Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g072850.3.1

CDS Infomation

Beta-D-xylosidase (AHRD V3.3 *** H1AC33_SOLLC)

Sequence

ATGAAACTTCACATCTCAACTCTCATTACTACTATTCTCATATCTCTATCATTAGTTTCG
ATTGTTCAATCAACTCAGCCACCTTTCTCTTGCGATTCGTCGAATCCGCAAACCAAATCG
TTAAAATTTTGCCAAACAGGACTTCCAATTAGTGTACGTGTACTAGACCTTGTTTCTCGA
CTCACACTCGATGAGAAAATATCTCAACTAGTTAACTCAGCTCCTGCAATACCCAGACTC
GGTATTCCGGCGTATGAGTGGTGGTCGGAATCATTGCACGGCGTTGGTTCTGCCGGAAAA
GGTATTTTCTTCAATGGGAGTATTGCCGGAGCCACCAGTTTTCCCCAAGTTATTCTCACT
GCTGCTACTTTTGATGAAAATCTATGGTACCGCATTGGTCAGGTGATTGGAGTAGAGGCC
AGGGGAGTATACAATGCAGGTCAAGCAATCGGTATGACATTTTGGGCACCAAATATAAAT
ATATTTAGGGATCCAAGATGGGGAAGAGGTCAAGAGACACCAGGGGAGGACCCAATAATG
ACTGGCAAATATGCAATTAGGTATGTTAGAGGTGTACAAGGTGACAGTTTTAATGGTGGA
CAGCTTAAAAAAGGTCACCTTCAAGCTTCTGCTTGCTGCAAACATTTCACTGCTTATGAT
TTGGATCAATGGAAAAACTTGGATCGATTTAGCTTCAACGCCATTGTAACCCCTCAAGAT
ATGGCAGATACATTTCAGCCCCCTTTCCAAGATTGTATACAGAAAGCACAAGCCAGTGGA
ATTATGTGCTCTTACAACAGTGTTAATGGAATCCCAAGTTGTGCTAATTATAATCTTTTA
ACTAAAACAGCTCGTCAACAATGGGGTTTTCATGGGTACATTACGTCCGATTGTGACGCA
GTTCAAGTCATGCATGATAACCACAGGTATGGAAATACACCAGAAGATTCAACAGCATTT
GCACTTAAAGCTGGCATGGATATAGACTGTGGGGATTACTTGAAGAAATACACAAAATCA
GCAGTAATGAAGAAAAAAGTATCACAAGTTCATATAGACAGGGCTCTTCACAATCTTTTT
TCCATAAGAATGAGGTTAGGATTATTCAATGGGGATCCCAGAAAACAGCTCTATGGAAAC
ATTAGTCCTAGCCAAGTTTGTGCTCCACAACACCAACAACTAGCCCTTGAAGCTGCAAGA
AATGGCATTGTCTTGCTCAAGAATACCGGCAAGTTGCTGCCTCTTTCCAAAGCGAAAACC
AACTCCCTTGCTGTCATCGGTCATAATGCCAACAATGCTTATATTCTTCGTGGGAACTAT
GACGGTCCTCCCTGCAAATACATCGAAATTCTCAAGGCATTGGTTGGTTATGCAAAGTCA
GTTCAGTACCAACAGGGTTGCAATGCGGCTAACTGCACGTCTGCTAACATTGATCAAGCT
GTCAACATTGCAAGAAATGCAGATTATGTTGTTTTAATCATGGGGTTGGATCAAACTCAA
GAGAGGGAACAATTTGATCGCGATGACTTAGTGCTCCCGGGGCAGCAAGAAAATCTTATC
AATAGTGTTGCTAAAGCTGCAAAGAAGCCTGTTATATTGGTGATTCTCTCAGGAGGTCCA
GTTGATATTTCTTTCGCGAAATATAACCCTAAAATAGGAAGCATTTTGTGGGCTGGCTAT
CCTGGTGAAGCTGGAGGAATTGCTTTAGCTGAAATCATATTTGGTGAACATAATCCTGGG
GGTAAATTACCTGTTACTTGGTATCCTCAAGCCTTTGTCAAAATACCAATGACAGATATG
AGGATGAGACCTGATCCTAAAACAGGTTACCCTGGAAGAACATATCGATTCTACAAAGGT
CCCAAAGTTTACGAGTTTGGATATGGTCTTAGCTACACTACTTATTCCTATGGATTCCAC
TCTGCCACTCCAAACACAATCCAGTTAAATCAATTATTATCTGTAAAGACAGTTGAAAAT
TCAGACTCAATCCGTTACACGTTTGTGGATGAAATAGGAAGTGACAACTGTGAGAAGGCG
AAATTCTCAGCTCATGTTAGTGTTGAAAACTCAGGGGAAATGGATGGTAAGCATCCAGTA
CTACTTTTTGTGAAACAGGACAAAGCGCGAAATGGAAGTCCTATCAAACAGTTAGTTGGA
TTCCAAAGTGTAAGCTTGAAGGCAGGGGAAAATTCACAACTTGTGTTTGAGATCAGTCCT
TGTGAACATCTTAGCAGTGCTAATGAAGATGGATTAATGATGATAGAAGAAGGATCGCGT
TACCTTGTCGTTGGAGATGCAGAGCATCCTATCAACATCATGATATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g072850.3.1

