Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g074980.3.1

CDS Infomation

TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RJT7_RICCO)

Sequence

ATGAGTGGTAGTGACAATCCTTCAGAGATGTCTGAAGATGAGGAGCGTCCTTGTCCTTCA
GATCTCACCGGTGGTGTTACTGCAAAAGCAAGGAACTGTTGCTTTAACGCCGCCGTTACC
GGTGGTGGAGGGGGGATTTTTAACTTTTCGCCACACCCAGATCAAGTTCTTGAAAATGTG
CTGGAAAATGTTCTTTGCTTCTTAACTGATCGCCGTGACCGTAACGCTGCATCCCTTGTA
AGCAAATCTTGGTATCGGGCTGAGGCTTTAACCAGATCCGAAGTGTTTATTGGCAACTGT
TATGCTGTTTCGCCGACCCGGGTTACGACCCGTTTCAAGAGGGTGACCTCTGTGGCCATT
AAAGGGAAACCTAGGTTTGCTGATTTCAGTTTGCTTCCTCCAGATTGGGGTGCTCACTTT
ACTCCTTGGGCTTCGGTTTTGGGTGATTCTTATCGTGGCCTTGAGAAATTGTATCTCAAA
CGTATGTCCATATCTGATGATGATCTAGGTTTATTGGCGCGTTGTTTCCCCAATTTCAAA
GAGCTTGTTCTTGTATGCTGTGAAGGTTTTGGGACTAGTGGACTTGCTATTGTAGCCCGT
GATTGCAGGCAAATTAGAGTGCTTGATCTGATTGAGTCTGAGGTATCTGACGATGAAGTG
GACTGGATTTCCTACTTCCCTGAGAACAAAACGTGTTTGGAGTCTTTGACCTTTGATTGT
GTTGAATGCCCTATAGACTTTGAGGCATTGGAGAAGCTAGTAATCAGGTCACCTAGTTTG
AAGAGACTAAGGTTGAATCGGTTTGTTTCTATTACTCAACTGTATCGGTTGATGATTCGA
GCTCCACAGCTTACCAATCTGGGAACAGGCTCTTTTGGCGCCTCAACGGTCACTGATGAA
CCAGATCCTGATTATGCTTCAGCATTTGCTGCCTGCAAATCCATGGTCTGTCTCTCTGGT
TTCAGGGAAATTGCTCCTGAATATCTGCCTGCAATCTATCCAGTTTGTGGCAATCTGACC
TCTCTTAATTTAAGCTATGGTGCCAACATTAATACTGAACAATTCAAGTCTGTCATCAGC
CGCTGCCATAAGCTCCAAGTATTGTGGGTATTTGATTCTGTATGTGACGAAGGCCTTGAG
GCAGTTGCTGCAACATGTAAGGATCTGCGGGAGATTCGAGTTTTCCCTATCGAAGCTCGG
GAAGATGCAGATGCCCCAGTTTCTGAAGTAGGCCTCCTTGCAATTTCTGAGGGTTGCAGG
AAACTCAAGTCCATCTTATATTTCTGCCAAAAAATGACAAATGCAGCTGTTATAGCTATG
TCAAAGAACTGCCCGGACCTTGTGGTATTCCGGCTATGCATTATGGGTCGGCACTTGCCT
GACCATGTTACAAATGAACCGATGGATGAAGGCTTTGGGGCTATTGTCAAGAACTGTAAG
AAGCTTACTAGACTTGCTGTATCTGGTTTACTGACTGATAGGGCTTTCAGTTACATTGGA
CAATATGGAAAACTAGTCCGAACCTTATCAGTTGCTTTTGCCGGAAACAGTGACTTGGCT
CTGAAGTATGTGCTCGAGGGCTGCCCTAAGTTGCAGAAGTTAGAGATCAGGGATTGCCCG
TTTGGAGATTTGTCTTTGCGTTCTGGTTTACACCACTATTACAACATGAGGTTCCTTTGG
CTATCATCTTGTAGAGTAACTCTACAAGGTTGTCAGGAGATTGCTCGCCAATTGCCCCGT
CTAGTTGTGGAAGTCATTAGTGGTGATGATGAGGAAGGGAGTGAGACTAATGAGCATGTC
AATACCTTGTACATGTACCGATCTCTTGATGGACCGAGGGCTGATGTACCCTCATTTGTC
CAAATACTGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g074980.3.1

PEP Infomation

TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RJT7_RICCO)

