Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g007320.2.1
CDS Infomation	Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative (AHRD V3.3 *** Q2HUD1_MEDTR)
Sequence	ATGAATCAACAAAAAAGTAGTACTACTTGTTTGATTCCAATAACTCCCGAAATTATTCGA TGGAGTTACGACGTTTTTCTAAGTTTCAGAGGTAAAGATGTACGTAAAACTTTTGTTGAT CATCTCTACGTTGCACTTCAACAAAAAGGGATCAACACATTCAAAGATGACGATAAGTTA GAGAAAGGTGATTCTATTTCACCAGGACTTGCGAGAGCAATTGAAGAATCGCGCATAGCT TTGATTATTTTCTCAAAGAACTATGCTGAATCGTCGTGGTGTTTGGATGAAGTAGTGAAG ATCATGGAATGTAAGAAGGTGAAAAAACAAATTGTTATTCCGATTTTCTACGATGTAGAT CCATCAACGGTAAGAAAACAAAAATCGAGCTTTGAAGAAGCTTTTAACAAGTATGAAGAT TGTATCAAGGTGCAAAAATGGAGAGGAGCACTAGAGGAAGCAGCTAATTTATCTGGTTGG GATTTGCCAAATACTTCCAATGCGCATGAAGCTATAGTGATAAAGCAAATTGTGGAAGAT ATAATGGCTAGATTGTGTGGTCAGAGACACACGAAAAACGCTGAAAATCTTGTTGGAATC GAGTCACGTATGCACAAAGTGTATAAAATGCTTGGCATGGGGTCTGGTGGAGTTCGTTTC GTTGGAATATTTGGAATGAGTGGAGTTGGGAAGACAACTCTAGCTAGAGTCATTTATGAG AATATTCGGAGTCATTTTGAAGGTTCGTGTTTTCTTCATGAAGTTAGAGATCGTTCTGCA AAACAAGGCGTAGAGCATTTGCAAGCCATACTTCTTTCTGAGATACTTTTGATGAAAGAT GTAAACATCAACAATTTATACGAAGGAGTCAATATGCAGATACAAAGATTACAGCACAAA AAGGTTCTTCTTGTTCTTGATGATGTTGATCACGTAGATCAGTTAGATGTTTTAGCGAGG AAACGTGAATGGTTTGGTCATGGAAGTAGAGTTATCATAACAACTCAAGATAAGCACTTG CTTGTTGAACATGAGGTAGAAAAGATATACAGAATGACAACGTTAAATGAATACGAAAGT TTGCAGCTCTTTAAGCTATATGCCTTTAAGAAAAACCGTCTTATGGATGAATTTAGGGAT GTTTCAGCTCAAATTATAAGGCATTGTGATGGACTCCCGTTGGCTCTGAAAGTCCTCGGA AGTTTCTTGTATGGAAGAGATTTGGATGAATGGACGAGTGAAGTGGAACGATTGAAACAA ATCCCAGAAGGTGAAATTGTGAAGAAACTCGAATTAAGTTTCAATGGACTAAACAGAATT GAACAAAAGATATTACTAGATATTGTGTGTTTCTTTATAGGAAAGAAGAAAGAATCAGTT ACAAGAATATTAGAGAGTTTCAACTTTAGTCCTGTTATTGGCATAAAAGTTCTCATGGAG AAATCTCTGATTACTGTTTCACAAGGTCGAATTCTGGTGCATCAATTGATACAAGAAATG TGTTGGTATATTATCCGTCAAGAAGCTTCCGATGATCCAACAAGATATAGTAGGTTGTGG TTACCTGATCATATTTCTAATGTACTTACTGGAGATTTGGGCAGTGAAAAGATTGAAGGC ATATCACTGAACTTGGCTTTTGCACAAGAAGTGAATGTCAGCAGCGCGGCATTCAGACAA ATGAGCAGACTAAGGTTTCTCAGTATCCAGAACAAAAATGTTCATCGGGGCCCTAATTTC CTTCCTGGTGAGTTGAGGTGGTTCAATTGGCACGCGTATCCATCAAGAAGTCTGCCTGTT