Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g072690.3.1
CDS Infomation	Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DI57_THECC)
Sequence	ATGGCGATTTCTCTTACGGCAGTTGTACTTCTGATGACGGCGGTATTGATGCTTTCCGTT GAGCTCGCCGCCGGTTATACATTCTCGTCGAGGTTGATTCACGGGTTCTCAGATGAAGCG TTGTCGTTTTGGGCATCTAAAGGGAAGAGTATGACGTGGCCGAAGCGCGAGAGTGTGGAG CATATGAGGTTGCTACTTAGTAATGATTGGAAACGACAGAGACTGAAGCTTGGTTCGCAG AAGCAGCTTTTGTTTCCATCTGAAGGAAGTGAAACTCATTTCTATGGAAATGAGTTGAGT TGGCTGCATTATGTGTGGATTGACATAGGGACACCAAACACATCATTTCTTGTCGCCTTG GATGCTGGAAGTGATCTGCTCTGGCTCCCTTGCAATTGTGTACAATGTGCTCCATTGTCT TCAAGCTACTACTCAATGCTGGATAAAGATCTGAATGAGTATAGCCCAGCACGATCAAGC AGTAGCAAGTATCTATCTTGCAGCCATCAATTATGTGAACTGGGTCCTAACTGCCGGAGT CCAAAGGAACATTGCCCTTATACTGTTAATTACTATTCTGAAAATACATCAACTTCGGGG TTCCTTTTCGAGGACCAATTGCATTTGACTTCAGTTGGTGGACATGAACATCAAGGTTCT GTGCTAGCTCCTATTGTTATAGGCTGTGGTAGCAAACAAAGTGGCAATTATTTGAGTGGA GCTGCTCCAGATGGGGTGATGGGATTAGGGCCAGGAGAAATTTCTGTTCCAAGTTTGCTG GCGAAGTCTGGATTTGTTCCACGCTCATTCTCATTGTGTTTTGGAAAGAGCAATTCTGGC ACAATTTTCTTTGGTGATAAAGGGCCTGAAAATCAAAGACGAAGTTCATTTGTATCTTTG GATGAAAATTACAATACCTATGTTGTTGAAGTTCAACATTATTGTGTTGGGGGTACCTGT CCAAAGCAAAGTGGATTTCAAGCCTTAGTTGATAGTGGGTCTTCCTTCACTTTTCTCCCT TCTGAAATCTTTACAAAAGTAGTAACTGAGTTTGAAGAGCAAATGAACGTTACGAGGTTA GCTATAGAAGATTTTCCTTGCTGCTATAAGGCTAGTTCACAAGGTTTACCGAACATTCCT AGCATGAAACTTTTGTTAGCTGCTAATCAGAGCTTTGTAATTCAGAACCCCATGTTTACC ATCTCCAGTAGTCAGGGTGATAACTTTTATTGTGTGGGTCTCCTACCTATTGAAGGAATG ATTGGTATTATTGGACAGAACTTTATGGAGGGATATCGATTGGTGTTTGATTGGGAAAAC ATGAAGTTGGGTTGGTCTCGCTCCAAGTGTCAAGACATAGACGGGACAGCAAAGGTATCA CCAACACCACCTCCGAGTGGTTTGACATCAAATCCCCTGCCAACAACTGAGCAACAAAGG AACCCGGGTGGACATGCAGTTGCACCCGCTATTGCTGGTAAAGCTACCCCTAAACCATCT GCAGCATCACTCCTTGCAATTTCACGGCATTACACTATGAGTTCTCTTATATTCTTATTG GTTGTATGGTTGCCTTATCTGATATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g072690.3.1
PEP Infomation	Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DI57_THECC)
