Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g119440.3.1
CDS Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IE39_POPTR)
Sequence	ATGAATTCCATTAACGGATTCAAAGGGATGGTGAAGAAAAAGAGAGCAAGTTCTTGGGAT GTGAGGGAAGTTATGGATTGCTTGAATCAGTTGATTGCTGATAAGCCATTTCTTCCAGTT GTAATTCCTGTGTTTTTAGTTGTTTGGGGCATAGAAAAGTGGATTTTCTCTCTGACCAAT TGGGTTCCTCTAGTTGTGGCTGTTTGGGCTGTTTTTCAGTACGGAAGTTACCAACGCAAA ATTCTTGCAGAAGACTTGAATAATAAATGGAAGCAAGTGTTGCTGGAGACATCTCCAACA ACACCTTTGGAGCAGTGTGAGTGGCTGAATAAGCTATTAATTGAAGTTTGGCCTAATTAT ATTAGCCCGAGGCTTTCTTTGAGGTTCTCTTCTATTGTCGAGAGACGCATGAAACAACGA AGATCAAAGTTGATTGAAAAGATTGAATTACAAGAATTTTCACTTGGTTCTAAGCCTCCA GTTTTAGGGCTTCGTGGAGTACGGTGGTCAACTTCCAATGATCAGCGAATTGCACATCTT GGTTTTGACTGGGATACTACTGATATAAGTATTATGTTGCTTGCCAAGTTGGGAAAGCCA TTAATGGGGACTGCTCGGATAGTCGTTAACAGTATCCACATCAAGGGTGATCTCCGCTTA GTGCCAGTTTTAGATGGAAGAGCATTTTTATACTCATTTGTGGCTTCCCCGGATGTTAGG ATAAATGTTGCTTTTGGAAGTGGTGGAAGCCAATCTCTTCCAGCAACTGAGCTGCCAGGG GTTTCTGCATGGCTGGTTAAACTTGTTAATGACTCCTTAGCTAAGAGGATGGTTGAACCT CGCCGTAATTGTTTTTCTTTGCCCGCGGTGAATTTATTCAAAACGGCTGTTGCTGGTGTA CTCTCTGTCACCGTGATGTCTGCCAGCAAATTGTCAAGGAGTAACCTGAGGACTAGTCCT TCCAGGAAACAACACAGTTCATCAACAGATGGTTATGTGGAGAATTCTAATGATTACAAG GATTTGCGGACATTTGTTGAGGTTGAACTTGAAGAATTAACCAGGAGAACAGAGGTCCAA CCAGGATCCTGCCCTAGATGGGACTCAAAGTTCAATATGACTCTACATGAGGATGCAGGA ACAATTAAGTTCAATTTATTTGAATGCACTCCTGGCGGTGTGAAGTATGACTATCTGACA AGCTGTGAAGTAAAGATGAGATATGTTGCAGACGATTCAACAATATTTTGGGCGACGGGA GCAGACTCCACTGCTATAGCCAGGCGCGCAGAGTTCTGTGGTAAAGAAATTGAAATGACG GTGCCATTTGAGGGGATCAATTCAGGGGAGTTGACGGTGAAACTCGTTTTAAAGGAATGG CAATTTGCTGATGGTTCACATAGCTCAAATGGTTTGCCAATGAGCTCTCAACCTTCACTC AACGGCACATCAAGTTTCCTATCTAGAACAGGAAGAAAAATCTATGTGACAATAGTTGAA GGAAAAGATCTTCCATCAAAAGATAAATATGGAAAGCTTGGTTCTGGCTGTTACGTGAAA TTCCAGTATGGGAAGGCTCTCAAAAGATCGAAAACTGTTCCACATACATCAAATGCTATC TGGAATCAGAAGTTTGAGTTTGATGAAATTGCTGGTGGTGAATATCTGAAGATAAAATGC