Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g015470.3.1
CDS Infomation	Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RJA3_RICCO)
Sequence	ATGCGTGAAACTGTGAAAAAACCTTGTGTTGTTGCTGCTGCTACTGTTGTTGTTGCTGTT GCTACTACTATGACGAAGAAAACTAGTCCGGAAGAAGATGGGGACGTGATAATCATCCCT CCGTTGTGTACATCAGCTAATCGGTCAAGATTACAAGCTGGGTCACGTCGCATTACGCCG ACGAATGATGATATGGCTGAGCTCCGGCAGCTGCCGAACGGAGATCTGTATACTGGGACA TTTTTGGGAAAAGTGCCTCATGGTAATGGGAAGTATTTATGGTCTGATGGGTGTATGTAT GAAGGTGAGTGGAGAAGAGGGAAGGCGAGTGGTAAAGGGAAGTTTTCGTGGCCTTCAGGG GCAACTTATGAAGGGGATTTTAAGGATGGAAGAATGGATGGGTATGGTACGTTTATCGGA GCTGATGGGGATACGTATAGGGGTTGGTGGGCAGCAGATCGGAAACATGGGTTTGGGGAG AAGTTATATGCTAATGGGGATTTGTATGTTGGTTCTTGGAAGTGGAATTTGCAAGAAGGG GAAGGGAGGTATGTTTGGGGAAATGGGAATGAGTATATTGGAGAATGGAGAAAAGGGGTT ATGTTTGGTAAAGGGGTTTTGATTTGGGCAAATGGGAAAAGATATGAAGGGGATTGGGAT AATGGGATGCCTAAAGGAAATGGTGTTTTTAGTTGGCCTGATGGTAGGACTTGTTATACT AGTGGTTCATGGGGTGATAGTAATTCATCCAAACAAGAATTTAGTACTGGTGGTGGTAAT GGTGGTAATGGTGGTCAGGTTCTAAGGAGATCTTCTGTGACAATGAATGTGCGCGAAAGG AATGTTAATTTACCGAGGATTTGCATATGGGAATCTGATGGTGAAGCAGGAGATATTACT TGTGACATTGTTGACAATAGGGAGGCTTCTTCTATGTTTGTTCCTAGGAATGATGATGAC GAGGACGAGGATGATGATGATGATGAAGAGAGTGAGAGTTCCGAAGGAGATGAAAGTGGG GATTTTCGAAAGAGTCCTTGCCACTCTGAAGTTGTGGAAATGAAGAAGCCGGGGCAACTA ATAACCAAGGGACATAAGAATTATGATTTGGTGCTTAGTCTTCAGCTAGGTATTAGGTAT TCTACTCAGAAGCACGCCTCAATTACCCGAGAACCAAAGAATGGGGATTTTGATCCTAAT GAGAAGTTCTGGACAAGGTTTCCACCTGAGGGTTCCAAATCCACACCACCCCATCAGGTT GTGGACTTCAAATGGAAGGACTACTGTCCCGTGGTTTTCAAGAATCTTAGGGAGTTATTT GGAATCGATCCAGCTGAATACATGCTGGCTATCTGTGGAAGTGATGCACTTAGGGAACTG TCTTCCCCTGGGAAAAGTGGCAGCAACTTCTATCTAACTCAAGATGACCGATTTATCATC AAAACTTTGAAAAAGTCCGAAGTTAAGGTGTTCATTAGAATGCTTCAAAGTTATTATCGG CATGTTCGTCAGTACCGAAGCTCATTGGTGACAAAGTTTTTTGGTGTACACTGTGTTAAA ATGGTTGGATGTCAAAAGACACGTTTTGTTGTTATGGGGAACCTGTTCTACTCTGAACGC GTGATCCATAAGCGTTTTGATTTAAAAGGATCCTCGTATGGGCGTACAACTGATAAGCCA GGAGGAGAGGCCGATGAGACTACGACGCTTAAAGACCTTGATCTCAACTTTGTCTTTCAA TTGCGACAATCTTGGTATAAAGAGCTTATAAGGCAAATTGATATAGATTGTCAGTTTCTG GAAGCTGAGAATATCATGGATTACAGTCTTTTGATTGGTGTTCATATCTGCAATTATAGT AACAACGGCGAGATGAATTTCTCACCTTCTGGCAAATCTGATGCTCAAGATTATTGCTTA TGTGATGCAGAAAGTCCTGATAAGGGACTGATCATTGACAAAAGGAACTCTCCTATAAGT