Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g071650.3.1
CDS Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1A8I3_SOLTU)
Sequence	ATGGATACTAAAGGGAGGCTTATTGCTGGTTCACATAATAGAAATGAATTTGTTCTCATC AATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTAAGTGGACAGATTTGCCAG ATTTGTGGAGATGAGATTGAAGTTACAGTAGATGGGGAGACATTTGTTGCTTGCAATGAG TGTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGTTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAATCAAGCT TGCCCTCAATGTAAAACTAGGTACAAGCGTATTAAAGGGAGCCAAAGAGTTGACGGAGAT GATGAAGAAGATGAGTTTGATGACTTAGATCATGAATTTGATTATGATGGTACACCTAGA CATCTTTCTGAGGCTGCACTTGCTCGACTTGGCCGCGGTACCAATTATAATGCTTCTGGG CTTAATACCCCAGCAGAAGTAGATCCTGCTGCCCTTAACTCAGAGATCCCTCTTCTTACT TATGGTCAAGAGGATGATACAATTTCAGCTGATAAACATGCACTTATCATACCACCTTTT ATGGGTCGTGGGAAGAAAATTCATCCTGTGCCTTATACTGATTCATCCATGTCTTTGCCG CCTCGCCCCATGGACCCTAAGAAAGATTTGGCAGTTTATGGATATGGTACTGTTGCATGG AAGGAAAGAATGGAGGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGATAAACTACAGGTGGTTAAGCAT GGAGGCAAAGGTGGTGATAACGATGGAGATGAGCTGGATGATCCCGATCTCCCCAAGATG GATGAAGGAAGACAACCACTTTCGAGAAAGCTGCCTATTGCCTCTAGCAGGCTAAGCCCA TACAGATTATCCATTTTAGTCCGCCTTGCTGTTCTTGGACTCTTTTTTCACTATCGAATA ACGCATCCTGTCAATGATGCATATGTATTATGGCTGCTATCTATTATATGTGAAATATGG TTTGCTGTGTCATGGATATTTGATCAGTTACCTAAATGGTGTCCAATTCGTCGAGAGACA TACTTGGATAGGCTATCTCTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGGGTTAGCCCCT GTAGATATATTTGTTAGTACAGTGGATCCCCTAAAAGAACCTCCACTTATTACTGCAAAT ACTGTTCTCTCCATTCTTGCTTGTGACTATCCTGTGGACAAGGTTTCGTGCTATGTCTCT GATGATGGTGCTGCCATGCTTACTTTTGAGGCTCTCTCTGAAACATCTGAGTTCGCAAGG AAATGGGTCCCATTCTGCAAAAAGTTCAACATAGAGCCTCGAGCGCCCGAGTGGTATTTT TCTCTGAAGGTTGATTATCTGAAAAATAAAGTACTGCCATCGTTTGTGAGGGAACGTCGT GCTATGAAGAGAGATTATGAAGAATTCAAGGTTCGGATAAATGGGCTGGTTGCCACAGCA CAAAAGGTTCCTGAAGATGGCTGGACCATGCAAGATGGAACACCTTGGCCAGGAAATCTT GTCAGGGATCATCCTGGAATGATTCAGGTCTTCCTGGGTAATGATGGTGTCCGTGATATT GAAGGGAATGTATTGCCTCGCCTTATCTATGTTTCTCGTGAAAAGCGTCCTGGATTTGAC CACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTTTGATGCGTGTATCAGCAGTCATATCAAAT GCTCCTTACATGCTCAATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCATTGAGA GAAGCTATGTGCTTTATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAATTT CCTCAAAGATTTGATGGTATTGACAGGCATGACAGATACTCCAACCGCAATGTTGTCTTC TTTGATATCAATATGAAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTCGGCACTGGA TGTGTCTTCAGGAGGCAAGCCCTTTATGGTTATGATGCTCCAAAGAAGACAAAACCTCCA GGAAAAACATGCAACTGCTGGCCGAGATGGTGTTGCTGTTGTTTCGGTACTCGAAAGAAG CACAAGAAAGCGAAAACAACCAAGGATAACAAAAAGAAGCCAAAAAGCAAAGAGGCTTCA CCACAAATTCATGCCCTTGAAAATATCGAGGAAGGAATTGAAGGAATTGATAGTGAAAAA GCAGCCCTCATGCCTCAGATAAAACTTGAAAAGAAATTTGGTCAATCACCGGTATTTGTT GCTTCAACACTTCTAGAAGATGGTGGCATTCCTCCAGGTGCAACATCAGCATCTCTCTTG AAAGAAGCAATACATGTTATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGCAAAGAG ATTGGATGGATTTATGGATCTGTTACTGAGGATATCCTTACTGGATTCAAGATGCACTGC CATGGTTGGAGATCCGTCTACTGCATGCCCAATAGGCCTGCATTTAAAGGGTCAGCTCCT ATAAATCTTTCAGATCGTCTTCATCAGGTTCTGCGATGGGCTTTGGGATCTGTTGAAATT TTCTTCAGTAGACATTGTCCAATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTGAAGCCTCTGGAG CGGTTTTCGTACATAAACTCAGTGGTCTACCCATTGACTTCTATTCCATTGATCATATAT TGTGCATTGCCTGCCGTCTGTTTGCTTACAGGGAAATTTATTGTTCCAGAGATTAGCAAC TATGCTAGCATTCTTTTCATGGCACTTTTCATAATGATTGCTGTGACGAGTGTTATTGAG ATGCAATGGGGAGGTGTTACTATTGATGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTGATT GGTGGTGCCTCATCTCACCTATTTGCTCTTTTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTAGCTGGT GTCAACACTAGCTTCACTGTTACTTCCAAAGCAGCGGACGATGGGGAGTTTTCTGAGCTC TATCTGTTCAAGTGGACATCTTTGTTGATTCCTCCTATGACTTTGTTAATTCTTAACATC ATTGGAGTTATAGTCGGTGTCTCAGACGCAATCAACAATGGTTATGATTCTTGGGGTCCT CTATTTGGTAGACTCTTCTTCGCCTTATGGGTCATTGTTCATCTGTATCCCTTCCTCAAG GGTTGCATGGGTAGACAAAACAACGTTCCAACCATCATTATTGTCTGGTCCATCCTTCTC GCATCTATCTGCTCCTTATTGTGGGTGCGTCTCAACCCATTCACCGCCAAAGGTGGACTC AGTTTAGAGGTATGTGGCTTGGACTGTGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g071650.3.1
PEP Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1A8I3_SOLTU)
Sequence	MDTKGRLIAGSHNRNEFVLINADEVGRVTSVKELSGQICQICGDEIEVTVDGETFVACNE CAFPVCRPCYEYERREGNQACPQCKTRYKRIKGSQRVDGDDEEDEFDDLDHEFDYDGTPR HLSEAALARLGRGTNYNASGLNTPAEVDPAALNSEIPLLTYGQEDDTISADKHALIIPPF MGRGKKIHPVPYTDSSMSLPPRPMDPKKDLAVYGYGTVAWKERMEDWKKKQNDKLQVVKH GGKGGDNDGDELDDPDLPKMDEGRQPLSRKLPIASSRLSPYRLSILVRLAVLGLFFHYRI THPVNDAYVLWLLSIICEIWFAVSWIFDQLPKWCPIRRETYLDRLSLRYEKEGKPSGLAP VDIFVSTVDPLKEPPLITANTVLSILACDYPVDKVSCYVSDDGAAMLTFEALSETSEFAR KWVPFCKKFNIEPRAPEWYFSLKVDYLKNKVLPSFVRERRAMKRDYEEFKVRINGLVATA QKVPEDGWTMQDGTPWPGNLVRDHPGMIQVFLGNDGVRDIEGNVLPRLIYVSREKRPGFD HHKKAGAMNALMRVSAVISNAPYMLNVDCDHYINNSKALREAMCFMMDPTSGKKICYVQF PQRFDGIDRHDRYSNRNVVFFDINMKGLDGIQGPIYVGTGCVFRRQALYGYDAPKKTKPP