Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g064700.3.1
CDS Infomation	Transcription elongation factor SPT5 (AHRD V3.3 *** K4BT61_SOLLC)
Sequence	ATGCCGCGCCACCGGGACTACGACGACGATGACGATGAGCCAGAGGAGGAAGAAGAGGAC GTGTATGAAGAGGAGGACGAGGAGGAAGAGGACGATGGAGGGAAGGCTGGACGGAAACGT CGTAGATCAGATTTTATTGATGATGCGGCGGAGGAAGATGACGATGAGGATGAGGACGAT GATGATGAGGATTATGGCGGTGGAGGTGGAGGCGGTGGTGGGAGAAGACGACCTAAACGG AGGACTGCTTTTCTTGTGGTATCTTTCTCCCTGCATTGTCTTTTATCTGTTGTGGTTTTG ATTGTTAGATTTTCTTTTGCAGATTTCATAGTAGATAGTGGAGCAGATATTCCTGACGAG GATGGTGCCAGACGTGAATATCGTCACCGATTGTTGCCGCATGAGGACCAAGAAGAAGAC CTTGAGGAGCTTACGAGGAGCATTAAGCAAAGATATGCGAGGTCACCTCATGTTGAGTAT GATGAGGAAGCAACAGATGTTGAGCAGCAAGCTCTCTTGCCATCTGTCAGGGATCCAAAG CTCTGGATGGTGAAATGTGCGATTGGCCGTGAGAGAGAGGTTGCGGTTTGCCTAATGCAA AAGGCGATTGATAGAGGACCTGAATTGCAAATTCGATCAGTTGTAGCCCTTGATCATCTT AAGAACTATATATACATAGAAGCGGACAAAGAAGCTCACGTGAGGGAGGCGTGCAAGGGT ATGCGCAATATATATGCCTCTGCGAAAATAATGCTGGTCCCCATAAAGGAGATGACTGAT GTCCTTTCAGTTGAAAGCAAAGCGGTTGATCTTGCCAGGGATACTTGGGTCAGAATGAAG ATGGGAACTTACAAGGGAGACCTTGCAAAGGTTATGGATGTAGATAATGTGAGACAGAAA GTCGTCGTGAAATTAATCCCAAGGATTGATTTACAGGCTCTTGCGAACAAGTTGGAAGGG AGGGAAGCTCCAAAGAAAAAGGCATTTATTCCTCCACCACGCTTTATGAATATCGATGAA GCTAGAGAGATGAACCTACGTGTGGAACGTAGGCGAGACCCGATGTCAGGTGACTATTTT GAGAATATTGGAGGTATGATGTTCAAAGATGGTTTCTTGTATAAGACAGTGTCAATGAAA TCAATCAGGACCCTGAATATACAGCCAACTTTTGATGAACTTGAGAAATTCCGGCAAACT GGTGAGGGTGGGGATGGTGATATGGCTAGTCTATCTACTTTGTTTGCAAATAGGAAAAAA GGTCATTTTATGAAGGGTGACCGCGTTATTGTGGTGAAGGGGGATCTCAGAAACTTGAAA GGCCATGTTGAGAAAGTCGAAGAAGATACTGTTCATATCAGACCAAATCAGAAGGACCTT CCTTTGACTTTGGCTTTTAGTGACAAAGAGCTATGCAAGTACTTTGATCTTGGAAATCAC GTGAAAGTAGTATCTGGTTCATCTGAAGGTGCAACCGGTATGGTTGTCTCTGTTCAGGGA CATGTGGTTAACCTGGTATCTGATACAACAAAGGAGCTTCTCCGTGTATTTGCCGATAAT GTTGTTGAGAGTTCTGAAGTAACATCTGGTCTCACTCGTATTGGGGAATATGAGCTCCAT GATCTTGTAATTCTAGACAATAAGAGCTTTGGTGTGATTATTCGTGTAGACAGTGAAGCC TTCCAGGTCCTTAAGGGTGTGCCTGATAGACCTGAAGTAGCACTTGTTAGACTTAGAGAG ATCAAAGCGAAAGTTGAAAAGAAAGGAAATGCCCAAGATCGGTATAAGAACCACTTGGCG GTGAAAGACGTGGTAAAAGTTCTCGAGGGTCCTTGTAAAGGAAAACAAGGTCCTGTTGAA CACATCTTCAGAGGAGTAGTTTTTATTTATGATCGTCATCACCTTGAGCATGCTGGTTAT ATTTGTGCCAAAACCCAATCTTGTGTGTTGATTGGTGGCTCACGGGCAAATGGTGATAGA