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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g120070.3.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U5FID5_POPTR)

Sequence

CTAGGAATGATAATTAACGAATCTGTGCGGCTATATCCACCAGCAGTGGCAGCAATTAGA
CGAGCAAAAGTTGATACACAACTAGGGGATTTCACATTACCTAGAGGGACTGAACTCCTT
ATACCAATTATAGCAATCCATCACGATCAAACACTATGGGGACAAGATGCTAACGAATTT
AATCCAGCAAGATTTGGTCTAGGAGTAGCACAAGCAGCAAAACACCCCATGGCGTTCATG
CCTTTTGGCCTCGGCGCGCGGCGATGCGCGGCATTCCGGTCGTCGCTCACTGGTGTCTAT
CGCCGCTTCATTACTGAGTCCACCGTCTTCCGCCCACAGATTCCAAATCGACGGGAAATG
CAGCCCCTATTACTCGTCTCGGAGGAATCTCAGTTTCTTCTTCGGATACTGAACGGGAGT
TTTCAAACCCTAGACATAATTAAGGACCGCATTTTTCACGATTTTGCCAATTTGTTCTGC
TCGAAAGCGAATTTGGATGTTATTGACATGAGACAAGAAAATGTAATGCATAGTGTGAAT
CGGGACGAGCTGGGATCCAAAGATTGGTCATCTAAGGGAAACAATTCGAATCCAGAAGGT
GACTCGACAGCGGGTTTCAGTGTGTTGGATACAATGTTAAAGCGCAGTTTGGATCGTCTG
AAGAGTATGAGGGAAAGAATATCGTTGGCTGAAGCAGGCATTAATTACTGCACCTGGGAA
ATAAATTTCAATAAAGATGCATATGTTGTTAGAGCCATGTGTCTGGATGGTCAACTGGGA
GCAGCTTTATCGCTTTGGTGGAACATGATACAGAATAGTATTGTTCCTGATGTTATCACA
CACAATTACCTCATCAATGCACTCTGCAAAAACGGTGAGTTAGAGAAGGCAGAATGGATT
GTTAGAGGTATGCTATATAGGGGTCCTTCTCCCACTTGTGCTGCATTCAACTCTTTAATA
AGGGGTTATTGCCTGGTGAATGATGTTGACAATGCTCTAAACACCTTTTCTACCATGGCC
AACCATGGAATTGTACCAAACAGAGTAACTTGTAACATCCTTGTTCATGCGCTTTGTAAG
AAGGGGCTGTTGGAGGAGGCAAATAATCTTTTCCATAAATTATTAAGCAAAGTTCATAAC
GGGGGGAGCTCAAATTTGATTACATCAACCATTATGATGGATGGCTGCTTTAAAAATGGA
GATACTGATCAAGCTCTTGCTTTTTGGGAGAGGATGTTATTAGAGCGTACCCAAGTTGAT
AAAGTTTCTTATAATGTTGTTATTCATGGATTTTGTTTGAGCCATGACCTGGGCACTGCA
TATAAGTATTGTTGTGAAATGTTAAAACTTGGTTTTGTTCCAGATGTTTATTCTTACAAC
ACTCTAATTGGAGCACTCTGTAGACAAGGAAAGATCAGTGATGCTTGTTATATCTATGAT
GTTATGACTGGAATGGGTGTCAAACCAGATCACATCACGTATAGAATGATAATACAGGGC
CTATGTATTAACAGGGAGATAGATAGAGCCAATTGTTTTCTTGATTACATGTTAGAGTAT
TCCCTTATACCTGAACCACTTGTTTGGAATGTTATAATTAATGGTTATGGAAGATGTGGA
GATATACAAAAAGCTTCATATATTAGAGAAAAAATGGTTGCATGTGGTGTTCTACCAAAC
ATATATACATATAATGCATTAATTTATGCTCAGATAAAGTCAGGAAATCTTTCTGCAGCT
CAGTCCTTGGAGAAGGAGTTGCTTCTATATGGTCTTACCCCTGATTCAGTCACTTACAAT
CTGTTGATTGGTGCTGCTTGTAATCTTGGCCTGATTCACTCAGCACTTCAACTACATGAT
AAAATGTTGAGAAAAGGTTGTCAGCCAGATGTAATTACTTACACGGAACTACTTAAGGTG
TTCTGTGTACAAGGTATGATGAGAGAGGCAGACAAGCTCTTTGGCAGGTTAATGGCATCT
GGTTTAGCAGTTGACCATGTTCCCTTTCTGATACTCATGAAAAGATACTGCAGAATGGGA
GAATTTAATGAAGTCTATGACCTTCACCAAAAGTGGTTAGAGACAATGCCCAGATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g120070.3.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U5FID5_POPTR)

