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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g072150.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T6B6_RICCO)

Sequence

ATGGCAATTTGTGCTTCTGGTCCGTCCGGCAAAATAGATAAAACACTACCGGAGATCAAT
TTCCGAACAGCCGTTGTTCCTCCGGCCAACCTCCGCTCGTACTTGAGTTGCTTCCAAATT
TGTAAGGTCGACAGAATCAGCTTGTTAAAAATTTTACATCAGCTGCAACATGTAACTGCA
ATGGTTTCTGATTTGTCATATATTTTAGTGGCAAATTTTGTTTTGAGGCTATTACACTAT
TTTCCTTCCTCATTCTTTGGTATTTCTGGGTTTGTTTGTGCAGATTCTAGTATAATGTTC
TATTATTTCCAGGATACAATCTTTATGGCACGCTCCTTACGAAAAGCTATCACAGTTTGC
TCTGTCTTCCGAAAAAGCTACTCTTCCATTCTTGCTGTCGCTTCAAATGCCATCAGATTG
ACCTACAATAGCACATATGTTCCGCTATATTTGGGAATGGAGTCCTCAATTTCATATGAA
AACTATAAACCAGGGGGTGTGATGTTTTCTCGACAGTTCAGTTCCAGGAGAGAGTCAGAG
ACATTATCTTGGGGAGTATCATCTGACGTTGTTTTGCTGGGAAAGCTTGAAAGTGCATTG
AGGAATCACAACTTGGAAGAGGCTTGGGAAACCTACAAGGATTTCAAACGTCTTTACGGT
TTCCCTGACCCCTTTCTTGTAGATAAGCTTCTCACTAAGTTGTCGTACTCATCTGATTCT
AGATGGCTTAAAAAGGCATGCAATATAGTCGGATCTATTTTGAAAGAGAAAAGGGAGATG
CTACGCACAGAGTTAATGACCAAGCTCTGCCTATCGTTGGCTAGAACTCAAATGCCCATT
CAAGCATCATCAATTCTCAGACTGATGTTGGAGAAAGGAAATCTCCCACCTATTGACATG
CTAGGGATGATAATATTTCACATGGTGAAGTCTGATACTGGAATGATTGTGTCATCAAAC
ATTTTGATTGAGATATATGGTAGCTCTCATCAATTAACTACAAAGAAATCCACTGAGTTA
AATAAACATAATACACTTCTTTTTAATCTTGTTCTTGATGCTTGTGCAAGATTTGGATCA
TCCAGTAAAGGCCATCAGATTATTGAGTTAATGGCCCAAGTTGGAGTGACAGCTGATGCT
CATACTATTTCAATTATTTCCTTGATCCATGAGATGAATGGTATGCGGGATGAATTAAAG
AAATTTAAGAAGCATATAGATCAGGTTTCAGTTCCATTATTTTCCTGCTATCAGCAATTC
TATGAAAGTCTCTTGTGTTTACATTTCAAGTTTAACGATATTGATGCTGCTTCTAATCTT
GTACAAGATATTTATGGATTTCAAGTGTCGCATCATCAGCAGGGAAATGAAACACAACCA
CCTAAACCGTGCCTTGTTTCAATTGGCTCTGATAATCTGAGAACGGGATTGAAATTACGA
ATTTTTCCCCATTCATTGTCAAGGGATTCTGTTTTCAATGTGGGACGTAATCAGGTGCTT
GTTATGTATAAGAATGGGAAACTAGCCCTTAGCAACAGAGCATTGGCCAAACTTATTATA
CAGTACAAGAGGTGTGGGAGAATTAATGATCTGTCAAAGCTTCTCTGTAGTATCCAGAAG
AAGGGCTCAGTTGAATCTAGCAGAATGTGCTCTGATGTGGTTTCTGCCTGCATTTGCATG
GGTTGGCTTGAAATTGCTCATGATATTTTGGATGATTTGGATTCTGAAGGAAATCCGCTG
GACGCTAGTTCATACATGTCTCTGTTGACTGCATATTGCAACAGAAATAAGCTAAGGGAG
GCAGAGGCACTACTAAAGCAATTAAAAAGATCAGGTGTCATATTAGCATCTGATCCATTG
TTAGCTCCTGCATCTATGTGTGAACTGGAAAGCAAGAATAAGCTGAAAGAATTAGACACT
