Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g119120.3.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2QPN9_GLYSO)
Sequence	ATGCGCTTGAGAAGATTACACAGCACCTGTTCGCGTTTACTACTGAATGAACCGGCGAGC CATCCCAAAGCAGAATTACCACGCGCAAAATTAACCGGCGGTAAACCACCGGTGAAGTCA GCAAAAGCCAGTAGCTCAGATATAGTGCAATGGAACAGGTCTATCACCCAATACATGCGA CAAGGAGAATGCGATTCCGCATTGACCTTATTCAACTCTATGCCTGCAAAGTCCTGTGTA TCCTGGAACGCAATGCTTTCTGGGTATTTGTTGAATGGCAAATTGGACCTTGCTCAGAAG CTGTTCGACGAAATGCCTCAAAGAGATTTAGTATCCTGGAACATCATGCTTAGTGGGTAT ATCAAGAATAAGAATTTTGGTGCAGCTAGGATTTTGTTTGATCAAATGCCTGTTAAAGAT GTAGTGTCGTGGAATGCATTGCTTTCCGGGTATGCGCAGAATGGGTACGTTGATGATGCT AGAAGGATCTTTATCATGATGCCTGTGAAGAATGAGATCTCTTGGAATGGACTTCTCGCT ACGTATGTTCAGAATGGAAGGATTGAGGAGGCAAGGAAGTTGTTTGAGTCAAAGGATAAT TGGCCGTTGGTTTCTTGGAATTGCTTGTTGGGTGGGTATTTGAGAAAGAAAATGCTGGCT GAGGCAAAGGTGCTTTTCGATAAAATGCCTGTCAAGGATCAAGTGTCATGGAACACGATA ATTTCTTGTTATGCCCAGAATGATGATTTGGAGGAAGCCAGGAGGTTATTCGATGAGTCC CCTATTAAGGATGTTTTTACCTGGACATCATTGCTTTCTGGTTATGTACAGAATAGGATG GTAGATGAGGCTAGGAGGATCTTCGATGAGATGCCAGAGCAGAATGAGGTTTCATGGAAT GCAATGATTGCAGGATATGTGCAGTCTAAAAGGATGGACTTGGCGAGGGAATTCTTTGAG GCAATGCCTTGTAAAAACATCGGCTCTTGGAATACAATGATAACAGGTTATGCTCAAATT GGGGATATAACTCATGCCAGAAGTTTGTTCGATTGTATGCCTAACCGTGATTGCATCTCT TGGGCAGCAATTATTGCTGGGTATGCTCAAAGTGGCAACAGTGAGGAGGCATTACGCATG TTTGTTCAAATGAAGAGAGATGGTGGGAGGATAAATAGGTCGGCGTTTACTTGTGTTTTG AGTACATCTGCTGACATTGCTGCATTTGAGTTTGGAAAGCAAATACATGGTCGACTTGTC AAGGCTGGATATCACAGTGGGTGCTATGTCGGAAATGCACTCCTATCAATGTACTGTAAG TGTGGAAGTATTGACGAGGCATATGATGTGTTCGAGGAGATAGCGGAGAAGGATGCTGTC TCTTGGAACACAATGATCATCGGTTATGCAAGGCATGGATTTGGCAAACAAGCTCTTAGA CAATTCGAATTAATGAAAGAAGCGGGTATCAGACCTGATGATGTCACCATGGTTGGTGTA TTATCTGCTTGTGGCCATACCGGCTTGATTGACAAAGGCATGGAACACTTTTACTCGATG GCTCGAGATTATGGAATAGTTACAAATCCCAGGCATTATACTTGCATGATTGACCTTCTG GGTCGAGCTGGGCGACTGGATGATGCTCAAAATCTAATGAAGGACATGCCTAGTGAACCA GATGCTGCAACCTGGGGTGCTCTCCTGGGGGCAAGTAGGATTCACGGAAACACTGAATTA GGAGAAAAGGCTGCTGAAATGATTTTCAGATTAGAGCCTTGGAATGCCGGGATGTATGTC CTTCTCTCAAATTTATATGCAGCCTCTGGCAGATGGCGTGACGTTAGCAAGATGAGATTA AAAATGAGGGACACAGGAGTAAGGAAAATGCCTGGTTACAGCTGGGTTGAGGTGCAAAAT CAGATACATCTTTTTTCAGTTGGGGATACCATGCATCCAGACAGCACGAGAATATATGCT TTCTTGGAAGAGTTAGAATTATTAATGAAGCAGGAAGGTTATGTCTCTGCCACGAAATTG GTCCTGCATGATGTGGATGAGGAGGAGAAGGCACACATGCTCAAGTATCACAGCGAAAAA TTAGCGGTTGCCTTTGCAATTCTAAATGTACCATCTGGGAGACCAATTCGTGTGATGAAA AATTTAAGGGTTTGTGGAGATTGTCATACAGCAATCAAACTCATATCGAAGATTGTGGGT AGATTAATTATTGTTCGGGATAGTAACCGTTTTCATCACTTCAGTGAAGGTGTTTGTACT TGTGGAGACTATTGGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g119120.3.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2QPN9_GLYSO)
