Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g051310.3.1
CDS Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT5G16520.1)
Sequence	ATGCAATGTCCCAGCAACTCCTTTCGCTACAATGCTACACAATGCGAGTGCAACCCTGGT TACTTGTTTAACTTCACAAGTAGAATATGTTACTTGTTTGATGAATGGGGTCCTGTGGAA AGTGATTCTGGGGTTGATTATAGATCTTTATCGTTTCCTGGAAGTGGTGCCCTTTTCGAT TTTGATTCAATTAGGAGGTTAACTCAATCGCAAGCTGTCTTTCTTGAAGCTACTCTTATT ATGTTGCTTTCTTGGCTTTGTTTCTGTTTTTTTGCTCGGTGTGCTCCGCTTGGTGATGGC CGTTCTATTTGGTTTAAGATCCGATGGTGGATTAGTCGACTTGATATCTGCTTTGCATCT CGGCACTGGCTTGATGACCAGAAGGTAGTCATGAAGCGGAAAACAGAGCTTGGTGGAACT TTTTCAATAGCTAGCTGGATACTTTTTATTGGTCTTTTTGCTGCTTTGCTATACCATATA ATAGCGAAGCGAGCTATTGAGATGCACAATGTGAGAGCAACAAATGCACCTGATTTAGCT GCTTTTATAAACGATTTGGAGTTTAATATCACTACAATCTCAAGTATGAGCTGCCTACAC TTACGTGGTCTTGGAACAGTCGTAACTGGGAATCCAGGGTTGATTGACTATCGATTTGCT CCTCTTTCAACATTTGCCAACTATTCCTGTATAAACACAACTAAGGGACCGACCATTATG CTCAAGTGCAGCAGATGTCCACTTAGCCGGGACAATGCCTATATTTCATGGCAATTTGTT GATCTCCCAAATAGTCCTGCAGCAGCTGCTGGATTTCAGTTCAATCTAACAGCAACAGAT CCTAAAAACAGGAAACATGTTAGCTTGGTCAGTGGGACACTGAGAAATGGAAGCAATTTT GACGACAAACCAGTTACATTTAGAGGGCTGACACCAAATATATTGAAGTTCAATTTTTTT CCGAGATTGTACCATAATTTGAATGACCTGAAGCTCATCCAACCACTACTTCATGAGTTT CTCCCAGGTTCCTCTTTTGATGAGGTAAGTCAACTCCAAGCATCACTCGAACGCCCCAAC GATGGTCTAATCAACACGACATTGTACATCAATTTCCTATCTTCATATATTGTTGAGATA AAGGATCAAAATGTTATGGGACCTGAAGTTTTTTTGGGCAATGTTTTGATGATATCTTCC TCTCCCAAGAGTGCAGTAAGCTTCCTTGCAGATGTTGGTGGCCTTTATTGCGTTAGTATT GGCCTCTTCTTCTACATTTTGGTGCAGTGTGAATATAGGATAAAGAAATTGCGCAATGAG GATAGTGTGATGCGAAAGGTTAGAAGTCGCCGAAAAGCTCAAGACCGCTGGGATAAATTG AGGAAATATGTGATGTACACGTACGCTCCTAACCAATTGGAAGAGGAGTATGACATGAGA AATGATGGTTGTTGCACAGGCGTCAAGATGGAATCACTCCAAAAAAAGAGCTCTTCAGTT AGAGGAAAAGGGTCTAGCAGATTAGATACTATCAGTTTTAGCAGAAAAGTTGGCTTACCT AGTGAGAAGAGGGCCATTCCAGAGAAGATTGATACTCAAAGTGCGACATATATTTTGCCT GTATCTGCAACAGATCTCCAAAAGAATACACATCTGAAGGAAAAAAGATTCCAAGAAAAT GCTGTACCTCCAAACACAAAAGGTAGAAATCCTGAAGACATAGTTGCTCCAGATGTAGAG AATGCTCTTCAGGCTCCAGCTTTTCCTGCAGCTAATGACATAACTGTTCCGCCTCCGCCC CTTTTAAAATTGCAGGCTGCTGATCATGTAAGTATGACCAATCTCCAGAAAGATCTCCAA AACCTCTATGAATATAATATGATGCTCAGGGAAAAGTTGATTGCTGCCCAATCGATGCTT CATTCATTAGCCATCAAGGAGTCAACTTTAGCAGCTGATAATGGCGATATTATTACTAGA GAATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g051310.3.1
