Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g011580.3.1
CDS Infomation	Pumilio, putative (AHRD V3.3 *** B9SDY2_RICCO)
Sequence	ATGTATGGAACAGATGGTTATGGTTGTTTAGCGATGATTACTGATGGTTATGCGAAGATG ATGTCGGAAATTGGAATGCGATCAATGCTAGGAGGAAGCAATGATTTTAGCGAAGAGTTA GGGATGTTGCTTAGTGAACGAAGGAGGAAGCAGCTGCAGCTGCAGCAACAGGAGGTGAGT GATCGAGAGAGAGAGCTCAGTATTTACCGTAGTGGTTCAGCTCCACCGACTGTTGACGGA TCGTTGAACGCTTTCAGTGGCTTGATGATAGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCGGT GGCGGTGGTGACAATGTTTATGATTTCGGCGGACTTTCAGAAGAGGAGTTAAGGTCTGAT CCAGCGTACATTTCGTATTACTACTCGAATGTGAATCTGAACCCAAGGCTTCCGCCACCT CTTTTGTCTAAAGAAGACTGGCGGTACGCCCAGCGTCTGCAGGGTAGCGGTAATGTTGGT AGTGGTGGTAATTCACCAGTATTAGGGGGGATTGGTGATAGAAGGAAAGGAAATCGTGGT GAGGCCGATAAGGGAAAGGATGTTGAATCACTTTTTTCAATGCCGATGGGATTTGGTGCT ATAAATGAAGAAAATGGACGTGAGGCGCGGAAGGAGTGGGGCGGTGATGGTCTCATTGGA TTGCCTGGATTAGGTTTAGGAAGCCGGCAGATGAGCATTACTGAGATGATTCAGGACCAT ATGAGCCAAACAACGTCAAGGCATCCATCACGTCCTGATTCCCGTGCATATGATGATATT GTTGATCCTTCTGAGTCCCAATTTGCTCATCTCCATCAAAATCTGGCATCTTTGGATGCA TTACATTCCAGGGAAAAAGTTCAAGGCATGTCCCTCCATAATGTCAGCTCATCAGGATCT CAGTCTTATGGTTCGGCCATGGGTACATCACTATCACGAAGTACCATCCCTGAGCCTCAG CTTGTGGCTAGAGATCCTAGCCCTCGTATTCCTTCTGCTGGAGGAGGGAGGATAGCATCA CTAGAGGATGTTTCATCTCATATGGGTGAGCATACTGATTTGGCTGCTGCGTTGTCTGGC ATGAGTCTATCAGGGAACAATATGGGAGATGAAGGGAAACATCAAAAGTATCAAATTCAT AATGAGATGGACGATCATCAGAACCTCTTCCGATTGCAGAATGTTCAGAATCCTATGAAG CAACATCCATATGCAAAAAAGTCTGAATCTGTTCAGTTTCACAAGTCTGTGGGTTCCTCT GCTGCATACATGATTGGGCACTCTATGCCAACTCTCAACAATGGAGAGAGTTCTCCATCT CAATATCCAACTATCGATAGTCCTAATTCTACATTTTCTCCTTATGCTTTAGGAGGTTAT GGTATGAACCCTCCATCACCATCCATGTTTGAAAACCAGCTTGGAGCTGGTAATTTGCCT TCCGTACTGGGAAACATAGCTTCTCCGGTGGGTGCATGTGGAATTGATGCTCATGTACCA GGAGGCGGATTAAATTTGGGTCCTAATTTAATGGCTGCAGCAGCTGAACTGCAGAACCTT AATAGACTTGGTAATCAGACCTTGGGGGGCTCTCTTCCAATGTCTCAGATGGATCCATTG TACTTACAATACTTGAGGTCACCTGAGTATCTTGCTGCTCAGCTAGCAGCTCTCAATGAC CCAACAGTGAATAGGGAATCTTTAGGGACTTCATACATGGAGTTGATTGAGCTTCAGAAA GCTTATCTGGAGACGTTGGTTGCATCTCAAAAATCACAATATGGTATTCCGTATCTTGGC AAATCCGGTGGCTTAAATCATGGTTACTATGGAAACCCAGCACTTGGCCTTAATATGTCA TATCCTGGAAGCCCTTTGGCAGGTGCAGGTCTTCCAAATTCCCCATTTGGACCTGGTAGT CCTGTAAGATATGGGGAAAGGAACATGCGTTTTCATTCAGGGATGAGAAACTTAGCTGGT GGTGTCATGGGAGCTTGGCATTCCGAGGCTGTTTCTAACATGGGTGAAACCTTTGCTTCC TCGCTACTAGACGAGTTTAAGAGCAATAAGAGTAAGTGTTTTGAGCTATCAGAGATTGAA GGCCATGTTGTCCAGTTCAGTGCGGATCAGTATGGCAGTCGGTTCATTCAACAAAAACTT