Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g121540.3.1
CDS Infomation	beta-galactosidase 3
Sequence	ATGGGTTGTACGCTTATACTAATGTTGAATGTGTTGTTGGTGTTGTTGGGTTCATGGGTT TTTTCTGGAACAGCTTCTGTTTCATATGACCATAGGGCTATTATTGTAAATGGACAAAGA AGAATACTTATTTCTGGTTCTGTTCATTATCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGGCCAGGT ATTATTCAAAAGGCTAAAGAAGGAGGTGTGGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAAT GGACATGAGCCTCAACAAGGGAAATATTATTTTGAAGGGAGATATGATTTAGTGAAGTTT ATTAAGCTGGTGCACCAAGCAGGACTTTATGTCCATCTTAGAGTTGGACCTTATGCTTGT GCTGAATGGAATTTTGGGGGCTTTCCTGTTTGGCTGAAATATGTTCCAGGTATCAGTTTC AGAACAGATAATGGACCTTTCAAGGCTGCAATGCAAAAATTTACTGCCAAGATTGTCAAT ATGATGAAAGCGGAACGTTTGTATGAAACTCAAGGGGGGCCAATAATTTTATCTCAGATT GAGAATGAATATGGACCCATGGAATGGGAACTGGGAGCACCAGGTAAATCTTACGCACAG TGGGCCGCCAAAATGGCTGTGGGTCTTGACACTGGTGTCCCATGGGTTATGTGCAAGCAA GACGATGCCCCTGATCCTATTATAAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGACTACTTTTCT CCAAACAAGGCTTATAAACCAAAGATATGGACTGAAGCCTGGACTGCATGGTTTACTGGT TTTGGAAATCCAGTTCCTTACCGTCCTGCTGAGGACTTGGCATTTTCTGTTGCAAAATTT ATACAGAAGGGAGGTTCCTTCATCAATTATTACATGTATCATGGAGGAACAAACTTTGGA CGGACTGCTGGTGGTCCATTTATTGCTACTAGTTATGACTATGATGCACCACTTGATGAA TATGGATTATTGCGACAACCAAAATGGGGTCACCTGAAAGATCTGCATAGAGCAATAAAG CTTTGTGAACCAGCTTTAGTCTCTGGAGATCCAGCTGTGACAGCACTTGGACACCAGCAG GAGGCCCATGTTTTTAGGTCGAAGGCTGGCTCTTGTGCTGCATTCCTTGCTAACTACGAC CAACACTCTTTTGCTACTGTGTCATTTGCAAACAGGCATTACAACTTGCCACCATGGTCA ATCAGCATTCTTCCCGACTGCAAGAACACTGTATTTAATACAGCACGGATCGGTGCTCAA AGTGCTCAGATGAAGATGACTCCAGTCAGCAGAGGATTGCCCTGGCAGTCATTCAATGAA GAGACATCATCTTATGAAGACAGTAGTTTTACAGTTGTTGGGCTATTGGAACAGATAAAT ACAACAAGAGACGTGTCTGATTATTTGTGGTATTCAACAGATGTCAAGATTGATTCAAGA GAAAAGTTTTTGAGAGGCGGAAAATGGCCTTGGCTTACGATCATGTCAGCTGGGCATGCA TTGCATGTTTTTGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGCATATGGAAGTTTAGAAAAACCG AAACTAACTTTCAGTAAAGCCGTAAATCTGAGAGCAGGTGTTAACAAGATTTCTCTACTG AGCATTGCTGTTGGCCTTCCGAATATCGGCCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGTGTT CTTGGGCCAGTCTCACTAACTGGTCTTGACGAGGGGAAAAGAGATTTAACATGGCAGAAA TGGTCTTACAAGGTTGGTCTAAAAGGAGAAGCCTTGAGCCTCCATTCACTCAGTGGTAGC TCGTCAGTTGAGTGGGTCGAGGGTTCTTTAGTGGCTCAGAGACAGCCACTCACATGGTAC AAGAGCACTTTTAATGCTCCAGCTGGAAATGATCCTTTGGCTTTAGACTTGAATACCATG GGCAAAGGACAAGTGTGGATAAATGGTCAAAGCCTCGGACGCTATTGGCCTGGATATAAA GCATCTGGTAACTGCGGTGCCTGTAACTATGCAGGCTGGTTTAATGAGAAAAAATGCCTA