Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g039670.3.1

CDS Infomation

ATP-citrate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHC9_RICCO)

Sequence

ATGGCCCGCAAGAAGATCAGAGAATATGATTCGAAAAGATTGTTGAAAGAACACTTTAAG
AGGCTTGCTGGTTATGATTTGGCCATCAAATCTGCCCAGATTACAGAGTCAACTGATTTG
AATGAGCTTGTAGAGAAAGAGCCATGGGTTTCTTCAAAAAAATTGGCGGTAAAGCCTGAT
ATGTTATTTGGGAAGCGTGGAAAAAGCGGGCTAGTTGCCTTGAATCCTGATCTGGCTCAA
GTTGCTCTTTTGTTGAAGGAACGGTTAGGCAAAGAGGTTGACATGAGTGGATGCAAAGGG
CCCATCACAACCTTTATTGTTGAGCCATTTGTACCTCACAATGAGGAGTTTTACCTAAAT
ATTGTTTCAGACAGACTTGGTTGTAGTGTTAGCTTTTCTGAATGTGGAGGAATAGATATT
GAAGAGAACTGGGACAAGGTTAAGACAATCTTTGTGCCAACAGGGACATCTTTTACATCA
GAGATTTGTGCACCACTTGCTGCTACTCTACCACTAGAGATTAAAGGTGTAATTGAGGAG
TTCCTCAAAGATGTCTATACTTTGTTTCAAGATCTGGACTTTACATTCCTGGAGATGAAT
CCTTTCACATTGGTCGAAGGAAAGCCTTATCCACTGGATATGAGGGGAGAGCTTGATGAC
ACTGCTACTTTTAAGAACTTCAAAAAGTGGGGAAATGTTGAATTTCCATTGCCATTTGGA
AGAGTGATGAGTGCTACGGAGAGCTTTATTCATGGGCTGGATGAAAAGACAAGTGTATCT
TTGAAGTTCACAGTCTTGAACCCCAAGGGGCGAATTTGGACAATGGTTGGTGGTGGAGGT
GCCAGTGTCATCTATGCAGATAATGTCGGTGATCTTGGATATGCTTCTGAGCTCGGTAAT
TATACCGAATATAGCGGTGCTCCAAATGAAGAAGAGGTCTTGCAGTACGCGAGAGTTGTA
ATTGATTGTGCAACCGCAGATCCTTATGGCCGTAAGAGAGCCCTTGTGATAGGTTGGGGA
ATAGCCAACTTTACTGATGTTGCTGCTACATTTAGTGGTATAATTCGAGCTCTGAAGGAG
AAGGAATTTAAACTTAAAGCTGCAAGAATGCACATATATGTTAGAAGAGGTGGTCCAAAC
TACCAAAAGGGTCTTGCAAAAATATGGTCTCTTGGGGAGGAAATTGGCATCCCAATTGAG
GTATATGGACCTGAGGAAACCAGGACTGGTATCTGCAAACAGGCTATTGAGTGCATCACT
GCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g039670.3.1

PEP Infomation

ATP-citrate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHC9_RICCO)

Sequence

MARKKIREYDSKRLLKEHFKRLAGYDLAIKSAQITESTDLNELVEKEPWVSSKKLAVKPD
MLFGKRGKSGLVALNPDLAQVALLLKERLGKEVDMSGCKGPITTFIVEPFVPHNEEFYLN
IVSDRLGCSVSFSECGGIDIEENWDKVKTIFVPTGTSFTSEICAPLAATLPLEIKGVIEE
FLKDVYTLFQDLDFTFLEMNPFTLVEGKPYPLDMRGELDDTATFKNFKKWGNVEFPLPFG
RVMSATESFIHGLDEKTSVSLKFTVLNPKGRIWTMVGGGGASVIYADNVGDLGYASELGN
YTEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATADPYGRKRALVIGWGIANFTDVAATFSGIIRALKE
KEFKLKAARMHIYVRRGGPNYQKGLAKIWSLGEEIGIPIEVYGPEETRTGICKQAIECIT
A*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g039670.3.1