GAGACTGCTACAACAGAAGAGAAGAACATGGTCTTCCAAGAAATTATGCCGCAAGCCCTT TCTTTGATGACTGATGTGTTTGGTAATTATGTGATCCAGAAGTTTTTCGAGCATGGAAGT TCACCTCAGATAAGAGAACTGGCTGACCAGCTCAATGGGCATGTACTCACCCTTAGCCTT CAGATGTATGGTTGCCGAGTAATCCAGAAGGCCATAGAGATGGTTGATCTGGATCAGCAG ACTAAAATGGTCGCCGAGCTTGACGGTCAGGTTATGCGCTGCGTTAGAGATCAAAATGGG AATCATGTAATCCAGAAGTGCATCGAATGCATTCCACAGGATGCTATCCAGTTTATTGTT TCCACATTTTATGATCAAGTTGTGACATTGTCCACCCATCCATATGGATGTCGTGTCATA CAGAGAGTCTTGGAACATTGCCATAATCCTGAAACCCAGAACATTGTGATGAATGAGATT TTGCAAAACGTTTGCATGTTGGCGCAAGATCAATATGGGAATTATGTTGTGCAGCATGTA CTGGAACACGGAAAGCCTGAGGAGCGTACTTCTATAATTACTAAGCTGACGGGACAGATA GTTCAGATGAGCCAGCAGAAATTTGCATCTAATGTTGTGGAGAAGTGCTTAAGCTTTGGA ACTCCCGAAGAACGTCAGACCTTGGTAAATGAGATGATTGGCACCACTGATGAAAATGAA CCTCTTCAGGCAATGATGAAAGATCAGTTTGCAAACTACGTTGTTCAGAAGGTGCTTGAG ACTTGTGATGACCAGCAGCTTGAACTCATTCTCAACCGAATCAAGGTTCATCTAAATGCT CTGAAGAAATATACTTACGGAAAGCATATAGTTGCCCGTGTAGAGAAACTGGTTGCTGCT GGAGAGAGGAGGATCAGCTTCCTGGCGTCATATTCTGCTGCTGCTTAG

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g011580.3.1
PEP Infomation	Pumilio, putative (AHRD V3.3 *** B9SDY2_RICCO)
Sequence	MYGTDGYGCLAMITDGYAKMMSEIGMRSMLGGSNDFSEELGMLLSERRRKQLQLQQQEVS DRERELSIYRSGSAPPTVDGSLNAFSGLMIGSGSGSGSGGGGGDNVYDFGGLSEEELRSD PAYISYYYSNVNLNPRLPPPLLSKEDWRYAQRLQGSGNVGSGGNSPVLGGIGDRRKGNRG EADKGKDVESLFSMPMGFGAINEENGREARKEWGGDGLIGLPGLGLGSRQMSITEMIQDH MSQTTSRHPSRPDSRAYDDIVDPSESQFAHLHQNLASLDALHSREKVQGMSLHNVSSSGS QSYGSAMGTSLSRSTIPEPQLVARDPSPRIPSAGGGRIASLEDVSSHMGEHTDLAAALSG MSLSGNNMGDEGKHQKYQIHNEMDDHQNLFRLQNVQNPMKQHPYAKKSESVQFHKSVGSS AAYMIGHSMPTLNNGESSPSQYPTIDSPNSTFSPYALGGYGMNPPSPSMFENQLGAGNLP SVLGNIASPVGACGIDAHVPGGGLNLGPNLMAAAAELQNLNRLGNQTLGGSLPMSQMDPL YLQYLRSPEYLAAQLAALNDPTVNRESLGTSYMELIELQKAYLETLVASQKSQYGIPYLG KSGGLNHGYYGNPALGLNMSYPGSPLAGAGLPNSPFGPGSPVRYGERNMRFHSGMRNLAG GVMGAWHSEAVSNMGETFASSLLDEFKSNKSKCFELSEIEGHVVQFSADQYGSRFIQQKL ETATTEEKNMVFQEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFFEHGSSPQIRELADQLNGHVLTLSL QMYGCRVIQKAIEMVDLDQQTKMVAELDGQVMRCVRDQNGNHVIQKCIECIPQDAIQFIV STFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCHNPETQNIVMNEILQNVCMLAQDQYGNYVVQHV LEHGKPEERTSIITKLTGQIVQMSQQKFASNVVEKCLSFGTPEERQTLVNEMIGTTDENE PLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAA GERRISFLASYSAAA*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g011580.3.1
