Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g016130.3.1

CDS Infomation

F-box/LRR-repeat protein family (AHRD V3.3 *** A0A151TR18_CAJCA)

Sequence

ATGGATAAACCAAGGCAGAAATCACCGGCGACGGCGTTACCGCCGGCGACGATTGATATG
ATCGGAGAAGACCTTCTATTCAACGTCTTCTCAAAACTTCCAGCAGTTGACTGTGCAGCA
GCAGCATGTGTGAGCCGTTCGTGGAATGTTACCATCACTCGCCTCCTTTCTCTTCCAAAG
CTCTCTTCTGCTGTTTCACTCAATCCTTCTCTTCAGGTTGCTGTGAATGATGTTATTGAC
AAAGTTTTAGCTTGTCCAATTCGGCCCCAGTTTGTCATTGCTTCCATTGGTCCTGCTTTT
GACTTGGATGAAGCTCACCGGCTGATCGCTGGTAGATTTGGCTCCCAAATTCCAGTAATC
ACTTCGATATCCCAAGGAATTTTTGGGCAAAATGCTACCACCAATGAGTTTGAAGAGGTT
CAGTGGGACACGTTTGATGATGATGATGAGGCTCATGCCGATCTTGGTAATGAGATCCAC
GGTGCTTTACTAACTGTTGGCTTCTTGCCAGGACTGGCAATTGATTTAATCCCATTATCA
AGGACTCTGGGAAATCAAGTACTCATGATTGATGATCTCGTGCTCAGTGTCAGGGAACGC
TCATCCTCTCGTTCTGGATCAGCATCACCGGTGGGGATTTTGTTATTTTCTGATGAGGAA
ACTGACATCAAATTTGTCCTTGAAAAGTTTGATTATGCCTTTTCCACTGAGACTGTCATT
GTGGGTGACGGAGGTTCTCAATTTTTATACCGAGGTGAGGCTGCAATTAATCCTTCTAAT
AACAAAGCGGCGAGTTCAGCTGCTGTTGTTCTTTTATTTTCAAGGGATAGAGGCAAACCT
CCTGGTGTTGGGGAAACTCAGTTTCACGTAATGTTATCCACTGGCATTTCATCGATTGGG
CCTACATACAAAGCTGTTTCTGTTAGGGGGAGATCCTGTGACTACTCAACTTGGCTCACT
GCAAAAAGAGAAGCAGTTCATGGAAGTCTAGATGGTCAGACTATTTTAGATCAGATTTAT
GATGAGCTTGGAGGTCATAACAATTGTCCAGTTCTATATATTGGAGTTACAAAGAGAAGG
AAATGCTCTATTGGCCAGGAAAAACCAAGCTGGATAAGTACACATGAATTCCATGAGGTT
TTAAGTGGTGATGAGGAGTATCTGTATGTCCATGGTGTTGGTATCAGAAGTGGAGACTCC
TTCCGGTTTTACCATGCAAGTTCAGATTTAGCCCGTGCTTCTTGCAACACTGTTGCAAAT
AACTTCAGACATTTGAAGCAACTACTTAACTATGAATGTGATGATCATACTAATAGCAAT
GGCGTAGCTACACACAAGAAGCCTGTGTTTGGTGGTATAATGTTTGCTTGTTGTGGTCGT
GGCAAGTTATTTTTTGGTGAACCTAATGTAGACGGCTCACCTTTCTTGGAGAAGTTCCCT
GGGGTTACTTTCTCAGGAACCTATTGTACCGGAGAAATTGCACGTGCAGATTTATGCTCA
TACGAACAGGGTTCTCAGGAACACAGCTCTATAAGTTGCAATTTGCACGTATTTAGCACC
GTCTACCTTGTTATGTCATATACCCCTCCATTGCCTCAACATTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g016130.3.1

PEP Infomation

F-box/LRR-repeat protein family (AHRD V3.3 *** A0A151TR18_CAJCA)

Sequence

MDKPRQKSPATALPPATIDMIGEDLLFNVFSKLPAVDCAAAACVSRSWNVTITRLLSLPK
LSSAVSLNPSLQVAVNDVIDKVLACPIRPQFVIASIGPAFDLDEAHRLIAGRFGSQIPVI
TSISQGIFGQNATTNEFEEVQWDTFDDDDEAHADLGNEIHGALLTVGFLPGLAIDLIPLS
RTLGNQVLMIDDLVLSVRERSSSRSGSASPVGILLFSDEETDIKFVLEKFDYAFSTETVI
VGDGGSQFLYRGEAAINPSNNKAASSAAVVLLFSRDRGKPPGVGETQFHVMLSTGISSIG
PTYKAVSVRGRSCDYSTWLTAKREAVHGSLDGQTILDQIYDELGGHNNCPVLYIGVTKRR
KCSIGQEKPSWISTHEFHEVLSGDEEYLYVHGVGIRSGDSFRFYHASSDLARASCNTVAN
NFRHLKQLLNYECDDHTNSNGVATHKKPVFGGIMFACCGRGKLFFGEPNVDGSPFLEKFP
GVTFSGTYCTGEIARADLCSYEQGSQEHSSISCNLHVFSTVYLVMSYTPPLPQH*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g016130.3.1

Transcript Infomation

F-box/LRR-repeat protein family (AHRD V3.3 *** A0A151TR18_CAJCA)

