Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g025260.3.1

CDS Infomation

Endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 (AHRD V3.3 *** A0A151SE95_CAJCA)

Sequence

ATGGTGAGGCAGAGGATTAATCGGGATAGTGGAAGTGTGGTTCTAGTAGCTAAGAGGTCA
AATTATGTGATTTTGGCTTTGTTTGTGGCAGCTGTATATGGGAGTTGGTTTGTATATGAA
CAGCAGTACCTCAATCTGCCTACACCACTTGGAGCTCAACATGTTGGTAAAAGGGGTTTT
TCTGAGCATGAAGCTATTCAGCATGTTATAGCCTTAACTCAATTCGGTCCACATCCTGTT
GGTTCACCTGCACTTAATCATGCCTTGCAGTATGTGTTGCAAGCCGCAGAAAATATTAAG
GAAACAGCTCATTGGGAAGTTGATGTAGAATTAGATCTTTTTCATGCTAAATCTGGTGCT
AATCATATGGTTGGTGGACTTTTCAAAGGGAAAACTCTGGTTTATTCTGATCTCAATCAT
ATTATATTAAGGATTTCGCCAAAATATGCTCCTGAAGCAACAGAAAATGCTATTCTTGTA
TCTTCCCACATTGATACTGTGTTTTCCGCTGAAGGGGCTGGAGATTGCAGCTCATGTGTA
GCTGTTATGTTGGAACTTGCTCGAGGAGTGTCTCAATGGGCTCATGGGTTCAAAAATGCC
GTAATTTTTTTGTTTAACACAGGAGAGGAGGAGGGCTTAAATGGTGCTCACAGTTTTATA
ACTCAGCACCCTTGGAGTGACACTTTAACAATGGCTATTGACTTGGAGGCCATGGGTGTT
GGAGGGAAGTCGGGAATATTTCAGGCTGGTCCTCAGCCATGGGCAATTGAAAATTTTGCC
TTGGCAGCACAATATCCATCTGGTCAAATAGTTGCACAGGATTTATTTAAATCCGGGGCA
GTAAAATCTGCTACTGATTTCCAAGTGTACCAAGAACTTGCTGGCCTTTCTGGTCTGGAT
TTTGCATATGCTGATAATACTGCTGTATACCACACAAAGAATGACAAATTAAAGCTTTTA
AAGCCTGGTTCTCTTCAACATCTTGGAGAAAATATGCTTGCTTTTCTGCTTAAGGCTGGA
ACTTCTACAAATTTGCCCAAAGGCAAGGGGACAAATTCCAGTGGAAAGTCTGGCCAGGAT
ACTGCTATATATTTCGACATTTTGGGAACATACATGGTCGTATTCCGACAGTACTTTGCG
AGTTTGCTCTACAATACAGTGATAGTGCAGGCACTTCTAATATGGACGACATCAGTAATT
ATGGGTGGACGTTCTGCCATGGTTTCCTTGGCCTTATCATCCTTGAGTCTCGTGCTCATG
TGGATGTGCGCTATTGGCTTCTCTGTATTTGTTGCTTTTGTTCTTCCCCTCGTATCATCT
TCACCCATTCCCTATGTTTCAAGTCCGTGGTTAGTGGTTGGTTTGTTCGGTGCACCTGCC
GTGCTCGGGGCTTTCATTGGTCAACATCTGGGCTATCTCATTCTGTTGAAGTATCTGACA
AAGACATTTTCAAGAAGAAACGCAAACTTGCCTTTGGTTGTGCAAGAAGATCTGGCAAAG
TTAGATGCTGAGAGATGGCTCTTTAAAGCTGGTTTATTGCAGTGGCTTGTTCTTTTGATT
GTGGGGAACTTTTACAAAATAGGATCATCTTATTTGGCTCTTGCTTGGCTAGCCTCTCCT
GCATTTGCATATGGATTGCTTGAAGCAACTTTGTCACCAGCACGGCTGCCAAAACCACTC
AAAACGGTCACCTTGCTGATTGGATCATCTGTGCCTTGCTTGCTTTCTTCTGGCATAATT
ATTCATTCGGTTTCTACACTAATTGGCAGTTCAGTTCGACTAGAAAGGAGTCCTGGCAGC
AACCCTGAGTGGCTGGGCAATGTAATAGTTGCAATGTTTATTGCTGCCATAGCATGTTTG
ACGCTGGTGTATCTTTTGTCATATATTCATATTTCAGGTGCAAAGGTGCCACTTATCATA
ACGACCTGTCTTCTGTTTGGCATCTCGCTCACCGTGATTCAACTAGGTGTTGTTCCTCCA
TTTACTGAAGATACTGCCAGAGCTGTAAATGTTGTGCATGTTGTAGATATGGCAGGAGCC
AATGGCAAAAAGCAAGAGCCAGCCTCTTACATTTCTTTATTTTCAACTACTCCAGGAAAT
CTAGTTAAGGAAGTTGAACAGATTGGAGAAGGATTTACTTGCGGCACTGTTAAGCCTCTT
GATTTTGTAACATTTTCGGTCAAGTATGGTTGTTGGAGTGACAAAAATGCTAATATTGGC
TGGCATGAGACAGATATTCCTCTGATTCATGTTGAGAATGATATCAACGGTGACAATAGA
GTAACTCATGTATCCATTGACACTAAACTTTCCACACGCTGGACTCTGGGTATCAACACT
GATGAAGTCGAGGATTTCCAGTTGAAAGACGGTCCTGAGGAGTTGGTTCCAATTGGTGAC
AAGAGCAATGCAGACTCATGGCACATAATTCAGTTTTCAGGAGGGAACAAGGCACCAAGG
AAATTCAGTCTGACTCTTTTCTGGGCCAACAATCAAACTCACAAGAAGGATAGCAACACA
AAGCAACCTTTGCTAAAACTACGGACAGATGTTGATAGAATAACTTCCCCAACTGAAACA
GTACTTGGGAAGCTTCCTCAGTGGTGTTCTTTGTTCGGGAAGTCCACGTCTCCTCTTACA
TTAGCTTTCTTGACTAGTTTACCTGTTGATTTTTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g025260.3.1

