Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g119950.1.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GWP3_POPTR)
Sequence	ATGGCGGCGGTCTCTGCTAAAACCCCAACTATATCTCTCCCTTTAGACCCCCAGAACCCT CAATTCTCTAAACTCCATTCTTCTAAATCTCTAAATTTCTCTCATATCTTCCAAAAATCC CATCTTTTTTCCCTTAAAAAACCCCACCAAAATTCTATCCTTAGTTCCTCTTCCACCTCT ACTCCCACCACTGACCCGAATTCCCATCTTATCCAATTATGCTTCCACAACCAGCTGGAA CAAGCAATAGTGTTCTTGAAGTCAATAAAGGACCTTCATGGCACCATAGAAGAAGACACT TTTGTTACTTTAGCTAGGCTTTGTGAATTCAAGAGAGCATCGAATGAGGCGTGTGAAGTA TTTTCTTGCATACACAACTGTATGACCCAGTTGAGCTTGAGGCTTGGAAATGCCTTGCTG AGTATGTTTGTCAGGTTGGGGAATTTGGGTGATGCTTGGTATGTTTTTGGGAAAATGGAG GAAAGGGATGTGTTCTCTTGGAATGTTTTGATTGGTGGGTATGCGAAAAATGGGTATTTT GATGAGGCTTTGGATTTGTATCAACGGATGTTGTGGGTTGGAATTAGGCCTGATGTCTAT ACTTTTCCTTGTGTCTTGAGGACTTGTGGGGGTTTGCCTGATTGGAGAATGGGTAGGGAG ATACATGCTCATGTAATACGTTTTAGCTATGATTCGGAAATCGATGTCGTTAATGCATTG ATTACAATGTATGTTAAGTGTGGTGATGTTTGCAGTGCAAGAGTGCTGTTTGATGGAATG TCTAAGAGAGATAGAATTTCTTGGAATGCTATGATTTCGGGTTACTTTGAGAATGGTGAG TTTTTGGAGGGGTTAGTCTTGTTCTCCTCAATGCGGGAATTTGGTTTTTTTCCGGATTTG ATGACTATGACAAGTGTGATTTCAGCTTGTGAGGCTCTTGGGGATGACAGGTTAGGGAGA GCACTTCACGGGTATGTGGCAAGAATGGAATTTTATAGTGATGTTTCGGCTCATAACTCT CTCATCCAACTTTATTCAGCTATTGGGAGCTGGGAGGAAGCAGAAAAGATCTTTGATAGG ATACAATGTAAAGATGTAGTTTCATGGACTGCAATGATTTCGGGTTATGAGAGTAATGGG TTTCCTGAGAAGGCCGTTAAAACGTACAAAATGATGGAGCTAGAAGGTGTCATGCCGGAT GAAATTACTATTGCTTCTGTTCTATCTGCCTGTACGTCATTAGGCCTTCTAGAAATGGGT GTTAAGCTTCAACATGTAGCCGAAAGAAGAGGACTTATAGCATACGTGATTGTCTCAAAC ACTCTGATCGACTTGTTTTCAAAGTGCAACTGTATTGACAAGGCATTGGAAATTTTTCAC AGGATACCGGATAAAAACGTCATATCTTGGACTTCTATCATTCTTGGTCTTAGGATAAAT AATCGCAGTTTGGAAGCTTTAAATTTTTTTAGAGAAATGAAACGCCATCAGGATCCCAAT TCTGTTACCTTAATGTCTGTCCTCTCTGCATGTTCTAGAATCGGTGCACTGATGTGTGGT AAAGAAATACATGCATATGTATTGAGAAATGGAATGGAATTTCATGGTTTTTTACCCAAT GCACTCCTTGATTTCTACGTGAGGTGTGGAAGGAGGGCCCCAGCACTGAATCTGTTTCAT ATGCAGAAAGAGGATGTTACTGCTTGGAATATCTTGCTGACTGGCTATGCTCAGCGAGGG CTAGGTGCACTTGCAATCGAGCTTTTTGATGGAATGATAAGTTCAAGAGTAAAGCCAGAC GAAATTACTTTCATTTCTCTGTTACGTGCTTGTAGTAGATCTGGGTTGGTGACTGAAGGC CTTGATTATTTGAATAGCATGGAGAGTAAATACTGTATTGTTCCCAATCTGAAGCATTAT GCTTGTGTGGTTGATCTGCTAGGCCGTGCAGGTTTAGTGGAAGATGCTTATGATTTTATT CTATCATTGCCTGTGAAACCCGATTCCGCTATCTGGGGGGCTTTATTAAATGCGTGTAGG