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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g054290.2.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HFU9_POPTR)

Sequence

ATGGATCATCAAAACTCGCAATCGTTTGCGTCTCAGTCACATTTCTATGTATCATTTCTC
CAAGACAGCTTGAAATCGAAAGTCCCATTTCCCATAAAGTTAATCCATGGCCGTATAATC
AAATCAGGCATCCATTTAAGTGTTTTCCTTATGAATAATCTCATAAATGGGTATGCGAAA
ACCGGGTTTTTATCCTATGCTCGTAAAGTGTTTGATGTAATGCCTGTGAGAGATTCTTCT
TCTTGGAATACACTTTTATCTGGTTATTCAAAAGGGGGTTTAATTAATGAAGCACATTCA
ATTTTTAGGGAAATGCCTTACCAGGATTCGGTGTCGTGGACTACTATGATTGCTGGGTGC
AATTTTGTTGGTAGTTTTCAGGTTGCAATTCAGATGTTTCTTGAGATGGTTAGTGTATCT
GATGTTTCGCCAACACAGTACACATTTACGAGTGTTCTTGCGTCGTGTGCTGAGATTAGA
GCGTTAAACGAGGGACGGAGAGTTCACTCCTTTGTTGTTAAATTTGGGTTGAGTAGTTAT
GTTTCTGTAGCAAATTCTATGTTGAATATGTATGCTAAGTCAGGGGATAGAAATGCAGCT
CAAATGGTATTTGATGGGATAGTAGTGAAGAACACGTCGAGTTGGAATACATTGATCTCG
TTGTATATGCAAACTGGTCAGGTGGATTTAGCGTTGGAACAATTCGAGCAAATGAATGAG
CATGACATAGTTTCGTGGAACTCAATGATTACGGGCTATAATCAGCACGGCTTTGACGTT
CTAGCTCTTAGTATGTTCTCTAAAATGCTTAAAGAATCGTTGCTGGAGCCTGATAGATAT
ACTTTAGCAAGTGCTTTATCAGCTTGTGCTAATCTTGGAGAATTAAATGTAGGAAAACAA
ATACATGCTCATCTCATCAGAACTGAATTCGACACATCAGGAGCTGTTGGAAATTCTTTG
ATTTGCATGTATTCCCGGAGCGGTGGCGTAGACATTGCTAGAAGAATTTTAGAGAAAAGT
AGAGAGTCCAATCTAAATGTAATTGCGTTTACATCACTACTGGATGGGTACATAAAGCTT
GGTGATATAAGTCCAGCAAGGAAGCTTTTTGACTCATTGAAGGACCGTGATGTTGTCGTT
TGGACAGCCATGATTGTTGGTTATGTTCAAAATGGCTTTAATGATGATGCGATGGAACTC
TTTAGGTTAATGGTTAAAGAAGGGCCAGACCCAAATAATTATACTCTAGCAGCAATGTTA
AGTGTATGTTCAAGCGTGGCATCGTTAAATCATGGTAAGCAAATACACTCAGCAGCCATT
AAGGCAGGGGAAGCATTATCAGTTTCTGTTAGCAATGCCCTGGTAACTATGTATGCCAAG
GCTGGAAATATCAGCTGCGCAAGGAGAGTATTTGATTTGATACACCTGAACAGAGACACA
GTCTCTTGGACTTCGATGATCTTGGCTTTAGCTCAGCATGGACTTGGAGCTGAAGCCTTA
CAATTGTTTGAGAATATGCTTGCACTTGGGATGAAGCCTGATCATATAACGTATGTTGGT
GTTCTTAATGCTTGCACACATGTCGGATTGGTTGCTCAAGGCCGTAATTATTACAAAATG
ATGAAAGAGATTCATGGAATTGAACCGACGTCAAGCCATTGTGCTTGCATGATTGACCTG
TTTGGTCGTGCTGGATTGCTAGAAGAAGCACAAGACTTCATAGAAAATATGCCAATCGAA
CCAGATGTGATTGCATGGGGTTCGCTTTTAGCATCTTGTAGAGTTCACAAAAAAATGGAG
CTAGCAAAAGTTGCAGCTGACAGATTGCTTTCAATTGATCCGGAAAACAGTGGGGCCTAC
TCAGCACTTGCTAATGTGTATTCTGCTTGTGGAAAATGGGCGGAAGCTGCTAAGATCAGA
AAATCAATGAAGGATAAACAGGTCAAGAAAGAACAAGGATTTAGCTGGATTCAAATAAAA
AACGTAGTCCACGTCTTTGGTGTAGAAGACGGGCTTCATCCGCAGAGAGATGCTATTTAC
AAGACAATGGAAAAAATCTGGAAAGATATCAAAAAGATGGGATTCATTCCTGACACCGAG
TCGGTGCTTCATGATCTTGATTACGAGGTGAAAGAGCAGATTCTTAGACATCATAGTGAG
AAGCTTGCAATTGCATTTGGGTTAATAAATACCCCGGAGAACACTACTTTAAGGATCATG
AAGAACCTTCGAGTCATGAACCAAATTTTATCTAAAATTCCACATCAGAGCATCTCTGGA
GAAAATTCCGAAGGAGGTTCGAGAAATTCATACATAAAGACTCAGACGTTATCTTGGAGC
ATTGATTCTGCAGGATTCCACACGACTAATCTCTTGGATGAACTATGGTCTCTCCTTCAT
CTCTCAGTACACCAAGTCAGATGTAGAATACATGATTTCCCTTTGCTGTTGCTCTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g054290.2.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HFU9_POPTR)

