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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g074160.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GTQ2_POPTR)

Sequence

ATGCAAGGCAACATCCTTATTTATTCAACCCCTAACAATAAAGTTGGTGTAACTATCACT
TGTAAAGAAAATTTCCTTCAAGCCTTCACTAGAAGAATAAACATTGTTGAAGTGATTTCA
CCTGAAGATTTGTTTTTGCTAGATTTCTGTATGGAGCTAGACTTGCAATCTTGTGCTCGA
CTGCTCAATACTGTTAACAGCAACCAATCTCTTCCTAATGGGAAGCAACTCCACCTCGTT
TTCCTCAAAAGGGGTATCCTTAACTCTGCTCTAACAATAGCCAATCGCCTTCTCCAAATG
TATACCAGGTGTGGACAAATGGCTGATGCACAGTTACTGTTCGATGAAATGTCTCAGAGA
AACTGCTTCACTTGGAATACCATGATTGAAGGGTATATGAAATGGGGGAAGATGAACAAC
TCTTTGGACTTGTTTCGTTTAATGCCTTCCAAGAATGAATTTTCTTGGAATGTGGTCATT
CTTGGTCTTGTTAAAGCAGAGGAGTTGGGTGTTGCTAGAAGACTATTGAGTGAAATGCCA
CGGAAGAATGAAGTAGTTTGGAATGGACTTATTCATGGGTATGCGAAAATGGGATTCCCT
GGGGTGGCTTTATGCTTGTTTAAGGAGTTTATAGACTGGGATTTTCGAGAGATGGGCGGT
GCATCACATATAGATTCATTTGTTTTGGCAACTGCATTAGGAGCTTGTGCTGACACAAGA
AGTGCTGATTTGGGGAAGCAAATTCATGCTCGTATTATAGTCAATGAAGTTGAAGTTGAT
TCTGTGTTGGCAAGTTCTTTAGTTAACATGTATGGAAAGGGTGGTGATTTGGATAATGCG
AACTATATTTTGAATAGAATGCAGAATCCTGATAACTTTTCCTTGTCAGCGCTAATTTCA
GCATATTCAAAACGTGGTCGAATGGATGATGCCAGAAAGATATTCAACCTGATAACTGAT
CCTAGTATTGTACTATGGAACTCCATGATTTCTGGGTTTGTGTCATGCGATGAAGTGTTA
GAAGCATTATTGCTTTTTGGAGAGATGCACAGAGAAGGAGTTATAGGAGATTCCTCTACA
TTAGCTAGTGTATTGAACGCCTGCGCTAGTGCATATGCCCTTAAAAATTGTTTGCAAGTG
CATGTTTATGGTTTTAAGCTTGGACTGTTGGATGACCTTGTCGTTGCTAGTGCGCTCATT
GACACATATGCCAAATGTGGATGTCCTGATGAAGCTTCCAATGTTTTTAATGAACTCAAA
ACACAGGATACCATCTTGCTAAATTCTATGATTACCATATATTTTAACTGCAACAGAATT
GAAGATGCGAGACAATTATTTGAGTCAATGCCCTACAAGAGCTTAATATCTTGGAACTCT
ATGATAATTGGTCTTAATCAAAATGGTTGTCCAGTTGAAGCACTTGATCTTTTCTACAGA
ATGAATAGGATGGATTTTAGGATGGACAAATTTAGCTTTTCAAGTGTGATCAGTGCCTGT
GCAAGCATTGCTTCAGTTGAACTTGGTGAACAGATTTTCGCAAGAGTTGTTATCATCGGC
CTTGATGGTGATCAAATAATTACTACCTCCTTAATTGATTTCTACTGCAAGTGTGGTTTT
GTTAGTGATGCCAGGAAGCTCTTTGACCAAATGATGAAATCCGACGAGGTTTCGTGGAAT
TCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGTTACGGAAATGAAGCTTTGAATCTATTCCAC
GAAATGAGAAGTGTGGGTGTTTCGCCAACAAATATCACATTTATTGGTGTCTTATCTGCC
TGTGATCATTGTGGTTTACTAGAAGAGGGAAAAAGGTGGTTTTATTCAATGAATTACGAT
TACCACATTGATCCAGGAATTGAACATTACTCCTGTATGGTAGATCTTTATGCAAGAGCT
GGATGTCTCGAAGAAGCTGTGAACCTCATCAAAAAGATGCCATTTGAGGCAGATTCAAGC
ATGTGGTTATCCATTTTGAGAGGATGTGTAGCTCATGGTAACAAGATACTAGGACAGCTC
GTGGCTCAACGCATTATAGAGCTTGATCCTGAGAATTCAGGTGCTTTCGTGCAGTTATCA
AACATATTTGCTACTTCTGAGGACTGGGAAAGATCTGCTTTAGTCAGGAGGCTGATGATA
GAAAAGAAAATCCATAAGAGTTCTGGTCGAAGCTGGATATTGCAGCAGTTGGAGAAGAGG
TTAATTTTATTTTTAGCCACCCACTTCAATAGTTCTTGTAACAATGGTTTTCTTCTAATC
TTGTTGCATTATTTTGTGAGCACAGCCCAGTTGAAGTGCTTTGTGAGAATTAGCAGTTTG
TTTCTCAGATGCCTTGATTTAGGGCAGAAAAGATATCTTTGCTTATCTGATTATCAGGTT
CTTGGAATTGTGTGGATGCAGAAATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g074160.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GTQ2_POPTR)