AATGGTAACCCCATGTCATCAAGATTTGCGCATATGAGACCTCCACCACGTGCTCCTCAA TCTCCAATGAGATCATCTAGAGGTGGCCCACCTATGAGTTATGGAGGCAGACATAGAGGT GGACGAGGGCACGATGCTTTAGTTGGAGCTGACGTGAAAATTCGCCTTGGACCATTCAAA GGCTGTAAAGGGCGTGTTGTTGATATCAAAGGAACTTCAGTCCGAGTTGAACTTGAAGCC CAGATGAAAGTTGTTACAGGCAAGTGTTTCATTGATCGCAACCATATCTCTGATAATGTT AACGTGTCAGTGCCGTTCAGGGAACCATCTAGATATGGTTTGGGAAGTGAAACACCATCA CATCCTTCAAGGACTCCACTGCACCCATTTATGACACCTATGAGAGATCCTGGAGCAACA CCTATCCATGATGGCATGAGGACGCCAATGCGTGACAGAGCATGGAATCCAATGAGTCCA ACTAGTGACAGGGGGGGTGATTGGGAAGATGGAAACCCTGCTTCCTGGGGGTCAAGTCCG CAATATCAGCCATCTAGTCCTCGTTCAAGGGCGTATGAAGCACCTACTCCTGGTTCTGGT TGGACTAATACACCTAGCGGTAATTACAGTGATGCTGGTACCCCAAGAGACAATGGTTCT GCATATGCTAATGCTCCAAGTCCTTACTTGCCATCAACTCCTGGTGGACAACCACCAATG ACACCAAGTTCAGCATATATACCTGGTACTCCTGGTGGGCAGCCAATGACTCCTGGAAGT GGTGGGCTGGATATGATGTCACCTATAGGAGGTGGGGATACAGAAGGTCCTTGGCTCTTG CCTGATATCTTGGTCAATGTACGGAAGTCCAATGATGATACTGTCATCGGAGTTGTCCAT GAGGTGTTAGCGCAGGATGGTTCCTGTAGTGTTGGTCTTGGATCAAGCGGCAATGGTGAC ACTATCATTGCGCACCCAACTGAAATTGATATAATTGTACCAAAGAAGTCTGATAAAATC AAGATAATGGGTGGTCCTCAACGTGGTGCAACCGGCAAGCTTATTGGTGTTGATGGCACT GATGGGATTGTAAAGGTGGATGATACCCTTGATGTTAAAATTTTAGACATGGTACTTTTG GCCAAGTTAGCGCATGCATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g064700.3.1
PEP Infomation	Transcription elongation factor SPT5 (AHRD V3.3 *** K4BT61_SOLLC)
Sequence	MPRHRDYDDDDDEPEEEEEDVYEEEDEEEEDDGGKAGRKRRRSDFIDDAAEEDDDEDEDD DDEDYGGGGGGGGGRRRPKRRTAFLVVSFSLHCLLSVVVLIVRFSFADFIVDSGADIPDE DGARREYRHRLLPHEDQEEDLEELTRSIKQRYARSPHVEYDEEATDVEQQALLPSVRDPK LWMVKCAIGREREVAVCLMQKAIDRGPELQIRSVVALDHLKNYIYIEADKEAHVREACKG MRNIYASAKIMLVPIKEMTDVLSVESKAVDLARDTWVRMKMGTYKGDLAKVMDVDNVRQK VVVKLIPRIDLQALANKLEGREAPKKKAFIPPPRFMNIDEAREMNLRVERRRDPMSGDYF ENIGGMMFKDGFLYKTVSMKSIRTLNIQPTFDELEKFRQTGEGGDGDMASLSTLFANRKK GHFMKGDRVIVVKGDLRNLKGHVEKVEEDTVHIRPNQKDLPLTLAFSDKELCKYFDLGNH VKVVSGSSEGATGMVVSVQGHVVNLVSDTTKELLRVFADNVVESSEVTSGLTRIGEYELH DLVILDNKSFGVIIRVDSEAFQVLKGVPDRPEVALVRLREIKAKVEKKGNAQDRYKNHLA VKDVVKVLEGPCKGKQGPVEHIFRGVVFIYDRHHLEHAGYICAKTQSCVLIGGSRANGDR NGNPMSSRFAHMRPPPRAPQSPMRSSRGGPPMSYGGRHRGGRGHDALVGADVKIRLGPFK GCKGRVVDIKGTSVRVELEAQMKVVTGKCFIDRNHISDNVNVSVPFREPSRYGLGSETPS HPSRTPLHPFMTPMRDPGATPIHDGMRTPMRDRAWNPMSPTSDRGGDWEDGNPASWGSSP QYQPSSPRSRAYEAPTPGSGWTNTPSGNYSDAGTPRDNGSAYANAPSPYLPSTPGGQPPM TPSSAYIPGTPGGQPMTPGSGGLDMMSPIGGGDTEGPWLLPDILVNVRKSNDDTVIGVVH EVLAQDGSCSVGLGSSGNGDTIIAHPTEIDIIVPKKSDKIKIMGGPQRGATGKLIGVDGT DGIVKVDDTLDVKILDMVLLAKLAHA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g064700.3.1