Sequence	MRLRRLHSTCSRLLLNEPASHPKAELPRAKLTGGKPPVKSAKASSSDIVQWNRSITQYMR QGECDSALTLFNSMPAKSCVSWNAMLSGYLLNGKLDLAQKLFDEMPQRDLVSWNIMLSGY IKNKNFGAARILFDQMPVKDVVSWNALLSGYAQNGYVDDARRIFIMMPVKNEISWNGLLA TYVQNGRIEEARKLFESKDNWPLVSWNCLLGGYLRKKMLAEAKVLFDKMPVKDQVSWNTI ISCYAQNDDLEEARRLFDESPIKDVFTWTSLLSGYVQNRMVDEARRIFDEMPEQNEVSWN AMIAGYVQSKRMDLAREFFEAMPCKNIGSWNTMITGYAQIGDITHARSLFDCMPNRDCIS WAAIIAGYAQSGNSEEALRMFVQMKRDGGRINRSAFTCVLSTSADIAAFEFGKQIHGRLV KAGYHSGCYVGNALLSMYCKCGSIDEAYDVFEEIAEKDAVSWNTMIIGYARHGFGKQALR QFELMKEAGIRPDDVTMVGVLSACGHTGLIDKGMEHFYSMARDYGIVTNPRHYTCMIDLL GRAGRLDDAQNLMKDMPSEPDAATWGALLGASRIHGNTELGEKAAEMIFRLEPWNAGMYV LLSNLYAASGRWRDVSKMRLKMRDTGVRKMPGYSWVEVQNQIHLFSVGDTMHPDSTRIYA FLEELELLMKQEGYVSATKLVLHDVDEEEKAHMLKYHSEKLAVAFAILNVPSGRPIRVMK NLRVCGDCHTAIKLISKIVGRLIIVRDSNRFHHFSEGVCTCGDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g119120.3.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A0B2QPN9_GLYSO)
Sequence	AGGATTCGTGGGCTGGGATGGCTGGGCCGATGTCAGAAGTTGTTACTTGTCAGCCCATTT TTGTCTCGGGGGCCATGAGCTGATTAGTGGATGTACGACTATCTCCGGCGAAATCAAATT GGTGTTTTGAGAGTTTGAAAACTAGCAATGCGCTTGAGAAGATTACACAGCACCTGTTCG CGTTTACTACTGAATGAACCGGCGAGCCATCCCAAAGCAGAATTACCACGCGCAAAATTA ACCGGCGGTAAACCACCGGTGAAGTCAGCAAAAGCCAGTAGCTCAGATATAGTGCAATGG AACAGGTCTATCACCCAATACATGCGACAAGGAGAATGCGATTCCGCATTGACCTTATTC AACTCTATGCCTGCAAAGTCCTGTGTATCCTGGAACGCAATGCTTTCTGGGTATTTGTTG AATGGCAAATTGGACCTTGCTCAGAAGCTGTTCGACGAAATGCCTCAAAGAGATTTAGTA TCCTGGAACATCATGCTTAGTGGGTATATCAAGAATAAGAATTTTGGTGCAGCTAGGATT TTGTTTGATCAAATGCCTGTTAAAGATGTAGTGTCGTGGAATGCATTGCTTTCCGGGTAT GCGCAGAATGGGTACGTTGATGATGCTAGAAGGATCTTTATCATGATGCCTGTGAAGAAT GAGATCTCTTGGAATGGACTTCTCGCTACGTATGTTCAGAATGGAAGGATTGAGGAGGCA AGGAAGTTGTTTGAGTCAAAGGATAATTGGCCGTTGGTTTCTTGGAATTGCTTGTTGGGT GGGTATTTGAGAAAGAAAATGCTGGCTGAGGCAAAGGTGCTTTTCGATAAAATGCCTGTC AAGGATCAAGTGTCATGGAACACGATAATTTCTTGTTATGCCCAGAATGATGATTTGGAG GAAGCCAGGAGGTTATTCGATGAGTCCCCTATTAAGGATGTTTTTACCTGGACATCATTG CTTTCTGGTTATGTACAGAATAGGATGGTAGATGAGGCTAGGAGGATCTTCGATGAGATG