TCAGCTGCAAATGTGCCTGCAAGGGCAATGTGTGTGACAAGGAGTGGAAGTGAGTCAACT TCTGAACAGGGTGGCTGTGAGGCTAATAATGCTATCCTTTGCCTGGGCATCATTGACATT CTTCAAGATTATGATATTAGCAAAAGACTAGAACATGCATACAAGTCATTTCAGGTGGAT CCCACTTCTATATCTGCTGTTGACCCAAAGCTCTACTCTAAAAGATTTCGGGATTTTATA AGTAGAATCTTTAAAGTAGACGAAGGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g015470.3.1
PEP Infomation	Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RJA3_RICCO)
Sequence	MRETVKKPCVVAAATVVVAVATTMTKKTSPEEDGDVIIIPPLCTSANRSRLQAGSRRITP TNDDMAELRQLPNGDLYTGTFLGKVPHGNGKYLWSDGCMYEGEWRRGKASGKGKFSWPSG ATYEGDFKDGRMDGYGTFIGADGDTYRGWWAADRKHGFGEKLYANGDLYVGSWKWNLQEG EGRYVWGNGNEYIGEWRKGVMFGKGVLIWANGKRYEGDWDNGMPKGNGVFSWPDGRTCYT SGSWGDSNSSKQEFSTGGGNGGNGGQVLRRSSVTMNVRERNVNLPRICIWESDGEAGDIT CDIVDNREASSMFVPRNDDDEDEDDDDDEESESSEGDESGDFRKSPCHSEVVEMKKPGQL ITKGHKNYDLVLSLQLGIRYSTQKHASITREPKNGDFDPNEKFWTRFPPEGSKSTPPHQV VDFKWKDYCPVVFKNLRELFGIDPAEYMLAICGSDALRELSSPGKSGSNFYLTQDDRFII KTLKKSEVKVFIRMLQSYYRHVRQYRSSLVTKFFGVHCVKMVGCQKTRFVVMGNLFYSER VIHKRFDLKGSSYGRTTDKPGGEADETTTLKDLDLNFVFQLRQSWYKELIRQIDIDCQFL EAENIMDYSLLIGVHICNYSNNGEMNFSPSGKSDAQDYCLCDAESPDKGLIIDKRNSPIS SAANVPARAMCVTRSGSESTSEQGGCEANNAILCLGIIDILQDYDISKRLEHAYKSFQVD PTSISAVDPKLYSKRFRDFISRIFKVDEG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g015470.3.1
Transcript Infomation	Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, putative (AHRD V3.3 *** B9RJA3_RICCO)
Sequence	CTAAAAAAGCTGTTAAACATACTGAGTGCTCAACAATACCACCAAAAAAATTTCAAAAAA GCAAAAGTAAGAAAGAGAGAGAAAAAAAATCATTAATAAAAGTCTCCGGCACCGGCAATG TCGTCGGTACCGACTCACCGGCGAGCAGAGTACTGTTGAGTTGAGCTGAAAAAGGAAGAA GGAAATGCGTGAAACTGTGAAAAAACCTTGTGTTGTTGCTGCTGCTACTGTTGTTGTTGC TGTTGCTACTACTATGACGAAGAAAACTAGTCCGGAAGAAGATGGGGACGTGATAATCAT CCCTCCGTTGTGTACATCAGCTAATCGGTCAAGATTACAAGCTGGGTCACGTCGCATTAC GCCGACGAATGATGATATGGCTGAGCTCCGGCAGCTGCCGAACGGAGATCTGTATACTGG GACATTTTTGGGAAAAGTGCCTCATGGTAATGGGAAGTATTTATGGTCTGATGGGTGTAT GTATGAAGGTGAGTGGAGAAGAGGGAAGGCGAGTGGTAAAGGGAAGTTTTCGTGGCCTTC AGGGGCAACTTATGAAGGGGATTTTAAGGATGGAAGAATGGATGGGTATGGTACGTTTAT CGGAGCTGATGGGGATACGTATAGGGGTTGGTGGGCAGCAGATCGGAAACATGGGTTTGG GGAGAAGTTATATGCTAATGGGGATTTGTATGTTGGTTCTTGGAAGTGGAATTTGCAAGA AGGGGAAGGGAGGTATGTTTGGGGAAATGGGAATGAGTATATTGGAGAATGGAGAAAAGG