PEP Infomation

Beta-D-xylosidase (AHRD V3.3 *** H1AC33_SOLLC)

Sequence

MKLHISTLITTILISLSLVSIVQSTQPPFSCDSSNPQTKSLKFCQTGLPISVRVLDLVSR
LTLDEKISQLVNSAPAIPRLGIPAYEWWSESLHGVGSAGKGIFFNGSIAGATSFPQVILT
AATFDENLWYRIGQVIGVEARGVYNAGQAIGMTFWAPNINIFRDPRWGRGQETPGEDPIM
TGKYAIRYVRGVQGDSFNGGQLKKGHLQASACCKHFTAYDLDQWKNLDRFSFNAIVTPQD
MADTFQPPFQDCIQKAQASGIMCSYNSVNGIPSCANYNLLTKTARQQWGFHGYITSDCDA
VQVMHDNHRYGNTPEDSTAFALKAGMDIDCGDYLKKYTKSAVMKKKVSQVHIDRALHNLF
SIRMRLGLFNGDPRKQLYGNISPSQVCAPQHQQLALEAARNGIVLLKNTGKLLPLSKAKT
NSLAVIGHNANNAYILRGNYDGPPCKYIEILKALVGYAKSVQYQQGCNAANCTSANIDQA
VNIARNADYVVLIMGLDQTQEREQFDRDDLVLPGQQENLINSVAKAAKKPVILVILSGGP
VDISFAKYNPKIGSILWAGYPGEAGGIALAEIIFGEHNPGGKLPVTWYPQAFVKIPMTDM
RMRPDPKTGYPGRTYRFYKGPKVYEFGYGLSYTTYSYGFHSATPNTIQLNQLLSVKTVEN
SDSIRYTFVDEIGSDNCEKAKFSAHVSVENSGEMDGKHPVLLFVKQDKARNGSPIKQLVG
FQSVSLKAGENSQLVFEISPCEHLSSANEDGLMMIEEGSRYLVVGDAEHPINIMI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g072850.3.1

Transcript Infomation

Beta-D-xylosidase (AHRD V3.3 *** H1AC33_SOLLC)