GKTCNCWPRWCCCCFGTRKKHKKAKTTKDNKKKPKSKEASPQIHALENIEEGIEGIDSEK AALMPQIKLEKKFGQSPVFVASTLLEDGGIPPGATSASLLKEAIHVISCGYEDKTEWGKE IGWIYGSVTEDILTGFKMHCHGWRSVYCMPNRPAFKGSAPINLSDRLHQVLRWALGSVEI FFSRHCPIWYGYGCGLKPLERFSYINSVVYPLTSIPLIIYCALPAVCLLTGKFIVPEISN YASILFMALFIMIAVTSVIEMQWGGVTIDDWWRNEQFWVIGGASSHLFALFQGLLKVLAG VNTSFTVTSKAADDGEFSELYLFKWTSLLIPPMTLLILNIIGVIVGVSDAINNGYDSWGP LFGRLFFALWVIVHLYPFLKGCMGRQNNVPTIIIVWSILLASICSLLWVRLNPFTAKGGL SLEVCGLDCD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g071650.3.1
Transcript Infomation	Cellulose synthase (AHRD V3.3 *** M1A8I3_SOLTU)
Sequence	GTTGTTGTTACTTGTAATGGGTGTTTAAAAGCAGTGTGTCATAAAGAGAAGAGGAGAAGG GTAGTGCTTTTCTTGAATGTGTTATGGTTTGAGGGGATTTCACTTTGAGTGGTCTCTAAT GTGCTGAAACTGAAGAGGGGTTTGTTTTACTTCTCCATTCTTGATTGTTTTGACTCAAAA TGGATACTAAAGGGAGGCTTATTGCTGGTTCACATAATAGAAATGAATTTGTTCTCATCA ATGCTGATGAAGTTGGAAGAGTAACTTCTGTGAAAGAATTAAGTGGACAGATTTGCCAGA TTTGTGGAGATGAGATTGAAGTTACAGTAGATGGGGAGACATTTGTTGCTTGCAATGAGT GTGCATTTCCTGTTTGCAGACCTTGTTATGAGTATGAAAGGAGAGAAGGGAATCAAGCTT GCCCTCAATGTAAAACTAGGTACAAGCGTATTAAAGGGAGCCAAAGAGTTGACGGAGATG ATGAAGAAGATGAGTTTGATGACTTAGATCATGAATTTGATTATGATGGTACACCTAGAC ATCTTTCTGAGGCTGCACTTGCTCGACTTGGCCGCGGTACCAATTATAATGCTTCTGGGC TTAATACCCCAGCAGAAGTAGATCCTGCTGCCCTTAACTCAGAGATCCCTCTTCTTACTT ATGGTCAAGAGGATGATACAATTTCAGCTGATAAACATGCACTTATCATACCACCTTTTA TGGGTCGTGGGAAGAAAATTCATCCTGTGCCTTATACTGATTCATCCATGTCTTTGCCGC CTCGCCCCATGGACCCTAAGAAAGATTTGGCAGTTTATGGATATGGTACTGTTGCATGGA AGGAAAGAATGGAGGACTGGAAGAAAAAGCAGAATGATAAACTACAGGTGGTTAAGCATG GAGGCAAAGGTGGTGATAACGATGGAGATGAGCTGGATGATCCCGATCTCCCCAAGATGG ATGAAGGAAGACAACCACTTTCGAGAAAGCTGCCTATTGCCTCTAGCAGGCTAAGCCCAT ACAGATTATCCATTTTAGTCCGCCTTGCTGTTCTTGGACTCTTTTTTCACTATCGAATAA CGCATCCTGTCAATGATGCATATGTATTATGGCTGCTATCTATTATATGTGAAATATGGT TTGCTGTGTCATGGATATTTGATCAGTTACCTAAATGGTGTCCAATTCGTCGAGAGACAT ACTTGGATAGGCTATCTCTGAGGTATGAGAAAGAAGGGAAGCCTTCTGGGTTAGCCCCTG TAGATATATTTGTTAGTACAGTGGATCCCCTAAAAGAACCTCCACTTATTACTGCAAATA CTGTTCTCTCCATTCTTGCTTGTGACTATCCTGTGGACAAGGTTTCGTGCTATGTCTCTG ATGATGGTGCTGCCATGCTTACTTTTGAGGCTCTCTCTGAAACATCTGAGTTCGCAAGGA AATGGGTCCCATTCTGCAAAAAGTTCAACATAGAGCCTCGAGCGCCCGAGTGGTATTTTT CTCTGAAGGTTGATTATCTGAAAAATAAAGTACTGCCATCGTTTGTGAGGGAACGTCGTG CTATGAAGAGAGATTATGAAGAATTCAAGGTTCGGATAAATGGGCTGGTTGCCACAGCAC AAAAGGTTCCTGAAGATGGCTGGACCATGCAAGATGGAACACCTTGGCCAGGAAATCTTG