Sequence

ACGTCAAGGGGTTTTCGGCTTTCAGTTCAGAAAAATGGATAAACCAAGGCAGAAATCACC
GGCGACGGCGTTACCGCCGGCGACGATTGATATGATCGGAGAAGACCTTCTATTCAACGT
CTTCTCAAAACTTCCAGCAGTTGACTGTGCAGCAGCAGCATGTGTGAGCCGTTCGTGGAA
TGTTACCATCACTCGCCTCCTTTCTCTTCCAAAGCTCTCTTCTGCTGTTTCACTCAATCC
TTCTCTTCAGGTTGCTGTGAATGATGTTATTGACAAAGTTTTAGCTTGTCCAATTCGGCC
CCAGTTTGTCATTGCTTCCATTGGTCCTGCTTTTGACTTGGATGAAGCTCACCGGCTGAT
CGCTGGTAGATTTGGCTCCCAAATTCCAGTAATCACTTCGATATCCCAAGGAATTTTTGG
GCAAAATGCTACCACCAATGAGTTTGAAGAGGTTCAGTGGGACACGTTTGATGATGATGA
TGAGGCTCATGCCGATCTTGGTAATGAGATCCACGGTGCTTTACTAACTGTTGGCTTCTT
GCCAGGACTGGCAATTGATTTAATCCCATTATCAAGGACTCTGGGAAATCAAGTACTCAT
GATTGATGATCTCGTGCTCAGTGTCAGGGAACGCTCATCCTCTCGTTCTGGATCAGCATC
ACCGGTGGGGATTTTGTTATTTTCTGATGAGGAAACTGACATCAAATTTGTCCTTGAAAA
GTTTGATTATGCCTTTTCCACTGAGACTGTCATTGTGGGTGACGGAGGTTCTCAATTTTT
ATACCGAGGTGAGGCTGCAATTAATCCTTCTAATAACAAAGCGGCGAGTTCAGCTGCTGT
TGTTCTTTTATTTTCAAGGGATAGAGGCAAACCTCCTGGTGTTGGGGAAACTCAGTTTCA
CGTAATGTTATCCACTGGCATTTCATCGATTGGGCCTACATACAAAGCTGTTTCTGTTAG
GGGGAGATCCTGTGACTACTCAACTTGGCTCACTGCAAAAAGAGAAGCAGTTCATGGAAG
TCTAGATGGTCAGACTATTTTAGATCAGATTTATGATGAGCTTGGAGGTCATAACAATTG
TCCAGTTCTATATATTGGAGTTACAAAGAGAAGGAAATGCTCTATTGGCCAGGAAAAACC
AAGCTGGATAAGTACACATGAATTCCATGAGGTTTTAAGTGGTGATGAGGAGTATCTGTA
TGTCCATGGTGTTGGTATCAGAAGTGGAGACTCCTTCCGGTTTTACCATGCAAGTTCAGA
TTTAGCCCGTGCTTCTTGCAACACTGTTGCAAATAACTTCAGACATTTGAAGCAACTACT
TAACTATGAATGTGATGATCATACTAATAGCAATGGCGTAGCTACACACAAGAAGCCTGT
GTTTGGTGGTATAATGTTTGCTTGTTGTGGTCGTGGCAAGTTATTTTTTGGTGAACCTAA
TGTAGACGGCTCACCTTTCTTGGAGAAGTTCCCTGGGGTTACTTTCTCAGGAACCTATTG
TACCGGAGAAATTGCACGTGCAGATTTATGCTCATACGAACAGGGTTCTCAGGAACACAG
CTCTATAAGTTGCAATTTGCACGTATTTAGCACCGTCTACCTTGTTATGTCATATACCCC
TCCATTGCCTCAACATTAGAGATAGCTGGTTTTGCCATTGAGAATCCTGACAGGTATTGG
CAAAAGAAAACAAAATTCTGGAATTTTGAACTTGTAATTTGTTGCTGTTTCTTAGTAGTT
AATAATGTTGTAAATTACATTACTGCAAGAATTGTGCTACTTTTTACACATTCTTATTGG
TATCTTCGAATAGACCAACAAAATTTGAGGCGAAATGGAACCGGTTAACAGTATTCCAAA
ATCCTTGATTCTTATTTCCTAAACCCTAAAAGCTAAAAAAAAAAAATGGTGTGGATCCTA
TAGAAACTATAATATAATTGATCAGGTAATTATTGTCCTACAAGTATTGTCCTACTTGTT
CGGTATAATTGTAAGTATACGCACAATTTTTTATTATATTTATGAAGAATGGACAATTAG
ATCATATAAATGATGAAAATATTAAAATAAATAAATAATGATAATTCACAAGGAGACTAT
AATTAGTTGGAACTTGAAAGCCATATATTAACAAATATTTGATACATATACTAGATCCAA
AAAAAAAAGGATCAAAATTTACATGTTTTAACCCTTGGAAGAATATAATTAGCGGTAGAG
AGAAGCTTAGGAAAATAGTGAGGATTAACCAAGTTTAAATAGCTATCAGAAACTAAATTT
AATTTTTCATGTTGCAATTATTAAAAAAATTAAGCACTTTTAATTTGTAGATAATCTGTT
ATACTGAATTAGAAAAACGTCCTATTGTTAATTTAATTTTAAATATATTCTCAAATGAAA
CTACCATTTATTTTGTAATAAAAGTAAATTAACTAAATACACTACTATGTTCTAAGCCGT
TCTA