PEP Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT5G16520.1)
Sequence	MQCPSNSFRYNATQCECNPGYLFNFTSRICYLFDEWGPVESDSGVDYRSLSFPGSGALFD FDSIRRLTQSQAVFLEATLIMLLSWLCFCFFARCAPLGDGRSIWFKIRWWISRLDICFAS RHWLDDQKVVMKRKTELGGTFSIASWILFIGLFAALLYHIIAKRAIEMHNVRATNAPDLA AFINDLEFNITTISSMSCLHLRGLGTVVTGNPGLIDYRFAPLSTFANYSCINTTKGPTIM LKCSRCPLSRDNAYISWQFVDLPNSPAAAAGFQFNLTATDPKNRKHVSLVSGTLRNGSNF DDKPVTFRGLTPNILKFNFFPRLYHNLNDLKLIQPLLHEFLPGSSFDEVSQLQASLERPN DGLINTTLYINFLSSYIVEIKDQNVMGPEVFLGNVLMISSSPKSAVSFLADVGGLYCVSI GLFFYILVQCEYRIKKLRNEDSVMRKVRSRRKAQDRWDKLRKYVMYTYAPNQLEEEYDMR NDGCCTGVKMESLQKKSSSVRGKGSSRLDTISFSRKVGLPSEKRAIPEKIDTQSATYILP VSATDLQKNTHLKEKRFQENAVPPNTKGRNPEDIVAPDVENALQAPAFPAANDITVPPPP LLKLQAADHVSMTNLQKDLQNLYEYNMMLREKLIAAQSMLHSLAIKESTLAADNGDIITR E*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g051310.3.1
Transcript Infomation	transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT5G16520.1)
Sequence	GTTATTATAAGTGGAATGTTGTTAATTGTTATAGAGAAATAAAATATAACATGAAAAATA TTTTAAAAAAAGTAGACCATTGTTGTGAAATGCTATTATAACAAATGACGGTTATAGAAA AATTTACATGTATAAGATAAGATAAAAAATAAATTATATTCAAACTATTTATTGATTAAA ATAACTTATACATTATATTACAGATCATGCTCAGGGACGAAGCTATATGGAGTCGAGGGA AACCCCTTTATTGAAAATTAACATACATATATATATATATTTGTAATTTTAATTATTAAT ATTTTCTAAATAAATGTAGCTTCTATGTTATCATTTCGTTTGAAAACTTGATTGAGATTT TCATATTTTAAATCCTTAATTACAATACATTCTATCTATTGTGTAACTATATGATTTGTT AACTTCCTCTCTTTTGTTGTTCATGCTGAGATAAATTTAAATTTTATCTAATTATTTATA TCTAATTCAACTTATTCATATCTGATTCAACTTAGAAATCATTAATTTCTTTTTGAATAT CTCAGTGAAAATTCTTTCTCCACGACTTCCGATGTCTTTCCTTGCAATTTCCTTAGAAAT ATGAGGGTTTGATGAAGGATTGAATAATCTTTGAAACCAAGTTAGGAATTTGCAAGAAAA TTGGATTTGGACTTTTCTTTAAACCAAATAAGGCAGCTACCGCGTATTGATTTTGCACTT TTTCTTCTTTAGCATTGTTCGTCACATTTGTTCTGACTTCTCTCTCTTTTGTCGCCCACC ATACATATATTCTTTACTTCTCCTCTCCATTTTCTTCACTTTGATGCGAAGAAGAAAATG CAATGTCCCAGCAACTCCTTTCGCTACAATGCTACACAATGCGAGTGCAACCCTGGTTAC TTGTTTAACTTCACAAGTAGAATATGTTACTTGTTTGATGAATGGGGTCCTGTGGAAAGT GATTCTGGGGTTGATTATAGATCTTTATCGTTTCCTGGAAGTGGTGCCCTTTTCGATTTT GATTCAATTAGGAGGTTAACTCAATCGCAAGCTGTCTTTCTTGAAGCTACTCTTATTATG TTGCTTTCTTGGCTTTGTTTCTGTTTTTTTGCTCGGTGTGCTCCGCTTGGTGATGGCCGT TCTATTTGGTTTAAGATCCGATGGTGGATTAGTCGACTTGATATCTGCTTTGCATCTCGG