Sequence	MAISLTAVVLLMTAVLMLSVELAAGYTFSSRLIHGFSDEALSFWASKGKSMTWPKRESVE HMRLLLSNDWKRQRLKLGSQKQLLFPSEGSETHFYGNELSWLHYVWIDIGTPNTSFLVAL DAGSDLLWLPCNCVQCAPLSSSYYSMLDKDLNEYSPARSSSSKYLSCSHQLCELGPNCRS PKEHCPYTVNYYSENTSTSGFLFEDQLHLTSVGGHEHQGSVLAPIVIGCGSKQSGNYLSG AAPDGVMGLGPGEISVPSLLAKSGFVPRSFSLCFGKSNSGTIFFGDKGPENQRRSSFVSL DENYNTYVVEVQHYCVGGTCPKQSGFQALVDSGSSFTFLPSEIFTKVVTEFEEQMNVTRL AIEDFPCCYKASSQGLPNIPSMKLLLAANQSFVIQNPMFTISSSQGDNFYCVGLLPIEGM IGIIGQNFMEGYRLVFDWENMKLGWSRSKCQDIDGTAKVSPTPPPSGLTSNPLPTTEQQR NPGGHAVAPAIAGKATPKPSAASLLAISRHYTMSSLIFLLVVWLPYLI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g072690.3.1
Transcript Infomation	Eukaryotic aspartyl protease family protein (AHRD V3.3 *** A0A061DI57_THECC)
Sequence	GGAGTATATATTTTTTTTGAAGCGTAATAAAATATTTTTTTTTCAAGTGTAATAAAATTT AAAGAGTGGTATTTGTCTTTTTCTTTTTGTTTTGTTTTTCACCAAAGAGTGGTGCTTGTC AGAAAAGAAAAAAGTAAAATCTGGAATTGCGATATGACTTTTCTCGTCAATGAACAGTGA ACACTCCCCAGTTTTTGTAACACAACTTCAACAAAACTAAAAACCCCTCCGATTCTCTAT TTCTCTTCACACCTAACAAAAATCTCTACCTTCTAGGGCTTTGCTTCAATGGCGATTTCT CTTACGGCAGTTGTACTTCTGATGACGGCGGTATTGATGCTTTCCGTTGAGCTCGCCGCC GGTTATACATTCTCGTCGAGGTTGATTCACGGGTTCTCAGATGAAGCGTTGTCGTTTTGG GCATCTAAAGGGAAGAGTATGACGTGGCCGAAGCGCGAGAGTGTGGAGCATATGAGGTTG CTACTTAGTAATGATTGGAAACGACAGAGACTGAAGCTTGGTTCGCAGAAGCAGCTTTTG TTTCCATCTGAAGGAAGTGAAACTCATTTCTATGGAAATGAGTTGAGTTGGCTGCATTAT GTGTGGATTGACATAGGGACACCAAACACATCATTTCTTGTCGCCTTGGATGCTGGAAGT GATCTGCTCTGGCTCCCTTGCAATTGTGTACAATGTGCTCCATTGTCTTCAAGCTACTAC TCAATGCTGGATAAAGATCTGAATGAGTATAGCCCAGCACGATCAAGCAGTAGCAAGTAT CTATCTTGCAGCCATCAATTATGTGAACTGGGTCCTAACTGCCGGAGTCCAAAGGAACAT TGCCCTTATACTGTTAATTACTATTCTGAAAATACATCAACTTCGGGGTTCCTTTTCGAG GACCAATTGCATTTGACTTCAGTTGGTGGACATGAACATCAAGGTTCTGTGCTAGCTCCT ATTGTTATAGGCTGTGGTAGCAAACAAAGTGGCAATTATTTGAGTGGAGCTGCTCCAGAT GGGGTGATGGGATTAGGGCCAGGAGAAATTTCTGTTCCAAGTTTGCTGGCGAAGTCTGGA TTTGTTCCACGCTCATTCTCATTGTGTTTTGGAAAGAGCAATTCTGGCACAATTTTCTTT GGTGATAAAGGGCCTGAAAATCAAAGACGAAGTTCATTTGTATCTTTGGATGAAAATTAC AATACCTATGTTGTTGAAGTTCAACATTATTGTGTTGGGGGTACCTGTCCAAAGCAAAGT