TTCATCGAGGAGATGTTTGCAGATGAGAACATTGGTAGTGCACGAGTAAACTTAGAAGGA CTTATAGAAGGCTCCCCAAGGGATGTGTGGATTCCTCTTGAAAAAGTGAATTCTGGAGAA TTGCGGCTCCAGATTGAAGCAGTCAGAGTTGAGGACTCTGAAGGATCCAAGGGTTCAACT TCCAATGGTTGGGTTGAACTTGCTCTCATCGAGGCTAAAGACCTTGTTGGTGCTGATCTC CGAGGAACCAGTGATCCTTATGTGAGGGTACAATATGGGAACTTGAAGAAAAGAACTAAG GTTATGTATAAAACGGTGAATCCAAAATGGCACCAGACGCTAGAATTTCCTGATGACGGG AGTCCCCTGGAGTTGCATGTTAAGGACCACAACCATTTGCTGCCAACATCAAGCATAGGT GATTGTGTTGTTGAGTACCAGAGGTTGCCTCCAAATGAAATGTTTGATAAGTGGATACCC CTTCAAAATGTAAAGAAGGGAGAGATCCATATTCAAGTCACACGTAAAGTCCCGGATCTA GAAAAGAAATCAAGCTTAGATTCTGAGTCTTCAGTAACCAAAGCACGACGCCAAGTTTCT AACCAGATGAAGCAAATGATGATCAAGTTCCAGTCTTTAATTGAAGACGATGATCTGGAA GGACTTTCAGCATCGTTGCACGAAATGGAAAGCCTACATGACACACAAGAAGAGTTTATG GTACAGCTCGAGACTGAACAAACACTTTTGCTCAACAAGATAAATGAGCTTGGACAGGAA ATCATTAATTCATCACCTTGTTATGCTTTGAGTAGAAGACCTATTTTACCTTGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g119440.3.1
PEP Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IE39_POPTR)
Sequence	MNSINGFKGMVKKKRASSWDVREVMDCLNQLIADKPFLPVVIPVFLVVWGIEKWIFSLTN WVPLVVAVWAVFQYGSYQRKILAEDLNNKWKQVLLETSPTTPLEQCEWLNKLLIEVWPNY ISPRLSLRFSSIVERRMKQRRSKLIEKIELQEFSLGSKPPVLGLRGVRWSTSNDQRIAHL GFDWDTTDISIMLLAKLGKPLMGTARIVVNSIHIKGDLRLVPVLDGRAFLYSFVASPDVR INVAFGSGGSQSLPATELPGVSAWLVKLVNDSLAKRMVEPRRNCFSLPAVNLFKTAVAGV LSVTVMSASKLSRSNLRTSPSRKQHSSSTDGYVENSNDYKDLRTFVEVELEELTRRTEVQ PGSCPRWDSKFNMTLHEDAGTIKFNLFECTPGGVKYDYLTSCEVKMRYVADDSTIFWATG ADSTAIARRAEFCGKEIEMTVPFEGINSGELTVKLVLKEWQFADGSHSSNGLPMSSQPSL NGTSSFLSRTGRKIYVTIVEGKDLPSKDKYGKLGSGCYVKFQYGKALKRSKTVPHTSNAI WNQKFEFDEIAGGEYLKIKCFIEEMFADENIGSARVNLEGLIEGSPRDVWIPLEKVNSGE LRLQIEAVRVEDSEGSKGSTSNGWVELALIEAKDLVGADLRGTSDPYVRVQYGNLKKRTK VMYKTVNPKWHQTLEFPDDGSPLELHVKDHNHLLPTSSIGDCVVEYQRLPPNEMFDKWIP LQNVKKGEIHIQVTRKVPDLEKKSSLDSESSVTKARRQVSNQMKQMMIKFQSLIEDDDLE GLSASLHEMESLHDTQEEFMVQLETEQTLLLNKINELGQEIINSSPCYALSRRPILP*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g119440.3.1