Transcript Infomation	Transcription elongation factor SPT5 (AHRD V3.3 *** K4BT61_SOLLC)
Sequence	ATGCCGCGCCACCGGGACTACGACGACGATGACGATGAGCCAGAGGAGGAAGAAGAGGAC GTGTATGAAGAGGAGGACGAGGAGGAAGAGGACGATGGAGGGAAGGCTGGACGGAAACGT CGTAGATCAGATTTTATTGATGATGCGGCGGAGGAAGATGACGATGAGGATGAGGACGAT GATGATGAGGATTATGGCGGTGGAGGTGGAGGCGGTGGTGGGAGAAGACGACCTAAACGG AGGACTGCTTTTCTTGTGGTATCTTTCTCCCTGCATTGTCTTTTATCTGTTGTGGTTTTG ATTGTTAGATTTTCTTTTGCAGATTTCATAGTAGATAGTGGAGCAGATATTCCTGACGAG GATGGTGCCAGACGTGAATATCGTCACCGATTGTTGCCGCATGAGGACCAAGAAGAAGAC CTTGAGGAGCTTACGAGGAGCATTAAGCAAAGATATGCGAGGTCACCTCATGTTGAGTAT GATGAGGAAGCAACAGATGTTGAGCAGCAAGCTCTCTTGCCATCTGTCAGGGATCCAAAG CTCTGGATGGTGAAATGTGCGATTGGCCGTGAGAGAGAGGTTGCGGTTTGCCTAATGCAA AAGGCGATTGATAGAGGACCTGAATTGCAAATTCGATCAGTTGTAGCCCTTGATCATCTT AAGAACTATATATACATAGAAGCGGACAAAGAAGCTCACGTGAGGGAGGCGTGCAAGGGT ATGCGCAATATATATGCCTCTGCGAAAATAATGCTGGTCCCCATAAAGGAGATGACTGAT GTCCTTTCAGTTGAAAGCAAAGCGGTTGATCTTGCCAGGGATACTTGGGTCAGAATGAAG ATGGGAACTTACAAGGGAGACCTTGCAAAGGTTATGGATGTAGATAATGTGAGACAGAAA GTCGTCGTGAAATTAATCCCAAGGATTGATTTACAGGCTCTTGCGAACAAGTTGGAAGGG AGGGAAGCTCCAAAGAAAAAGGCATTTATTCCTCCACCACGCTTTATGAATATCGATGAA GCTAGAGAGATGAACCTACGTGTGGAACGTAGGCGAGACCCGATGTCAGGTGACTATTTT GAGAATATTGGAGGTATGATGTTCAAAGATGGTTTCTTGTATAAGACAGTGTCAATGAAA TCAATCAGGACCCTGAATATACAGCCAACTTTTGATGAACTTGAGAAATTCCGGCAAACT GGTGAGGGTGGGGATGGTGATATGGCTAGTCTATCTACTTTGTTTGCAAATAGGAAAAAA GGTCATTTTATGAAGGGTGACCGCGTTATTGTGGTGAAGGGGGATCTCAGAAACTTGAAA GGCCATGTTGAGAAAGTCGAAGAAGATACTGTTCATATCAGACCAAATCAGAAGGACCTT CCTTTGACTTTGGCTTTTAGTGACAAAGAGCTATGCAAGTACTTTGATCTTGGAAATCAC GTGAAAGTAGTATCTGGTTCATCTGAAGGTGCAACCGGTATGGTTGTCTCTGTTCAGGGA CATGTGGTTAACCTGGTATCTGATACAACAAAGGAGCTTCTCCGTGTATTTGCCGATAAT GTTGTTGAGAGTTCTGAAGTAACATCTGGTCTCACTCGTATTGGGGAATATGAGCTCCAT GATCTTGTAATTCTAGACAATAAGAGCTTTGGTGTGATTATTCGTGTAGACAGTGAAGCC TTCCAGGTCCTTAAGGGTGTGCCTGATAGACCTGAAGTAGCACTTGTTAGACTTAGAGAG