GGATTTCAAGCCTTAGTTGATAGTGGGTCTTCCTTCACTTTTCTCCCTTCTGAAATCTTT ACAAAAGTAGTAACTGAGTTTGAAGAGCAAATGAACGTTACGAGGTTAGCTATAGAAGAT TTTCCTTGCTGCTATAAGGCTAGTTCACAAGGTTTACCGAACATTCCTAGCATGAAACTT TTGTTAGCTGCTAATCAGAGCTTTGTAATTCAGAACCCCATGTTTACCATCTCCAGTAGT CAGGGTGATAACTTTTATTGTGTGGGTCTCCTACCTATTGAAGGAATGATTGGTATTATT GGACAGAACTTTATGGAGGGATATCGATTGGTGTTTGATTGGGAAAACATGAAGTTGGGT TGGTCTCGCTCCAAGTGTCAAGACATAGACGGGACAGCAAAGGTATCACCAACACCACCT CCGAGTGGTTTGACATCAAATCCCCTGCCAACAACTGAGCAACAAAGGAACCCGGGTGGA CATGCAGTTGCACCCGCTATTGCTGGTAAAGCTACCCCTAAACCATCTGCAGCATCACTC CTTGCAATTTCACGGCATTACACTATGAGTTCTCTTATATTCTTATTGGTTGTATGGTTG CCTTATCTGATATAGCATTTGTAATTATGTACGTATATGTAAATTCTCATGTCTACAGTC AGATCCTTCTCTCAGAAATCATGTAGTCTAGTCAATTAATTTCATTGGTTTTGTTTCTAT CCTCAAAAAAAAAAAAAAACTTAGCAATATTATCTTGTTTTTTTATTGGGCTAAAACAAT CTAAAAATAGAAAAAACAATTATCATTAAGTTTTTGAGAGATCCTGGATCAGGAGTCGAG TACTGGGTTAAGGTCGGATATCATATCTCGAGTCGAGGTCAAAAGTCGAGTTAAAACTGA AAGTTGGTTACAAAGTTGAGGTCGAATCTCAAGTTAGGGTTATGGCTAAGAGTCAAGACT TAGGGGGTTGGGGGTAGAGTTTTGGATTAGGGACGAAAATCAGGTTTTGAGTCAGGGTTG AGAATTGAGTCTTAGTTCAGCGTTAGAATAGAGAGATATGTATCGAATTGAGGTCAATAG AATGAGTCAAAGATCGGATCTCGAGTCTCAAGTCGGGTACATAATTGAGAGTCGAGTTTT GTGTTAGGGTCGATATTTTAAGTCTTGAATTGGGGTTGAAGTCCGGAGTCATATTTCAGG TTTCGAATTTGAGTCGAGAGTCAGGTATCAAGAAGGGATAGAGGTCGAGAATAAAATTTC AGTTTGAAGTCAAAAAAAGGTACCTTGGCTAGAGTAAAGACTCGAGTTGGGGTCGGGACC CGACTCTTGAATAATGTACACTTAAGATATAGTTTGATTAAAAATCTAGATATATCTCAA AATTATAACCAAAAATATAATCATGGAATGATAACCATGATAAATAATCACACCATGATT ATAAAAATTTGAATCCCATAATAAACAAAAATTCCACCACTATATAGAATAAATTATCTC ATAATTATAGTATAAATTTATCTTTATTTTAACCTATACCTTCCACTAAACACAACATAA ATTTAAATTCAAATTTTAAATTGAAAAATTCACTTAATTTATTTCTCCAACCAACCCCCT CCCTAATTATAATATGAGACTTTATTCGCACGTACAAACACTTTTGCCTCGAAAGATTAT GAAGATTGAAAACATACGTTATCTATTCCTTATACTAAGGATCTCTTGGGCGGTGCCATT TTTGTTATCTTTGAAGAATACACCATTTTTTCTAGTCTTTGGTCAAGCACAACAACAAAT TGCCTATGCGTTACTAATTATAGAAGTGGACTGTCAGTTAGTTCTTATTAAGTTCCTTAA ACTATGGAGAATATGTAACATTTGTGTACAACTACTTTTGAATGAAT