TCAGGGATCATCCTGGAATGATTCAGGTCTTCCTGGGTAATGATGGTGTCCGTGATATTG AAGGGAATGTATTGCCTCGCCTTATCTATGTTTCTCGTGAAAAGCGTCCTGGATTTGACC ACCACAAGAAGGCTGGTGCCATGAATGCTTTGATGCGTGTATCAGCAGTCATATCAAATG CTCCTTACATGCTCAATGTGGATTGTGATCACTATATAAATAACAGTAAGGCATTGAGAG AAGCTATGTGCTTTATGATGGACCCCACTTCAGGAAAGAAAATATGCTACGTACAATTTC CTCAAAGATTTGATGGTATTGACAGGCATGACAGATACTCCAACCGCAATGTTGTCTTCT TTGATATCAATATGAAAGGACTTGATGGGATCCAGGGTCCAATTTATGTCGGCACTGGAT GTGTCTTCAGGAGGCAAGCCCTTTATGGTTATGATGCTCCAAAGAAGACAAAACCTCCAG GAAAAACATGCAACTGCTGGCCGAGATGGTGTTGCTGTTGTTTCGGTACTCGAAAGAAGC ACAAGAAAGCGAAAACAACCAAGGATAACAAAAAGAAGCCAAAAAGCAAAGAGGCTTCAC CACAAATTCATGCCCTTGAAAATATCGAGGAAGGAATTGAAGGAATTGATAGTGAAAAAG CAGCCCTCATGCCTCAGATAAAACTTGAAAAGAAATTTGGTCAATCACCGGTATTTGTTG CTTCAACACTTCTAGAAGATGGTGGCATTCCTCCAGGTGCAACATCAGCATCTCTCTTGA AAGAAGCAATACATGTTATTAGTTGTGGTTATGAAGACAAAACAGAATGGGGCAAAGAGA TTGGATGGATTTATGGATCTGTTACTGAGGATATCCTTACTGGATTCAAGATGCACTGCC ATGGTTGGAGATCCGTCTACTGCATGCCCAATAGGCCTGCATTTAAAGGGTCAGCTCCTA TAAATCTTTCAGATCGTCTTCATCAGGTTCTGCGATGGGCTTTGGGATCTGTTGAAATTT TCTTCAGTAGACATTGTCCAATTTGGTATGGATATGGGTGTGGTCTGAAGCCTCTGGAGC GGTTTTCGTACATAAACTCAGTGGTCTACCCATTGACTTCTATTCCATTGATCATATATT GTGCATTGCCTGCCGTCTGTTTGCTTACAGGGAAATTTATTGTTCCAGAGATTAGCAACT ATGCTAGCATTCTTTTCATGGCACTTTTCATAATGATTGCTGTGACGAGTGTTATTGAGA TGCAATGGGGAGGTGTTACTATTGATGACTGGTGGAGAAACGAGCAGTTTTGGGTGATTG GTGGTGCCTCATCTCACCTATTTGCTCTTTTCCAAGGTCTTCTTAAAGTTTTAGCTGGTG TCAACACTAGCTTCACTGTTACTTCCAAAGCAGCGGACGATGGGGAGTTTTCTGAGCTCT ATCTGTTCAAGTGGACATCTTTGTTGATTCCTCCTATGACTTTGTTAATTCTTAACATCA TTGGAGTTATAGTCGGTGTCTCAGACGCAATCAACAATGGTTATGATTCTTGGGGTCCTC TATTTGGTAGACTCTTCTTCGCCTTATGGGTCATTGTTCATCTGTATCCCTTCCTCAAGG GTTGCATGGGTAGACAAAACAACGTTCCAACCATCATTATTGTCTGGTCCATCCTTCTCG CATCTATCTGCTCCTTATTGTGGGTGCGTCTCAACCCATTCACCGCCAAAGGTGGACTCA GTTTAGAGGTATGTGGCTTGGACTGTGATTAAGTAAGCAGCATTGTAGAACATGTTGTAT GATATCAAAATAGAGCTCAAACTCAGGGAGAAGGAACAAGGGGTATGTTTTTATCTCCCG AAAATTTGGTCATCGACGAAAAGTTTTGAGTTGGACAAGCAAGAGAATGAGCTCTGTGGA TTGTTGTATAAAGGGCAGAATAGCAGATACATTGATATTTGTTTTGCAAAGTTTTTTTTT TCTTTTTTTGATTCTTTTGATAGATTTTGGGATTTGTTGCTTGGAGTGCAGTGGAGTTTC CATTATTTGTAATATCAATCAAACATAAAAATTGTTGTGTTAAGCCACAACACCCCCCTC CCCTTCTTAATAACGGACTTCACATAGAAAAATGTTGTCAAAAAATTTGATCAGTAATTA TGAACTATATTATACTGTTTTAATTTCAAGAAAGTGAAACTCCAAGACTTTCCCTGTCTC AAGACTTTCTTTTAGTTATTCTTTTATGCT