GGTTATGTTTGGTAAAGGGGTTTTGATTTGGGCAAATGGGAAAAGATATGAAGGGGATTG GGATAATGGGATGCCTAAAGGAAATGGTGTTTTTAGTTGGCCTGATGGTAGGACTTGTTA TACTAGTGGTTCATGGGGTGATAGTAATTCATCCAAACAAGAATTTAGTACTGGTGGTGG TAATGGTGGTAATGGTGGTCAGGTTCTAAGGAGATCTTCTGTGACAATGAATGTGCGCGA AAGGAATGTTAATTTACCGAGGATTTGCATATGGGAATCTGATGGTGAAGCAGGAGATAT TACTTGTGACATTGTTGACAATAGGGAGGCTTCTTCTATGTTTGTTCCTAGGAATGATGA TGACGAGGACGAGGATGATGATGATGATGAAGAGAGTGAGAGTTCCGAAGGAGATGAAAG TGGGGATTTTCGAAAGAGTCCTTGCCACTCTGAAGTTGTGGAAATGAAGAAGCCGGGGCA ACTAATAACCAAGGGACATAAGAATTATGATTTGGTGCTTAGTCTTCAGCTAGGTATTAG GTATTCTACTCAGAAGCACGCCTCAATTACCCGAGAACCAAAGAATGGGGATTTTGATCC TAATGAGAAGTTCTGGACAAGGTTTCCACCTGAGGGTTCCAAATCCACACCACCCCATCA GGTTGTGGACTTCAAATGGAAGGACTACTGTCCCGTGGTTTTCAAGAATCTTAGGGAGTT ATTTGGAATCGATCCAGCTGAATACATGCTGGCTATCTGTGGAAGTGATGCACTTAGGGA ACTGTCTTCCCCTGGGAAAAGTGGCAGCAACTTCTATCTAACTCAAGATGACCGATTTAT CATCAAAACTTTGAAAAAGTCCGAAGTTAAGGTGTTCATTAGAATGCTTCAAAGTTATTA TCGGCATGTTCGTCAGTACCGAAGCTCATTGGTGACAAAGTTTTTTGGTGTACACTGTGT TAAAATGGTTGGATGTCAAAAGACACGTTTTGTTGTTATGGGGAACCTGTTCTACTCTGA ACGCGTGATCCATAAGCGTTTTGATTTAAAAGGATCCTCGTATGGGCGTACAACTGATAA GCCAGGAGGAGAGGCCGATGAGACTACGACGCTTAAAGACCTTGATCTCAACTTTGTCTT TCAATTGCGACAATCTTGGTATAAAGAGCTTATAAGGCAAATTGATATAGATTGTCAGTT TCTGGAAGCTGAGAATATCATGGATTACAGTCTTTTGATTGGTGTTCATATCTGCAATTA TAGTAACAACGGCGAGATGAATTTCTCACCTTCTGGCAAATCTGATGCTCAAGATTATTG CTTATGTGATGCAGAAAGTCCTGATAAGGGACTGATCATTGACAAAAGGAACTCTCCTAT AAGTTCAGCTGCAAATGTGCCTGCAAGGGCAATGTGTGTGACAAGGAGTGGAAGTGAGTC AACTTCTGAACAGGGTGGCTGTGAGGCTAATAATGCTATCCTTTGCCTGGGCATCATTGA CATTCTTCAAGATTATGATATTAGCAAAAGACTAGAACATGCATACAAGTCATTTCAGGT GGATCCCACTTCTATATCTGCTGTTGACCCAAAGCTCTACTCTAAAAGATTTCGGGATTT TATAAGTAGAATCTTTAAAGTAGACGAAGGGTAAGGAGCATGGGAAGAGTATGTAGATAA GCATATGGAGACGGGCAAGTGAGATACAAGATGAGACTGGAATTAGTTGAATCGGTTAAC GCCCTTGTTTACTGATTATATGTTGACTGGTTTTTGTGAAGATCTTGGCCATTGGTAAAG TGTGAATGAATGGTCTGATGAAGTTGTTGATGCCCAATTTTATTTTATCCCCTTTCCCTC CCTTGCTATATATGTCAAGGATGATCAAGCTAGGTAAAGTTATGTATATCATTTTTTATT TTTTTTTCTCTCTTTCACCCATCCTTTGGTCACTCTCTAGTTGAGTTGAGTGAACATGAA GATTTTGATCAAATGTACAGTAAAGGAAATCTTTTTTGTTAGTATTTGTAGTTACTGTGT TCCACGACGAAATTTAAAGCTTAGTTTCCTTGTTTGATTTGTGTTAGCAATGGCTTGTAG AT