Plant GARDEN
How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Species By Keywords Genes By Markers By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only) Sequences Other Tools

Data List

All Markers Trait-Related Loci
Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g119720.3.1
CDS Infomation

Lipase family protein (AHRD V3.3 *** B9I2Q8_POPTR)
Sequence

ATGCAACGGCTCGTTGACCATACCCTTGCTGTTACCAAAGAGTCAGTTAAGACATTGACC
TATGAGTCGCTGAATAATGTTGTGAGATTGATTAATGGAGTGTCAGCACTATTATTGACA
CTATTGCCGGGGAAATCTACTATTCTTGAAGGCATACATGGCTGGGAACTTCGTCCAACC
TTTCGTGGACCTCGGCTTCCACAGTGGATGGAGAATGGCGCCTCATCTTTTAACCAGTTC
ATCCATGAACATTCTTTTGATTCTGATTCCTCCTCCTCAAGTGTAGATTATTCATCAGAA
GAAGAAGAACAATATACTGATGAAACCAGTTGTCCTCCATCTCCACTGTCACAAAGTTCT
CGGGTTTCTAGAGCCCGCAGTCTTTCAAGGCGGAACAGGCATTGGATACATTGGTTCAGA
TACATCATCTCATGGCTCCTATTCCCTATTAAATTTATGTTGGGCCTACCTTTGTTTATA
TATGCTTTGAGTAGGGGCCGTAGAGCCTCTCGGACATCTGAGAATTTTCAGTCTTCCCAT
GTACAAGCTAGGAAGAGATTACAGACACTTAGGGACCAAGTTATCCAGTCTACCACTGAC
AGAAGACGTGGCGTTGTCGAGGATCTCCATCTAGCAATTGAGATCACCATAGAGGCTGTT
TTTGAATTTTTCCACAAGGCTGCACACTGTCTTCTTTCACCAATAGACACCTTGAAGAAA
GTGGTGAAGTGGTTTTCTTCTGACTACAGTGGTCGTGTGGACGTTCCCACTGTCGGTTCA
GGTGTCTCTGTTCCTGTGGACACCCTTTCAGAGAGTGATCCTACTCCAAGAGAACAGAAA
ACGGGCTTTCATTCCCTAAATACAGATGCTCGGACATGTCAAGATGTCATTACAGAGCTT
GGATACCCATATGAAGCTCTTCGTGTGGTTACTGATGATGGATATATTCTCCTTTTGGAG
AGAATTCCAAGACGTGATGCTCGAAAAGTTGTTTATCTACAACATGGGATTTTTGATTCA
TCCATGGGGTGGGTATCAAACGGAGTTGTTGGTTCCCCAGCATTTGCAGCCTATGATCAA
GGGTATGATGTTTTCCTAGGAAATTTCCGGGGATTGGTGTCGAGAGAGCACGTTGACAAG
AATATATCCTCACGTCGGTACTGGAAGTACTCCATAAATGAGCATGGGACACAGGATATA
CCTGCAATGATAGAGAAGATCCACCAAACAAAAGTTACTGAATTGAAAAATAGCCAAAAA
GTTGTGGAGGAAGAGAGTGGCAATGATCAGCCTTACAAACTTTGTGCAATTTGTCATAGT
TTGGGTGGAGCTGCTATTTTAATGTACATTCTAACACGTCGAATTGAGGTAAAGCCCCAT
AGGCTTTCCAGATTAATCTTATTATCACCGGCTGGGTTTCATCATGATTCCAATCCTGTA
TTCACCATGATGGAATGCTTATTCCTGGTATTGTCTCCTCTACTTGCCCCTTTTGTGTCA
GCTTTCTATATTCCCACTCGGTTTTTCCGCATGTTGTTTAACAAGTTGGCCCGAGACTTC
CATAACTTACCAGCAGTTGGAGGCCTTGTGCAAACTCTCATAAGTTATTTGGTTGGTGGA
GACAGCTCCAATTGGGTTGGAGCCTTAGGGTTGCCACACTACAATATGAATGATATGCCA
GCTGTTTCATTCCGTGTGGCCCTTCATTTGGCACAGATCAAGAACACTCGGAAGTTTATG
ATGTTTGACTATGGGAGTGCAGCTGCGAACATGAAAGCTTATGGTTCCCCTCATCCTTTA
GATTTGGGGGAGTTCTATTCCCTTATTGATATTCCGGTTGATCTTGTTGCTGGGCGTAAG
GACAAGGTCATCAGGCCGTCCATGGTAAGGAAGCATTATAAGCTGATGAAGGATGCAGGT
GTGGAGGTGTCATATAATGAGTTTGAGTATGCTCATTTGGATTTTACATTTTCCCACCAT
GAAGAACTATTGGCCTATGTTATGTCTCGATTAATTTTAGTAGATGCTTCTATGAAGCAG
CAACCTGGCCAGAAATCATTGAAGAACAGGAGAAAAGAGGGGCAAACCAGCAGCAGCCGT
TAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g119720.3.1
PEP Infomation