TCGGCGAAAGGGGAGCTGGCTTACCATATTGTTGAAGAAATGAGAGCTGAAGAAAATGAA
GCTTCTTTTATGATGCATGATTTAAATTTTTCAATCTACTTTTTTATGAAGGCTCACATG
GTTGAAGATGCCGTAAGGGCTTACCGAAAAATGCAGGCAATGAAGATCCATCCGACGGTG
TCAACTTTCATGAATCTGCTTAATGGGTATTCTTCTTTAGGGATGTATCGTGAAATTACA
ATCTTGTGGGGAGATATTAAAAGGAACATGGAAAGTCGTAAGAACTTGAATACCAGGGAT
TTATACGAGTTCTTGCTGTTGAATTTTCTTCGAGGCGGTTATTTTCATAGGGTGATGGAG
GTTATTGGTTTAATGAAAGAAAATGGCATGTATTTGGACAAGTGGATGTATAGACGTGAG
TTCTTGAAATATCACAAGGGTCTTTACCTAAGAATAAAAGTATCTGATGCTAAAAATGAC
GTACAAACTCAGAGGATTGATCTTATAGGTATCAAGAATATTCTTCTTGCATGCTGGGAA
AGAGTCAAGACAATATTGAGCCATCCTTTGCCAAATTTTGACAGGCTTCTCTCCATCTTT
ATCTACCTGAGATTATATATTTCACTCGAAGACAAAAAGTTGCAGGAAAGGACGTCTTTC
TCTTCAGTTGTTCCATTGGGTATTGTATCTAATAGGTCAGTGCTCTTTAGCTTTTGTGGC
AGATTGTTGAATTTGCAACTTTTGCATCCACTCTATAAAATTTAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g072150.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T6B6_RICCO)

Sequence

MAICASGPSGKIDKTLPEINFRTAVVPPANLRSYLSCFQICKVDRISLLKILHQLQHVTA
MVSDLSYILVANFVLRLLHYFPSSFFGISGFVCADSSIMFYYFQDTIFMARSLRKAITVC
SVFRKSYSSILAVASNAIRLTYNSTYVPLYLGMESSISYENYKPGGVMFSRQFSSRRESE
TLSWGVSSDVVLLGKLESALRNHNLEEAWETYKDFKRLYGFPDPFLVDKLLTKLSYSSDS
RWLKKACNIVGSILKEKREMLRTELMTKLCLSLARTQMPIQASSILRLMLEKGNLPPIDM
LGMIIFHMVKSDTGMIVSSNILIEIYGSSHQLTTKKSTELNKHNTLLFNLVLDACARFGS
SSKGHQIIELMAQVGVTADAHTISIISLIHEMNGMRDELKKFKKHIDQVSVPLFSCYQQF
YESLLCLHFKFNDIDAASNLVQDIYGFQVSHHQQGNETQPPKPCLVSIGSDNLRTGLKLR
IFPHSLSRDSVFNVGRNQVLVMYKNGKLALSNRALAKLIIQYKRCGRINDLSKLLCSIQK
KGSVESSRMCSDVVSACICMGWLEIAHDILDDLDSEGNPLDASSYMSLLTAYCNRNKLRE
AEALLKQLKRSGVILASDPLLAPASMCELESKNKLKELDTSAKGELAYHIVEEMRAEENE
ASFMMHDLNFSIYFFMKAHMVEDAVRAYRKMQAMKIHPTVSTFMNLLNGYSSLGMYREIT
ILWGDIKRNMESRKNLNTRDLYEFLLLNFLRGGYFHRVMEVIGLMKENGMYLDKWMYRRE
FLKYHKGLYLRIKVSDAKNDVQTQRIDLIGIKNILLACWERVKTILSHPLPNFDRLLSIF
IYLRLYISLEDKKLQERTSFSSVVPLGIVSNRSVLFSFCGRLLNLQLLHPLYKI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g072150.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein, putative (AHRD V3.3 *** B9T6B6_RICCO)

Sequence

AAGTTATTTGTATATATATTCTATTGTACAAGTATTGTTTGAAGGAGTAATAATGCAGCC
CATTTTGTAAGGCCCAAAAACATTTGGTTTGAAGATTAGAAGAACGTGGAAACGGCTAAA
