Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g063270.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IJY6_POPTR)
Sequence	ATGATAAAATCCAGCTTTACCTCCAAAACCCAACAACTCATAGATCTTCTCAGTTCTTGT TCTTCTCTAAAACATGTTTACCAAATTCATACTCAAATCGTAATCTCAGGACTATCTCAA CAAAATTGCATCCTCCTCAAAATTGTCAACTTTTTTGCTTCTCATACTCCAATAAACTCA TCTTCTTACGTCGCTCTTGTCATCAAACAATCCCAAAATTCATCTAATTCTTGGTGGAAT ATCCTCATTAGGAATTATGCTAAACATAGTGAAGCCATTCGATTTTTTGTTGAAATGCGG CGTTCTGGAGTTGTTTCTGATGAATTCACATACCCTTTTCTCTTCAAAGCTTGTTCGTCT TTTATGGGTTTGAAAGAAGGAAAACAGATTCATTGCGATGTCATCAAGATGGGTATTTGT AAAAACGTGTATGTACAGAATACTTTGATTTATTTTTATGGGTCTTGCAACAAGATTATG GAAGCATACAAGGTGTTTGATGTAATGCCGCTTAGAACTGTTGTTTCTTGGAATTCGATA ATTTCGGCTTGTGTTGAAAGCTGTTGGTATTATGATGCGATTGAGATTTTTCGTTTGATG AGAAAATGTGGGGTTCGACCGGATGAGACAACGATGGTGATTTTGCTTTCTGTTTGTGCT GAGTTGGGAGATTTGAGTTTAGGGAAATGGATTCATTGTCAAGTGATTGAGCAAGGGATG TATGTGAATTGTCAATTGGGAACTTCTCTTGTTGACATGTATGCTAAATGTGGAGCAGTC GATTATGCTCGTTTGATCTTCGATAGGATAGGCGAAAGAAATGTGTGGACATGGAGTGCG ATGATTCTTGGATCAGCTCAGCATGGATTTGCTGCACAAGCCTTGGAACTCTTTTGGAAA ATGAAGGATTGTTCTGTGAAGCCTAATTTTGTGTCCTTTCTTGGTGTGCTTTGTGCCTGT AGCCATGTTGGGATGGTGGAAGAAGGGTATCGTTTGTTTCAAGAGATGGAAACTCTCCAT AGCATCAAACCTATGATGGCACATTATGGTGCCATGGTAGATATCTTGAGTCGTGCTGGT CGTCTAGAAGAAGCACACAAATTCATACTTGACATGCCCATTGAGGCTGATGCAGTCATA TGGAGGACATTGCTCAGTGCATGCCACATTCATGATATTAGCGTCGATACTGGAGTGGGA GAGAAGGTCAGAAAGAGGTTACTTGAATTGGAGCCTAAAAGGAGTGGGAATTTGGTCATG TTAGCAAATAAGTATGCTGAAACTGGATTATGGGACAAAGCAGCAACATTGAGAAGAGGA ATGAAAGAGAGACGACTTAAGAAGATCGCTGGAGAAAGCTGTGTATCAGTTTTTCAGAAT CGATAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g063270.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IJY6_POPTR)
Sequence	MIKSSFTSKTQQLIDLLSSCSSLKHVYQIHTQIVISGLSQQNCILLKIVNFFASHTPINS SSYVALVIKQSQNSSNSWWNILIRNYAKHSEAIRFFVEMRRSGVVSDEFTYPFLFKACSS FMGLKEGKQIHCDVIKMGICKNVYVQNTLIYFYGSCNKIMEAYKVFDVMPLRTVVSWNSI ISACVESCWYYDAIEIFRLMRKCGVRPDETTMVILLSVCAELGDLSLGKWIHCQVIEQGM YVNCQLGTSLVDMYAKCGAVDYARLIFDRIGERNVWTWSAMILGSAQHGFAAQALELFWK MKDCSVKPNFVSFLGVLCACSHVGMVEEGYRLFQEMETLHSIKPMMAHYGAMVDILSRAG RLEEAHKFILDMPIEADAVIWRTLLSACHIHDISVDTGVGEKVRKRLLELEPKRSGNLVM LANKYAETGLWDKAATLRRGMKERRLKKIAGESCVSVFQNR*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g063270.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IJY6_POPTR)
Sequence	ATGATAAAATCCAGCTTTACCTCCAAAACCCAACAACTCATAGATCTTCTCAGTTCTTGT TCTTCTCTAAAACATGTTTACCAAATTCATACTCAAATCGTAATCTCAGGACTATCTCAA CAAAATTGCATCCTCCTCAAAATTGTCAACTTTTTTGCTTCTCATACTCCAATAAACTCA TCTTCTTACGTCGCTCTTGTCATCAAACAATCCCAAAATTCATCTAATTCTTGGTGGAAT ATCCTCATTAGGAATTATGCTAAACATAGTGAAGCCATTCGATTTTTTGTTGAAATGCGG CGTTCTGGAGTTGTTTCTGATGAATTCACATACCCTTTTCTCTTCAAAGCTTGTTCGTCT TTTATGGGTTTGAAAGAAGGAAAACAGATTCATTGCGATGTCATCAAGATGGGTATTTGT AAAAACGTGTATGTACAGAATACTTTGATTTATTTTTATGGGTCTTGCAACAAGATTATG GAAGCATACAAGGTGTTTGATGTAATGCCGCTTAGAACTGTTGTTTCTTGGAATTCGATA ATTTCGGCTTGTGTTGAAAGCTGTTGGTATTATGATGCGATTGAGATTTTTCGTTTGATG AGAAAATGTGGGGTTCGACCGGATGAGACAACGATGGTGATTTTGCTTTCTGTTTGTGCT GAGTTGGGAGATTTGAGTTTAGGGAAATGGATTCATTGTCAAGTGATTGAGCAAGGGATG TATGTGAATTGTCAATTGGGAACTTCTCTTGTTGACATGTATGCTAAATGTGGAGCAGTC GATTATGCTCGTTTGATCTTCGATAGGATAGGCGAAAGAAATGTGTGGACATGGAGTGCG ATGATTCTTGGATCAGCTCAGCATGGATTTGCTGCACAAGCCTTGGAACTCTTTTGGAAA ATGAAGGATTGTTCTGTGAAGCCTAATTTTGTGTCCTTTCTTGGTGTGCTTTGTGCCTGT AGCCATGTTGGGATGGTGGAAGAAGGGTATCGTTTGTTTCAAGAGATGGAAACTCTCCAT AGCATCAAACCTATGATGGCACATTATGGTGCCATGGTAGATATCTTGAGTCGTGCTGGT CGTCTAGAAGAAGCACACAAATTCATACTTGACATGCCCATTGAGGCTGATGCAGTCATA TGGAGGACATTGCTCAGTGCATGCCACATTCATGATATTAGCGTCGATACTGGAGTGGGA GAGAAGGTCAGAAAGAGGTTACTTGAATTGGAGCCTAAAAGGAGTGGGAATTTGGTCATG TTAGCAAATAAGTATGCTGAAACTGGATTATGGGACAAAGCAGCAACATTGAGAAGAGGA ATGAAAGAGAGACGACTTAAGAAGATCGCTGGAGAAAGCTGTGTATCAGTTTTTCAGAAT CGATAG