Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g076430.3.1

CDS Infomation

Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha (AHRD V3.3 *** W9QC24_9ROSA)

Sequence

ATGCACGGAAGACCACGCAAAGCTCCAACTCTAGAAGAGCAAGAAGCTTTTAGTGTCAAA
GCTTCCAAATTACGGTCTCTACAATCACAATTTCTCCAATTTCATCACGCCAAAATATAT
ACAAAGGAAGCTTTAGATGTAAGTGCAAAGTTGTTAGAGTCGAACCCTGAGTATTATACT
GCTTGGAATTATAGAAAACTTGCTGTCCAGCATAATTTGAATCTACCTGAGGTGGAGAAC
AATGAGGAGACTGTTAAGTCAATTCTTGATGAAGAACTCAGATTGGTAGAGAATGCGTTG
AGGAGGAATTTCAAGTCTTACGGAGCATGGCATCACCGTAAATGGGTGCTGAGCAAAGGT
CATTCTTCCACAGACAAGGAATTGTTGCTTCTGGGTAAGTTCCAGAAGGCAGACTCCCGC
AATTTTCATGCATGGAATTATAGAAGGTTCGTCACAACATTGAAGAACATACCAAATGAG
AAGGAGCTAGAATACACTACCGACATGATATATGATAATTTCAGCAACTATTCTGCTTGG
CACAACCGCAGTGTTCTTCTTTCTCATTTGCTGAAGGAAAAAGCAAAAGGATATTCTCCC
AAGGACAATGTATTTACAGAAGAGTACGAGTTTGTGCGTCATGCTCTTTTCACAGATCCA
GATGATCAAAGTGGTTGGTTTTATCATCTGTGGCTTCTTGATCAGACAGTTAAACTAGAG
ACATTGTTGGTTTCTTCATGGCCACCACATGGCTGTAATCTTTCTTTATCCACGGATGGA
TCGTTTGGAGATTGCTCTTTATCACCCTTTACGAGTCTTCAGACTAATACTAGAACACTT
CCACTCATTCTCTATTTCAGCGAAGCTGTTGAGAATATATGCTCATCTACAGTAGTAATC
GAATGTGAAAATATTGCGAGTAATGAGCTCGTCTGGAGATCACTCTCAGGAGATGGAGCT
GGGTCTGCTCAAGCTTGGTTGACATATCTTAATTTCCCAGAGGAACATGCACATTCTGAA
AAGGCTTACCAAGTAAAGGTCAGCCTTGCTCATTCTCGAGGCATTTTCTCTTCAACTGGT
GTTCATCATGGAGATTCTTCTCATATTGAATTTTCAGTGTCTGTACCACCTCATCGTTCA
GAACATGTTGATTTAAATAATGAAGGGAAAATCTCTTGGAGTGATGAAAGTTTCTGCACT
CATGACACACAGTTTCTTGAGTCAGCTCTGATTAACTTGTTCCATCTGGAAAGAACCAAG
ATAGATGAAACAGTGGTGGACTATCAGTGGAATATTACGACCATCAATAATGAGATATCA
CACTATAGGGAGTTGTTATCAACAATGAACTGTAAAATTGGGAAGCTGACACTTGCCAGA
CTGCTGATTGCCCATGACACCTTAATGTCATATACTGGCACTAGTCACAGAAATGTTAGC
CACCATGCAGAAGTTCTTCAACTTTATGACGATTTAAAGAAAATGGACCCAGCACATCTC
CACTACTACCAGGATGAGTACAGTATAGTACTTCTGAAACAGACAATCTCCAATCAAGAA
TTGTTGTTGAAGCACTGCCGTAAATATAGGGATCCATCTTCTCCAAGAATCAATAATTTC
TGTCTGCGGCTTAATAATCTCTCACTTTCACGTATTGGGTCTATGGAGCAACTTTTGTGG
GTCCAAGTATTAGATCTCAGCCACAACCAACTTAAGACACTTGAAGGCTTGGAGGTGATG
CAACTTCTCTCCTGCTTGAATGTTAGCTACAATAAACTCTGCAGTTTTACTGCATTGGAG
CCTTTGAAACTGCTAAGGTCACTGAAAGTCTTAGATATCTCTTACAACGAGATTGGAGCG
CATTCTATTGACACGAGGAGGTATTTGTGCTCTTCCCCTCTTAACCATAGAAGTGGAGGT
GACTGGAAAACTGAGGAATCTGAGATCCATTGCGTTGAGGTGGCTGATAATTGGGAAGCC
TATGCTATTTTTAAAGACTTGAACTTGATACAATTAGATCTTAAAGGAAATGCAGTTTCC
GATGAAAAGATACAATCACTTCTAATTAAGCTATTACCATCACTAAAGTGGCTTGATGGT
GAAAGTTGCCGATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g076430.3.1

