Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g076520.2.1
CDS Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DJ93_THECC)
Sequence	ATGTGCGGAAGTGGTACAACTACTACTACTATGTCACCAGACGTTTGTGGATCTAGCTTG CTTCTATCACTGCCTGATGACGTGTTTGCTATAGTAAGTAGATCACTTTCTCCAAGGGAT GTATGTAATCTTGGTTTATGCTGTAGAAACTTGCATGATTTAGCTGCCTCTGAGAAGGTT TGGCTATCACAATGTGAAATGCTTGGGGTGGTTCCTTATCGGGATGTTATTGAATGGCGA AAGGGAGTTTGTTCCTACAAGGCACTTTGTCACTTCTTTGTAAGCATAAAGCCTTTGCTT GGTATTTGGGTTCATCAAAATCCTGAACTCGGCAATGTTGTTTATGTTATGCCTGGTTTT ATCTCTGCGGTTGGTTGTCGGATTATTCCCCAAGAACTTGGTCCATTAGGCCTTGAAGAC AGTCCAATTTTGTGGTCGCCTGTATTTGAAGTTGTTTCTGATTTTGAGGGCTCTGCTGCA TTTTTCCTTCATGGTAGGGAGAATGGAACTGACTATGTTTATCCTGGTTCGCTTAAGAAG GTCGAGAGGACTTGCAATGTGCTTTTGTTAGAGGTTGAGCCTCAGCAGTACACAAGTGGG GGTAAGTTGTTCCACAGCAAGAGTTTTCTTCATCTTTCAGAGAATGAGGCATCACGGAAG ATATGCAGATCCACTAATGGGGTTTCTGTGTCAGAGAGGGTAACAGAACAGCGCGCAACA ACAGTGCCCTTTGGACGGCTTGCATTTGTTGATAGGAGAAAGTTGCTTGACACAGTTACT AATCAAGTTCGTCAAACGCTGCCAGATGCTAAAGATGCCATATTATTTCCTTGTTTGAGA AGAGAGGAGGCTGATTTACGGGAGAATATGAAACTCTTGTATGAAAGGAGATTGCTCTTC ATGCAAATGTACGATGGTGGTGGTGGTTTTACTGTCTGGAAGGCTGGTTCGGAGTTGCCT TTGCATCCTTCTCCTGTCGGATTGAGTGAGTTCAGACAGAATCTTGATCTGATAAGTGGC TGTCATGCCTCACAAACTGCTACTGATCATGAGAGTCGGAGTCGGAAGTCACTTGCTGGA TATGTTAAACACAGTCTAAAATATATACTCAAGAAGTCAAACTCTACCAATGGCAAACGT GATCTCCTTGGAAAGAATTCCTCTGGCCACGGAAGTAAGCATGCCCAGCTTCACGAGTTC CTGCAGCCAGGTGATATGCATGAAAGTAAATTTGCTCTGTACAAGTTGCCTATGCGGACA CCAGAAGTGGGCCAAGAATATGCTGGTGTATGGGGAGGGACTTTTGGTTGGCCCCCGGGG AGGCCTTCTGATGATAAGCCCGGAAAAGCATTGTTTCTTCTTTTGCTGTCTTATGAGGAG TCCCAAGGTCAGAAGCTACTTATTGCGACCAAGATATTAGAAGGTACACATTATGTTTTG CATCCTAATGGCTCAGCTATGTTTATAGTAAATATTGAAGAGCCTTCGAATGATCCATTC CCTTGGTGCACCGATGGGCATGATTCCAACCCTGTAGATGTTAAGCATGCTTTTATGGGT GAAGGTATTGCTAACGGGTATGGTTTCCGATATCCTGGTTCAAAACCTGGTTCACTCTTT GTAATCCATGATAAAATGCTTGCTTTTATATGGAAGGAGTCCAGGTCTGTGTTGGCCTTG CAGAGGCTCGATTTGCAAGAGGTTTTGAGCAAGGGGGAAAGGATCCCTGCTCTACCTCCG GTTTCCAACTTTGCATACCTTACCAGGTCCTATTCAAACGTGTTTGCCAACGGTCTGACT TCACCAAGGCAAAATCATCCGTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g076520.2.1
PEP Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DJ93_THECC)
Sequence	MCGSGTTTTTMSPDVCGSSLLLSLPDDVFAIVSRSLSPRDVCNLGLCCRNLHDLAASEKV WLSQCEMLGVVPYRDVIEWRKGVCSYKALCHFFVSIKPLLGIWVHQNPELGNVVYVMPGF ISAVGCRIIPQELGPLGLEDSPILWSPVFEVVSDFEGSAAFFLHGRENGTDYVYPGSLKK VERTCNVLLLEVEPQQYTSGGKLFHSKSFLHLSENEASRKICRSTNGVSVSERVTEQRAT TVPFGRLAFVDRRKLLDTVTNQVRQTLPDAKDAILFPCLRREEADLRENMKLLYERRLLF MQMYDGGGGFTVWKAGSELPLHPSPVGLSEFRQNLDLISGCHASQTATDHESRSRKSLAG YVKHSLKYILKKSNSTNGKRDLLGKNSSGHGSKHAQLHEFLQPGDMHESKFALYKLPMRT PEVGQEYAGVWGGTFGWPPGRPSDDKPGKALFLLLLSYEESQGQKLLIATKILEGTHYVL HPNGSAMFIVNIEEPSNDPFPWCTDGHDSNPVDVKHAFMGEGIANGYGFRYPGSKPGSLF VIHDKMLAFIWKESRSVLALQRLDLQEVLSKGERIPALPPVSNFAYLTRSYSNVFANGLT SPRQNHP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g076520.2.1