Sequence

LGMIINESVRLYPPAVAAIRRAKVDTQLGDFTLPRGTELLIPIIAIHHDQTLWGQDANEF
NPARFGLGVAQAAKHPMAFMPFGLGARRCAAFRSSLTGVYRRFITESTVFRPQIPNRREM
QPLLLVSEESQFLLRILNGSFQTLDIIKDRIFHDFANLFCSKANLDVIDMRQENVMHSVN
RDELGSKDWSSKGNNSNPEGDSTAGFSVLDTMLKRSLDRLKSMRERISLAEAGINYCTWE
INFNKDAYVVRAMCLDGQLGAALSLWWNMIQNSIVPDVITHNYLINALCKNGELEKAEWI
VRGMLYRGPSPTCAAFNSLIRGYCLVNDVDNALNTFSTMANHGIVPNRVTCNILVHALCK
KGLLEEANNLFHKLLSKVHNGGSSNLITSTIMMDGCFKNGDTDQALAFWERMLLERTQVD
KVSYNVVIHGFCLSHDLGTAYKYCCEMLKLGFVPDVYSYNTLIGALCRQGKISDACYIYD
VMTGMGVKPDHITYRMIIQGLCINREIDRANCFLDYMLEYSLIPEPLVWNVIINGYGRCG
DIQKASYIREKMVACGVLPNIYTYNALIYAQIKSGNLSAAQSLEKELLLYGLTPDSVTYN
LLIGAACNLGLIHSALQLHDKMLRKGCQPDVITYTELLKVFCVQGMMREADKLFGRLMAS
GLAVDHVPFLILMKRYCRMGEFNEVYDLHQKWLETMPR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g120070.3.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** U5FID5_POPTR)

Sequence

CTAGGAATGATAATTAACGAATCTGTGCGGCTATATCCACCAGCAGTGGCAGCAATTAGA
CGAGCAAAAGTTGATACACAACTAGGGGATTTCACATTACCTAGAGGGACTGAACTCCTT
ATACCAATTATAGCAATCCATCACGATCAAACACTATGGGGACAAGATGCTAACGAATTT
AATCCAGCAAGATTTGGTCTAGGAGTAGCACAAGCAGCAAAACACCCCATGGCGTTCATG
CCTTTTGGCCTCGGCGCGCGGCGATGCGCGGCATTCCGGTCGTCGCTCACTGGTGTCTAT
CGCCGCTTCATTACTGAGTCCACCGTCTTCCGCCCACAGATTCCAAATCGACGGGAAATG
CAGCCCCTATTACTCGTCTCGGAGGAATCTCAGTTTCTTCTTCGGATACTGAACGGGAGT
TTTCAAACCCTAGACATAATTAAGGACCGCATTTTTCACGATTTTGCCAATTTGTTCTGC
TCGAAAGCGAATTTGGATGTTATTGACATGAGACAAGAAAATGTAATGCATAGTGTGAAT
CGGGACGAGCTGGGATCCAAAGATTGGTCATCTAAGGGAAACAATTCGAATCCAGAAGGT
GACTCGACAGCGGGTTTCAGTGTGTTGGATACAATGTTAAAGCGCAGTTTGGATCGTCTG
AAGAGTATGAGGGAAAGAATATCGTTGGCTGAAGCAGGCATTAATTACTGCACCTGGGAA
ATAAATTTCAATAAAGATGCATATGTTGTTAGAGCCATGTGTCTGGATGGTCAACTGGGA
GCAGCTTTATCGCTTTGGTGGAACATGATACAGAATAGTATTGTTCCTGATGTTATCACA
CACAATTACCTCATCAATGCACTCTGCAAAAACGGTGAGTTAGAGAAGGCAGAATGGATT
GTTAGAGGTATGCTATATAGGGGTCCTTCTCCCACTTGTGCTGCATTCAACTCTTTAATA
AGGGGTTATTGCCTGGTGAATGATGTTGACAATGCTCTAAACACCTTTTCTACCATGGCC
AACCATGGAATTGTACCAAACAGAGTAACTTGTAACATCCTTGTTCATGCGCTTTGTAAG
AAGGGGCTGTTGGAGGAGGCAAATAATCTTTTCCATAAATTATTAAGCAAAGTTCATAAC
GGGGGGAGCTCAAATTTGATTACATCAACCATTATGATGGATGGCTGCTTTAAAAATGGA
GATACTGATCAAGCTCTTGCTTTTTGGGAGAGGATGTTATTAGAGCGTACCCAAGTTGAT
AAAGTTTCTTATAATGTTGTTATTCATGGATTTTGTTTGAGCCATGACCTGGGCACTGCA
TATAAGTATTGTTGTGAAATGTTAAAACTTGGTTTTGTTCCAGATGTTTATTCTTACAAC
ACTCTAATTGGAGCACTCTGTAGACAAGGAAAGATCAGTGATGCTTGTTATATCTATGAT
GTTATGACTGGAATGGGTGTCAAACCAGATCACATCACGTATAGAATGATAATACAGGGC
CTATGTATTAACAGGGAGATAGATAGAGCCAATTGTTTTCTTGATTACATGTTAGAGTAT
TCCCTTATACCTGAACCACTTGTTTGGAATGTTATAATTAATGGTTATGGAAGATGTGGA
GATATACAAAAAGCTTCATATATTAGAGAAAAAATGGTTGCATGTGGTGTTCTACCAAAC
ATATATACATATAATGCATTAATTTATGCTCAGATAAAGTCAGGAAATCTTTCTGCAGCT
CAGTCCTTGGAGAAGGAGTTGCTTCTATATGGTCTTACCCCTGATTCAGTCACTTACAAT
CTGTTGATTGGTGCTGCTTGTAATCTTGGCCTGATTCACTCAGCACTTCAACTACATGAT
AAAATGTTGAGAAAAGGTTGTCAGCCAGATGTAATTACTTACACGGAACTACTTAAGGTG
TTCTGTGTACAAGGTATGATGAGAGAGGCAGACAAGCTCTTTGGCAGGTTAATGGCATCT
GGTTTAGCAGTTGACCATGTTCCCTTTCTGATACTCATGAAAAGATACTGCAGAATGGGA
GAATTTAATGAAGTCTATGACCTTCACCAAAAGTGGTTAGAGACAATGCCCAGATGA