PEP Infomation

Endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 (AHRD V3.3 *** A0A151SE95_CAJCA)

Sequence

MVRQRINRDSGSVVLVAKRSNYVILALFVAAVYGSWFVYEQQYLNLPTPLGAQHVGKRGF
SEHEAIQHVIALTQFGPHPVGSPALNHALQYVLQAAENIKETAHWEVDVELDLFHAKSGA
NHMVGGLFKGKTLVYSDLNHIILRISPKYAPEATENAILVSSHIDTVFSAEGAGDCSSCV
AVMLELARGVSQWAHGFKNAVIFLFNTGEEEGLNGAHSFITQHPWSDTLTMAIDLEAMGV
GGKSGIFQAGPQPWAIENFALAAQYPSGQIVAQDLFKSGAVKSATDFQVYQELAGLSGLD
FAYADNTAVYHTKNDKLKLLKPGSLQHLGENMLAFLLKAGTSTNLPKGKGTNSSGKSGQD
TAIYFDILGTYMVVFRQYFASLLYNTVIVQALLIWTTSVIMGGRSAMVSLALSSLSLVLM
WMCAIGFSVFVAFVLPLVSSSPIPYVSSPWLVVGLFGAPAVLGAFIGQHLGYLILLKYLT
KTFSRRNANLPLVVQEDLAKLDAERWLFKAGLLQWLVLLIVGNFYKIGSSYLALAWLASP
AFAYGLLEATLSPARLPKPLKTVTLLIGSSVPCLLSSGIIIHSVSTLIGSSVRLERSPGS
NPEWLGNVIVAMFIAAIACLTLVYLLSYIHISGAKVPLIITTCLLFGISLTVIQLGVVPP
FTEDTARAVNVVHVVDMAGANGKKQEPASYISLFSTTPGNLVKEVEQIGEGFTCGTVKPL
DFVTFSVKYGCWSDKNANIGWHETDIPLIHVENDINGDNRVTHVSIDTKLSTRWTLGINT
DEVEDFQLKDGPEELVPIGDKSNADSWHIIQFSGGNKAPRKFSLTLFWANNQTHKKDSNT
KQPLLKLRTDVDRITSPTETVLGKLPQWCSLFGKSTSPLTLAFLTSLPVDF*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g025260.3.1