Transcript Infomation	Pumilio, putative (AHRD V3.3 *** B9SDY2_RICCO)
Sequence	ATGTATGGAACAGATGGTTATGGTTGTTTAGCGATGATTACTGATGGTTATGCGAAGATG ATGTCGGAAATTGGAATGCGATCAATGCTAGGAGGAAGCAATGATTTTAGCGAAGAGTTA GGGATGTTGCTTAGTGAACGAAGGAGGAAGCAGCTGCAGCTGCAGCAACAGGAGGTGAGT GATCGAGAGAGAGAGCTCAGTATTTACCGTAGTGGTTCAGCTCCACCGACTGTTGACGGA TCGTTGAACGCTTTCAGTGGCTTGATGATAGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCAGTGGCGGT GGCGGTGGTGACAATGTTTATGATTTCGGCGGACTTTCAGAAGAGGAGTTAAGGTCTGAT CCAGCGTACATTTCGTATTACTACTCGAATGTGAATCTGAACCCAAGGCTTCCGCCACCT CTTTTGTCTAAAGAAGACTGGCGGTACGCCCAGCGTCTGCAGGGTAGCGGTAATGTTGGT AGTGGTGGTAATTCACCAGTATTAGGGGGGATTGGTGATAGAAGGAAAGGAAATCGTGGT GAGGCCGATAAGGGAAAGGATGTTGAATCACTTTTTTCAATGCCGATGGGATTTGGTGCT ATAAATGAAGAAAATGGACGTGAGGCGCGGAAGGAGTGGGGCGGTGATGGTCTCATTGGA TTGCCTGGATTAGGTTTAGGAAGCCGGCAGATGAGCATTACTGAGATGATTCAGGACCAT ATGAGCCAAACAACGTCAAGGCATCCATCACGTCCTGATTCCCGTGCATATGATGATATT GTTGATCCTTCTGAGTCCCAATTTGCTCATCTCCATCAAAATCTGGCATCTTTGGATGCA TTACATTCCAGGGAAAAAGTTCAAGGCATGTCCCTCCATAATGTCAGCTCATCAGGATCT CAGTCTTATGGTTCGGCCATGGGTACATCACTATCACGAAGTACCATCCCTGAGCCTCAG CTTGTGGCTAGAGATCCTAGCCCTCGTATTCCTTCTGCTGGAGGAGGGAGGATAGCATCA CTAGAGGATGTTTCATCTCATATGGGTGAGCATACTGATTTGGCTGCTGCGTTGTCTGGC ATGAGTCTATCAGGGAACAATATGGGAGATGAAGGGAAACATCAAAAGTATCAAATTCAT AATGAGATGGACGATCATCAGAACCTCTTCCGATTGCAGAATGTTCAGAATCCTATGAAG CAACATCCATATGCAAAAAAGTCTGAATCTGTTCAGTTTCACAAGTCTGTGGGTTCCTCT GCTGCATACATGATTGGGCACTCTATGCCAACTCTCAACAATGGAGAGAGTTCTCCATCT CAATATCCAACTATCGATAGTCCTAATTCTACATTTTCTCCTTATGCTTTAGGAGGTTAT GGTATGAACCCTCCATCACCATCCATGTTTGAAAACCAGCTTGGAGCTGGTAATTTGCCT TCCGTACTGGGAAACATAGCTTCTCCGGTGGGTGCATGTGGAATTGATGCTCATGTACCA GGAGGCGGATTAAATTTGGGTCCTAATTTAATGGCTGCAGCAGCTGAACTGCAGAACCTT AATAGACTTGGTAATCAGACCTTGGGGGGCTCTCTTCCAATGTCTCAGATGGATCCATTG TACTTACAATACTTGAGGTCACCTGAGTATCTTGCTGCTCAGCTAGCAGCTCTCAATGAC CCAACAGTGAATAGGGAATCTTTAGGGACTTCATACATGGAGTTGATTGAGCTTCAGAAA GCTTATCTGGAGACGTTGGTTGCATCTCAAAAATCACAATATGGTATTCCGTATCTTGGC AAATCCGGTGGCTTAAATCATGGTTACTATGGAAACCCAGCACTTGGCCTTAATATGTCA TATCCTGGAAGCCCTTTGGCAGGTGCAGGTCTTCCAAATTCCCCATTTGGACCTGGTAGT CCTGTAAGATATGGGGAAAGGAACATGCGTTTTCATTCAGGGATGAGAAACTTAGCTGGT GGTGTCATGGGAGCTTGGCATTCCGAGGCTGTTTCTAACATGGGTGAAACCTTTGCTTCC TCGCTACTAGACGAGTTTAAGAGCAATAAGAGTAAGTGTTTTGAGCTATCAGAGATTGAA GGCCATGTTGTCCAGTTCAGTGCGGATCAGTATGGCAGTCGGTTCATTCAACAAAAACTT GAGACTGCTACAACAGAAGAGAAGAACATGGTCTTCCAAGAAATTATGCCGCAAGCCCTT