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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g076330.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199VX93_ANACO)

Sequence

ATGTCAGCCAATTCTCTAAGGAAATTACTCAGCAAGTTTGAGTCCCTCTTCACCATACCA
TTTGACTTGTCTACTTCTGCCATTGCTGACCACCCATTCCTCCATTTTACCCATCTTTTA
AGCTCATGTCATTCCCTCCCAGCCCTCAAACAGTTGCACACTCTGGTCTTGACAACTGGT
TACCACAAAAACCTCCTAATATGCACAAAGATTGTATCTTTAGCTTGTTTTTTATCGCCC
ACAATGGACTATGCACGAAAACTGTTCGACCAAATGCCTCAAAGAGATGTCTTTGCTTGG
AACACCTTGATTCGGGGATATTCCAATCTGGGTCCTTGTCAAGAATCCATCTTTCTTTAT
AAAGAGTTGCATTTACAGGGAGTTTTGCCTGATAACTATACATTCCCTTTTGTACTTCGT
TCTTGCTCTGTGTTGTCAGCTTTGAAGGAAGGTAGGGAAATACATTGTAACATAATTAAA
CATGGGTTTGAATCTGATGTGTTTGTGCAGAGTTCTTTGATTAGTCTGTATGCGCAGAGC
GGGGAGACGTTGGATTCGGAGTTGGTGTTTGATCAAATGAGAGTGAGGAATATAGTTTCT
TGGACTGCGATGATTGCAGGGTATGTGCAAAATGGAATTCATGAGAAGGGATTAGGAGTT
TTTCTCAAAATGGTTGATTCGGGTACTCTACCGAATGCTATTACTTTGGTGAGTGTGCTT
CCTGCTTGTGCACGGTTGGATTGTTTGGATTTGGGAATGTTGATTCATGGATATAGTATT
AAGTTAGGGGTGGAAACAGATGTTTCACTAGTTAATGCTTTGGTTGCATTCTATGGGAAG
TGTGGACTAGTTGATGTCGCTTGGTCTTTGTTTGATCAAATGAAGGAGCATAGTGTGGTT
TCATGGAATGCAATAATTGCTGCTTATGAGCAAAATGATGTTTCCTCCACAATAAAGCTA
TTTCATAGAATGCTAGATCAAGGGGTAGAGTTCGATTATATTACAGTAGTTACTGTTATT
TCAGCTTGTGCCAGGTTGGGGGCTCTAGGTACTGGAAAATGGATTCATGAGCTTGTCAAA
AGCAGAGGTTTAGAATGGAATGTTCCAATCACAAATGCACTAATCGATATGTATGCAAAA
TGTGGGAGTATAGAATCGGCAAGAGATGTTTTTGACAGGTTACCTATTAGAAGTGTGGTT
TCCTGGTCATCAATTATAGGGGCTTGTGCTTCACATGGTCATGGGAGAGATGCTCTTGAG
TTGTTTTCAAGGATGAAAGAAGAAGGAGTCCCACCTAATAGCTTCACCTTCACTGCTGTA
TTGACAGCTTGTCGACATTCAGGTCTTGTCGAGGAAGGGAGGAAGCACTTTGAGAGCATG
AGAATGGAATACTCGATAGTGCCAGGGGTGGAGCAATGTGCTTGTATGGTGGATCTTCTA
GGACGATCAGGACAACTTCTTGAGGCTTATGAATTTATAGAGAACATGCCTATTGAGCCT
GATGCGGATGTTTGGGGAGCTTTGCTTGGTGCTTGCAGAATTCACGGCAATCTTGAGATG
GCAGAATATGTAGCAGATCGACTATTTGATTTCAATCCCCAGGCAGTACCTTTCTACATA
CTCATGAAAAATATCTATGCTGAAGCCGGAAGGTGGGACGATGTAGCTAGGTTGAAATTT
TTGTTGGAAGAATTGGAAGTGGAAAAGATTCCTGGTAAAAGTTCAGTTGAGATAAATCGA
CGGATTCACACATTTTTGTCTGGGTCAAGGATTTCAAACTTCTCAAGAGTTCCACCCCGC
GAATATGTTCAACTGAAATGCATAGAGATAGAATTTGTTGCTGTTTCGACGAAGAAACAG
GATGCTCAATCTCAGCTTGAGACAAAAACAGAAGAGTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g076330.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199VX93_ANACO)

Sequence

MSANSLRKLLSKFESLFTIPFDLSTSAIADHPFLHFTHLLSSCHSLPALKQLHTLVLTTG
YHKNLLICTKIVSLACFLSPTMDYARKLFDQMPQRDVFAWNTLIRGYSNLGPCQESIFLY
KELHLQGVLPDNYTFPFVLRSCSVLSALKEGREIHCNIIKHGFESDVFVQSSLISLYAQS
GETLDSELVFDQMRVRNIVSWTAMIAGYVQNGIHEKGLGVFLKMVDSGTLPNAITLVSVL
PACARLDCLDLGMLIHGYSIKLGVETDVSLVNALVAFYGKCGLVDVAWSLFDQMKEHSVV
SWNAIIAAYEQNDVSSTIKLFHRMLDQGVEFDYITVVTVISACARLGALGTGKWIHELVK
SRGLEWNVPITNALIDMYAKCGSIESARDVFDRLPIRSVVSWSSIIGACASHGHGRDALE
LFSRMKEEGVPPNSFTFTAVLTACRHSGLVEEGRKHFESMRMEYSIVPGVEQCACMVDLL
GRSGQLLEAYEFIENMPIEPDADVWGALLGACRIHGNLEMAEYVADRLFDFNPQAVPFYI
LMKNIYAEAGRWDDVARLKFLLEELEVEKIPGKSSVEINRRIHTFLSGSRISNFSRVPPR
EYVQLKCIEIEFVAVSTKKQDAQSQLETKTEEW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g076330.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199VX93_ANACO)