Transcript Infomation

Endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 (AHRD V3.3 *** A0A151SE95_CAJCA)

Sequence

ATATATGGAGAACAACTTTAGTAGTAAGAAAAAACTACTTTGTTTTATTTGGACTTTTGA
TTGAGAGTCCAATGTAAAACTACGCTAACTTCTTCATATTTTCCCAAAAAGAAAGTGTTT
TAATTGGGCAAGAAAAATTGTAAAATTTCAATTTTCGTAATATTTGGATAACCATCAACC
TAATTCCTACCTTACCAGTATGGAAGAAATATTAATTCTATACCTGAACAAATTATAATC
CTTAAATTAAGAATCCTAATTCTTAAAAAATTAAATAACAATTTGAGAAAAGATGATTTT
TTCTAAAACAAAACCTTTTAAAAGGACAAACGGTTCATTTTTTAATAGTATAAAATTTTT
TAATCAAGATTCTACTTTTGTGATTTTTTTATTTGTTCAAAAGAAAAAAAAAGTATAATA
GGAAAACCCCCTAAAATGCCCTTGACCAAGAGAGGTCCCGAGTTCAACTCTCTATTTTAG
TTAGAGCAATAGATGGAGCATGAAAATATGACAAAGTCAGTTAGGTTTTTGAAGTAGTAC
TCCATATTTAGGTATTTAAGATTGTTGAGTACAAGTCATATTTTTATTCATATCACCCAA
AGACAATGGTGAGGCAGAGGATTAATCGGGATAGTGGAAGTGTGGTTCTAGTAGCTAAGA
GGTCAAATTATGTGATTTTGGCTTTGTTTGTGGCAGCTGTATATGGGAGTTGGTTTGTAT
ATGAACAGCAGTACCTCAATCTGCCTACACCACTTGGAGCTCAACATGTTGGTAAAAGGG
GTTTTTCTGAGCATGAAGCTATTCAGCATGTTATAGCCTTAACTCAATTCGGTCCACATC
CTGTTGGTTCACCTGCACTTAATCATGCCTTGCAGTATGTGTTGCAAGCCGCAGAAAATA
TTAAGGAAACAGCTCATTGGGAAGTTGATGTAGAATTAGATCTTTTTCATGCTAAATCTG
GTGCTAATCATATGGTTGGTGGACTTTTCAAAGGGAAAACTCTGGTTTATTCTGATCTCA
ATCATATTATATTAAGGATTTCGCCAAAATATGCTCCTGAAGCAACAGAAAATGCTATTC
TTGTATCTTCCCACATTGATACTGTGTTTTCCGCTGAAGGGGCTGGAGATTGCAGCTCAT
GTGTAGCTGTTATGTTGGAACTTGCTCGAGGAGTGTCTCAATGGGCTCATGGGTTCAAAA
ATGCCGTAATTTTTTTGTTTAACACAGGAGAGGAGGAGGGCTTAAATGGTGCTCACAGTT
TTATAACTCAGCACCCTTGGAGTGACACTTTAACAATGGCTATTGACTTGGAGGCCATGG
GTGTTGGAGGGAAGTCGGGAATATTTCAGGCTGGTCCTCAGCCATGGGCAATTGAAAATT
TTGCCTTGGCAGCACAATATCCATCTGGTCAAATAGTTGCACAGGATTTATTTAAATCCG
GGGCAGTAAAATCTGCTACTGATTTCCAAGTGTACCAAGAACTTGCTGGCCTTTCTGGTC
TGGATTTTGCATATGCTGATAATACTGCTGTATACCACACAAAGAATGACAAATTAAAGC
TTTTAAAGCCTGGTTCTCTTCAACATCTTGGAGAAAATATGCTTGCTTTTCTGCTTAAGG
CTGGAACTTCTACAAATTTGCCCAAAGGCAAGGGGACAAATTCCAGTGGAAAGTCTGGCC
