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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc04g009340.3.1

CDS Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G19895.1)

Sequence

ATGGTTATGGTCATGATGCATCAGCATCAGCATCATCACTCCACTGCTCCCTCAACTCAT
CCAATCAATCCTCCCCCACCTTCTTCAGCTTCCGTTCTTAGATCCCCCAACACACCTACT
TCAAATACCCAGCAATTTCCTTCCATTGGGTCGCCTTCTGTGGAACATGGGTTGCCGTTA
GCACGGGTTAAGCTCTCCGATATTGTACCTTATGATGGAGCTCCGGTTGGGCCTTATTTG
CGGGCTGTGGAAGCGCTTTCAGGATCACTTATGCGACATAACGCTGCGGTGATTGAGCTA
GGTGGTGAAGGTACGGCAGTGTTGCGTTGTGGGTTGGAGTCGGCGAGGTACTTCTTTAAG
ACGAGGGCGGTTGCTCAGAATGGTGGGGGTGGCGCTGGTGGGGCCGCGTTGGGCAAGAGT
GGTCGTGGGGTTTATATATACAGAGCTGGAAGGCCTTTGGAAGACATGGACTCTTCTCCC
CCATGCATGACTGAAGTTTTCCGCTGCATGGGAAGGGCAGCTCGTGCTGCTTTATGTGCA
ATTGCAAGGCATCTTCGATTGCGAAGCGATGTCTTCAATAACTTGCTTGATGACAATCCG
CTGCCCGTTAATGAGGCCTCTTCATCTGTTGTTGTTGCAACCTTCTCCAATACCACCTCT
CAAAATGGGAAAGGAGCTATTGGAGGAGGGAAGCTAGTTACAAATGGTGAAGTAGAGAAA
GGGCTGTTGACACTAGTTTCATCTGATGCTCCTGGTCTTCAGGTTTGTGATCCCAATGGT
CATTGGTATCTAGCAGATAGTGGCTTGACTCCTGGGGATTTACTATTGCTTACTGGGAAA
GCTCTCAGCCATGCTACTGCCGGTCTTCGTCCTGCAGCCGTATACCGGGGTTCAGCTGAT
AATTATGTGGGCACTACTTGTGGTGGAAGGACATCACTTGCATTTAGGCTTATACCTCAG
AGCAATGCAATACTGGATTGTTCTCCGATTACAGCTGCTGGTCATGTTATTCCTCATAGC
TACGTGCCAATATCTGTAAGCCAGTTTATGGATGACCTTTCAGCCGAGGAAGACATGCTT
TGTAGCAATACTGATAATGCTTATGTGGCCCGAGACAATGTAAATAAGGAACCATCACTC
AGAAGTGTTCTTTCAGATCCCTTATCTGGCGCATTCCTTGAAGATGCTATGTTTGTTTCA
TGTGGACATTCCTTTGGTGGTCTCATGCTGAAAAGGGTTATTGATATGGCAAGATGTATC
CTCTGCAATGCTGAAATTGAGCGTGGTTCCTTAATTCCTAACCACGTACTGAGAACTGCG
GCTGCAGCAGTGAAGCATGAGGATGACCGAAGACTTTTCCACAATGCAGCTCTTAGAAAG
CGTCGAAAAGAAGTGGGAGACATTAGGGAGAATGGTGAGCTTCCTTCTGAAAATGGACCG
CATAAAGGTGTTCAGTATCCATTCTCAGTGAATGAGAAAGTTCTTATAAAGGGAAATCGG
AGGACACCAGATAAATTTGTTGGAAAGGAAGCTGTAATCACATCACAGTGTCTTAATGGC
TGGTATTTGCTTAAGATTATGGACAGCGGTGAGAATGTTCGATTGCAGTACCGCTCTCTG
CGTAAGTTCCTTCCTACACAGGAAACAGAGGAGAGATGCCAGTCACAGACAGTTCAGAAC
AGTAGCTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc04g009340.3.1

PEP Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G19895.1)

Sequence

MVMVMMHQHQHHHSTAPSTHPINPPPPSSASVLRSPNTPTSNTQQFPSIGSPSVEHGLPL
ARVKLSDIVPYDGAPVGPYLRAVEALSGSLMRHNAAVIELGGEGTAVLRCGLESARYFFK
TRAVAQNGGGGAGGAALGKSGRGVYIYRAGRPLEDMDSSPPCMTEVFRCMGRAARAALCA
IARHLRLRSDVFNNLLDDNPLPVNEASSSVVVATFSNTTSQNGKGAIGGGKLVTNGEVEK
GLLTLVSSDAPGLQVCDPNGHWYLADSGLTPGDLLLLTGKALSHATAGLRPAAVYRGSAD
NYVGTTCGGRTSLAFRLIPQSNAILDCSPITAAGHVIPHSYVPISVSQFMDDLSAEEDML
CSNTDNAYVARDNVNKEPSLRSVLSDPLSGAFLEDAMFVSCGHSFGGLMLKRVIDMARCI
LCNAEIERGSLIPNHVLRTAAAAVKHEDDRRLFHNAALRKRRKEVGDIRENGELPSENGP
HKGVQYPFSVNEKVLIKGNRRTPDKFVGKEAVITSQCLNGWYLLKIMDSGENVRLQYRSL
RKFLPTQETEERCQSQTVQNSS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc04g009340.3.1