AGTTTTCAGGGCGAAAAGCTTGTTGGTTTGAAGTTGAAAGATAGTCGAATCATACAACTT TGGCAAGGCTCCAAGATTCTAGGAAAATTGAAATACATCAACCTTAGTGAGTCACGGAAG CTAGTAAGGACCCCGGATTTTTCAGGTATCCCTAATCTTGAAAGGCTGGTTCTTGAACGA TGTGTAAATTTGGTAGAAATCAATTTTTCTGTTAGAGATCTCAGAAGGCTAGTCTTGTTG AATCTGAAGAACTGTAGCAATTTAAAGACCCTACCGAAGATCATTCAATTGGAAAGTCTT AAGGTTTTGATTCTATCAGGCTGCTTAAAACTCAAAAAGTTGTCGGAAATAAAAGAAGAA ATGAATCGTTTGTCACAAGTGTACTTGGAAGGAACTGGTTTGAGAGAACTACCCGAATCA ATTGACAACTTTTCAGGAGTAAAATTGATAAATCTAAGTAACTGCAAGTATCTTGAGAAT CTTCCAAGCAGTATTTTTAAATTGAAGTCTCTAAGAACACTGGATCTATCCGGATGTTCA AGACTCGAAAAATTATCAGATGATTTGGGACTTTTAGACGGTTTAGAGGAGCTCCATTGT GATGACACAGCCATCCGAACAATGCCTTCCACTATCTCTCAGCTAAAGAACCTTAAGCAC TTATCTCTCCGGGGATGTAAAAATGCTTTGGGTTTACAAGTATGGAGTTCACTCTTTTTG TCGCGACTATTTAGGAAAGACCACAACTCTATCGGTCTGGTTTTTCCTAATTTATCAGGT CTTTGCTCATTGACAAAGCTGGACATAAGTGACTGCAATATTTCAGACGGAGGAATCCTA TCTAATCTTGGGTTCTTGCCATCTTTGGAGGAAGTGAATCTCGGAAAGAATAACTTTGTT GGTATTCCATCTGCAAGCATCAATGGTCTAACTCGACTAAAAGTTGTTGAATTGGTTGGT TGTAAGAGGCTCGAGATTTTTCCAGAGCTTCCTTCAAGTATAGAAGAGGTGTATGCCGAT GAATGTACATCACTGAGGAGTATTGGCATTGATCAATTAACCAAATATCCAATGTTGTCT CGAGTTTCACTTACTCAATGTCACCAATTTGTCAAAAATGAACCTGATGTTGCTATTATT GATTCACTGTGGAATCACATGCTCAAGGGACTATCGATGGTGGATGATGAATTCAGTATA TGTATCCCTGGATCTGAAGTTCCTGACTGGTTTATGTACAAGAACTTGGGTCCTTCATTA TCAGTGAAGCTACCTAAAAATTGGTACACAAACAAATTCATGGGCTTTGCTCTTTGTGTT GTTTTTGACAGTTTCAAGGAACCTTCCTGTATGAATAATGCTTACCTTCAAAAAATCCCG GGATTTCTGGTCATGTTTAAGCTCGTAAGGCACGATGGAAAGACTGGGGTGTTTTTTAAA AGTATTGGCTCAGTAGGAAGTGAGGAATGTCCTGATTCAGGGCACACTCTACTGGCCTAT GCATCATTTGATAATTTTTGGTCAATGTATGAGAAACATGTTTGCAATCCTAACGACTGG ATTCAAATCGAGGTTTGTGAGACTGATGCAAATGTTGCAATCAAAGGTTGGGGGATGCAT CTTCTGTACGAGAACGATATTATAAATGATGAGTTGATGATACAAAATGCCACCTCTCAA AATGGAAAGATGGGCTTGTTTCATGTAATATTTGATGGATCAAAGTATGTGAAAAGGAAA CGACACGGACATAAATCATTTTCTAGGCTGCCACCAGATGATGAACCAGCTGGATATGTC AATTCATTTGGAGAAACAAGTAATGAAGATTTTGATGAAACATTATTTGGGAGAGGAATT ACTGGGATTGTAGAAGCTCAACAAACAGTTACTATAAGTATGCCTGAATCAACCTTTAAT TGGATGATGAGACCATCAGTACTTTTGAGTATGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g007320.2.1
