Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g025440.3.1

CDS Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G23460.1)

Sequence

ATGGTTAAGATACTCTTCTTCTTGTTTCTTGTTTGGTTAATGGGGGCTCTTGGAGCTGCA
AAAAACAACTTTTTGGATGATGTCATCCTGTCAGAGCTTGATGATTTGGATGTAGAAGAC
AGTGACGAAGCAGAGTTGTTTGACCTCCCCAGATGGGGAATTGATCGCGGCAACAAGATT
CTTGTCAATGTTGATAGCTTTGGTGCAGTTGGTGATGGAACTTCAGATGACACCAAGGCT
TTTGTTGATGCATGGAAGCAAGCTTGTTCAACACCAAAATCAGTCCTCTTGGTCCCTGCA
GGACGAAGTTATCTAGTAAATGCAACAAGGTTCCGAGGGCCTTGTGTGGGCATACTGAGA
GTCCAGATTGAAGGAACTATAGTAGCACCAGATGATCCTAAGAACTGGAATTTTGCAAAG
AATGGACGAATTTGGCTTGGCTTCTTTAACTTGACTGGAGCTCTGTTCCAAGGAGGAGGT
GTTGTTGATGGATCAGGCAGCAAATGGTGGGCAGCTTCATGCAAGAAGAACAAGACTAAT
CCATGCGTAGCAGCACCAACTGCTTTAACTATATATGGAAGCTCAGGTATAAAGGTGAGG
GACCTAACAATCCAAAATGGCCAACAAATGAATTTTGCCATTTCTCGATCAGACTCTATA
AGAATAGCTGGTGTTACGGTGTCTGCTCCTGAAGACAGTCCTAATACTGATGGAATCCAT
ATAACTGAATCTACAAATGTTGTACTCCAGAATTCCAAAATTGGAACAGGTGATGATTGT
GTCTCTATTGTCAATGCTAGTTCTCATATCAAGATGAAGAGAATTTACTGTGGACCTGGC
CATGGAATCAGCATTGGGAGCCTTGGTAAGGACAACTCTGTTGGTATAGTTACTGGGATT
GTACTTGATAATGCGTTTCTCAGAGGTACCACAAACGGTCTGCGGATCAAGACATGGCAG
GGAGGATCAGGTTATGTGCGTGCAGTGCGCTTCCAAAATGTAAGGATGCAAGATGTTTCC
AATCCTATCATCATTGACCAATTCTATTGTGACTCACCGAAGTCCTGCCAGAATCAGACA
TCTGCAGTTGAGATTAGTGAGATAGTTTACCGGAATGTTAGTGGTACTTCAAAGAGCCAA
AAGGCAATCAAATTTGCATGTAGCGACAACGTGCCCTGCAGCCATATTGTTCTGAACAAC
ATCAACTTAGAGACCAGAGATGGTACTGCTGAGGTCTACTGCAACTCCGCCACAGGGATT
GGTTATGGTTATATTCATCCATCAGCAGAATGTCTCAACTCATCTGACAAGAAAATTAAG
CAGAAAATGGATGCTCGACTTGTCGAACCAAGGGAAGAATACATCGTTCATACCGAGTTA
TGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g025440.3.1

PEP Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G23460.1)

Sequence

MVKILFFLFLVWLMGALGAAKNNFLDDVILSELDDLDVEDSDEAELFDLPRWGIDRGNKI
LVNVDSFGAVGDGTSDDTKAFVDAWKQACSTPKSVLLVPAGRSYLVNATRFRGPCVGILR
VQIEGTIVAPDDPKNWNFAKNGRIWLGFFNLTGALFQGGGVVDGSGSKWWAASCKKNKTN
PCVAAPTALTIYGSSGIKVRDLTIQNGQQMNFAISRSDSIRIAGVTVSAPEDSPNTDGIH
ITESTNVVLQNSKIGTGDDCVSIVNASSHIKMKRIYCGPGHGISIGSLGKDNSVGIVTGI
VLDNAFLRGTTNGLRIKTWQGGSGYVRAVRFQNVRMQDVSNPIIIDQFYCDSPKSCQNQT
SAVEISEIVYRNVSGTSKSQKAIKFACSDNVPCSHIVLNNINLETRDGTAEVYCNSATGI
GYGYIHPSAECLNSSDKKIKQKMDARLVEPREEYIVHTEL*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g025440.3.1

Transcript Infomation

Pectin lyase-like superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT1G23460.1)