Sequence

MSGSDNPSEMSEDEERPCPSDLTGGVTAKARNCCFNAAVTGGGGGIFNFSPHPDQVLENV
LENVLCFLTDRRDRNAASLVSKSWYRAEALTRSEVFIGNCYAVSPTRVTTRFKRVTSVAI
KGKPRFADFSLLPPDWGAHFTPWASVLGDSYRGLEKLYLKRMSISDDDLGLLARCFPNFK
ELVLVCCEGFGTSGLAIVARDCRQIRVLDLIESEVSDDEVDWISYFPENKTCLESLTFDC
VECPIDFEALEKLVIRSPSLKRLRLNRFVSITQLYRLMIRAPQLTNLGTGSFGASTVTDE
PDPDYASAFAACKSMVCLSGFREIAPEYLPAIYPVCGNLTSLNLSYGANINTEQFKSVIS
RCHKLQVLWVFDSVCDEGLEAVAATCKDLREIRVFPIEAREDADAPVSEVGLLAISEGCR
KLKSILYFCQKMTNAAVIAMSKNCPDLVVFRLCIMGRHLPDHVTNEPMDEGFGAIVKNCK
KLTRLAVSGLLTDRAFSYIGQYGKLVRTLSVAFAGNSDLALKYVLEGCPKLQKLEIRDCP
FGDLSLRSGLHHYYNMRFLWLSSCRVTLQGCQEIARQLPRLVVEVISGDDEEGSETNEHV
NTLYMYRSLDGPRADVPSFVQIL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g074980.3.1

Transcript Infomation

TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 protein, putative (AHRD V3.3 *** B9RJT7_RICCO)

