Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g071940.3.1
CDS Infomation	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G52340.1),Pfam:PF13561
Sequence	ATGACTGATACTTCTCTTCCTATCCAAAGGTTATTGGGAAAAGTTGCTTTAGTCACTGGA GGGGCAACTGGCATAGGAGAGAGCATAGTACGTCTATTTCATAAGCATGGTGCAAAAGTA TGCATTGCTGATATTCAAGATGAAGTTGGACAGCATGTTTGTGAGACCCTTGGTAATGAC CAGAATGTGTGCTTTATCCACTGTGATGTGACTGTAGAAGCTGATATTAGTAATGCAGTT GATTTTACGGTTCAAAAGTTTGGTACACTTGACATAATGGTTAATAATGCCGGGTTGTCT GGGCCCCCTATTGGAGATATCCGTGAATATGAACTTTCTGTGTTTGAAAATGTGCTTGAC GTGAACTTGAAAGGTACTTTCCTTGGAATGAAGCATGCTGCTCGCATAATGATACCACTA AAGAAGGGAGCAATAGTATCTCTGTGCAGTGTGGCAAGTGCCATTGGTGGAGTCGGACCT CATGGTTATACAGCTTCCAAGTATGCTGTTTTGGGACTTACACAGAACGTTGCAGCTGAG TTGGGAAAACACGGTGTACATGTGAATTGTGTTTCTCCTTATGCAGTTCCAACTGGATTA GCTCTGGCTCACTTGCCTGAGGATGAGAAGACTGATGATGCAATGGAAGGTTTTCGTGAT TTTGCTGCCAGGAATGCTAACTTGCAGGGGGTGGAATTGACGGTTGATGATGTTGCTAAT GCCGTGCTTTTCTTAGCCAGTGATGAATCAAGGTATATAAGTGGGCATAATCTGATGGTC GATGGTGGTTTCTCGTGTGTTAATCACTCCCTTCGGGTCTTCAGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g071940.3.1
PEP Infomation	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G52340.1),Pfam:PF13561
Sequence	MTDTSLPIQRLLGKVALVTGGATGIGESIVRLFHKHGAKVCIADIQDEVGQHVCETLGND QNVCFIHCDVTVEADISNAVDFTVQKFGTLDIMVNNAGLSGPPIGDIREYELSVFENVLD VNLKGTFLGMKHAARIMIPLKKGAIVSLCSVASAIGGVGPHGYTASKYAVLGLTQNVAAE LGKHGVHVNCVSPYAVPTGLALAHLPEDEKTDDAMEGFRDFAARNANLQGVELTVDDVAN AVLFLASDESRYISGHNLMVDGGFSCVNHSLRVFR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g071940.3.1
Transcript Infomation	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G52340.1),Pfam:PF13561
Sequence	ATTAATTTATAAAGTTGTAAAATTCATTTTCCTTTTTTAAACTCCAAATTAAAATACGCC ACGCAATTTGAGACAGGGAGTAGGATTTAAACTGGACATCTCCACCGAAATAATAGCGTT TTTTTTCCTGATAGAAAAGAAGGAACTTTATTGCTATGACTGATACTTCTCTTCCTATCC AAAGGTTATTGGGAAAAGTTGCTTTAGTCACTGGAGGGGCAACTGGCATAGGAGAGAGCA TAGTACGTCTATTTCATAAGCATGGTGCAAAAGTATGCATTGCTGATATTCAAGATGAAG TTGGACAGCATGTTTGTGAGACCCTTGGTAATGACCAGAATGTGTGCTTTATCCACTGTG ATGTGACTGTAGAAGCTGATATTAGTAATGCAGTTGATTTTACGGTTCAAAAGTTTGGTA CACTTGACATAATGGTTAATAATGCCGGGTTGTCTGGGCCCCCTATTGGAGATATCCGTG AATATGAACTTTCTGTGTTTGAAAATGTGCTTGACGTGAACTTGAAAGGTACTTTCCTTG GAATGAAGCATGCTGCTCGCATAATGATACCACTAAAGAAGGGAGCAATAGTATCTCTGT GCAGTGTGGCAAGTGCCATTGGTGGAGTCGGACCTCATGGTTATACAGCTTCCAAGTATG CTGTTTTGGGACTTACACAGAACGTTGCAGCTGAGTTGGGAAAACACGGTGTACATGTGA ATTGTGTTTCTCCTTATGCAGTTCCAACTGGATTAGCTCTGGCTCACTTGCCTGAGGATG AGAAGACTGATGATGCAATGGAAGGTTTTCGTGATTTTGCTGCCAGGAATGCTAACTTGC AGGGGGTGGAATTGACGGTTGATGATGTTGCTAATGCCGTGCTTTTCTTAGCCAGTGATG AATCAAGGTATATAAGTGGGCATAATCTGATGGTCGATGGTGGTTTCTCGTGTGTTAATC ACTCCCTTCGGGTCTTCAGATAGCTGTATGTTGATCGATCTTATTGGGAACTTTCAAGAG ATTGTCATCCTGTTTGTGATTTTTCCATTCAAACAAACCTGCTTATGTTTCCAAAGCACT ATGCTAAAACTAGACTTATCCTTTGTGAGGAGTTGCTTTGCAATTTGTGTTGAACTCCAA CTGATTAGTGATTCCCTTTTTATGATTTCTTTTGGAAATTTGTGGAGTAAAAGTCAATAC TTTTTTTCCTCATGAACTTTTCATTTCCTAATTTCTAAATCTTTGGGTTAAGAAAAAAAA TTGCTCTTTTTCGTTTTGTTTTAATCAATTTGGTATTGAT