Lipase family protein (AHRD V3.3 *** B9I2Q8_POPTR)
Sequence

MQRLVDHTLAVTKESVKTLTYESLNNVVRLINGVSALLLTLLPGKSTILEGIHGWELRPT
FRGPRLPQWMENGASSFNQFIHEHSFDSDSSSSSVDYSSEEEEQYTDETSCPPSPLSQSS
RVSRARSLSRRNRHWIHWFRYIISWLLFPIKFMLGLPLFIYALSRGRRASRTSENFQSSH
VQARKRLQTLRDQVIQSTTDRRRGVVEDLHLAIEITIEAVFEFFHKAAHCLLSPIDTLKK
VVKWFSSDYSGRVDVPTVGSGVSVPVDTLSESDPTPREQKTGFHSLNTDARTCQDVITEL
GYPYEALRVVTDDGYILLLERIPRRDARKVVYLQHGIFDSSMGWVSNGVVGSPAFAAYDQ
GYDVFLGNFRGLVSREHVDKNISSRRYWKYSINEHGTQDIPAMIEKIHQTKVTELKNSQK
VVEEESGNDQPYKLCAICHSLGGAAILMYILTRRIEVKPHRLSRLILLSPAGFHHDSNPV
FTMMECLFLVLSPLLAPFVSAFYIPTRFFRMLFNKLARDFHNLPAVGGLVQTLISYLVGG
DSSNWVGALGLPHYNMNDMPAVSFRVALHLAQIKNTRKFMMFDYGSAAANMKAYGSPHPL
DLGEFYSLIDIPVDLVAGRKDKVIRPSMVRKHYKLMKDAGVEVSYNEFEYAHLDFTFSHH
EELLAYVMSRLILVDASMKQQPGQKSLKNRRKEGQTSSSR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g119720.3.1
Transcript Infomation