Sequence

GATATTTTAGATTCTTTTCCAATTTAAAAATTATCACCCCTACACATCAATTAAGACTTG
AGTCACCTATTCCTAATTTTAAAACTTCTCTATCTCACTTAATTCATTGTCTCGAAAAAC
CTTTGCGCTGATAAGAAAACTTGAGAGTTAAAAGTAGTACTATTAATAACACTAATATTA
AAATTATCACCTCAAAGCAATAATTGAATCTGGTATCACGTTTTCTTTGTTTTAATATTT
TCTTTTGTCACCTTCAATAAAAAAAAGTTCCAAGAAAGCCAACTTCAAAATTGAGGTGCA
CCAATTTCCAAGGCGACTAATGCCTAATGGCCCTTGAAATCTCCCTACGACTTGTATGAT
TATTATTTTGTTCCGTATTTAGCGCCTTAACTTGGTTATCAATGCGGACGAAACTTACTA
TGGCGTCTTTTGCCAGAAGCAGATATGTAACAACCAATTCTCACAATTGCCAACAATGCA
CTCTACCTCTTCACTTTAACTCTCTAAGCAACTATGATGTTTCCTCAACTAACAAAACAT
TACATGATGTTGTAAAGTATGGGTCTTTAACCTCTGCACGCCATATGTTTGATGAAATGA
CTAAACGTGATGTTGTTACATGGAATATCATGATTTCTGGATATAGTCATAATGGGTTCC
CAAGAAAATCACTGCACTTGTATAATAAAATGGTTTCTAACGGTATTATAGAGAATTCAT
CTACTTTCTCCTCTATATTGACCATATCTGCAAATGTAGGTTTGTTCAAACAAGGGGTTG
AGATTCACAGCAGAGTTGTTGTTTTGGGATGTAGTATGAACTTATATGTTGCTAGTTCAC
TTATTAATATGTATATAAAAATGGGGTTTACAGATTTTTCTTTTAAATTGTTTTATGACT
TACCTAAACGAACTTTACCCATATGGAACTTGGTTTTAGGCGGAATTTGTGAATTGGGTC
GGTTGAGTGAGTTCTTAAGATTGTATAGTGATATGAAGATGGAGAATGTCGAGCCTAATG
GGCTGACGTTTTGTTATTTGATTAATGGTTGTTGTAAAGAGATACTTGTTGATGAGGGAA
GGCAGTTGCACTCACATGTGATTAAGACAGGATGGTTAGGATCAAATATTTTTTTAGCTA
ATGTATTAGTGGATTTTTACTCTGCTTGTGGTATTTTGGTTGATGCTGATAAAGCATTTG
AATGCATTCCACCTCAGGATGTCATTTCATGGAATTCAATGGTTTCAGTTTATGCTGCTA
ATGATTTGTTACGTGAAGCTGTTCGAGCCTTAGAAGAGATGAGATTGTGGGACAAAAATC
CCTCTTCTATGTCATTTGTGGCATTGTTGAATTTATCAAGTCGCGGAAAGGAACTGCTAT
TTGGAAAACAAATACATAATTTTGTTATAAAACTGGGTTTTGATTGTGAAAGTGTCCTCA
TTCAGTCAGCTTTGATTGATATGTATGGGAAAAATGATGACATTCAAAGTTCAATAACTG
TATTCCGGTGTTCACGTGAGAGAAGTCTCGAATGTTGTAATTCAATGATGACATCTTTGC
TGCATCTTGGTTTCCTACACGATGTATTTGAGCTTTTCAGTCAGATGGTTTGTGAAAATA
TTATGTTTGATGAAGTGAGTTTGTCCTCAACAATTAAGGCATTATCATTGTATTCCTCTC
CTAGCTTGGATAACTGTTGTTTGTTCCATTGTTGTGCAATAAAATCAGGTTTTGATTCTG
ATAGTATGGTCTTATGTTCTCTGATTGATGCATATTCAAGATCTGGACAGATTAGATTCT
CTCAGCAGATTTTTGAAGCACTTCGCTCACCTAATATTTTCGGTTTCACTTCAATAATTA
ATGCATATGCTCAGAAAGGAATGGGATATGAATGCCTTGCAGTGTTTGAAGAAATGATCC
AAAAGGGTCTAAAACCAGATAAAGTAACATTCTTGTGTATACTGTTGGGATGCAACCATT
CAGGTCTAGTCGAAGAGGGGAAAAGGATTTTTGATTCTATGAGGACTCTCCATGATGTCT
ATCCAGACAGGCGGCACTATTCATGTATGGTTGATCTTCTAGGTCGTGCAGGTCTAGTCA
ATGAGGCAGAAGAGCTGCTAATGCATGGTTCATCGGAAGGAGATTCTGTCATGTGGAGCT
CACTTTTGCGAAGTTGCAGGATTCATCAAAATGAACATGTTGGAAGAAGAGCAGCTAAAA
GGTTGATGGATCTTGAGCCAGAGGATCCTTCTTTTTGGTTACAGGCCTCAAATTTTTATT
CTGAAATTGGAGAATTTGAGGCTGCCGTATACATTCGAGAGGTTGCAGTGGCAAGGAAGA