Sequence

ATATAACAAAACAATAATGGCCCAAAAGGTAAATAGCCAAAAGACAAGGGATTCCTCTCA
CCAAACAACCTTTGGCATTAACCCCTAACATGTATACAACATATGATTAAGACGTATGCT
AGAATTATTTTCTTTTTACATTTTTTTCAAAAAAATAATTAAAGACAACATGAGATATTC
AAAATACAATGCCTAATATTAAAGATTTTCAAATTCTCATAAAAAATAAAAAATCAAAAC
ACATACTAATTTATTTTAAAAGGAAAAAAAAATACACTAAAATCAAATCTAAACGACAAT
AACCTTTTACAAAAAAGTTCAGAATATTCTTCACATATTATTATTTTTTTTAAAAAAAAT
AAGATGCAATTTTCCCTTCCAAAAATAAAAATGAATTTTGTAATAAACAATTACAAAGAC
CAAAATCCAAAAGAAATGGCAAAAGAAAAAGACAAAAGCAAGGCTTAAAGAAAAGCCCCC
CTCAAATAATGAAGAAGCAGATGTGTTGAGAGCCATTAGATTTTGCAGGCTCACCATTTT
CATCACTAACAAAGAAGCCATTGGAGAATCCCCATGCTACCTTCACCCCACCCCCACCCC
CACCCCATATTACTTCACTGTAATTTCAGTTTTCATTTCATCTTCACCCAACCACCTCTC
TGTTTTTAAACCCCCCAAATAACCAAGCTTAAAATCTTGATTAGTGATAAAGAACTGTTT
TTTTTTTTCATCTTCTTCAACTCTTCCTGGATCTGAAAAAAAGATATTTTATTACTTCAA
GAGGGGGTTTATTTAATATTTTTGTTTATAAATAAATTATTCAATTCAGATTTCAGAGAA
ACACTTCCCATTAATCTAGACCCTCTTTTACCCCCACCCCACCCACCCTACCCACCCCCC
ACATGAGTGGTAGTGACAATCCTTCAGAGATGTCTGAAGATGAGGAGCGTCCTTGTCCTT
CAGATCTCACCGGTGGTGTTACTGCAAAAGCAAGGAACTGTTGCTTTAACGCCGCCGTTA
CCGGTGGTGGAGGGGGGATTTTTAACTTTTCGCCACACCCAGATCAAGTTCTTGAAAATG
TGCTGGAAAATGTTCTTTGCTTCTTAACTGATCGCCGTGACCGTAACGCTGCATCCCTTG
TAAGCAAATCTTGGTATCGGGCTGAGGCTTTAACCAGATCCGAAGTGTTTATTGGCAACT
GTTATGCTGTTTCGCCGACCCGGGTTACGACCCGTTTCAAGAGGGTGACCTCTGTGGCCA
TTAAAGGGAAACCTAGGTTTGCTGATTTCAGTTTGCTTCCTCCAGATTGGGGTGCTCACT
TTACTCCTTGGGCTTCGGTTTTGGGTGATTCTTATCGTGGCCTTGAGAAATTGTATCTCA
AACGTATGTCCATATCTGATGATGATCTAGGTTTATTGGCGCGTTGTTTCCCCAATTTCA
AAGAGCTTGTTCTTGTATGCTGTGAAGGTTTTGGGACTAGTGGACTTGCTATTGTAGCCC
GTGATTGCAGGCAAATTAGAGTGCTTGATCTGATTGAGTCTGAGGTATCTGACGATGAAG
TGGACTGGATTTCCTACTTCCCTGAGAACAAAACGTGTTTGGAGTCTTTGACCTTTGATT
GTGTTGAATGCCCTATAGACTTTGAGGCATTGGAGAAGCTAGTAATCAGGTCACCTAGTT
TGAAGAGACTAAGGTTGAATCGGTTTGTTTCTATTACTCAACTGTATCGGTTGATGATTC
GAGCTCCACAGCTTACCAATCTGGGAACAGGCTCTTTTGGCGCCTCAACGGTCACTGATG
AACCAGATCCTGATTATGCTTCAGCATTTGCTGCCTGCAAATCCATGGTCTGTCTCTCTG
GTTTCAGGGAAATTGCTCCTGAATATCTGCCTGCAATCTATCCAGTTTGTGGCAATCTGA
CCTCTCTTAATTTAAGCTATGGTGCCAACATTAATACTGAACAATTCAAGTCTGTCATCA
GCCGCTGCCATAAGCTCCAAGTATTGTGGGTATTTGATTCTGTATGTGACGAAGGCCTTG
AGGCAGTTGCTGCAACATGTAAGGATCTGCGGGAGATTCGAGTTTTCCCTATCGAAGCTC
GGGAAGATGCAGATGCCCCAGTTTCTGAAGTAGGCCTCCTTGCAATTTCTGAGGGTTGCA
GGAAACTCAAGTCCATCTTATATTTCTGCCAAAAAATGACAAATGCAGCTGTTATAGCTA
TGTCAAAGAACTGCCCGGACCTTGTGGTATTCCGGCTATGCATTATGGGTCGGCACTTGC
CTGACCATGTTACAAATGAACCGATGGATGAAGGCTTTGGGGCTATTGTCAAGAACTGTA
AGAAGCTTACTAGACTTGCTGTATCTGGTTTACTGACTGATAGGGCTTTCAGTTACATTG
GACAATATGGAAAACTAGTCCGAACCTTATCAGTTGCTTTTGCCGGAAACAGTGACTTGG
CTCTGAAGTATGTGCTCGAGGGCTGCCCTAAGTTGCAGAAGTTAGAGATCAGGGATTGCC
CGTTTGGAGATTTGTCTTTGCGTTCTGGTTTACACCACTATTACAACATGAGGTTCCTTT
GGCTATCATCTTGTAGAGTAACTCTACAAGGTTGTCAGGAGATTGCTCGCCAATTGCCCC
GTCTAGTTGTGGAAGTCATTAGTGGTGATGATGAGGAAGGGAGTGAGACTAATGAGCATG
TCAATACCTTGTACATGTACCGATCTCTTGATGGACCGAGGGCTGATGTACCCTCATTTG
TCCAAATACTGTGACCGACCTTTATAGAAGATAGGAACTTTCTGCAGTCAATTGATTGGT
ACCTTTGAGAAATGATTTAACTATTTTCTTGGGAAGAGATGCTCTCGGGAAATCTGTTGC
AAATTTCCTTGTAGAGAAAACGAATGGTGATCCTCTTGCAAAAGCAGTGAGCCAATGTGT
AATGTATTCAATGCTGGTCTCCATGGATGTCATTGTATATGGTTCCGTACAGAGATTGTT
TTTTTCCAGCAAGGAAAATCTAGAAGACAAAACGTTGTTGTATCAGTAATCTTTTCTATT
CTTCATATTCATGGAGCCTTCAATTAGCAAGTGGAGTCAATGCTAGTAAGGGTAGATGTT
CCAAACTCAAAAGGCTTTTGGATCAAATTGCAGCTGAATGAGATGTTTTTGCAGAATCAA
CACGTGCATGCTGGGTCAAGTAGTATCTTTTCATACCTTGTTATTTTTTTTTTGTTTCAT
TGTTAGTTTAGAGTTGGAAGTTCTTTTTTATTTTTAGTTGGTGGATAGCCTAATGGTCAG
TCAGAAGAATCTCCTCCATCTCGCTTTCTAGAAAAATATTGGTTCTTTCCAGGATGTGTT
GTTTCTTAGCACCTGACTGTTGAATTTATTATTGTTATTTTTAGAAGAAATGTGAGATGG
GTAATAAATGCCAAATATGCATGGACCACTTTATGGGGAATGATCAGCTTGATAGTGAAG
GAAGACCCATAAATGTTGTGTGGAACAAGTACAAAAATGCAGGACCCCTCCTCTCTCTTA
TCCTCCATTACCTTTCCAGCTGATGATGAATGGCCCTTATTTCTCTTTGTATCTCGAGGA
GCCTGTTCTATACATGGATGGATAGTACAGCACACCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGCC
TGATGCAACTTTATAATAATTCATTTTGGATAACAGTCTTGAGGAGCCTGCTGCTGCAGC
ATTCTTCATCTCTATTATTGACGACAACTCAAAGTGGGACCAATCACTAACGGATTATTA
TTTGGCACAACCCCTGTTATATTGTTTCAAGAAAAGGCTGTTTATTCTTCGAAAATACAC
AGATAAT