Sequence

MDHQNSQSFASQSHFYVSFLQDSLKSKVPFPIKLIHGRIIKSGIHLSVFLMNNLINGYAK
TGFLSYARKVFDVMPVRDSSSWNTLLSGYSKGGLINEAHSIFREMPYQDSVSWTTMIAGC
NFVGSFQVAIQMFLEMVSVSDVSPTQYTFTSVLASCAEIRALNEGRRVHSFVVKFGLSSY
VSVANSMLNMYAKSGDRNAAQMVFDGIVVKNTSSWNTLISLYMQTGQVDLALEQFEQMNE
HDIVSWNSMITGYNQHGFDVLALSMFSKMLKESLLEPDRYTLASALSACANLGELNVGKQ
IHAHLIRTEFDTSGAVGNSLICMYSRSGGVDIARRILEKSRESNLNVIAFTSLLDGYIKL
GDISPARKLFDSLKDRDVVVWTAMIVGYVQNGFNDDAMELFRLMVKEGPDPNNYTLAAML
SVCSSVASLNHGKQIHSAAIKAGEALSVSVSNALVTMYAKAGNISCARRVFDLIHLNRDT
VSWTSMILALAQHGLGAEALQLFENMLALGMKPDHITYVGVLNACTHVGLVAQGRNYYKM
MKEIHGIEPTSSHCACMIDLFGRAGLLEEAQDFIENMPIEPDVIAWGSLLASCRVHKKME
LAKVAADRLLSIDPENSGAYSALANVYSACGKWAEAAKIRKSMKDKQVKKEQGFSWIQIK
NVVHVFGVEDGLHPQRDAIYKTMEKIWKDIKKMGFIPDTESVLHDLDYEVKEQILRHHSE
KLAIAFGLINTPENTTLRIMKNLRVMNQILSKIPHQSISGENSEGGSRNSYIKTQTLSWS
IDSAGFHTTNLLDELWSLLHLSVHQVRCRIHDFPLLLL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g054290.2.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9HFU9_POPTR)