PEP Infomation	Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative (AHRD V3.3 *** Q2HUD1_MEDTR)
Sequence	MNQQKSSTTCLIPITPEIIRWSYDVFLSFRGKDVRKTFVDHLYVALQQKGINTFKDDDKL EKGDSISPGLARAIEESRIALIIFSKNYAESSWCLDEVVKIMECKKVKKQIVIPIFYDVD PSTVRKQKSSFEEAFNKYEDCIKVQKWRGALEEAANLSGWDLPNTSNAHEAIVIKQIVED IMARLCGQRHTKNAENLVGIESRMHKVYKMLGMGSGGVRFVGIFGMSGVGKTTLARVIYE NIRSHFEGSCFLHEVRDRSAKQGVEHLQAILLSEILLMKDVNINNLYEGVNMQIQRLQHK KVLLVLDDVDHVDQLDVLARKREWFGHGSRVIITTQDKHLLVEHEVEKIYRMTTLNEYES LQLFKLYAFKKNRLMDEFRDVSAQIIRHCDGLPLALKVLGSFLYGRDLDEWTSEVERLKQ IPEGEIVKKLELSFNGLNRIEQKILLDIVCFFIGKKKESVTRILESFNFSPVIGIKVLME KSLITVSQGRILVHQLIQEMCWYIIRQEASDDPTRYSRLWLPDHISNVLTGDLGSEKIEG ISLNLAFAQEVNVSSAAFRQMSRLRFLSIQNKNVHRGPNFLPGELRWFNWHAYPSRSLPV SFQGEKLVGLKLKDSRIIQLWQGSKILGKLKYINLSESRKLVRTPDFSGIPNLERLVLER CVNLVEINFSVRDLRRLVLLNLKNCSNLKTLPKIIQLESLKVLILSGCLKLKKLSEIKEE MNRLSQVYLEGTGLRELPESIDNFSGVKLINLSNCKYLENLPSSIFKLKSLRTLDLSGCS RLEKLSDDLGLLDGLEELHCDDTAIRTMPSTISQLKNLKHLSLRGCKNALGLQVWSSLFL SRLFRKDHNSIGLVFPNLSGLCSLTKLDISDCNISDGGILSNLGFLPSLEEVNLGKNNFV GIPSASINGLTRLKVVELVGCKRLEIFPELPSSIEEVYADECTSLRSIGIDQLTKYPMLS RVSLTQCHQFVKNEPDVAIIDSLWNHMLKGLSMVDDEFSICIPGSEVPDWFMYKNLGPSL SVKLPKNWYTNKFMGFALCVVFDSFKEPSCMNNAYLQKIPGFLVMFKLVRHDGKTGVFFK SIGSVGSEECPDSGHTLLAYASFDNFWSMYEKHVCNPNDWIQIEVCETDANVAIKGWGMH LLYENDIINDELMIQNATSQNGKMGLFHVIFDGSKYVKRKRHGHKSFSRLPPDDEPAGYV NSFGETSNEDFDETLFGRGITGIVEAQQTVTISMPESTFNWMMRPSVLLSM*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g007320.2.1
Transcript Infomation	Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative (AHRD V3.3 *** Q2HUD1_MEDTR)
Sequence	AAAATTGTTAAAGTGGACAAACAATTTTGTGTGTCAATTGCAATTTTGTGTTTGGTTTCT TATGAATATCACGTTTAATCGAGGTGTTCAAGTAAAATATATAAACTAGTTTATAAAGCT ATTTATATATTACGCTTAATTTCTTGGTAGATTCTTTATTTTTATGTTAGTCTAGTCAAT GAAGCCTCAGGATGATTTTGACAATGACAACATTATATATTTTTAATTATAATTGGGTCA CATTCACCATAGACTTTATCATTGACTCATTCCTCTAGCAAAAATTAATTTTGCCACTTT CTACCCCACACGTTTATTTTTGTGAGTTTAAATGATAATTAATAATAAAGTCAACTTCAG ACCTTCACATCAGTGTTAAATATTATTTATGAGTATATATTTATAACCAAGTTTTTGTTA