CTTTTGGCCGGAAATGGCAATTTGTGCTTCTGGTCCGTCCGGCAAAATAGATAAAACACT
ACCGGAGATCAATTTCCGAACAGCCGTTGTTCCTCCGGCCAACCTCCGCTCGTACTTGAG
TTGCTTCCAAATTTGTAAGGTCGACAGAATCAGCTTGTTAAAAATTTTACATCAGCTGCA
ACATGTAACTGCAATGGTTTCTGATTTGTCATATATTTTAGTGGCAAATTTTGTTTTGAG
GCTATTACACTATTTTCCTTCCTCATTCTTTGGTATTTCTGGGTTTGTTTGTGCAGATTC
TAGTATAATGTTCTATTATTTCCAGGATACAATCTTTATGGCACGCTCCTTACGAAAAGC
TATCACAGTTTGCTCTGTCTTCCGAAAAAGCTACTCTTCCATTCTTGCTGTCGCTTCAAA
TGCCATCAGATTGACCTACAATAGCACATATGTTCCGCTATATTTGGGAATGGAGTCCTC
AATTTCATATGAAAACTATAAACCAGGGGGTGTGATGTTTTCTCGACAGTTCAGTTCCAG
GAGAGAGTCAGAGACATTATCTTGGGGAGTATCATCTGACGTTGTTTTGCTGGGAAAGCT
TGAAAGTGCATTGAGGAATCACAACTTGGAAGAGGCTTGGGAAACCTACAAGGATTTCAA
ACGTCTTTACGGTTTCCCTGACCCCTTTCTTGTAGATAAGCTTCTCACTAAGTTGTCGTA
CTCATCTGATTCTAGATGGCTTAAAAAGGCATGCAATATAGTCGGATCTATTTTGAAAGA
GAAAAGGGAGATGCTACGCACAGAGTTAATGACCAAGCTCTGCCTATCGTTGGCTAGAAC
TCAAATGCCCATTCAAGCATCATCAATTCTCAGACTGATGTTGGAGAAAGGAAATCTCCC
ACCTATTGACATGCTAGGGATGATAATATTTCACATGGTGAAGTCTGATACTGGAATGAT
TGTGTCATCAAACATTTTGATTGAGATATATGGTAGCTCTCATCAATTAACTACAAAGAA
ATCCACTGAGTTAAATAAACATAATACACTTCTTTTTAATCTTGTTCTTGATGCTTGTGC
AAGATTTGGATCATCCAGTAAAGGCCATCAGATTATTGAGTTAATGGCCCAAGTTGGAGT
GACAGCTGATGCTCATACTATTTCAATTATTTCCTTGATCCATGAGATGAATGGTATGCG
GGATGAATTAAAGAAATTTAAGAAGCATATAGATCAGGTTTCAGTTCCATTATTTTCCTG
CTATCAGCAATTCTATGAAAGTCTCTTGTGTTTACATTTCAAGTTTAACGATATTGATGC
TGCTTCTAATCTTGTACAAGATATTTATGGATTTCAAGTGTCGCATCATCAGCAGGGAAA
TGAAACACAACCACCTAAACCGTGCCTTGTTTCAATTGGCTCTGATAATCTGAGAACGGG
ATTGAAATTACGAATTTTTCCCCATTCATTGTCAAGGGATTCTGTTTTCAATGTGGGACG
TAATCAGGTGCTTGTTATGTATAAGAATGGGAAACTAGCCCTTAGCAACAGAGCATTGGC
CAAACTTATTATACAGTACAAGAGGTGTGGGAGAATTAATGATCTGTCAAAGCTTCTCTG
TAGTATCCAGAAGAAGGGCTCAGTTGAATCTAGCAGAATGTGCTCTGATGTGGTTTCTGC
CTGCATTTGCATGGGTTGGCTTGAAATTGCTCATGATATTTTGGATGATTTGGATTCTGA
AGGAAATCCGCTGGACGCTAGTTCATACATGTCTCTGTTGACTGCATATTGCAACAGAAA
TAAGCTAAGGGAGGCAGAGGCACTACTAAAGCAATTAAAAAGATCAGGTGTCATATTAGC
ATCTGATCCATTGTTAGCTCCTGCATCTATGTGTGAACTGGAAAGCAAGAATAAGCTGAA
AGAATTAGACACTTCGGCGAAAGGGGAGCTGGCTTACCATATTGTTGAAGAAATGAGAGC
TGAAGAAAATGAAGCTTCTTTTATGATGCATGATTTAAATTTTTCAATCTACTTTTTTAT
GAAGGCTCACATGGTTGAAGATGCCGTAAGGGCTTACCGAAAAATGCAGGCAATGAAGAT