TGAGCAGAGATATTGGCTATAGTTTAATTCGGGTACATGAGTTCCATTAAATATACACTC
AAACAAAAAGAGGGAAAAAAGGACATCATGGCTGTTTGGTCTGCAGGACATGCTGGATAT
ACTTTTTCTTTAAAAAAATATATCTACCAGAATGGAGAGACTTTGTCTGCCTCTATACTT
TTGAAGCAAGGACACTGTGCTGCTTGTTAACCAACTCTAATACCAAAATACAATACAAGT
TTCAGAAGAAATGTATATGCGTTGTTTGGTCTCTCCATTTACCAAGTAACTTTTTTCTAG
TGCCCTTCATCTTTTTCAAGATTTCCACATTTATTGATGAAGTAAAACTACTGTAACGGT
AATTTGACTGTCTAAAAGGGGAACCTTTGAAGATCGGTGCTGTAACATTTGTTGTTGTAT
GGGTGAGAAAGAATCTAGAGAAGCATTTTACTTATGAATAGTATGTTGAACCATGGCTGA
GGAGTAAAGCAACAATCTCTAAAGTGATATTCTTACACTTAAAGTGTGGGATTGTAGAAA
ATTAAACACCTTTATCTACTTTCAAGCCAAGCCATATAACCCCACTAAATCATCCATTTT
CAGCACTAATACATCCATATAAATTAATACTCTATGGCCTCCTTTGATTTATGTAAAATC
TAGAAATACAGAACGAATACCAGAAACCCCTAAATCATGGTTAAGATACTCTTCTTCTTG
TTTCTTGTTTGGTTAATGGGGGCTCTTGGAGCTGCAAAAAACAACTTTTTGGATGATGTC
ATCCTGTCAGAGCTTGATGATTTGGATGTAGAAGACAGTGACGAAGCAGAGTTGTTTGAC
CTCCCCAGATGGGGAATTGATCGCGGCAACAAGATTCTTGTCAATGTTGATAGCTTTGGT
GCAGTTGGTGATGGAACTTCAGATGACACCAAGGCTTTTGTTGATGCATGGAAGCAAGCT
TGTTCAACACCAAAATCAGTCCTCTTGGTCCCTGCAGGACGAAGTTATCTAGTAAATGCA
ACAAGGTTCCGAGGGCCTTGTGTGGGCATACTGAGAGTCCAGATTGAAGGAACTATAGTA
GCACCAGATGATCCTAAGAACTGGAATTTTGCAAAGAATGGACGAATTTGGCTTGGCTTC
TTTAACTTGACTGGAGCTCTGTTCCAAGGAGGAGGTGTTGTTGATGGATCAGGCAGCAAA
TGGTGGGCAGCTTCATGCAAGAAGAACAAGACTAATCCATGCGTAGCAGCACCAACTGCT
TTAACTATATATGGAAGCTCAGGTATAAAGGTGAGGGACCTAACAATCCAAAATGGCCAA
CAAATGAATTTTGCCATTTCTCGATCAGACTCTATAAGAATAGCTGGTGTTACGGTGTCT
GCTCCTGAAGACAGTCCTAATACTGATGGAATCCATATAACTGAATCTACAAATGTTGTA
CTCCAGAATTCCAAAATTGGAACAGGTGATGATTGTGTCTCTATTGTCAATGCTAGTTCT
CATATCAAGATGAAGAGAATTTACTGTGGACCTGGCCATGGAATCAGCATTGGGAGCCTT
GGTAAGGACAACTCTGTTGGTATAGTTACTGGGATTGTACTTGATAATGCGTTTCTCAGA
GGTACCACAAACGGTCTGCGGATCAAGACATGGCAGGGAGGATCAGGTTATGTGCGTGCA
GTGCGCTTCCAAAATGTAAGGATGCAAGATGTTTCCAATCCTATCATCATTGACCAATTC
TATTGTGACTCACCGAAGTCCTGCCAGAATCAGACATCTGCAGTTGAGATTAGTGAGATA
GTTTACCGGAATGTTAGTGGTACTTCAAAGAGCCAAAAGGCAATCAAATTTGCATGTAGC
GACAACGTGCCCTGCAGCCATATTGTTCTGAACAACATCAACTTAGAGACCAGAGATGGT
ACTGCTGAGGTCTACTGCAACTCCGCCACAGGGATTGGTTATGGTTATATTCATCCATCA
GCAGAATGTCTCAACTCATCTGACAAGAAAATTAAGCAGAAAATGGATGCTCGACTTGTC
GAACCAAGGGAAGAATACATCGTTCATACCGAGTTATGAATCGCCATCACTCAAACACAT
TTTTAATATAAATCTCGTAGTTTAGTTCTTACTGATTTGAGTAATCTCAGATTCAGAGGT
TCCTAACTAGGTAAATTAACAGCTAAATACTGTTATACAGCGATTCATTAAAAATATTTA
TATGAGACATATTGTATTATTATATACATTATTTTCTTTCATGTTAAGCTCAATGTAATA
CACAAATTTATCAAGACGGCCATTTTCTCATA