TCTTTGATGACTGATGTGTTTGGTAATTATGTGATCCAGAAGTTTTTCGAGCATGGAAGT TCACCTCAGATAAGAGAACTGGCTGACCAGCTCAATGGGCATGTACTCACCCTTAGCCTT CAGATGTATGGTTGCCGAGTAATCCAGAAGGCCATAGAGATGGTTGATCTGGATCAGCAG ACTAAAATGGTCGCCGAGCTTGACGGTCAGGTTATGCGCTGCGTTAGAGATCAAAATGGG AATCATGTAATCCAGAAGTGCATCGAATGCATTCCACAGGATGCTATCCAGTTTATTGTT TCCACATTTTATGATCAAGTTGTGACATTGTCCACCCATCCATATGGATGTCGTGTCATA CAGAGAGTCTTGGAACATTGCCATAATCCTGAAACCCAGAACATTGTGATGAATGAGATT TTGCAAAACGTTTGCATGTTGGCGCAAGATCAATATGGGAATTATGTTGTGCAGCATGTA CTGGAACACGGAAAGCCTGAGGAGCGTACTTCTATAATTACTAAGCTGACGGGACAGATA GTTCAGATGAGCCAGCAGAAATTTGCATCTAATGTTGTGGAGAAGTGCTTAAGCTTTGGA ACTCCCGAAGAACGTCAGACCTTGGTAAATGAGATGATTGGCACCACTGATGAAAATGAA CCTCTTCAGGCAATGATGAAAGATCAGTTTGCAAACTACGTTGTTCAGAAGGTGCTTGAG ACTTGTGATGACCAGCAGCTTGAACTCATTCTCAACCGAATCAAGGTTCATCTAAATGCT CTGAAGAAATATACTTACGGAAAGCATATAGTTGCCCGTGTAGAGAAACTGGTTGCTGCT GGAGAGAGGAGGATCAGCTTCCTGGCGTCATATTCTGCTGCTGCTTAGATGGTGTAGGAA ACTTGTACAGCTAACTGAGGCTAGAACAAGTACCCTCGTCTTTGTTTTCTTGTCGAGAGT TTTTGTTCTACCTCTTTGCTGATGGAAAATGTTTGAAAAATAAACATGTAGTGATGGTGT TTGTAACATTGTACATTATAGTTTTGAGGTATAATCTATATAAGCAGGTTTAACTGTGAG GCTCAGATGGTAAACATACCTGGATGCCCCTGCCGCGGAGATAGAGTAACTGTACAAGGG TGTAAAGAAAAGAAAAAGAAAAACTGTAGTCAGATCTTCTTCTTAAACTGTACAAATTGT TGCCATGTGCAGAGCCTGTCGTTTTAGGTAAAAAATTATAATGTTATGGATTTGATAATT ATCTTTTCTTCTGTTATAGATAAACTATTTCCCTTATATAGCCTATGAATTATCAATCTT GCTTGTCTCTGTTCTTATCTGAATTCATTCACAATATATTACCTGTTAGTTAGTATATCT ACTGCCATATTTGTACATTTCTCGATTTGTTTGTGTCATTCTTGTGCAGAGGTCATACTA ATCTATGTGGATACAGATCTAGCTTGTAGGTTCTATCCATATACTATGTATATGTAGAGA ATGCCGTAGTACCTCTTATTGCTCTAAACATGTTTAACAAAAACTATTTATCTGTGGACT TTGAATAATCCTATATGTTTGCATATAAAAAAAATAACAAAGAATATTGTTTTCTTTTAT GTTTATCAAAGTGAATGCTTTCAATCGTGGTCAGATGTTAGTATAAAGATTTTAATATGT TTGAACAAGATTGATGAAAATTTATCATCTACTATATAACAAAAACTATGACTTTGTATA TACAATGTGATAGGTTTGGATGAACCCCTTCTGCCCCAAGGAGAATAATAGTATTACCCA CTAGATGTATAGTTGAGAGCTTATAAATTATATATCAGATGTTAGTATTTGTAGTGTCAT TAAAGGGAGCTATATAATGTTGCTTCATTTAGGTTGTTAATGATCAGCTTTATTGACAAT TGCATATGATCATCCATAACTAGAATGATTTTAAGTAGTTTTCTTGACAATTACATGTGA TCTTTCATAAACTATGAACGATATCAGACTCACAAGATCTTCTATCGATGAATAAGAAAA ATTATGTCATTATCTAGATGCATAAACTCGAGGACCATAACGGAGGCCCCCAAAGAGGTG GAATTTCAATCCATCCCTAGTTTCCGTCAACTATAGGTTGAAGTTTTACAGAAGTCCTAG TGTTTTCAGTTGTTGAACATGCTCTTGTGGGAGAGGTGGAGGAGACCAATCATTTCCAGT ATCCTCACCATCAACATCCTGCACGACGTATTCCTACATGAGAGTTGAGAAACATATTA