Sequence

MQGNILIYSTPNNKVGVTITCKENFLQAFTRRINIVEVISPEDLFLLDFCMELDLQSCAR
LLNTVNSNQSLPNGKQLHLVFLKRGILNSALTIANRLLQMYTRCGQMADAQLLFDEMSQR
NCFTWNTMIEGYMKWGKMNNSLDLFRLMPSKNEFSWNVVILGLVKAEELGVARRLLSEMP
RKNEVVWNGLIHGYAKMGFPGVALCLFKEFIDWDFREMGGASHIDSFVLATALGACADTR
SADLGKQIHARIIVNEVEVDSVLASSLVNMYGKGGDLDNANYILNRMQNPDNFSLSALIS
AYSKRGRMDDARKIFNLITDPSIVLWNSMISGFVSCDEVLEALLLFGEMHREGVIGDSST
LASVLNACASAYALKNCLQVHVYGFKLGLLDDLVVASALIDTYAKCGCPDEASNVFNELK
TQDTILLNSMITIYFNCNRIEDARQLFESMPYKSLISWNSMIIGLNQNGCPVEALDLFYR
MNRMDFRMDKFSFSSVISACASIASVELGEQIFARVVIIGLDGDQIITTSLIDFYCKCGF
VSDARKLFDQMMKSDEVSWNSMLMGYATNGYGNEALNLFHEMRSVGVSPTNITFIGVLSA
CDHCGLLEEGKRWFYSMNYDYHIDPGIEHYSCMVDLYARAGCLEEAVNLIKKMPFEADSS
MWLSILRGCVAHGNKILGQLVAQRIIELDPENSGAFVQLSNIFATSEDWERSALVRRLMI
EKKIHKSSGRSWILQQLEKRLILFLATHFNSSCNNGFLLILLHYFVSTAQLKCFVRISSL
FLRCLDLGQKRYLCLSDYQVLGIVWMQK*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g074160.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GTQ2_POPTR)