Transcript Infomation	F-box family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DJ93_THECC)
Sequence	ATTGGAGTGAGTATTTTTTATTTCAATTAATCAACTAATCATAGACTCACTCCACTTTCA ATTATTCACAGTCACATCCCTTTGTTAAAATACCATTCCAAAAAAGCTGCTTATTTGTCT CTTTCAAAGAAACCTCACATTCTTCATCATCATTAATGGGCTTTCACAGGAATAAATACG AGTTGTTCATTCGGTTTTGGTTAGTGGATGACTTATGACTCTTACCAAGTCCAACATTTA CATCAATCTGTAGCAATTTTGCATTAAGAAAGTTGATTTCATTTTTCAGTGGGTGGAATT CTGTGGGAACCAGATGACAAAGTCATTCTGTAGTTCTTTTTTGATGAAATTAGGAGGTTA CAGCAAAATCTTGAATCCCAATTGAGATGTGCGGAAGTGGTACAACTACTACTACTATGT CACCAGACGTTTGTGGATCTAGCTTGCTTCTATCACTGCCTGATGACGTGTTTGCTATAG TAAGTAGATCACTTTCTCCAAGGGATGTATGTAATCTTGGTTTATGCTGTAGAAACTTGC ATGATTTAGCTGCCTCTGAGAAGGTTTGGCTATCACAATGTGAAATGCTTGGGGTGGTTC CTTATCGGGATGTTATTGAATGGCGAAAGGGAGTTTGTTCCTACAAGGCACTTTGTCACT TCTTTGTAAGCATAAAGCCTTTGCTTGGTATTTGGGTTCATCAAAATCCTGAACTCGGCA ATGTTGTTTATGTTATGCCTGGTTTTATCTCTGCGGTTGGTTGTCGGATTATTCCCCAAG AACTTGGTCCATTAGGCCTTGAAGACAGTCCAATTTTGTGGTCGCCTGTATTTGAAGTTG TTTCTGATTTTGAGGGCTCTGCTGCATTTTTCCTTCATGGTAGGGAGAATGGAACTGACT ATGTTTATCCTGGTTCGCTTAAGAAGGTCGAGAGGACTTGCAATGTGCTTTTGTTAGAGG TTGAGCCTCAGCAGTACACAAGTGGGGGTAAGTTGTTCCACAGCAAGAGTTTTCTTCATC TTTCAGAGAATGAGGCATCACGGAAGATATGCAGATCCACTAATGGGGTTTCTGTGTCAG AGAGGGTAACAGAACAGCGCGCAACAACAGTGCCCTTTGGACGGCTTGCATTTGTTGATA GGAGAAAGTTGCTTGACACAGTTACTAATCAAGTTCGTCAAACGCTGCCAGATGCTAAAG ATGCCATATTATTTCCTTGTTTGAGAAGAGAGGAGGCTGATTTACGGGAGAATATGAAAC TCTTGTATGAAAGGAGATTGCTCTTCATGCAAATGTACGATGGTGGTGGTGGTTTTACTG TCTGGAAGGCTGGTTCGGAGTTGCCTTTGCATCCTTCTCCTGTCGGATTGAGTGAGTTCA GACAGAATCTTGATCTGATAAGTGGCTGTCATGCCTCACAAACTGCTACTGATCATGAGA GTCGGAGTCGGAAGTCACTTGCTGGATATGTTAAACACAGTCTAAAATATATACTCAAGA AGTCAAACTCTACCAATGGCAAACGTGATCTCCTTGGAAAGAATTCCTCTGGCCACGGAA GTAAGCATGCCCAGCTTCACGAGTTCCTGCAGCCAGGTGATATGCATGAAAGTAAATTTG CTCTGTACAAGTTGCCTATGCGGACACCAGAAGTGGGCCAAGAATATGCTGGTGTATGGG GAGGGACTTTTGGTTGGCCCCCGGGGAGGCCTTCTGATGATAAGCCCGGAAAAGCATTGT TTCTTCTTTTGCTGTCTTATGAGGAGTCCCAAGGTCAGAAGCTACTTATTGCGACCAAGA TATTAGAAGGTACACATTATGTTTTGCATCCTAATGGCTCAGCTATGTTTATAGTAAATA TTGAAGAGCCTTCGAATGATCCATTCCCTTGGTGCACCGATGGGCATGATTCCAACCCTG TAGATGTTAAGCATGCTTTTATGGGTGAAGGTATTGCTAACGGGTATGGTTTCCGATATC CTGGTTCAAAACCTGGTTCACTCTTTGTAATCCATGATAAAATGCTTGCTTTTATATGGA AGGAGTCCAGGTCTGTGTTGGCCTTGCAGAGGCTCGATTTGCAAGAGGTTTTGAGCAAGG GGGAAAGGATCCCTGCTCTACCTCCGGTTTCCAACTTTGCATACCTTACCAGGTCCTATT CAAACGTGTTTGCCAACGGTCTGACTTCACCAAGGCAAAATCATCCGTAGGGATGACATG CAAGAAGAGC