Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g118620.3.1
CDS Infomation	Outer arm dynein light chain 1 (AHRD V3.3 *** G7LE75_MEDTR)
Sequence	ATGGTGCTTGTTACCGGAGATAGATACTTAGATTCACTTGTGAAATTTGTGGAGAACAAT GTAGAGTCATTGATCGAAGGGACGTTGGTGTTGAAATTGAATCCAATTGGGCTTCACTAC GTGCACTCCAGGCTTGAATCCTTGTTGGAGCTTGAGAGTCTTATTTCAGGTGCACCTGTT GATTATTTGCGTGCTTATGTATCTGATTTGGGTGACCATCGTGCGCTTGAGCGGCTTCGA CGGATTCTTCGTCTCCTTGCCTCGCTCAAGGTGGTATCTGTGCTTCCTCCTCCTGGAAGG GATCCTACGCCGTTGTCGCTTTTGCCTTTTGGTAGACTCAAGGTTTTGGAGCTTAGAGGA TGTGATCTGTCAACCTCCGCTGCTAGAGGACTTTTGGAATTAAGGCATACCTTGGAAAAG TTGATATGTCATAATTCTACAGATGCTCTTAAGCATGTATTTGCTAGTAGAATTGCTGAT ATAAGAAATTCTCCGCACTGGAATCGGTTATCGTTTATATCATGTGCCTGCAATGGCTTG GTTCTGATGGACGAGTCCTTGCAACTTCTTCCTGCTGTTGAGACTCTTGATTTGAGCAGA AACAAGTTTGCCAAGTTGGATAATCTGCGGAAGTGCACCAAATTGAAGCACCTGGATCTT GGCTTCAACCACCTCAGAAATATCGTTTCCTTTAGTGGGGTCTCATGTCATATTGTTAAG CTTGTTTTGAGGAACAATGCTCTCACATCTTTGCGTGGAATTGAAAGTTTGAAGTCACTT CAGGGGCTTGATGTTTCGTACAATATAATCTCCAACCTCTTAGAGATGGAAATTCTTGTT GGTCTATCCTCTCTTCAAAGCTTGTGGCTTGAGGGGAATCCTCTATGCTACTCTCGTTGG TATAGAGCTCAAGTCTTCAGTTTCTTTCCTAGTCCAGAGAAGATTGAGCTTGATGAAAAG AAAATCTGTAGAAGTGAGTCATGGCAGCGGCAGATTATAATTGCCAGTAGGCAAAAGCGG CCTGCTAGCTTTGGATTTTATTCACCAGCAAGAGATGGGGCCAAACTAGAAGGAAGTATT AATACAAAAAGGAAGAGGCTCTCACGTGTGGTTAGTATTGAGACTGAAGAACAGAACACC TCCATTTGCTCCGATATAGAATCTGTGTCTGTTGATATCGACAATCAAACCAAGGAGGAG AATGCCCTTTCTGACGAGGAAGCTGAAATAGTTGAGTTGATGAACCGCATTGAAAATATG AAGAAGGAAAGGTCTGATGAATGGCTGCGGGAGTTCAAAGATTGGATAAATGACTCTTCT GACAATTTTATTGGAGTTGCTAGAGGCAAAGAGAATGTTTCCAGTAACTACAGAGCTGAT GAAGTTAAGAATCAGACTAGAGACAAACAGCTAGGTGAGACCTCAAAATATTTATCCGAC TCAATGCTGGTTTCTGGAGATGACACCAGCACAAATATACTAGAATCTGACAACTCATTT GCAGAGACGTCCACTAATATCAGTATGTTTCATTACCCCAACCAAATTGGTGAAGCAGCT TCCATATTTCCTCGCAATCACACAGGAGACTCAATTCAGATAACTAGAAGCCAACGTCAG GATAAATTTAGCCCTCTAAATAATGAGGTGCTTCTACATCCAAATACGATGTCCCCTCAG TCTGAATCCTTCTCAATCCAAAGGAGTCTTAAAATGAGTGCTAAAATCAATATTCCACCC GCTACTGGTGCTGATAATATTTTGGATTCTCGATCATCCTTGGCTAGCACAGGATCACCT CCTCACTACAAGGAGGACATTCTGCACAGACGCCAAAACTTGGAAGAAGAACTCCTGCAG ATGTCTGCTGACTCCTTCTCAGTTGCATCTTCAGATAGTGATACAAGCTGTAGTGACGAC GATTGCCTTGATTTGACCTCAATGCATCTGGTTGATAAGTCTCTTGTCGACAGTGTCTCA GAAATGAGTGTGGAAAGCCCCTCACCAGTGCTTCTTTCCATGGATGTATGCCATGAATTG TATCCGATAAAAATAAATTGTAGATTCCCAGCACGTTTAGGCACTAAGGGAACCTCTAAT TGCACGGTGGTCAGAGAATCAGGCACTTCCTCCCAGCAAGGGCATTTTTCTACTGAAAAT