CCAGAGCAGAATGAGGTTTCATGGAATGCAATGATTGCAGGATATGTGCAGTCTAAAAGG ATGGACTTGGCGAGGGAATTCTTTGAGGCAATGCCTTGTAAAAACATCGGCTCTTGGAAT ACAATGATAACAGGTTATGCTCAAATTGGGGATATAACTCATGCCAGAAGTTTGTTCGAT TGTATGCCTAACCGTGATTGCATCTCTTGGGCAGCAATTATTGCTGGGTATGCTCAAAGT GGCAACAGTGAGGAGGCATTACGCATGTTTGTTCAAATGAAGAGAGATGGTGGGAGGATA AATAGGTCGGCGTTTACTTGTGTTTTGAGTACATCTGCTGACATTGCTGCATTTGAGTTT GGAAAGCAAATACATGGTCGACTTGTCAAGGCTGGATATCACAGTGGGTGCTATGTCGGA AATGCACTCCTATCAATGTACTGTAAGTGTGGAAGTATTGACGAGGCATATGATGTGTTC GAGGAGATAGCGGAGAAGGATGCTGTCTCTTGGAACACAATGATCATCGGTTATGCAAGG CATGGATTTGGCAAACAAGCTCTTAGACAATTCGAATTAATGAAAGAAGCGGGTATCAGA CCTGATGATGTCACCATGGTTGGTGTATTATCTGCTTGTGGCCATACCGGCTTGATTGAC AAAGGCATGGAACACTTTTACTCGATGGCTCGAGATTATGGAATAGTTACAAATCCCAGG CATTATACTTGCATGATTGACCTTCTGGGTCGAGCTGGGCGACTGGATGATGCTCAAAAT CTAATGAAGGACATGCCTAGTGAACCAGATGCTGCAACCTGGGGTGCTCTCCTGGGGGCA AGTAGGATTCACGGAAACACTGAATTAGGAGAAAAGGCTGCTGAAATGATTTTCAGATTA GAGCCTTGGAATGCCGGGATGTATGTCCTTCTCTCAAATTTATATGCAGCCTCTGGCAGA TGGCGTGACGTTAGCAAGATGAGATTAAAAATGAGGGACACAGGAGTAAGGAAAATGCCT GGTTACAGCTGGGTTGAGGTGCAAAATCAGATACATCTTTTTTCAGTTGGGGATACCATG CATCCAGACAGCACGAGAATATATGCTTTCTTGGAAGAGTTAGAATTATTAATGAAGCAG GAAGGTTATGTCTCTGCCACGAAATTGGTCCTGCATGATGTGGATGAGGAGGAGAAGGCA CACATGCTCAAGTATCACAGCGAAAAATTAGCGGTTGCCTTTGCAATTCTAAATGTACCA TCTGGGAGACCAATTCGTGTGATGAAAAATTTAAGGGTTTGTGGAGATTGTCATACAGCA ATCAAACTCATATCGAAGATTGTGGGTAGATTAATTATTGTTCGGGATAGTAACCGTTTT CATCACTTCAGTGAAGGTGTTTGTACTTGTGGAGACTATTGGTAACGCTAGAGAGTAGAG TGTGAAAGTATACTTAGCTATTGTGCTGGTCATCTCCATAAGTGTTGAGGATTTGCACAC ATGGAAGCAAAGCACAGAAGAGGGATAAGTGGATAATCCCTTTCTTGTTGTTTGGTGAAT TTGGCGCGTATAATCTGTGATCTCCTCATTAATATTGGTAAAAAGGATATATGCTGAGAT GTATCATCCATAATTGTTGCACTTACGCACCCACCCTATAACAAAAGGAAGAGAAATAGT TTCCTCAAGTTTCTCAGAGATCTGATAATCAGAATAGAGTGCCGTGAATTTGTAGGTGGG GTTTAGCAGTTGTGCCTCTTAAAATAAATAAAATTATCACTTCAGGAGTACTTTGGTCCT CTGTTATCTGGCGAGAGATTCTTGATTGGCTCCTTCAACCTGTCTGGCCTAAACGCATGA CAGTGACTGTTTGTTGGGTATCATAAATCTGCTCTACCCTAAGCTCACTGACTGATTTCC TGCTTCTTTGAGTCCCAGTAGCTAAGCGGTAGTGATACTATTGTGGCCCTCAGCATTTAC ACATAGTTGAACTCTCCTCAAAATCTGCTATCTATCTGCAGCCACGAGAAAAATCATCCT TCTCTTGATATGGTGAAGATTACATGTATTGGATGGCTAGACAATCACCAAACTCACTTG TAGTTGGTACTGGTATCCTTCTGAGTTTTGAGAGCTAAAGGAAGAAAGCCTCTTGGTTGA GAGTGCATGAGAACTGCGAAGGAGAGAATCATTTTTGTACAATAACTCTCTTGGTTGAGA GGGTTTAAAATGCAAAGACGATGACAACAACAATAACAAAGTCAACA