AGTAACTGTGGAGAGGCTTCACAACGATGGTATCATGTTCCCCGTTCTTGGCTGTATCCT ACTGGAAATTTGTTAGTTCTATTTGAGGAATGGGGAGGAGAGCCTCATGGAATCTCTTTG GTAAAAAGAGAAGTTGCAAGTGTTTGTGCAGATATAAACGAATGGCAACCACAGTTGGTG AATTGGCAAATGCAAGCATCTGGTAAAGTTGACAAACCACTGAGACCTAAAGCTCACCTC TCGTGTGCTTCTGGTCAGAAGATTACTTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACACCACAA GGGGTCTGCGGAAGCTTCCGTGAAGGAAGCTGCCACGCCTTCCACTCATATGATGCTTTT GAAAGGTATTGCATCGGGCAAAACTCGTGCTCAGTACCTGTAACACCAGAGATCTTTGGA GGTGATCCATGTCCACATGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAGGTTATTTGCAGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g121540.3.1
PEP Infomation	beta-galactosidase 3
Sequence	MGCTLILMLNVLLVLLGSWVFSGTASVSYDHRAIIVNGQRRILISGSVHYPRSTPEMWPG IIQKAKEGGVDVIQTYVFWNGHEPQQGKYYFEGRYDLVKFIKLVHQAGLYVHLRVGPYAC AEWNFGGFPVWLKYVPGISFRTDNGPFKAAMQKFTAKIVNMMKAERLYETQGGPIILSQI ENEYGPMEWELGAPGKSYAQWAAKMAVGLDTGVPWVMCKQDDAPDPIINACNGFYCDYFS PNKAYKPKIWTEAWTAWFTGFGNPVPYRPAEDLAFSVAKFIQKGGSFINYYMYHGGTNFG RTAGGPFIATSYDYDAPLDEYGLLRQPKWGHLKDLHRAIKLCEPALVSGDPAVTALGHQQ EAHVFRSKAGSCAAFLANYDQHSFATVSFANRHYNLPPWSISILPDCKNTVFNTARIGAQ SAQMKMTPVSRGLPWQSFNEETSSYEDSSFTVVGLLEQINTTRDVSDYLWYSTDVKIDSR EKFLRGGKWPWLTIMSAGHALHVFVNGQLAGTAYGSLEKPKLTFSKAVNLRAGVNKISLL SIAVGLPNIGPHFETWNAGVLGPVSLTGLDEGKRDLTWQKWSYKVGLKGEALSLHSLSGS SSVEWVEGSLVAQRQPLTWYKSTFNAPAGNDPLALDLNTMGKGQVWINGQSLGRYWPGYK ASGNCGACNYAGWFNEKKCLSNCGEASQRWYHVPRSWLYPTGNLLVLFEEWGGEPHGISL VKREVASVCADINEWQPQLVNWQMQASGKVDKPLRPKAHLSCASGQKITSIKFASFGTPQ GVCGSFREGSCHAFHSYDAFERYCIGQNSCSVPVTPEIFGGDPCPHVMKKLSVEVICS*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g121540.3.1
Transcript Infomation	beta-galactosidase 3
Sequence	CAACTCCCAATTCTTCATTTATTCACACTTATTACTCACTCTCATTTACTATTAGCTAAA GTTCATTATTTTTTTTGCATTTTGAAAAAGAAGAAAAAAATAAAGTTAAAGGGGGGGGGA AAAAGTTTTCATTTTGCCTTAAAAAGGCACAATCTTGATAGAAAAGGAGATAATTTTACA TGGGTTGTACGCTTATACTAATGTTGAATGTGTTGTTGGTGTTGTTGGGTTCATGGGTTT TTTCTGGAACAGCTTCTGTTTCATATGACCATAGGGCTATTATTGTAAATGGACAAAGAA GAATACTTATTTCTGGTTCTGTTCATTATCCAAGAAGCACTCCTGAGATGTGGCCAGGTA TTATTCAAAAGGCTAAAGAAGGAGGTGTGGATGTGATTCAGACTTATGTTTTCTGGAATG GACATGAGCCTCAACAAGGGAAATATTATTTTGAAGGGAGATATGATTTAGTGAAGTTTA TTAAGCTGGTGCACCAAGCAGGACTTTATGTCCATCTTAGAGTTGGACCTTATGCTTGTG CTGAATGGAATTTTGGGGGCTTTCCTGTTTGGCTGAAATATGTTCCAGGTATCAGTTTCA GAACAGATAATGGACCTTTCAAGGCTGCAATGCAAAAATTTACTGCCAAGATTGTCAATA