Transcript Infomation	C2 domain-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9IE39_POPTR)
Sequence	ATAGTAATATCCGAACCAAGTGAAATATAAAGATGGTTACTTGTAAATTATAATAAAGGA AAAGAAATCTTAATCCAAACATTTAAAAATATATCTAGTGTTCAATTATGATTTTTTTTT CTGTTTGCCATAAAATTTGATCAAAATTTTAGCTTCAAGTGCTAGTATATAATGATTCAA AAATAAAATATGACATTATTTTATCTCACATTTGATTGGAGTCAATGGCGCATGAATTTT TTTTTACATTTAGGTTTAAACTCATAACTCTCGTGGAACAATTGTCACATTTAACCAACT AAGCTCCACGCTCCTTTATAAGAAAAATTAGCACTATATTATATATACGTTTGCCCTTTT CTATTTGTTATAATATATACATCAATTTTTTTTCGATGTAGCTATGTCCATTTATTAGAT AGTTATTAAATTTATTTATATTTTTAATTAACACTAAAATAATAAAATATTTATTTTAAA ATAACTTATTTTCAATCGCTCTTTATAATTTCGATTTCAAAATTGAGGACCAAAAGGAAC CGTATAATGACAGGAAAAATATGCAAAAATATAGGGAATAAGAGTTCCGATTCTCACTCA AAACTAGCTGATAAATTAAAACTAAAAGCTGACATTGTCTGCTCCTATATGGAATAGTAA TAAAATATAGTAATTCTCAACATGTTGGAGTATTGCAGCATTGGCCAAAGAGGCTCTGTT GACTTGAGACTTTTCTTCTTGGCTACCAATCTTCCAGCTCTCCATTTTGGAACAGAGAAA ACAAAAAGCCACAATATTTACCAAGTCTAATAGCCGTCTATATGAATTCCATTAACGGAT TCAAAGGGATGGTGAAGAAAAAGAGAGCAAGTTCTTGGGATGTGAGGGAAGTTATGGATT GCTTGAATCAGTTGATTGCTGATAAGCCATTTCTTCCAGTTGTAATTCCTGTGTTTTTAG TTGTTTGGGGCATAGAAAAGTGGATTTTCTCTCTGACCAATTGGGTTCCTCTAGTTGTGG CTGTTTGGGCTGTTTTTCAGTACGGAAGTTACCAACGCAAAATTCTTGCAGAAGACTTGA ATAATAAATGGAAGCAAGTGTTGCTGGAGACATCTCCAACAACACCTTTGGAGCAGTGTG AGTGGCTGAATAAGCTATTAATTGAAGTTTGGCCTAATTATATTAGCCCGAGGCTTTCTT TGAGGTTCTCTTCTATTGTCGAGAGACGCATGAAACAACGAAGATCAAAGTTGATTGAAA AGATTGAATTACAAGAATTTTCACTTGGTTCTAAGCCTCCAGTTTTAGGGCTTCGTGGAG TACGGTGGTCAACTTCCAATGATCAGCGAATTGCACATCTTGGTTTTGACTGGGATACTA CTGATATAAGTATTATGTTGCTTGCCAAGTTGGGAAAGCCATTAATGGGGACTGCTCGGA TAGTCGTTAACAGTATCCACATCAAGGGTGATCTCCGCTTAGTGCCAGTTTTAGATGGAA GAGCATTTTTATACTCATTTGTGGCTTCCCCGGATGTTAGGATAAATGTTGCTTTTGGAA GTGGTGGAAGCCAATCTCTTCCAGCAACTGAGCTGCCAGGGGTTTCTGCATGGCTGGTTA AACTTGTTAATGACTCCTTAGCTAAGAGGATGGTTGAACCTCGCCGTAATTGTTTTTCTT TGCCCGCGGTGAATTTATTCAAAACGGCTGTTGCTGGTGTACTCTCTGTCACCGTGATGT