ATATCATTTAGCCACGAAAATGAATCAACAAAAAAGTAGTACTACTTGTTTGATTCCAAT AACTCCCGAAATTATTCGATGGAGTTACGACGTTTTTCTAAGTTTCAGAGGTAAAGATGT ACGTAAAACTTTTGTTGATCATCTCTACGTTGCACTTCAACAAAAAGGGATCAACACATT CAAAGATGACGATAAGTTAGAGAAAGGTGATTCTATTTCACCAGGACTTGCGAGAGCAAT TGAAGAATCGCGCATAGCTTTGATTATTTTCTCAAAGAACTATGCTGAATCGTCGTGGTG TTTGGATGAAGTAGTGAAGATCATGGAATGTAAGAAGGTGAAAAAACAAATTGTTATTCC GATTTTCTACGATGTAGATCCATCAACGGTAAGAAAACAAAAATCGAGCTTTGAAGAAGC TTTTAACAAGTATGAAGATTGTATCAAGGTGCAAAAATGGAGAGGAGCACTAGAGGAAGC AGCTAATTTATCTGGTTGGGATTTGCCAAATACTTCCAATGCGCATGAAGCTATAGTGAT AAAGCAAATTGTGGAAGATATAATGGCTAGATTGTGTGGTCAGAGACACACGAAAAACGC TGAAAATCTTGTTGGAATCGAGTCACGTATGCACAAAGTGTATAAAATGCTTGGCATGGG GTCTGGTGGAGTTCGTTTCGTTGGAATATTTGGAATGAGTGGAGTTGGGAAGACAACTCT AGCTAGAGTCATTTATGAGAATATTCGGAGTCATTTTGAAGGTTCGTGTTTTCTTCATGA AGTTAGAGATCGTTCTGCAAAACAAGGCGTAGAGCATTTGCAAGCCATACTTCTTTCTGA GATACTTTTGATGAAAGATGTAAACATCAACAATTTATACGAAGGAGTCAATATGCAGAT ACAAAGATTACAGCACAAAAAGGTTCTTCTTGTTCTTGATGATGTTGATCACGTAGATCA GTTAGATGTTTTAGCGAGGAAACGTGAATGGTTTGGTCATGGAAGTAGAGTTATCATAAC AACTCAAGATAAGCACTTGCTTGTTGAACATGAGGTAGAAAAGATATACAGAATGACAAC GTTAAATGAATACGAAAGTTTGCAGCTCTTTAAGCTATATGCCTTTAAGAAAAACCGTCT TATGGATGAATTTAGGGATGTTTCAGCTCAAATTATAAGGCATTGTGATGGACTCCCGTT GGCTCTGAAAGTCCTCGGAAGTTTCTTGTATGGAAGAGATTTGGATGAATGGACGAGTGA AGTGGAACGATTGAAACAAATCCCAGAAGGTGAAATTGTGAAGAAACTCGAATTAAGTTT CAATGGACTAAACAGAATTGAACAAAAGATATTACTAGATATTGTGTGTTTCTTTATAGG AAAGAAGAAAGAATCAGTTACAAGAATATTAGAGAGTTTCAACTTTAGTCCTGTTATTGG CATAAAAGTTCTCATGGAGAAATCTCTGATTACTGTTTCACAAGGTCGAATTCTGGTGCA TCAATTGATACAAGAAATGTGTTGGTATATTATCCGTCAAGAAGCTTCCGATGATCCAAC AAGATATAGTAGGTTGTGGTTACCTGATCATATTTCTAATGTACTTACTGGAGATTTGGG CAGTGAAAAGATTGAAGGCATATCACTGAACTTGGCTTTTGCACAAGAAGTGAATGTCAG CAGCGCGGCATTCAGACAAATGAGCAGACTAAGGTTTCTCAGTATCCAGAACAAAAATGT TCATCGGGGCCCTAATTTCCTTCCTGGTGAGTTGAGGTGGTTCAATTGGCACGCGTATCC ATCAAGAAGTCTGCCTGTTAGTTTTCAGGGCGAAAAGCTTGTTGGTTTGAAGTTGAAAGA TAGTCGAATCATACAACTTTGGCAAGGCTCCAAGATTCTAGGAAAATTGAAATACATCAA CCTTAGTGAGTCACGGAAGCTAGTAAGGACCCCGGATTTTTCAGGTATCCCTAATCTTGA