Sequence

CCACTCCTAACTCCAACTTCCATTTTCCCCCATTTTTCACTTCACAATGAAACTTCACAT
CTCAACTCTCATTACTACTATTCTCATATCTCTATCATTAGTTTCGATTGTTCAATCAAC
TCAGCCACCTTTCTCTTGCGATTCGTCGAATCCGCAAACCAAATCGTTAAAATTTTGCCA
AACAGGACTTCCAATTAGTGTACGTGTACTAGACCTTGTTTCTCGACTCACACTCGATGA
GAAAATATCTCAACTAGTTAACTCAGCTCCTGCAATACCCAGACTCGGTATTCCGGCGTA
TGAGTGGTGGTCGGAATCATTGCACGGCGTTGGTTCTGCCGGAAAAGGTATTTTCTTCAA
TGGGAGTATTGCCGGAGCCACCAGTTTTCCCCAAGTTATTCTCACTGCTGCTACTTTTGA
TGAAAATCTATGGTACCGCATTGGTCAGGTGATTGGAGTAGAGGCCAGGGGAGTATACAA
TGCAGGTCAAGCAATCGGTATGACATTTTGGGCACCAAATATAAATATATTTAGGGATCC
AAGATGGGGAAGAGGTCAAGAGACACCAGGGGAGGACCCAATAATGACTGGCAAATATGC
AATTAGGTATGTTAGAGGTGTACAAGGTGACAGTTTTAATGGTGGACAGCTTAAAAAAGG
TCACCTTCAAGCTTCTGCTTGCTGCAAACATTTCACTGCTTATGATTTGGATCAATGGAA
AAACTTGGATCGATTTAGCTTCAACGCCATTGTAACCCCTCAAGATATGGCAGATACATT
TCAGCCCCCTTTCCAAGATTGTATACAGAAAGCACAAGCCAGTGGAATTATGTGCTCTTA
CAACAGTGTTAATGGAATCCCAAGTTGTGCTAATTATAATCTTTTAACTAAAACAGCTCG
TCAACAATGGGGTTTTCATGGGTACATTACGTCCGATTGTGACGCAGTTCAAGTCATGCA
TGATAACCACAGGTATGGAAATACACCAGAAGATTCAACAGCATTTGCACTTAAAGCTGG
CATGGATATAGACTGTGGGGATTACTTGAAGAAATACACAAAATCAGCAGTAATGAAGAA
AAAAGTATCACAAGTTCATATAGACAGGGCTCTTCACAATCTTTTTTCCATAAGAATGAG
GTTAGGATTATTCAATGGGGATCCCAGAAAACAGCTCTATGGAAACATTAGTCCTAGCCA
AGTTTGTGCTCCACAACACCAACAACTAGCCCTTGAAGCTGCAAGAAATGGCATTGTCTT
GCTCAAGAATACCGGCAAGTTGCTGCCTCTTTCCAAAGCGAAAACCAACTCCCTTGCTGT
CATCGGTCATAATGCCAACAATGCTTATATTCTTCGTGGGAACTATGACGGTCCTCCCTG
CAAATACATCGAAATTCTCAAGGCATTGGTTGGTTATGCAAAGTCAGTTCAGTACCAACA
GGGTTGCAATGCGGCTAACTGCACGTCTGCTAACATTGATCAAGCTGTCAACATTGCAAG
AAATGCAGATTATGTTGTTTTAATCATGGGGTTGGATCAAACTCAAGAGAGGGAACAATT
TGATCGCGATGACTTAGTGCTCCCGGGGCAGCAAGAAAATCTTATCAATAGTGTTGCTAA
AGCTGCAAAGAAGCCTGTTATATTGGTGATTCTCTCAGGAGGTCCAGTTGATATTTCTTT
CGCGAAATATAACCCTAAAATAGGAAGCATTTTGTGGGCTGGCTATCCTGGTGAAGCTGG
AGGAATTGCTTTAGCTGAAATCATATTTGGTGAACATAATCCTGGGGGTAAATTACCTGT
TACTTGGTATCCTCAAGCCTTTGTCAAAATACCAATGACAGATATGAGGATGAGACCTGA
TCCTAAAACAGGTTACCCTGGAAGAACATATCGATTCTACAAAGGTCCCAAAGTTTACGA
GTTTGGATATGGTCTTAGCTACACTACTTATTCCTATGGATTCCACTCTGCCACTCCAAA
CACAATCCAGTTAAATCAATTATTATCTGTAAAGACAGTTGAAAATTCAGACTCAATCCG
TTACACGTTTGTGGATGAAATAGGAAGTGACAACTGTGAGAAGGCGAAATTCTCAGCTCA
TGTTAGTGTTGAAAACTCAGGGGAAATGGATGGTAAGCATCCAGTACTACTTTTTGTGAA
ACAGGACAAAGCGCGAAATGGAAGTCCTATCAAACAGTTAGTTGGATTCCAAAGTGTAAG
CTTGAAGGCAGGGGAAAATTCACAACTTGTGTTTGAGATCAGTCCTTGTGAACATCTTAG
CAGTGCTAATGAAGATGGATTAATGATGATAGAAGAAGGATCGCGTTACCTTGTCGTTGG
AGATGCAGAGCATCCTATCAACATCATGATATGAAACCAAAAAAAAAAATGGTTACAAAA
AGTTATTTTTACTATTTTGAATTTCACAAATCCTCTCTAAATACCTATAAGAGTGGCAAT
GTTGCAGCAGCAACAGCTAAAGTATAGATATCAAGATGAATTTGGGCTATTATCTCTTTC
TCTTGCTAGATATCTATTTTATTTTCTCTTCTTTTTTTTTCAAGAACTCGAAAAGTTTTA
TAAGAAATTCAAGTACTACTAGCATTAAGATGTTAAGGATGCTCACTAGTGTATCTCATT
ATGAATTATAGAACAAAGACGTTAACAT