TGATGAAAGCGGAACGTTTGTATGAAACTCAAGGGGGGCCAATAATTTTATCTCAGATTG AGAATGAATATGGACCCATGGAATGGGAACTGGGAGCACCAGGTAAATCTTACGCACAGT GGGCCGCCAAAATGGCTGTGGGTCTTGACACTGGTGTCCCATGGGTTATGTGCAAGCAAG ACGATGCCCCTGATCCTATTATAAATGCTTGCAATGGCTTCTACTGTGACTACTTTTCTC CAAACAAGGCTTATAAACCAAAGATATGGACTGAAGCCTGGACTGCATGGTTTACTGGTT TTGGAAATCCAGTTCCTTACCGTCCTGCTGAGGACTTGGCATTTTCTGTTGCAAAATTTA TACAGAAGGGAGGTTCCTTCATCAATTATTACATGTATCATGGAGGAACAAACTTTGGAC GGACTGCTGGTGGTCCATTTATTGCTACTAGTTATGACTATGATGCACCACTTGATGAAT ATGGATTATTGCGACAACCAAAATGGGGTCACCTGAAAGATCTGCATAGAGCAATAAAGC TTTGTGAACCAGCTTTAGTCTCTGGAGATCCAGCTGTGACAGCACTTGGACACCAGCAGG AGGCCCATGTTTTTAGGTCGAAGGCTGGCTCTTGTGCTGCATTCCTTGCTAACTACGACC AACACTCTTTTGCTACTGTGTCATTTGCAAACAGGCATTACAACTTGCCACCATGGTCAA TCAGCATTCTTCCCGACTGCAAGAACACTGTATTTAATACAGCACGGATCGGTGCTCAAA GTGCTCAGATGAAGATGACTCCAGTCAGCAGAGGATTGCCCTGGCAGTCATTCAATGAAG AGACATCATCTTATGAAGACAGTAGTTTTACAGTTGTTGGGCTATTGGAACAGATAAATA CAACAAGAGACGTGTCTGATTATTTGTGGTATTCAACAGATGTCAAGATTGATTCAAGAG AAAAGTTTTTGAGAGGCGGAAAATGGCCTTGGCTTACGATCATGTCAGCTGGGCATGCAT TGCATGTTTTTGTGAATGGTCAATTAGCAGGAACTGCATATGGAAGTTTAGAAAAACCGA AACTAACTTTCAGTAAAGCCGTAAATCTGAGAGCAGGTGTTAACAAGATTTCTCTACTGA GCATTGCTGTTGGCCTTCCGAATATCGGCCCACATTTTGAGACATGGAATGCTGGTGTTC TTGGGCCAGTCTCACTAACTGGTCTTGACGAGGGGAAAAGAGATTTAACATGGCAGAAAT GGTCTTACAAGGTTGGTCTAAAAGGAGAAGCCTTGAGCCTCCATTCACTCAGTGGTAGCT CGTCAGTTGAGTGGGTCGAGGGTTCTTTAGTGGCTCAGAGACAGCCACTCACATGGTACA AGAGCACTTTTAATGCTCCAGCTGGAAATGATCCTTTGGCTTTAGACTTGAATACCATGG GCAAAGGACAAGTGTGGATAAATGGTCAAAGCCTCGGACGCTATTGGCCTGGATATAAAG CATCTGGTAACTGCGGTGCCTGTAACTATGCAGGCTGGTTTAATGAGAAAAAATGCCTAA GTAACTGTGGAGAGGCTTCACAACGATGGTATCATGTTCCCCGTTCTTGGCTGTATCCTA CTGGAAATTTGTTAGTTCTATTTGAGGAATGGGGAGGAGAGCCTCATGGAATCTCTTTGG TAAAAAGAGAAGTTGCAAGTGTTTGTGCAGATATAAACGAATGGCAACCACAGTTGGTGA ATTGGCAAATGCAAGCATCTGGTAAAGTTGACAAACCACTGAGACCTAAAGCTCACCTCT CGTGTGCTTCTGGTCAGAAGATTACTTCAATCAAATTTGCAAGCTTTGGAACACCACAAG GGGTCTGCGGAAGCTTCCGTGAAGGAAGCTGCCACGCCTTCCACTCATATGATGCTTTTG AAAGGTATTGCATCGGGCAAAACTCGTGCTCAGTACCTGTAACACCAGAGATCTTTGGAG GTGATCCATGTCCACATGTTATGAAGAAACTCTCAGTTGAGGTTATTTGCAGTTGATGAC ACTGAGGAGAAACAAATAAAAGTGGTTTCAGTTAGTTGTCTGAACATATCAAAAAGTTGG CTTTGATGGAGGTGAAGTTGTACAGATATGCAACACACCTTTCCATTTGAGGCACATATG AATTGCAATGGCCCAAGATTCTGTACATATATGTTGGTTACTGTCAAGTTGGTATTGGTT TGCAAATGTAAAACAGTAGTATAGTCATTGGTTCAAGTGCGCATCGAGATTGTGCTA