AAGGCTGGTTCTTGAACGATGTGTAAATTTGGTAGAAATCAATTTTTCTGTTAGAGATCT CAGAAGGCTAGTCTTGTTGAATCTGAAGAACTGTAGCAATTTAAAGACCCTACCGAAGAT CATTCAATTGGAAAGTCTTAAGGTTTTGATTCTATCAGGCTGCTTAAAACTCAAAAAGTT GTCGGAAATAAAAGAAGAAATGAATCGTTTGTCACAAGTGTACTTGGAAGGAACTGGTTT GAGAGAACTACCCGAATCAATTGACAACTTTTCAGGAGTAAAATTGATAAATCTAAGTAA CTGCAAGTATCTTGAGAATCTTCCAAGCAGTATTTTTAAATTGAAGTCTCTAAGAACACT GGATCTATCCGGATGTTCAAGACTCGAAAAATTATCAGATGATTTGGGACTTTTAGACGG TTTAGAGGAGCTCCATTGTGATGACACAGCCATCCGAACAATGCCTTCCACTATCTCTCA GCTAAAGAACCTTAAGCACTTATCTCTCCGGGGATGTAAAAATGCTTTGGGTTTACAAGT ATGGAGTTCACTCTTTTTGTCGCGACTATTTAGGAAAGACCACAACTCTATCGGTCTGGT TTTTCCTAATTTATCAGGTCTTTGCTCATTGACAAAGCTGGACATAAGTGACTGCAATAT TTCAGACGGAGGAATCCTATCTAATCTTGGGTTCTTGCCATCTTTGGAGGAAGTGAATCT CGGAAAGAATAACTTTGTTGGTATTCCATCTGCAAGCATCAATGGTCTAACTCGACTAAA AGTTGTTGAATTGGTTGGTTGTAAGAGGCTCGAGATTTTTCCAGAGCTTCCTTCAAGTAT AGAAGAGGTGTATGCCGATGAATGTACATCACTGAGGAGTATTGGCATTGATCAATTAAC CAAATATCCAATGTTGTCTCGAGTTTCACTTACTCAATGTCACCAATTTGTCAAAAATGA ACCTGATGTTGCTATTATTGATTCACTGTGGAATCACATGCTCAAGGGACTATCGATGGT GGATGATGAATTCAGTATATGTATCCCTGGATCTGAAGTTCCTGACTGGTTTATGTACAA GAACTTGGGTCCTTCATTATCAGTGAAGCTACCTAAAAATTGGTACACAAACAAATTCAT GGGCTTTGCTCTTTGTGTTGTTTTTGACAGTTTCAAGGAACCTTCCTGTATGAATAATGC TTACCTTCAAAAAATCCCGGGATTTCTGGTCATGTTTAAGCTCGTAAGGCACGATGGAAA GACTGGGGTGTTTTTTAAAAGTATTGGCTCAGTAGGAAGTGAGGAATGTCCTGATTCAGG GCACACTCTACTGGCCTATGCATCATTTGATAATTTTTGGTCAATGTATGAGAAACATGT TTGCAATCCTAACGACTGGATTCAAATCGAGGTTTGTGAGACTGATGCAAATGTTGCAAT CAAAGGTTGGGGGATGCATCTTCTGTACGAGAACGATATTATAAATGATGAGTTGATGAT ACAAAATGCCACCTCTCAAAATGGAAAGATGGGCTTGTTTCATGTAATATTTGATGGATC AAAGTATGTGAAAAGGAAACGACACGGACATAAATCATTTTCTAGGCTGCCACCAGATGA TGAACCAGCTGGATATGTCAATTCATTTGGAGAAACAAGTAATGAAGATTTTGATGAAAC ATTATTTGGGAGAGGAATTACTGGGATTGTAGAAGCTCAACAAACAGTTACTATAAGTAT GCCTGAATCAACCTTTAATTGGATGATGAGACCATCAGTACTTTTGAGTATGTAATTGTT TGAGTTATGTGACATTCTCTTTTTTAGTTAATCAGGGAAAAGAACGTCTTTCTATATTAC TCTGAGGATCTATAGCTGCACAAATATTTATGATTTAGTTTAAATAAAAAAGGGAAATAT TAAAAGACCTACCTAAGTTACAGAGATTGATAATTTTTTGCTC