Lipase family protein (AHRD V3.3 *** B9I2Q8_POPTR)
Sequence

TGTAATTTGTGTTTCACCAATAGAAGAAAAATACCTTTCCTATTCATAAGAGAGATCTTC
ATATTTAATTTTTTGTTTCTCCATTATTTCACGAATATTTAATTTTATTATGATAATTTT
AATTTTTATACCTATTTATTTCTCGGGGCATCATTAAAAATATCATAAATATTTTCCAAC
AAATATTTTTTATGTCTATCTGAATAAGTGAGATTCGTCGGAGTGATCGAATACTTTTTA
TCATCAATGCTAGTTTGAGCATTCATGTTACTCCCCAAAAAATGAGTAAATTAGACATTT
CCTTGTCATTTAGCACTAATTCAGGGACTGTATTTGCAATATGATGAAATAGTTAAATCT
AAGCGTATCTTGACTCTAGAGTCGAATGGATATATAAACACAAACGTGTAGTCATTGACA
CGTCACTTGCAAGGATTGAAATAATTATAGCCAAAAAAAAATAAAATTATAGCCAATTAT
AGAAAGCCAAGTTGCAATTTGGGAACCTTTTTTACAGACACTTATTCTGGACGGCAAGAA
TCGGGCGTGTTATATCTTTACCGACTCCTACTTCGCCGGACACGGATCCATTTTCTCTCT
CTATCTCGCCGGAGAATTTTGGAAATTTTGTTTTACAGTTATTTCAATTGAATAATTTTT
TCTTCCCGGAGATATATCGGTTTCCATTATTTGTTGTTGTTGTTGTTACCAAATCTAATC
TACGTTGTCGCAAACCGATGCAACGGCTCGTTGACCATACCCTTGCTGTTACCAAAGAGT
CAGTTAAGACATTGACCTATGAGTCGCTGAATAATGTTGTGAGATTGATTAATGGAGTGT
CAGCACTATTATTGACACTATTGCCGGGGAAATCTACTATTCTTGAAGGCATACATGGCT
GGGAACTTCGTCCAACCTTTCGTGGACCTCGGCTTCCACAGTGGATGGAGAATGGCGCCT
CATCTTTTAACCAGTTCATCCATGAACATTCTTTTGATTCTGATTCCTCCTCCTCAAGTG
TAGATTATTCATCAGAAGAAGAAGAACAATATACTGATGAAACCAGTTGTCCTCCATCTC
CACTGTCACAAAGTTCTCGGGTTTCTAGAGCCCGCAGTCTTTCAAGGCGGAACAGGCATT
GGATACATTGGTTCAGATACATCATCTCATGGCTCCTATTCCCTATTAAATTTATGTTGG
GCCTACCTTTGTTTATATATGCTTTGAGTAGGGGCCGTAGAGCCTCTCGGACATCTGAGA
ATTTTCAGTCTTCCCATGTACAAGCTAGGAAGAGATTACAGACACTTAGGGACCAAGTTA
TCCAGTCTACCACTGACAGAAGACGTGGCGTTGTCGAGGATCTCCATCTAGCAATTGAGA
TCACCATAGAGGCTGTTTTTGAATTTTTCCACAAGGCTGCACACTGTCTTCTTTCACCAA
TAGACACCTTGAAGAAAGTGGTGAAGTGGTTTTCTTCTGACTACAGTGGTCGTGTGGACG
TTCCCACTGTCGGTTCAGGTGTCTCTGTTCCTGTGGACACCCTTTCAGAGAGTGATCCTA
CTCCAAGAGAACAGAAAACGGGCTTTCATTCCCTAAATACAGATGCTCGGACATGTCAAG
ATGTCATTACAGAGCTTGGATACCCATATGAAGCTCTTCGTGTGGTTACTGATGATGGAT
ATATTCTCCTTTTGGAGAGAATTCCAAGACGTGATGCTCGAAAAGTTGTTTATCTACAAC
ATGGGATTTTTGATTCATCCATGGGGTGGGTATCAAACGGAGTTGTTGGTTCCCCAGCAT
TTGCAGCCTATGATCAAGGGTATGATGTTTTCCTAGGAAATTTCCGGGGATTGGTGTCGA
GAGAGCACGTTGACAAGAATATATCCTCACGTCGGTACTGGAAGTACTCCATAAATGAGC
ATGGGACACAGGATATACCTGCAATGATAGAGAAGATCCACCAAACAAAAGTTACTGAAT
TGAAAAATAGCCAAAAAGTTGTGGAGGAAGAGAGTGGCAATGATCAGCCTTACAAACTTT
GTGCAATTTGTCATAGTTTGGGTGGAGCTGCTATTTTAATGTACATTCTAACACGTCGAA
TTGAGGTAAAGCCCCATAGGCTTTCCAGATTAATCTTATTATCACCGGCTGGGTTTCATC
ATGATTCCAATCCTGTATTCACCATGATGGAATGCTTATTCCTGGTATTGTCTCCTCTAC
TTGCCCCTTTTGTGTCAGCTTTCTATATTCCCACTCGGTTTTTCCGCATGTTGTTTAACA
AGTTGGCCCGAGACTTCCATAACTTACCAGCAGTTGGAGGCCTTGTGCAAACTCTCATAA
GTTATTTGGTTGGTGGAGACAGCTCCAATTGGGTTGGAGCCTTAGGGTTGCCACACTACA
ATATGAATGATATGCCAGCTGTTTCATTCCGTGTGGCCCTTCATTTGGCACAGATCAAGA
ACACTCGGAAGTTTATGATGTTTGACTATGGGAGTGCAGCTGCGAACATGAAAGCTTATG
GTTCCCCTCATCCTTTAGATTTGGGGGAGTTCTATTCCCTTATTGATATTCCGGTTGATC
TTGTTGCTGGGCGTAAGGACAAGGTCATCAGGCCGTCCATGGTAAGGAAGCATTATAAGC
TGATGAAGGATGCAGGTGTGGAGGTGTCATATAATGAGTTTGAGTATGCTCATTTGGATT
TTACATTTTCCCACCATGAAGAACTATTGGCCTATGTTATGTCTCGATTAATTTTAGTAG
ATGCTTCTATGAAGCAGCAACCTGGCCAGAAATCATTGAAGAACAGGAGAAAAGAGGGGC
AAACCAGCAGCAGCCGTTAAAGTGTAGCACTAACAAGAGCCGTACCTGTCTATATCTTGG
GTGTTTCTTGTAATCCATGTATGTCACTTATACAGAAAAATATAGTGAATGCTGAATCAG
GATAGGACACTTATGCGGCCCCTTATTGACATTACCAAAGCCTACTCAAGGAAATAGAAT
TGGGTTGGATGTTGTGTCCTAGTGTGTTGGATGTGGTTTTGTGTATATTCTGTATGTATG
TTGTAACTTGTAAAGGTGTACCATTGTTTTGGAATGAGTACTACACATGGTGTTTAGTGT
GTAAATTAGTACTTTGTAGGATTTGAGAACTATGAAATTTGTATGAATGGGCATGATGCA
AGATACAAATGATATGCCTTGAAAATATCAGC