CACTGGCTTGATGACCAGAAGGTAGTCATGAAGCGGAAAACAGAGCTTGGTGGAACTTTT TCAATAGCTAGCTGGATACTTTTTATTGGTCTTTTTGCTGCTTTGCTATACCATATAATA GCGAAGCGAGCTATTGAGATGCACAATGTGAGAGCAACAAATGCACCTGATTTAGCTGCT TTTATAAACGATTTGGAGTTTAATATCACTACAATCTCAAGTATGAGCTGCCTACACTTA CGTGGTCTTGGAACAGTCGTAACTGGGAATCCAGGGTTGATTGACTATCGATTTGCTCCT CTTTCAACATTTGCCAACTATTCCTGTATAAACACAACTAAGGGACCGACCATTATGCTC AAGTGCAGCAGATGTCCACTTAGCCGGGACAATGCCTATATTTCATGGCAATTTGTTGAT CTCCCAAATAGTCCTGCAGCAGCTGCTGGATTTCAGTTCAATCTAACAGCAACAGATCCT AAAAACAGGAAACATGTTAGCTTGGTCAGTGGGACACTGAGAAATGGAAGCAATTTTGAC GACAAACCAGTTACATTTAGAGGGCTGACACCAAATATATTGAAGTTCAATTTTTTTCCG AGATTGTACCATAATTTGAATGACCTGAAGCTCATCCAACCACTACTTCATGAGTTTCTC CCAGGTTCCTCTTTTGATGAGGTAAGTCAACTCCAAGCATCACTCGAACGCCCCAACGAT GGTCTAATCAACACGACATTGTACATCAATTTCCTATCTTCATATATTGTTGAGATAAAG GATCAAAATGTTATGGGACCTGAAGTTTTTTTGGGCAATGTTTTGATGATATCTTCCTCT CCCAAGAGTGCAGTAAGCTTCCTTGCAGATGTTGGTGGCCTTTATTGCGTTAGTATTGGC CTCTTCTTCTACATTTTGGTGCAGTGTGAATATAGGATAAAGAAATTGCGCAATGAGGAT AGTGTGATGCGAAAGGTTAGAAGTCGCCGAAAAGCTCAAGACCGCTGGGATAAATTGAGG AAATATGTGATGTACACGTACGCTCCTAACCAATTGGAAGAGGAGTATGACATGAGAAAT GATGGTTGTTGCACAGGCGTCAAGATGGAATCACTCCAAAAAAAGAGCTCTTCAGTTAGA GGAAAAGGGTCTAGCAGATTAGATACTATCAGTTTTAGCAGAAAAGTTGGCTTACCTAGT GAGAAGAGGGCCATTCCAGAGAAGATTGATACTCAAAGTGCGACATATATTTTGCCTGTA TCTGCAACAGATCTCCAAAAGAATACACATCTGAAGGAAAAAAGATTCCAAGAAAATGCT GTACCTCCAAACACAAAAGGTAGAAATCCTGAAGACATAGTTGCTCCAGATGTAGAGAAT GCTCTTCAGGCTCCAGCTTTTCCTGCAGCTAATGACATAACTGTTCCGCCTCCGCCCCTT TTAAAATTGCAGGCTGCTGATCATGTAAGTATGACCAATCTCCAGAAAGATCTCCAAAAC CTCTATGAATATAATATGATGCTCAGGGAAAAGTTGATTGCTGCCCAATCGATGCTTCAT TCATTAGCCATCAAGGAGTCAACTTTAGCAGCTGATAATGGCGATATTATTACTAGAGAA TGATTATGCTCAATTAAGGTTGTAGGTGTGTGGATGAACAAAAGCAAGAAAATGGCTGCT ACTTATCTGAACATTCAAAATTCTATTCTCTTGAATGTTCTGAGAGCTCTGGTGCAGATG TTGGGACTTTTGGTTTCTGTGGAGTTGCAGTAGTACTTTGTTAGTAGAACAAGTACTGAA TGCAACACTGCCAAGGTGATGAAGTACTGTCCTCTGTGCTGTACATTGTGTATTCAGATG CATTATCACCTGATGATTGTTGGAGTGGCTGAAGCCGATGTCTTCTGTTTGTTGTATAAT TTTAGTGTGGAGTATTCTTTTGGGAGCAGGATTGTGTTCCTTAATGAGTTAAACATTTGA ATGTACATTATGTAGGATTAGGACAATGATTTAAGGAAATTCGATTGTGATATTAGTGTG CATTGGATACAGTAATTATTAAACCATATAAATCTACCCAAGACAGTTCTGCAGAAATGT ATTTTGGTATTCCTTATTCTGTTTCTC