PEP Infomation

Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha (AHRD V3.3 *** W9QC24_9ROSA)

Sequence

MHGRPRKAPTLEEQEAFSVKASKLRSLQSQFLQFHHAKIYTKEALDVSAKLLESNPEYYT
AWNYRKLAVQHNLNLPEVENNEETVKSILDEELRLVENALRRNFKSYGAWHHRKWVLSKG
HSSTDKELLLLGKFQKADSRNFHAWNYRRFVTTLKNIPNEKELEYTTDMIYDNFSNYSAW
HNRSVLLSHLLKEKAKGYSPKDNVFTEEYEFVRHALFTDPDDQSGWFYHLWLLDQTVKLE
TLLVSSWPPHGCNLSLSTDGSFGDCSLSPFTSLQTNTRTLPLILYFSEAVENICSSTVVI
ECENIASNELVWRSLSGDGAGSAQAWLTYLNFPEEHAHSEKAYQVKVSLAHSRGIFSSTG
VHHGDSSHIEFSVSVPPHRSEHVDLNNEGKISWSDESFCTHDTQFLESALINLFHLERTK
IDETVVDYQWNITTINNEISHYRELLSTMNCKIGKLTLARLLIAHDTLMSYTGTSHRNVS
HHAEVLQLYDDLKKMDPAHLHYYQDEYSIVLLKQTISNQELLLKHCRKYRDPSSPRINNF
CLRLNNLSLSRIGSMEQLLWVQVLDLSHNQLKTLEGLEVMQLLSCLNVSYNKLCSFTALE
PLKLLRSLKVLDISYNEIGAHSIDTRRYLCSSPLNHRSGGDWKTEESEIHCVEVADNWEA
YAIFKDLNLIQLDLKGNAVSDEKIQSLLIKLLPSLKWLDGESCR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g076430.3.1

Transcript Infomation

Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha (AHRD V3.3 *** W9QC24_9ROSA)