Transcript Infomation

RING/U-box superfamily protein (AHRD V3.3 *** AT3G19895.1)

Sequence

GCCAAATTTAAGGAGAAAAAAAGAGGAACGGTTTTCTGCAAAGCCAAAAACCTCCCAAAT
TTCCCTTTTCAAGAATCTCACCATTTTCCCATTTTGCAAAATTCTCTAAAATTTCATCTC
TCAAACAGCATAAACCCTAATTTAACTCTCTATTTTTCAGTGTTTGTATGCAAATATAGC
AAAAATCAAGCACATATACAGACGGAAATGATCCATGGTTATGGTCATGATGCATCAGCA
TCAGCATCATCACTCCACTGCTCCCTCAACTCATCCAATCAATCCTCCCCCACCTTCTTC
AGCTTCCGTTCTTAGATCCCCCAACACACCTACTTCAAATACCCAGCAATTTCCTTCCAT
TGGGTCGCCTTCTGTGGAACATGGGTTGCCGTTAGCACGGGTTAAGCTCTCCGATATTGT
ACCTTATGATGGAGCTCCGGTTGGGCCTTATTTGCGGGCTGTGGAAGCGCTTTCAGGATC
ACTTATGCGACATAACGCTGCGGTGATTGAGCTAGGTGGTGAAGGTACGGCAGTGTTGCG
TTGTGGGTTGGAGTCGGCGAGGTACTTCTTTAAGACGAGGGCGGTTGCTCAGAATGGTGG
GGGTGGCGCTGGTGGGGCCGCGTTGGGCAAGAGTGGTCGTGGGGTTTATATATACAGAGC
TGGAAGGCCTTTGGAAGACATGGACTCTTCTCCCCCATGCATGACTGAAGTTTTCCGCTG
CATGGGAAGGGCAGCTCGTGCTGCTTTATGTGCAATTGCAAGGCATCTTCGATTGCGAAG
CGATGTCTTCAATAACTTGCTTGATGACAATCCGCTGCCCGTTAATGAGGCCTCTTCATC
TGTTGTTGTTGCAACCTTCTCCAATACCACCTCTCAAAATGGGAAAGGAGCTATTGGAGG
AGGGAAGCTAGTTACAAATGGTGAAGTAGAGAAAGGGCTGTTGACACTAGTTTCATCTGA
TGCTCCTGGTCTTCAGGTTTGTGATCCCAATGGTCATTGGTATCTAGCAGATAGTGGCTT
GACTCCTGGGGATTTACTATTGCTTACTGGGAAAGCTCTCAGCCATGCTACTGCCGGTCT
TCGTCCTGCAGCCGTATACCGGGGTTCAGCTGATAATTATGTGGGCACTACTTGTGGTGG
AAGGACATCACTTGCATTTAGGCTTATACCTCAGAGCAATGCAATACTGGATTGTTCTCC
GATTACAGCTGCTGGTCATGTTATTCCTCATAGCTACGTGCCAATATCTGTAAGCCAGTT
TATGGATGACCTTTCAGCCGAGGAAGACATGCTTTGTAGCAATACTGATAATGCTTATGT
GGCCCGAGACAATGTAAATAAGGAACCATCACTCAGAAGTGTTCTTTCAGATCCCTTATC
TGGCGCATTCCTTGAAGATGCTATGTTTGTTTCATGTGGACATTCCTTTGGTGGTCTCAT
GCTGAAAAGGGTTATTGATATGGCAAGATGTATCCTCTGCAATGCTGAAATTGAGCGTGG
TTCCTTAATTCCTAACCACGTACTGAGAACTGCGGCTGCAGCAGTGAAGCATGAGGATGA
CCGAAGACTTTTCCACAATGCAGCTCTTAGAAAGCGTCGAAAAGAAGTGGGAGACATTAG
GGAGAATGGTGAGCTTCCTTCTGAAAATGGACCGCATAAAGGTGTTCAGTATCCATTCTC
AGTGAATGAGAAAGTTCTTATAAAGGGAAATCGGAGGACACCAGATAAATTTGTTGGAAA
GGAAGCTGTAATCACATCACAGTGTCTTAATGGCTGGTATTTGCTTAAGATTATGGACAG
CGGTGAGAATGTTCGATTGCAGTACCGCTCTCTGCGTAAGTTCCTTCCTACACAGGAAAC
AGAGGAGAGATGCCAGTCACAGACAGTTCAGAACAGTAGCTGATTCTCATTAGATGATTT
ACAACCAATTTCCATGTGGATTATGTTGAGCTCCCTCTATACTCAAAAGTTTAAAGATGC
AACTTTTTTTCTTGTAGCTTACATTGTTTTTACTTAAGAGGATGGGGGTTTAGAGCTTAT
CAAAATCCTTAAGAGTTTGCTTGTATAGGATTGTAAGTGAGATAAATTTGAGGATAACAA
GATGCTCATTTTTCTTGAAAAATTCCCTGTATGATGCATCTGTAGTACTTTTCAGTGCCT
ATTTATGTTTTCATTCATCATGTGCAAATGTGAAAATCACTGTTTCATTCCTGTCCTATT
TCAGATGCTTGAAGGAGC