CTGCCAGCAAATTGTCAAGGAGTAACCTGAGGACTAGTCCTTCCAGGAAACAACACAGTT CATCAACAGATGGTTATGTGGAGAATTCTAATGATTACAAGGATTTGCGGACATTTGTTG AGGTTGAACTTGAAGAATTAACCAGGAGAACAGAGGTCCAACCAGGATCCTGCCCTAGAT GGGACTCAAAGTTCAATATGACTCTACATGAGGATGCAGGAACAATTAAGTTCAATTTAT TTGAATGCACTCCTGGCGGTGTGAAGTATGACTATCTGACAAGCTGTGAAGTAAAGATGA GATATGTTGCAGACGATTCAACAATATTTTGGGCGACGGGAGCAGACTCCACTGCTATAG CCAGGCGCGCAGAGTTCTGTGGTAAAGAAATTGAAATGACGGTGCCATTTGAGGGGATCA ATTCAGGGGAGTTGACGGTGAAACTCGTTTTAAAGGAATGGCAATTTGCTGATGGTTCAC ATAGCTCAAATGGTTTGCCAATGAGCTCTCAACCTTCACTCAACGGCACATCAAGTTTCC TATCTAGAACAGGAAGAAAAATCTATGTGACAATAGTTGAAGGAAAAGATCTTCCATCAA AAGATAAATATGGAAAGCTTGGTTCTGGCTGTTACGTGAAATTCCAGTATGGGAAGGCTC TCAAAAGATCGAAAACTGTTCCACATACATCAAATGCTATCTGGAATCAGAAGTTTGAGT TTGATGAAATTGCTGGTGGTGAATATCTGAAGATAAAATGCTTCATCGAGGAGATGTTTG CAGATGAGAACATTGGTAGTGCACGAGTAAACTTAGAAGGACTTATAGAAGGCTCCCCAA GGGATGTGTGGATTCCTCTTGAAAAAGTGAATTCTGGAGAATTGCGGCTCCAGATTGAAG CAGTCAGAGTTGAGGACTCTGAAGGATCCAAGGGTTCAACTTCCAATGGTTGGGTTGAAC TTGCTCTCATCGAGGCTAAAGACCTTGTTGGTGCTGATCTCCGAGGAACCAGTGATCCTT ATGTGAGGGTACAATATGGGAACTTGAAGAAAAGAACTAAGGTTATGTATAAAACGGTGA ATCCAAAATGGCACCAGACGCTAGAATTTCCTGATGACGGGAGTCCCCTGGAGTTGCATG TTAAGGACCACAACCATTTGCTGCCAACATCAAGCATAGGTGATTGTGTTGTTGAGTACC AGAGGTTGCCTCCAAATGAAATGTTTGATAAGTGGATACCCCTTCAAAATGTAAAGAAGG GAGAGATCCATATTCAAGTCACACGTAAAGTCCCGGATCTAGAAAAGAAATCAAGCTTAG ATTCTGAGTCTTCAGTAACCAAAGCACGACGCCAAGTTTCTAACCAGATGAAGCAAATGA TGATCAAGTTCCAGTCTTTAATTGAAGACGATGATCTGGAAGGACTTTCAGCATCGTTGC ACGAAATGGAAAGCCTACATGACACACAAGAAGAGTTTATGGTACAGCTCGAGACTGAAC AAACACTTTTGCTCAACAAGATAAATGAGCTTGGACAGGAAATCATTAATTCATCACCTT GTTATGCTTTGAGTAGAAGACCTATTTTACCTTGAAAAAACTATAACCCCATTGTTATCC TTTTTGTTAATATACTTTATATGATTATCACACTAGATAGGTCATAGGTCCATATTGATC TTGTTGAATTTTTAAAGATGTAGAATTGATTTTTCTGTATGTATATTAACTGGAAGAAAA ATACATTCACACATTTTCAAAATGAAACCACTGGCTAAAGAAAGGACAGTCTGGTGGATT AAGCTGCAGG