ATCCACAGGCAGATTGAACTTGGAGAACTAGCAGCTAGACACATCCTTGAAACAGATGAG AGAGGTGTGGGATATTATGTACTCCTCTGCAACTTCTATTCTGACAATGGTAGATGGGAT GAAGTTGTAAGATTAAGGAAGATTATGATAGAAAAAGGACTGACTATTGATCCTGGTTGC AGCTGGATAGAAGTAAAGGGAAATGTGCATGCATTTCTTAGTGGTGATAACTTACATCCC CAAAGCAAGGAGATTAATGCAGTTCTAGAAGGATTTTATGAAAAAATGGAGGCAGCACGT CGTAGTAAATCAGAGAGACATACAGTAAATGAAGTTAAAGACTCAAAAGCCGAGATCTTT TGTGGACACAGTGAGAGACTAGCTATTGGATTTGGTCTTATAAATACAGCTCCAGGGACG CCTATTTGGGTTACAAAGAATCTTTATATGTGCAAGAGCTGTCACGACACAATCAAGTTT ATCTCTGAGGTTGTTCGGAGGGAGATTGCAGTTAGAGATACTGAGCAATTCCATCATTTT AAGGATGGAAGATGCACATGTGGGGATGAAAATTATTTGGGAGAAACTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g119950.1.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GWP3_POPTR)
Sequence	MAAVSAKTPTISLPLDPQNPQFSKLHSSKSLNFSHIFQKSHLFSLKKPHQNSILSSSSTS TPTTDPNSHLIQLCFHNQLEQAIVFLKSIKDLHGTIEEDTFVTLARLCEFKRASNEACEV FSCIHNCMTQLSLRLGNALLSMFVRLGNLGDAWYVFGKMEERDVFSWNVLIGGYAKNGYF DEALDLYQRMLWVGIRPDVYTFPCVLRTCGGLPDWRMGREIHAHVIRFSYDSEIDVVNAL ITMYVKCGDVCSARVLFDGMSKRDRISWNAMISGYFENGEFLEGLVLFSSMREFGFFPDL MTMTSVISACEALGDDRLGRALHGYVARMEFYSDVSAHNSLIQLYSAIGSWEEAEKIFDR IQCKDVVSWTAMISGYESNGFPEKAVKTYKMMELEGVMPDEITIASVLSACTSLGLLEMG VKLQHVAERRGLIAYVIVSNTLIDLFSKCNCIDKALEIFHRIPDKNVISWTSIILGLRIN NRSLEALNFFREMKRHQDPNSVTLMSVLSACSRIGALMCGKEIHAYVLRNGMEFHGFLPN ALLDFYVRCGRRAPALNLFHMQKEDVTAWNILLTGYAQRGLGALAIELFDGMISSRVKPD EITFISLLRACSRSGLVTEGLDYLNSMESKYCIVPNLKHYACVVDLLGRAGLVEDAYDFI LSLPVKPDSAIWGALLNACRIHRQIELGELAARHILETDERGVGYYVLLCNFYSDNGRWD EVVRLRKIMIEKGLTIDPGCSWIEVKGNVHAFLSGDNLHPQSKEINAVLEGFYEKMEAAR RSKSERHTVNEVKDSKAEIFCGHSERLAIGFGLINTAPGTPIWVTKNLYMCKSCHDTIKF ISEVVRREIAVRDTEQFHHFKDGRCTCGDENYLGET*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g119950.1.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9GWP3_POPTR)
Sequence	ATGGCGGCGGTCTCTGCTAAAACCCCAACTATATCTCTCCCTTTAGACCCCCAGAACCCT CAATTCTCTAAACTCCATTCTTCTAAATCTCTAAATTTCTCTCATATCTTCCAAAAATCC CATCTTTTTTCCCTTAAAAAACCCCACCAAAATTCTATCCTTAGTTCCTCTTCCACCTCT ACTCCCACCACTGACCCGAATTCCCATCTTATCCAATTATGCTTCCACAACCAGCTGGAA CAAGCAATAGTGTTCTTGAAGTCAATAAAGGACCTTCATGGCACCATAGAAGAAGACACT TTTGTTACTTTAGCTAGGCTTTGTGAATTCAAGAGAGCATCGAATGAGGCGTGTGAAGTA TTTTCTTGCATACACAACTGTATGACCCAGTTGAGCTTGAGGCTTGGAAATGCCTTGCTG AGTATGTTTGTCAGGTTGGGGAATTTGGGTGATGCTTGGTATGTTTTTGGGAAAATGGAG