ATCAAAGCGAAAGTTGAAAAGAAAGGAAATGCCCAAGATCGGTATAAGAACCACTTGGCG GTGAAAGACGTGGTAAAAGTTCTCGAGGGTCCTTGTAAAGGAAAACAAGGTCCTGTTGAA CACATCTTCAGAGGAGTAGTTTTTATTTATGATCGTCATCACCTTGAGCATGCTGGTTAT ATTTGTGCCAAAACCCAATCTTGTGTGTTGATTGGTGGCTCACGGGCAAATGGTGATAGA AATGGTAACCCCATGTCATCAAGATTTGCGCATATGAGACCTCCACCACGTGCTCCTCAA TCTCCAATGAGATCATCTAGAGGTGGCCCACCTATGAGTTATGGAGGCAGACATAGAGGT GGACGAGGGCACGATGCTTTAGTTGGAGCTGACGTGAAAATTCGCCTTGGACCATTCAAA GGCTGTAAAGGGCGTGTTGTTGATATCAAAGGAACTTCAGTCCGAGTTGAACTTGAAGCC CAGATGAAAGTTGTTACAGGCAAGTGTTTCATTGATCGCAACCATATCTCTGATAATGTT AACGTGTCAGTGCCGTTCAGGGAACCATCTAGATATGGTTTGGGAAGTGAAACACCATCA CATCCTTCAAGGACTCCACTGCACCCATTTATGACACCTATGAGAGATCCTGGAGCAACA CCTATCCATGATGGCATGAGGACGCCAATGCGTGACAGAGCATGGAATCCAATGAGTCCA ACTAGTGACAGGGGGGGTGATTGGGAAGATGGAAACCCTGCTTCCTGGGGGTCAAGTCCG CAATATCAGCCATCTAGTCCTCGTTCAAGGGCGTATGAAGCACCTACTCCTGGTTCTGGT TGGACTAATACACCTAGCGGTAATTACAGTGATGCTGGTACCCCAAGAGACAATGGTTCT GCATATGCTAATGCTCCAAGTCCTTACTTGCCATCAACTCCTGGTGGACAACCACCAATG ACACCAAGTTCAGCATATATACCTGGTACTCCTGGTGGGCAGCCAATGACTCCTGGAAGT GGTGGGCTGGATATGATGTCACCTATAGGAGGTGGGGATACAGAAGGTCCTTGGCTCTTG CCTGATATCTTGGTCAATGTACGGAAGTCCAATGATGATACTGTCATCGGAGTTGTCCAT GAGGTGTTAGCGCAGGATGGTTCCTGTAGTGTTGGTCTTGGATCAAGCGGCAATGGTGAC ACTATCATTGCGCACCCAACTGAAATTGATATAATTGTACCAAAGAAGTCTGATAAAATC AAGATAATGGGTGGTCCTCAACGTGGTGCAACCGGCAAGCTTATTGGTGTTGATGGCACT GATGGGATTGTAAAGGTGGATGATACCCTTGATGTTAAAATTTTAGACATGGTACTTTTG GCCAAGTTAGCGCATGCATAGTGACAAGCAATTCTAGTTAGTGAACAAGTTGTGATCAAT AGTTGTATTATATTTTCATGTTATGCTCATGAGTTTCAAGTGTTTACTTTGTTCCTTTAT GTTTGAACGGAACTATGCAAATGCATTTTCAAAAGAATCGTTTAAAAGGGGATTTTCATG TTCAAGTGAAACTCCGGAGGCCATCGTTTCTGATGTGTTTGTTTATTTGGGTTTGAATTG AACGCCTCCAGTGGTCCTCTCTTGAAAATTGTCATAAAAAATGATTAATGGTTGTGTGAG AGTATAACCTGCAGCCTAAGTCCAAATGCTGTCTCTCTTTTTGTGCTTCTTCGAGATTGA GAGAGGTGAGTGGGATGGGGGTGGGAGAGAGAATGAATATGTATGTTGTATCATGAATAC AATCTATACATAATATATATATCGTTGTTAGAATACAAATCTAATCTCTCTCTCACTTAT ATTTGATGGGATACAATTGTTGTACTTGTATCATGAATACAGTCAATACATATTATAAAC ATTGTTGTTAGAATACAAATTTCATCTCTGTCACTTATATTTTATTGAATACAAAATAAA TTTGATATTGAGAATTGATACATATTATATTCGATGTACCCCAAACACAGTGATTCTTAA GTACAAGTAAAAATTTGCTCCATCATCTGGATCTATTGATACAAGTTAAAAATATGTGAT ATCTACTCATTACGTGATGGTGATATAAAGTGTAATGAAAT