Sequence

GTAATTCCATGTTATTTTTCAGTGACATGTTAGAAATTAAATATATAACGAAATAAAAAA
AAATCAAATATCAAACTTTTGTAAAATTTGAATTTTTTTAAATAGTCATATTCTTCAATC
TTCATATATGTTTACGATTTGAGCACTAATTCATGTCAAACAAATGAAACCCAACTAGAC
TCAATCACGAATTTGAATTAATTTCATAAAATAATAATAAACTTTTTTATGTGAATTTAA
ATTTAATCGAACTAAAAAATAATAATTTCAGATCCATTTGTATTAATAGTTCTAATAGAT
CGCAGGCTGCAAGTTTCCTTCGTTCAGTCTTCTGAGTCCTCTGTGTGTGTGTGAGAAAAA
AGGAAAAAATGCACGGAAGACCACGCAAAGCTCCAACTCTAGAAGAGCAAGAAGCTTTTA
GTGTCAAAGCTTCCAAATTACGGTCTCTACAATCACAATTTCTCCAATTTCATCACGCCA
AAATATATACAAAGGAAGCTTTAGATGTAAGTGCAAAGTTGTTAGAGTCGAACCCTGAGT
ATTATACTGCTTGGAATTATAGAAAACTTGCTGTCCAGCATAATTTGAATCTACCTGAGG
TGGAGAACAATGAGGAGACTGTTAAGTCAATTCTTGATGAAGAACTCAGATTGGTAGAGA
ATGCGTTGAGGAGGAATTTCAAGTCTTACGGAGCATGGCATCACCGTAAATGGGTGCTGA
GCAAAGGTCATTCTTCCACAGACAAGGAATTGTTGCTTCTGGGTAAGTTCCAGAAGGCAG
ACTCCCGCAATTTTCATGCATGGAATTATAGAAGGTTCGTCACAACATTGAAGAACATAC
CAAATGAGAAGGAGCTAGAATACACTACCGACATGATATATGATAATTTCAGCAACTATT
CTGCTTGGCACAACCGCAGTGTTCTTCTTTCTCATTTGCTGAAGGAAAAAGCAAAAGGAT
ATTCTCCCAAGGACAATGTATTTACAGAAGAGTACGAGTTTGTGCGTCATGCTCTTTTCA
CAGATCCAGATGATCAAAGTGGTTGGTTTTATCATCTGTGGCTTCTTGATCAGACAGTTA
AACTAGAGACATTGTTGGTTTCTTCATGGCCACCACATGGCTGTAATCTTTCTTTATCCA
CGGATGGATCGTTTGGAGATTGCTCTTTATCACCCTTTACGAGTCTTCAGACTAATACTA
GAACACTTCCACTCATTCTCTATTTCAGCGAAGCTGTTGAGAATATATGCTCATCTACAG
TAGTAATCGAATGTGAAAATATTGCGAGTAATGAGCTCGTCTGGAGATCACTCTCAGGAG
ATGGAGCTGGGTCTGCTCAAGCTTGGTTGACATATCTTAATTTCCCAGAGGAACATGCAC
ATTCTGAAAAGGCTTACCAAGTAAAGGTCAGCCTTGCTCATTCTCGAGGCATTTTCTCTT
CAACTGGTGTTCATCATGGAGATTCTTCTCATATTGAATTTTCAGTGTCTGTACCACCTC
ATCGTTCAGAACATGTTGATTTAAATAATGAAGGGAAAATCTCTTGGAGTGATGAAAGTT
TCTGCACTCATGACACACAGTTTCTTGAGTCAGCTCTGATTAACTTGTTCCATCTGGAAA
GAACCAAGATAGATGAAACAGTGGTGGACTATCAGTGGAATATTACGACCATCAATAATG
AGATATCACACTATAGGGAGTTGTTATCAACAATGAACTGTAAAATTGGGAAGCTGACAC
TTGCCAGACTGCTGATTGCCCATGACACCTTAATGTCATATACTGGCACTAGTCACAGAA
ATGTTAGCCACCATGCAGAAGTTCTTCAACTTTATGACGATTTAAAGAAAATGGACCCAG
CACATCTCCACTACTACCAGGATGAGTACAGTATAGTACTTCTGAAACAGACAATCTCCA
ATCAAGAATTGTTGTTGAAGCACTGCCGTAAATATAGGGATCCATCTTCTCCAAGAATCA
ATAATTTCTGTCTGCGGCTTAATAATCTCTCACTTTCACGTATTGGGTCTATGGAGCAAC
TTTTGTGGGTCCAAGTATTAGATCTCAGCCACAACCAACTTAAGACACTTGAAGGCTTGG
AGGTGATGCAACTTCTCTCCTGCTTGAATGTTAGCTACAATAAACTCTGCAGTTTTACTG
CATTGGAGCCTTTGAAACTGCTAAGGTCACTGAAAGTCTTAGATATCTCTTACAACGAGA
TTGGAGCGCATTCTATTGACACGAGGAGGTATTTGTGCTCTTCCCCTCTTAACCATAGAA
GTGGAGGTGACTGGAAAACTGAGGAATCTGAGATCCATTGCGTTGAGGTGGCTGATAATT
GGGAAGCCTATGCTATTTTTAAAGACTTGAACTTGATACAATTAGATCTTAAAGGAAATG
CAGTTTCCGATGAAAAGATACAATCACTTCTAATTAAGCTATTACCATCACTAAAGTGGC
TTGATGGTGAAAGTTGCCGATAATTAAAAGTTACATCTCCGTCACTGTTACTGAATTTCT
CTACAGAACAGACAAGGGTAATCTTTTGTTACTATTATGAATTTTAGATATCTGATGCAC
GGAACTGTTTTTGTACCATGTAGTTGTTGCAAGACTTGCTTGTAATTGTTTGGCTTTTTC
AGATGATCTCTATTTATCAGCACCTAAACAGAGATTTTGTTTTTCTGAGAGTTGCTACCA
AATTTATCTTAAGTGTTAAAGCATTTCTTCCGTTATATTGTTCAACCATCATGTCATTCA
AATATATATGAATTATCATACAGGGAAAAAAACATTACAT