Sequence

ATGTCAGCCAATTCTCTAAGGAAATTACTCAGCAAGTTTGAGTCCCTCTTCACCATACCA
TTTGACTTGTCTACTTCTGCCATTGCTGACCACCCATTCCTCCATTTTACCCATCTTTTA
AGCTCATGTCATTCCCTCCCAGCCCTCAAACAGTTGCACACTCTGGTCTTGACAACTGGT
TACCACAAAAACCTCCTAATATGCACAAAGATTGTATCTTTAGCTTGTTTTTTATCGCCC
ACAATGGACTATGCACGAAAACTGTTCGACCAAATGCCTCAAAGAGATGTCTTTGCTTGG
AACACCTTGATTCGGGGATATTCCAATCTGGGTCCTTGTCAAGAATCCATCTTTCTTTAT
AAAGAGTTGCATTTACAGGGAGTTTTGCCTGATAACTATACATTCCCTTTTGTACTTCGT
TCTTGCTCTGTGTTGTCAGCTTTGAAGGAAGGTAGGGAAATACATTGTAACATAATTAAA
CATGGGTTTGAATCTGATGTGTTTGTGCAGAGTTCTTTGATTAGTCTGTATGCGCAGAGC
GGGGAGACGTTGGATTCGGAGTTGGTGTTTGATCAAATGAGAGTGAGGAATATAGTTTCT
TGGACTGCGATGATTGCAGGGTATGTGCAAAATGGAATTCATGAGAAGGGATTAGGAGTT
TTTCTCAAAATGGTTGATTCGGGTACTCTACCGAATGCTATTACTTTGGTGAGTGTGCTT
CCTGCTTGTGCACGGTTGGATTGTTTGGATTTGGGAATGTTGATTCATGGATATAGTATT
AAGTTAGGGGTGGAAACAGATGTTTCACTAGTTAATGCTTTGGTTGCATTCTATGGGAAG
TGTGGACTAGTTGATGTCGCTTGGTCTTTGTTTGATCAAATGAAGGAGCATAGTGTGGTT
TCATGGAATGCAATAATTGCTGCTTATGAGCAAAATGATGTTTCCTCCACAATAAAGCTA
TTTCATAGAATGCTAGATCAAGGGGTAGAGTTCGATTATATTACAGTAGTTACTGTTATT
TCAGCTTGTGCCAGGTTGGGGGCTCTAGGTACTGGAAAATGGATTCATGAGCTTGTCAAA
AGCAGAGGTTTAGAATGGAATGTTCCAATCACAAATGCACTAATCGATATGTATGCAAAA
TGTGGGAGTATAGAATCGGCAAGAGATGTTTTTGACAGGTTACCTATTAGAAGTGTGGTT
TCCTGGTCATCAATTATAGGGGCTTGTGCTTCACATGGTCATGGGAGAGATGCTCTTGAG
TTGTTTTCAAGGATGAAAGAAGAAGGAGTCCCACCTAATAGCTTCACCTTCACTGCTGTA
TTGACAGCTTGTCGACATTCAGGTCTTGTCGAGGAAGGGAGGAAGCACTTTGAGAGCATG
AGAATGGAATACTCGATAGTGCCAGGGGTGGAGCAATGTGCTTGTATGGTGGATCTTCTA
GGACGATCAGGACAACTTCTTGAGGCTTATGAATTTATAGAGAACATGCCTATTGAGCCT
GATGCGGATGTTTGGGGAGCTTTGCTTGGTGCTTGCAGAATTCACGGCAATCTTGAGATG
GCAGAATATGTAGCAGATCGACTATTTGATTTCAATCCCCAGGCAGTACCTTTCTACATA
CTCATGAAAAATATCTATGCTGAAGCCGGAAGGTGGGACGATGTAGCTAGGTTGAAATTT
TTGTTGGAAGAATTGGAAGTGGAAAAGATTCCTGGTAAAAGTTCAGTTGAGATAAATCGA
CGGATTCACACATTTTTGTCTGGGTCAAGGATTTCAAACTTCTCAAGAGTTCCACCCCGC
GAATATGTTCAACTGAAATGCATAGAGATAGAATTTGTTGCTGTTTCGACGAAGAAACAG
GATGCTCAATCTCAGCTTGAGACAAAAACAGAAGAGTGGTGATGCAGCAAAACGTCTTGA
AGATGCAATCGACAGAATTAAGACTCAAAAGATACGAATGCACTTCTGAATGTGAAAGAA
CATCTCTTTTCTTTTCTCGGAAACTGGTAAGGTCGTATTCCTCAGAACAGGGCGGGATTG
ATTGTTCTACCTTAAAAACATGGTTTACCTTCCAGGTATTAGTGCTGGAGACCATCAAAA
AACAAGAGTTTTAACAGGAAAGAAAATACTAACAGAGATCCTAACAAATCTACAAGTTCT
GTCTCCTCTAAAAAGGGTGACTATTGGTCTCTTCATCATTCCCACATAGTTGACATTAGG
AAACAATGTGCGGAC