Transcript Infomation

ATP-citrate synthase, putative (AHRD V3.3 *** B9SHC9_RICCO)

Sequence

TATGAGTTGGTTGGTCGACATGGATGGGTAGGTAATTTTCTCGCTCGTGGTTCATATTTG
CGCTGTCCATCGCAGACAATTACTTCCCGCTAATGTACTCTATGATTCTAGTTTTTGTAT
GTGACTATATACTATACTATATTTTTTAATTAGCCCATTTTTTTATAATGTAATGTAAAG
CAGCCATCTCTGAAAATATCATCAATATCACAACTATAAATATAGTGAGTTGAATCCCAA
TATTCTTACAAGTTCCATACAAATTCAGCTTTTTAACGAGAAAATGGCCCGCAAGAAGAT
CAGAGAATATGATTCGAAAAGATTGTTGAAAGAACACTTTAAGAGGCTTGCTGGTTATGA
TTTGGCCATCAAATCTGCCCAGATTACAGAGTCAACTGATTTGAATGAGCTTGTAGAGAA
AGAGCCATGGGTTTCTTCAAAAAAATTGGCGGTAAAGCCTGATATGTTATTTGGGAAGCG
TGGAAAAAGCGGGCTAGTTGCCTTGAATCCTGATCTGGCTCAAGTTGCTCTTTTGTTGAA
GGAACGGTTAGGCAAAGAGGTTGACATGAGTGGATGCAAAGGGCCCATCACAACCTTTAT
TGTTGAGCCATTTGTACCTCACAATGAGGAGTTTTACCTAAATATTGTTTCAGACAGACT
TGGTTGTAGTGTTAGCTTTTCTGAATGTGGAGGAATAGATATTGAAGAGAACTGGGACAA
GGTTAAGACAATCTTTGTGCCAACAGGGACATCTTTTACATCAGAGATTTGTGCACCACT
TGCTGCTACTCTACCACTAGAGATTAAAGGTGTAATTGAGGAGTTCCTCAAAGATGTCTA
TACTTTGTTTCAAGATCTGGACTTTACATTCCTGGAGATGAATCCTTTCACATTGGTCGA
AGGAAAGCCTTATCCACTGGATATGAGGGGAGAGCTTGATGACACTGCTACTTTTAAGAA
CTTCAAAAAGTGGGGAAATGTTGAATTTCCATTGCCATTTGGAAGAGTGATGAGTGCTAC
GGAGAGCTTTATTCATGGGCTGGATGAAAAGACAAGTGTATCTTTGAAGTTCACAGTCTT
GAACCCCAAGGGGCGAATTTGGACAATGGTTGGTGGTGGAGGTGCCAGTGTCATCTATGC
AGATAATGTCGGTGATCTTGGATATGCTTCTGAGCTCGGTAATTATACCGAATATAGCGG
TGCTCCAAATGAAGAAGAGGTCTTGCAGTACGCGAGAGTTGTAATTGATTGTGCAACCGC
AGATCCTTATGGCCGTAAGAGAGCCCTTGTGATAGGTTGGGGAATAGCCAACTTTACTGA
TGTTGCTGCTACATTTAGTGGTATAATTCGAGCTCTGAAGGAGAAGGAATTTAAACTTAA
AGCTGCAAGAATGCACATATATGTTAGAAGAGGTGGTCCAAACTACCAAAAGGGTCTTGC
AAAAATATGGTCTCTTGGGGAGGAAATTGGCATCCCAATTGAGGTATATGGACCTGAGGA
AACCAGGACTGGTATCTGCAAACAGGCTATTGAGTGCATCACTGCATAAAGCAACCAACT
CTGCTAAATTGTTTTGGTTTTTTTAGCTTTGTGTTATCATAATGATGTTGTTTGTGTCTG
ATATAAAAAAGAGTGCTTTGTAATTTAGCCATATTACATTCGCAAATGGGCTCTAATAAT
AATATCTACATATTCATCTTCTGAAAGTATTTTGTGGCATATTACATTATATTATATCTA
TCTACATCCCACCATCCATAATTACGTTAGCGCTCAAGGAAATTTATAAATTTTTTTTAT
CGGTTTT