GAAAGGGATGTGTTCTCTTGGAATGTTTTGATTGGTGGGTATGCGAAAAATGGGTATTTT GATGAGGCTTTGGATTTGTATCAACGGATGTTGTGGGTTGGAATTAGGCCTGATGTCTAT ACTTTTCCTTGTGTCTTGAGGACTTGTGGGGGTTTGCCTGATTGGAGAATGGGTAGGGAG ATACATGCTCATGTAATACGTTTTAGCTATGATTCGGAAATCGATGTCGTTAATGCATTG ATTACAATGTATGTTAAGTGTGGTGATGTTTGCAGTGCAAGAGTGCTGTTTGATGGAATG TCTAAGAGAGATAGAATTTCTTGGAATGCTATGATTTCGGGTTACTTTGAGAATGGTGAG TTTTTGGAGGGGTTAGTCTTGTTCTCCTCAATGCGGGAATTTGGTTTTTTTCCGGATTTG ATGACTATGACAAGTGTGATTTCAGCTTGTGAGGCTCTTGGGGATGACAGGTTAGGGAGA GCACTTCACGGGTATGTGGCAAGAATGGAATTTTATAGTGATGTTTCGGCTCATAACTCT CTCATCCAACTTTATTCAGCTATTGGGAGCTGGGAGGAAGCAGAAAAGATCTTTGATAGG ATACAATGTAAAGATGTAGTTTCATGGACTGCAATGATTTCGGGTTATGAGAGTAATGGG TTTCCTGAGAAGGCCGTTAAAACGTACAAAATGATGGAGCTAGAAGGTGTCATGCCGGAT GAAATTACTATTGCTTCTGTTCTATCTGCCTGTACGTCATTAGGCCTTCTAGAAATGGGT GTTAAGCTTCAACATGTAGCCGAAAGAAGAGGACTTATAGCATACGTGATTGTCTCAAAC ACTCTGATCGACTTGTTTTCAAAGTGCAACTGTATTGACAAGGCATTGGAAATTTTTCAC AGGATACCGGATAAAAACGTCATATCTTGGACTTCTATCATTCTTGGTCTTAGGATAAAT AATCGCAGTTTGGAAGCTTTAAATTTTTTTAGAGAAATGAAACGCCATCAGGATCCCAAT TCTGTTACCTTAATGTCTGTCCTCTCTGCATGTTCTAGAATCGGTGCACTGATGTGTGGT AAAGAAATACATGCATATGTATTGAGAAATGGAATGGAATTTCATGGTTTTTTACCCAAT GCACTCCTTGATTTCTACGTGAGGTGTGGAAGGAGGGCCCCAGCACTGAATCTGTTTCAT ATGCAGAAAGAGGATGTTACTGCTTGGAATATCTTGCTGACTGGCTATGCTCAGCGAGGG CTAGGTGCACTTGCAATCGAGCTTTTTGATGGAATGATAAGTTCAAGAGTAAAGCCAGAC GAAATTACTTTCATTTCTCTGTTACGTGCTTGTAGTAGATCTGGGTTGGTGACTGAAGGC CTTGATTATTTGAATAGCATGGAGAGTAAATACTGTATTGTTCCCAATCTGAAGCATTAT GCTTGTGTGGTTGATCTGCTAGGCCGTGCAGGTTTAGTGGAAGATGCTTATGATTTTATT CTATCATTGCCTGTGAAACCCGATTCCGCTATCTGGGGGGCTTTATTAAATGCGTGTAGG ATCCACAGGCAGATTGAACTTGGAGAACTAGCAGCTAGACACATCCTTGAAACAGATGAG AGAGGTGTGGGATATTATGTACTCCTCTGCAACTTCTATTCTGACAATGGTAGATGGGAT GAAGTTGTAAGATTAAGGAAGATTATGATAGAAAAAGGACTGACTATTGATCCTGGTTGC AGCTGGATAGAAGTAAAGGGAAATGTGCATGCATTTCTTAGTGGTGATAACTTACATCCC CAAAGCAAGGAGATTAATGCAGTTCTAGAAGGATTTTATGAAAAAATGGAGGCAGCACGT CGTAGTAAATCAGAGAGACATACAGTAAATGAAGTTAAAGACTCAAAAGCCGAGATCTTT TGTGGACACAGTGAGAGACTAGCTATTGGATTTGGTCTTATAAATACAGCTCCAGGGACG CCTATTTGGGTTACAAAGAATCTTTATATGTGCAAGAGCTGTCACGACACAATCAAGTTT ATCTCTGAGGTTGTTCGGAGGGAGATTGCAGTTAGAGATACTGAGCAATTCCATCATTTT AAGGATGGAAGATGCACATGTGGGGATGAAAATTATTTGGGAGAAACTTGA