Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc04g005090.3.1
CDS Infomation	cofactor assembly of complex C (AHRD V3.3 *** AT1G59840.2)
Sequence	ATGGAAGCGGGAAATCTGCTTCGGTTAAACCAACCGCCACAACGACATGTCCATTCTCGT CGTTTCTCTCACAGTCGAACTCTTACTCTTAATGTGAAGGGAGAAATTGGGTATAGAGGG ATGAAGCCACGGAGGGAATGGATAGCTGATTGGGTATCTAATAATGATGATTTGGTTCGG AGTATGCCAATTTATGTGGGTGGATTGTCTTTATTGGCTGTTCTATTCAATCGTACTCTA TCTGGTATTGCTCCAGTCGCTGATGCTAGCAGTTCTCAATCCAGAGCAGATTTATTGACA CTTGGGTTGGCAGTTACCAACATCTTAAATGGTCTTGTTTGGCTTTCAATCCGACCAAAA TCCATATCTGTGGTGAGGGCTGTAAATCCTAAGGGTGTGGAGTGCCAAAGAATAGCTTCT CACCTACCAGATTTTGTTATTTCTGAGCTGCTATGGGCATGGAATTCTCTATCAGATGTC ACATGCTGCAGGTCTCTGGTCGTTGTTTATGATGGAAAATGTATCCTTCAAACTGGGTTT GCTGCTGCATCTTTATCTAATGGAAGTGATGCAGTAGCTGTGGACAGTAATAAATTTATA GAAGGATCACTTTACCAAGGAGTTCTAAAATCTGCATCACAGAGCTACTTGGCCAACTTA TCTCTTTATCCTGGGAAGTCGGAGCTACCATTTCTTCCTTCAAATACACAGGCAGTAATC TTGCAACCTTTAGGAGACAAAGGAATTGCCATAATTGGTGGTGATACAATTAGAGGATTT ACATCTTCTGACCAGGCATGGATCACATTGATCGGAGAGAAGTTAGATGCTACACTGACA AAAGTTATTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc04g005090.3.1
PEP Infomation	cofactor assembly of complex C (AHRD V3.3 *** AT1G59840.2)
Sequence	MEAGNLLRLNQPPQRHVHSRRFSHSRTLTLNVKGEIGYRGMKPRREWIADWVSNNDDLVR SMPIYVGGLSLLAVLFNRTLSGIAPVADASSSQSRADLLTLGLAVTNILNGLVWLSIRPK SISVVRAVNPKGVECQRIASHLPDFVISELLWAWNSLSDVTCCRSLVVVYDGKCILQTGF AAASLSNGSDAVAVDSNKFIEGSLYQGVLKSASQSYLANLSLYPGKSELPFLPSNTQAVI LQPLGDKGIAIIGGDTIRGFTSSDQAWITLIGEKLDATLTKVI*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc04g005090.3.1
Transcript Infomation	cofactor assembly of complex C (AHRD V3.3 *** AT1G59840.2)
Sequence	AGAATTTTGATGATTTGGCCGCTCAGAAATGATTTAGGTGGAATAAAAAAAAGGAAGAAA TATAGGAAACAAGCTAAGGTATTATCCATTTTATGAACCATCGGAAAAATGGAAGCGGGA AATCTGCTTCGGTTAAACCAACCGCCACAACGACATGTCCATTCTCGTCGTTTCTCTCAC AGTCGAACTCTTACTCTTAATGTGAAGGGAGAAATTGGGTATAGAGGGATGAAGCCACGG AGGGAATGGATAGCTGATTGGGTATCTAATAATGATGATTTGGTTCGGAGTATGCCAATT TATGTGGGTGGATTGTCTTTATTGGCTGTTCTATTCAATCGTACTCTATCTGGTATTGCT CCAGTCGCTGATGCTAGCAGTTCTCAATCCAGAGCAGATTTATTGACACTTGGGTTGGCA GTTACCAACATCTTAAATGGTCTTGTTTGGCTTTCAATCCGACCAAAATCCATATCTGTG GTGAGGGCTGTAAATCCTAAGGGTGTGGAGTGCCAAAGAATAGCTTCTCACCTACCAGAT TTTGTTATTTCTGAGCTGCTATGGGCATGGAATTCTCTATCAGATGTCACATGCTGCAGG TCTCTGGTCGTTGTTTATGATGGAAAATGTATCCTTCAAACTGGGTTTGCTGCTGCATCT TTATCTAATGGAAGTGATGCAGTAGCTGTGGACAGTAATAAATTTATAGAAGGATCACTT TACCAAGGAGTTCTAAAATCTGCATCACAGAGCTACTTGGCCAACTTATCTCTTTATCCT GGGAAGTCGGAGCTACCATTTCTTCCTTCAAATACACAGGCAGTAATCTTGCAACCTTTA GGAGACAAAGGAATTGCCATAATTGGTGGTGATACAATTAGAGGATTTACATCTTCTGAC CAGGCATGGATCACATTGATCGGAGAGAAGTTAGATGCTACACTGACAAAAGTTATTTGA CATTCATAGTGGCAGTGCAAAATGGATGTTTTAAGATATTCTAACAGCAGTATCATAAGT TCAAGTGTTTGCTATAATCATGTCTAAATTCAAAGTGATTTTCCTTCCTTTAGTTTATGT TGCACAGATGGCCATGCATTCTAGACAATAAATATGTATCATCTCTTGACTCTTATATTT GGACTCCCTCTCCAAAAGGAGGACTTGCAGTTTCAGCTTGTTTTTATTTTCTACTGACGT ACACAGGTGTTCCCTACATCTTTTAGAGGCAACCTTTGGCTATTGTGAAATATATCATTT ATTGGTTCATTTCATCACTTATGTAGGCACAAAGAGTGGTAATTTCTTTCCATGATTGTT TGCTTTGAAATGATTTCCCTGCGAGCTTTAGCTCTGCTGTCATGTTGATTGGTGAGTGGC TGAGATACTGTAGGAGGTAACATTTTCATCTTTCTTGTGAGAAAATGAGGAAGATAATAT CCAGAGAAAACCAATATGGCAATTTCATTCCTGGACCTTCCATCTCCAAAGGCATAGTTA ATAGTTATCCCAGAGACAACAAATCGTCCTTGATCTAAATGGTTTGAAAGGTAAGCAGTC AGATGTGATCTAGTTGGATCTGGCTCTGGGCAAAGTGATGTTCTTTCAACCTTGAATGGT TGGTTATTCATTGTAATCTGGTTGGATATCGTTTGTGGTGGATATATGAACCTCGCGTGT CCCCTATAGGTTATGCTATCTGACAGATTGATGAGTCTTGAAGTAAGCAGTAATAAGACC AACCCTGCAGCCACTTCAGTTAAGG