAGCCTAATGAGTTCACATTTACAAGTGTACTAAGTTTGTGTTGCATAA
TGCAGGCTTTAAAGATAGGATCACAAATTCATTCTTTGAGCATTAAACTGGGGTATGGTT
CTAATCTAAGAGTAACAAATTCAATTATGTACTTATACTTGAAAAATGGATGGATTATAG
AGGCAAAGAAGCTGTTTGATGGAATGGAGTCAATTAGTTTGGTTACATGGAACGCGATGA
TTGCAGGTCTTGCTCAAATGATGGATCTTGGAGAGGACGGTATTGCTGCACATTCCAGCG
GTTTTGAGGCACTAAACACTTTTTTGAGACTGCATCATTCGGGGATGAAGCCTGATTTAT
TCACCTTCTCAAGTGTGTTATCTGTATGTAGTAGTTTGGTTGCTTTGGAACAAGGGGAAC
AAATTCATGCTCAGGTTATTAAGTCTGGGTTTTTGTCGGACGTTGTAGTGGGAACTGCCC
TAGTTAACATGTATAATAAATGTGGGAGCATTGATAGGGCAAGTAAAGCTTTTGTGGAGA
TGTCTACACGAACTTTGATATCTTGGACGTCTATGATTACAGCCTTCGCACAACATGGGT
ACTCTAAACAAGCGTTGCAGCTCTTTGAGGATATGAGGTTCGTAGGAGTTAGACCAAACA
AGGTTACATTCGTGGGAGTGCTCTCGGCTTGTAGCCATGCTGGACTGGTCAAAGAGGCAT
TGACATACTTTGACATGATGAAAAAAGAGTACAAAATTAAGCCCGTGATGGACCATTATG
CATGCTTGATTGATATGTTTGTGAGGTTAGGTAGGATAGATGAGGCTTTTGATTTCGTCA
AGAAGATGGATTTTGAGCCTAACGAGTTTATATGGTCAATTCTAATAGCTGGCTGTAGAA
GCCATGGGAAGTTAGAACTAGGTTTTTATGCTGCTGAACAACTACTCAGCCTGAATCCGA
AAAATTCAGAAGCATACTTCCTGTTGTTAAACATGTACCTATCAGCTGAGAGATGGAAGG
ATGTTTCCAGGTTGAGAAAGCTAATGAAAGATGAAAAAATCGGAAAGCTAAAGGATTGGA
GCTGGATCAGCATCAGGGACAAAGTTCATTCGTTTAGAACAGGTGATCAGTTGAATCCTC
CATACGAAAATATAGATATTTTCTTAAGTGATTTACATGACAAAGCAAGTACAATGGGAT
TTGAGTTGCACACAAGTTTGGAGCTCAAAAACGAAGAAGATAATGAAACAGCTTTTCCTA
TTGGTCGTCACAGTGAAAAACTGGCTGTTGCATTTGGATTGCTGAACATACCAAGTGCTG
CACCCATCCGAGTTATTAAGAGTATAAGCATGTGTAGAGATTGCCACAGCTTTATGAAAT
TCATCTCACAGCTAACTTCAAGAAAAATCATCATTAGAGATAGTAAAAGGCTTCACAAAT
TTGTGAATGGACATTGTTCTTGCGGCGATTTTGGTAGTCTTGTTTAA