AGGATACTGCTATATATTTCGACATTTTGGGAACATACATGGTCGTATTCCGACAGTACT
TTGCGAGTTTGCTCTACAATACAGTGATAGTGCAGGCACTTCTAATATGGACGACATCAG
TAATTATGGGTGGACGTTCTGCCATGGTTTCCTTGGCCTTATCATCCTTGAGTCTCGTGC
TCATGTGGATGTGCGCTATTGGCTTCTCTGTATTTGTTGCTTTTGTTCTTCCCCTCGTAT
CATCTTCACCCATTCCCTATGTTTCAAGTCCGTGGTTAGTGGTTGGTTTGTTCGGTGCAC
CTGCCGTGCTCGGGGCTTTCATTGGTCAACATCTGGGCTATCTCATTCTGTTGAAGTATC
TGACAAAGACATTTTCAAGAAGAAACGCAAACTTGCCTTTGGTTGTGCAAGAAGATCTGG
CAAAGTTAGATGCTGAGAGATGGCTCTTTAAAGCTGGTTTATTGCAGTGGCTTGTTCTTT
TGATTGTGGGGAACTTTTACAAAATAGGATCATCTTATTTGGCTCTTGCTTGGCTAGCCT
CTCCTGCATTTGCATATGGATTGCTTGAAGCAACTTTGTCACCAGCACGGCTGCCAAAAC
CACTCAAAACGGTCACCTTGCTGATTGGATCATCTGTGCCTTGCTTGCTTTCTTCTGGCA
TAATTATTCATTCGGTTTCTACACTAATTGGCAGTTCAGTTCGACTAGAAAGGAGTCCTG
GCAGCAACCCTGAGTGGCTGGGCAATGTAATAGTTGCAATGTTTATTGCTGCCATAGCAT
GTTTGACGCTGGTGTATCTTTTGTCATATATTCATATTTCAGGTGCAAAGGTGCCACTTA
TCATAACGACCTGTCTTCTGTTTGGCATCTCGCTCACCGTGATTCAACTAGGTGTTGTTC
CTCCATTTACTGAAGATACTGCCAGAGCTGTAAATGTTGTGCATGTTGTAGATATGGCAG
GAGCCAATGGCAAAAAGCAAGAGCCAGCCTCTTACATTTCTTTATTTTCAACTACTCCAG
GAAATCTAGTTAAGGAAGTTGAACAGATTGGAGAAGGATTTACTTGCGGCACTGTTAAGC
CTCTTGATTTTGTAACATTTTCGGTCAAGTATGGTTGTTGGAGTGACAAAAATGCTAATA
TTGGCTGGCATGAGACAGATATTCCTCTGATTCATGTTGAGAATGATATCAACGGTGACA
ATAGAGTAACTCATGTATCCATTGACACTAAACTTTCCACACGCTGGACTCTGGGTATCA
ACACTGATGAAGTCGAGGATTTCCAGTTGAAAGACGGTCCTGAGGAGTTGGTTCCAATTG
GTGACAAGAGCAATGCAGACTCATGGCACATAATTCAGTTTTCAGGAGGGAACAAGGCAC
CAAGGAAATTCAGTCTGACTCTTTTCTGGGCCAACAATCAAACTCACAAGAAGGATAGCA
ACACAAAGCAACCTTTGCTAAAACTACGGACAGATGTTGATAGAATAACTTCCCCAACTG
AAACAGTACTTGGGAAGCTTCCTCAGTGGTGTTCTTTGTTCGGGAAGTCCACGTCTCCTC
TTACATTAGCTTTCTTGACTAGTTTACCTGTTGATTTTTAGGGTTACTGCAACTTTTACT
GGACATAAAGCAGAGTAGCTACAGCCTACAAGACTTCGATATGGTGGCTGTAGTGCTTCA
CTGGTAACAAATTACAACAGGTGCTCATGGTTATTATTGTATGCCAGAGTAAATGTTTGA
ACATATAACAGCCTAAAAATTGCATTCAAAACTTCAATCTATATCAAATCAGCCTAAAAA
TTGCATTCAAAACTTCAATCTATATCAAAT