CCATCCGACGGTGTCAACTTTCATGAATCTGCTTAATGGGTATTCTTCTTTAGGGATGTA
TCGTGAAATTACAATCTTGTGGGGAGATATTAAAAGGAACATGGAAAGTCGTAAGAACTT
GAATACCAGGGATTTATACGAGTTCTTGCTGTTGAATTTTCTTCGAGGCGGTTATTTTCA
TAGGGTGATGGAGGTTATTGGTTTAATGAAAGAAAATGGCATGTATTTGGACAAGTGGAT
GTATAGACGTGAGTTCTTGAAATATCACAAGGGTCTTTACCTAAGAATAAAAGTATCTGA
TGCTAAAAATGACGTACAAACTCAGAGGATTGATCTTATAGGTATCAAGAATATTCTTCT
TGCATGCTGGGAAAGAGTCAAGACAATATTGAGCCATCCTTTGCCAAATTTTGACAGGCT
TCTCTCCATCTTTATCTACCTGAGATTATATATTTCACTCGAAGACAAAAAGTTGCAGGA
AAGGACGTCTTTCTCTTCAGTTGTTCCATTGGGTATTGTATCTAATAGGTCAGTGCTCTT
TAGCTTTTGTGGCAGATTGTTGAATTTGCAACTTTTGCATCCACTCTATAAAATTTAAAG
GATCAGGAAACTGTGTTCTGATTGGCACTCCAGATGTGATTTTATGCTCCTTGTCAGTCT
TGAGTATCTCTTCGAGTCGGAATTGATACTCTGACATGCGTGGATATTGAAAATTATTCA
TGGCTCCAGTGTCTACTCCAAGCCTGTAGCTTTCTGTCATGGAGCTGAAAAAAGTTGCTA
AGGAGATGTTGGACCACTGGGTATGTTTAGCCAGAACTGGCTCTATAAAATATTTTTTAG
CTAATATTCAGTTCTCCTAGTTCTTTATTTCCAAAGAAGGTCTCCGTATAGTTTCAGGAA
AAGAAGGTTTTCGTATAACAGTCCTTGTTTTTGGTTTTGATATCCTTGACCTTTGACCAT
CTTGCGGATCATAAATACTAATAGAACATCGAAGAGCACTCTGTGGGAATACATCATCAT
TTATCGGTGATGGAAAAAGGGATCTTGTTGCACTTGGACTTTACTTGTAGGTTTCTTTCT
AGGTTTTAGTAAACTGCACGTAATATTTCTTATTGTCAAGTATTTTAGAATGGAAATGGC
TGAAAGTTGGGATCTCTTATAGACCAACTATTATTTAGACCAACTAGTGGGATAACCTAT
GATCTACCCGTGTTCCATGGTGGTTATCAGAAGCCATTGGCTAATGATGTTTGTACTCGT
ATGTTTGTTCTCTTACCTTTTCTCACTATTCCCCATCACTTCCAATTTGGAGACAGAACA
CTGAAAAGATAAGAGCCTCCCACATTCTTCCCTTGTTGCAACCAAGTCATTGTGAATTAT
CTTGAAAGAGCTTAATTTTATGTTGAGATGTTTTTTCCGGCTTATCCATCAACTTTGATT
CACTCCGGGGAAGTACATGCAGAAAAATTGGTAAAACTCTGTACTTCTGAACCGATTTTG
CTCTTCTGATAGACAAACAGATCTTATTGTCCTCACCTGCAAATTGCTACAGTACCTTGT
GTGAGGTCATTGCCTGTTTCAAGAATAGAGATGCTTGATTAGACCCTGAAAGTGAAAACA
CTGGCATCATTACATGTGCACTTGTATTGTTCAATGAGTTGTTGGAGGATTTCTCTTAAG
AAGACTCTTTATCTAGGCAAAGTTATCGTTATGTTTCCTGTTCATCAGCTGGGCATTATA
CACATGAAACCAACCCCGATTTTTCTGTAGCACTAGGTTCAAAAACGCCTATCTACCTTT
CTCTGCTTACTCTGTGACTAGGTTCAAACACTTGACTTGTGTTTCTGGGGAAAAGGACAC
AAGGCAACTATCTATGATTTACTGTAAAGATTTAAGGAAGGACAAGGGAGCAAAAGAAGG
GAACAGCTTCATCAGAAAAGAAGTGAACAGTCATTGTTTAGTTGAAGGACTTGTAATGCT
AGTGTTGTTGTACTGTAAAAAAAAAATGTGAAGACGCAGACTTCAGTAGGATATACGATT
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TGTGCAGTACATGATAACAAAGTTCAATGAGGACACC