Sequence

ATGCAAGGCAACATCCTTATTTATTCAACCCCTAACAATAAAGTTGGTGTAACTATCACT
TGTAAAGAAAATTTCCTTCAAGCCTTCACTAGAAGAATAAACATTGTTGAAGTGATTTCA
CCTGAAGATTTGTTTTTGCTAGATTTCTGTATGGAGCTAGACTTGCAATCTTGTGCTCGA
CTGCTCAATACTGTTAACAGCAACCAATCTCTTCCTAATGGGAAGCAACTCCACCTCGTT
TTCCTCAAAAGGGGTATCCTTAACTCTGCTCTAACAATAGCCAATCGCCTTCTCCAAATG
TATACCAGGTGTGGACAAATGGCTGATGCACAGTTACTGTTCGATGAAATGTCTCAGAGA
AACTGCTTCACTTGGAATACCATGATTGAAGGGTATATGAAATGGGGGAAGATGAACAAC
TCTTTGGACTTGTTTCGTTTAATGCCTTCCAAGAATGAATTTTCTTGGAATGTGGTCATT
CTTGGTCTTGTTAAAGCAGAGGAGTTGGGTGTTGCTAGAAGACTATTGAGTGAAATGCCA
CGGAAGAATGAAGTAGTTTGGAATGGACTTATTCATGGGTATGCGAAAATGGGATTCCCT
GGGGTGGCTTTATGCTTGTTTAAGGAGTTTATAGACTGGGATTTTCGAGAGATGGGCGGT
GCATCACATATAGATTCATTTGTTTTGGCAACTGCATTAGGAGCTTGTGCTGACACAAGA
AGTGCTGATTTGGGGAAGCAAATTCATGCTCGTATTATAGTCAATGAAGTTGAAGTTGAT
TCTGTGTTGGCAAGTTCTTTAGTTAACATGTATGGAAAGGGTGGTGATTTGGATAATGCG
AACTATATTTTGAATAGAATGCAGAATCCTGATAACTTTTCCTTGTCAGCGCTAATTTCA
GCATATTCAAAACGTGGTCGAATGGATGATGCCAGAAAGATATTCAACCTGATAACTGAT
CCTAGTATTGTACTATGGAACTCCATGATTTCTGGGTTTGTGTCATGCGATGAAGTGTTA
GAAGCATTATTGCTTTTTGGAGAGATGCACAGAGAAGGAGTTATAGGAGATTCCTCTACA
TTAGCTAGTGTATTGAACGCCTGCGCTAGTGCATATGCCCTTAAAAATTGTTTGCAAGTG
CATGTTTATGGTTTTAAGCTTGGACTGTTGGATGACCTTGTCGTTGCTAGTGCGCTCATT
GACACATATGCCAAATGTGGATGTCCTGATGAAGCTTCCAATGTTTTTAATGAACTCAAA
ACACAGGATACCATCTTGCTAAATTCTATGATTACCATATATTTTAACTGCAACAGAATT
GAAGATGCGAGACAATTATTTGAGTCAATGCCCTACAAGAGCTTAATATCTTGGAACTCT
ATGATAATTGGTCTTAATCAAAATGGTTGTCCAGTTGAAGCACTTGATCTTTTCTACAGA
ATGAATAGGATGGATTTTAGGATGGACAAATTTAGCTTTTCAAGTGTGATCAGTGCCTGT
GCAAGCATTGCTTCAGTTGAACTTGGTGAACAGATTTTCGCAAGAGTTGTTATCATCGGC
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GTTAGTGATGCCAGGAAGCTCTTTGACCAAATGATGAAATCCGACGAGGTTTCGTGGAAT
TCTATGTTGATGGGTTATGCTACAAATGGTTACGGAAATGAAGCTTTGAATCTATTCCAC
GAAATGAGAAGTGTGGGTGTTTCGCCAACAAATATCACATTTATTGGTGTCTTATCTGCC
TGTGATCATTGTGGTTTACTAGAAGAGGGAAAAAGGTGGTTTTATTCAATGAATTACGAT
TACCACATTGATCCAGGAATTGAACATTACTCCTGTATGGTAGATCTTTATGCAAGAGCT
GGATGTCTCGAAGAAGCTGTGAACCTCATCAAAAAGATGCCATTTGAGGCAGATTCAAGC
ATGTGGTTATCCATTTTGAGAGGATGTGTAGCTCATGGTAACAAGATACTAGGACAGCTC
GTGGCTCAACGCATTATAGAGCTTGATCCTGAGAATTCAGGTGCTTTCGTGCAGTTATCA
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GAAAAGAAAATCCATAAGAGTTCTGGTCGAAGCTGGATATTGCAGCAGTTGGAGAAGAGG
TTAATTTTATTTTTAGCCACCCACTTCAATAGTTCTTGTAACAATGGTTTTCTTCTAATC
TTGTTGCATTATTTTGTGAGCACAGCCCAGTTGAAGTGCTTTGTGAGAATTAGCAGTTTG
TTTCTCAGATGCCTTGATTTAGGGCAGAAAAGATATCTTTGCTTATCTGATTATCAGGTT
CTTGGAATTGTGTGGATGCAGAAATGA