Sequence

ATGGATCATCAAAACTCGCAATCGTTTGCGTCTCAGTCACATTTCTATGTATCATTTCTC
CAAGACAGCTTGAAATCGAAAGTCCCATTTCCCATAAAGTTAATCCATGGCCGTATAATC
AAATCAGGCATCCATTTAAGTGTTTTCCTTATGAATAATCTCATAAATGGGTATGCGAAA
ACCGGGTTTTTATCCTATGCTCGTAAAGTGTTTGATGTAATGCCTGTGAGAGATTCTTCT
TCTTGGAATACACTTTTATCTGGTTATTCAAAAGGGGGTTTAATTAATGAAGCACATTCA
ATTTTTAGGGAAATGCCTTACCAGGATTCGGTGTCGTGGACTACTATGATTGCTGGGTGC
AATTTTGTTGGTAGTTTTCAGGTTGCAATTCAGATGTTTCTTGAGATGGTTAGTGTATCT
GATGTTTCGCCAACACAGTACACATTTACGAGTGTTCTTGCGTCGTGTGCTGAGATTAGA
GCGTTAAACGAGGGACGGAGAGTTCACTCCTTTGTTGTTAAATTTGGGTTGAGTAGTTAT
GTTTCTGTAGCAAATTCTATGTTGAATATGTATGCTAAGTCAGGGGATAGAAATGCAGCT
CAAATGGTATTTGATGGGATAGTAGTGAAGAACACGTCGAGTTGGAATACATTGATCTCG
TTGTATATGCAAACTGGTCAGGTGGATTTAGCGTTGGAACAATTCGAGCAAATGAATGAG
CATGACATAGTTTCGTGGAACTCAATGATTACGGGCTATAATCAGCACGGCTTTGACGTT
CTAGCTCTTAGTATGTTCTCTAAAATGCTTAAAGAATCGTTGCTGGAGCCTGATAGATAT
ACTTTAGCAAGTGCTTTATCAGCTTGTGCTAATCTTGGAGAATTAAATGTAGGAAAACAA
ATACATGCTCATCTCATCAGAACTGAATTCGACACATCAGGAGCTGTTGGAAATTCTTTG
ATTTGCATGTATTCCCGGAGCGGTGGCGTAGACATTGCTAGAAGAATTTTAGAGAAAAGT
AGAGAGTCCAATCTAAATGTAATTGCGTTTACATCACTACTGGATGGGTACATAAAGCTT
GGTGATATAAGTCCAGCAAGGAAGCTTTTTGACTCATTGAAGGACCGTGATGTTGTCGTT
TGGACAGCCATGATTGTTGGTTATGTTCAAAATGGCTTTAATGATGATGCGATGGAACTC
TTTAGGTTAATGGTTAAAGAAGGGCCAGACCCAAATAATTATACTCTAGCAGCAATGTTA
AGTGTATGTTCAAGCGTGGCATCGTTAAATCATGGTAAGCAAATACACTCAGCAGCCATT
AAGGCAGGGGAAGCATTATCAGTTTCTGTTAGCAATGCCCTGGTAACTATGTATGCCAAG
GCTGGAAATATCAGCTGCGCAAGGAGAGTATTTGATTTGATACACCTGAACAGAGACACA
GTCTCTTGGACTTCGATGATCTTGGCTTTAGCTCAGCATGGACTTGGAGCTGAAGCCTTA
CAATTGTTTGAGAATATGCTTGCACTTGGGATGAAGCCTGATCATATAACGTATGTTGGT
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ATGAAAGAGATTCATGGAATTGAACCGACGTCAAGCCATTGTGCTTGCATGATTGACCTG
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CCAGATGTGATTGCATGGGGTTCGCTTTTAGCATCTTGTAGAGTTCACAAAAAAATGGAG
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AAATCAATGAAGGATAAACAGGTCAAGAAAGAACAAGGATTTAGCTGGATTCAAATAAAA
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AAGACAATGGAAAAAATCTGGAAAGATATCAAAAAGATGGGATTCATTCCTGACACCGAG
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GAAAATTCCGAAGGAGGTTCGAGAAATTCATACATAAAGACTCAGACGTTATCTTGGAGC
ATTGATTCTGCAGGATTCCACACGACTAATCTCTTGGATGAACTATGGTCTCTCCTTCAT
CTCTCAGTACACCAAGTCAGATGTAGAATACATGATTTCCCTTTGCTGTTGCTCTAGTTT
GTGATGCAGAAGGGAAGTGGATGGTGAACCAAAAGTGTAGACGAGGTTTGAGGAAACTTG
ATTCACACTTGTAACTACTTTGCATGTACGATGATAGTGCAGTTGCTCGTGTTGCCTTTA
GCATAAGGTCAAGATATCAACATATCTGCATCTTATATCAATACTACTACAACAACAACG
AACATAGTGTAATCCGAATTGGGAATCTAGGGAGGATAGAGTGTATGCAGACCTTACACC
TACCTCGTGGAGGTAAGAGGCTTTTGCTTATATCAATAAAACTGTTTAATCCTGAATTTC
AGATCATTCTTAGAATTTTGTATTTGGTAAATCACGTGTTTGTTCTTCCTTTTTTCTGCA
AGGGGCGAGCTGATTGTGTAACAAAATGGAGAGAACTAGTGTATGACGACAATAATGCTG
AAATGCAGGGACAGTTTATTCTGCATTCTTCGAGTTGTCTTTGTTGTTTAATAGTGAATC
AGTACTATCATAACCAGAAAAAACAGTACAAACTTAGCAATTTTAAACATTTTGTTGAGC
TGGTAACTGATATACCAGTTATAAATTCAAGAAATGAACCACAAATGGTGGTTTGATGTT
TTTTCCTTCTTGTTTAATTTAGCTGTCTTACTGACTAAAGTTTCGTAGACAAATTATTTT
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CAGCAAATGTGTCTCAGCCTAGATTGACTAACCTAACTCACCCTTAAGGAGGTTTTTCCA
TAGTTGAGTGTCTACTTTAGTGTGCTTCACAAAGACTGGTAGGTTTGATAATATCCAAAA
CAAATAAAAAGAGATCGAGGTTTATATTGGAAAATACCAGAACACATATAAGATAGTGCT
CCGATGGCAGTGGGAGCACATTGCACAATTGAGATAATTTCAACTATTTCAAAAGAAAAA
TAAGCAAGTTAGTGCTCAGTAAGCATGACATAGCTATCTGTCCTAGGTACGGTCTTTCTT
TTAGTATTTCATTTTGGCTCGACCAATCTAGATTAGGCGCTCAAAAAATCTCATTTTTGG
GAGGTAAAGTATTTCCTACCAACATTCCCGAGTTCAAATCCTAATACGAAGGAATACTTA
CCATCCGATAGTCAATATATAATTTTCCAAGCTCCTAGATTTTACATACTAAAATATAGA
TGG