GTAAGTGTAGACAGTGTACAAGTTGTGAAGCAGGACCCTGATTGGTTGGAAAAGAAGAAA CGTCGTAGGAAACCTGCAAGGAGAATAATCTCATTGTCTGAAGAACATATGGAAGCAGAA CCTAAAAAATCAAATGTGGATACAAATGGTATTCAAGACAGGGGGATTGGAACATTTAGC CGAAGTGAGATGAGAAAATCCCTTGACAGTTGTGGGGCTGAGGAGCTAATTAAGAATTAC TTTAACAATAAAGCTGCTGATTCTGGAATTTATGAATCTTGTCAGAGATACATTTTATGC AACTGTTTGCTTGAGAAGGACTCTCAGTTCAGTGAAAGCAAGGTAGCTGTAACCTTGAGC AGTGAGCATAAGTTACATTTGCTACTCCTTGAAAACTCATGTGATGGGTCAGGTTCAAGA TTAAAATTGGTTGGCTGTCATGGTACACAACAGACTAGAGAGATTTTTGTGGGTTTGGGA CTTCAGATTGTAAGAGTGTGCTTTGAACGGGACACAACCTACCTCTTCGTGACAAGAAAT ATAGACGTATCCAGAGAACTATTATCGATATTAGGGTTTACTGATTCACATGTGATGGAA AATAACTGTTCTCTGCGAAGTTTGGAAAAGGTTCAGGCGGATCTGTTCGAAAGGCATGTC TGTGGAGGTTTGAAGATGAACATTCTTCAGTATGCAATGGTGATGTTCTGGTGCAACTAT TCGAAAGAGGATTCATGGATGGGTAGATCACTATTTGTGCTTGGGAGGCATCTACTTCTG TGCAGGGAAGATGTAATCCTGCTTGGTTCCCTTTCTGAGAGTGCATCTTGCTCCTCCTAT TTCTCGTTGGACTGTTGTTGTTCCATTGTCAGCGTGTCAGAAGTGGTAATCGAAACCGCA GATTGCTATTGCGTGAGCCTGACTTTGGAAGGTGTCATGTCAGAGTTCCCCCTTTCATTG AAGGAGGGCAAGGTAGTCAAAAATACTAAACTCATGAAGAGAAAACCTGTGTCAGGTCCC CTGAAATGGAAGCTAAAATGGTTTTCAGAAGAAAGTCTCTTCAAATTTGTGGCTTTATTG AAAGCGTTACGTAGTGAAACAACCACAAGTGGCCTACTTGTATACTGTCATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g118620.3.1
PEP Infomation	Outer arm dynein light chain 1 (AHRD V3.3 *** G7LE75_MEDTR)
Sequence	MVLVTGDRYLDSLVKFVENNVESLIEGTLVLKLNPIGLHYVHSRLESLLELESLISGAPV DYLRAYVSDLGDHRALERLRRILRLLASLKVVSVLPPPGRDPTPLSLLPFGRLKVLELRG CDLSTSAARGLLELRHTLEKLICHNSTDALKHVFASRIADIRNSPHWNRLSFISCACNGL VLMDESLQLLPAVETLDLSRNKFAKLDNLRKCTKLKHLDLGFNHLRNIVSFSGVSCHIVK LVLRNNALTSLRGIESLKSLQGLDVSYNIISNLLEMEILVGLSSLQSLWLEGNPLCYSRW YRAQVFSFFPSPEKIELDEKKICRSESWQRQIIIASRQKRPASFGFYSPARDGAKLEGSI NTKRKRLSRVVSIETEEQNTSICSDIESVSVDIDNQTKEENALSDEEAEIVELMNRIENM KKERSDEWLREFKDWINDSSDNFIGVARGKENVSSNYRADEVKNQTRDKQLGETSKYLSD SMLVSGDDTSTNILESDNSFAETSTNISMFHYPNQIGEAASIFPRNHTGDSIQITRSQRQ DKFSPLNNEVLLHPNTMSPQSESFSIQRSLKMSAKINIPPATGADNILDSRSSLASTGSP PHYKEDILHRRQNLEEELLQMSADSFSVASSDSDTSCSDDDCLDLTSMHLVDKSLVDSVS EMSVESPSPVLLSMDVCHELYPIKINCRFPARLGTKGTSNCTVVRESGTSSQQGHFSTEN VSVDSVQVVKQDPDWLEKKKRRRKPARRIISLSEEHMEAEPKKSNVDTNGIQDRGIGTFS RSEMRKSLDSCGAEELIKNYFNNKAADSGIYESCQRYILCNCLLEKDSQFSESKVAVTLS SEHKLHLLLLENSCDGSGSRLKLVGCHGTQQTREIFVGLGLQIVRVCFERDTTYLFVTRN IDVSRELLSILGFTDSHVMENNCSLRSLEKVQADLFERHVCGGLKMNILQYAMVMFWCNY SKEDSWMGRSLFVLGRHLLLCREDVILLGSLSESASCSSYFSLDCCCSIVSVSEVVIETA DCYCVSLTLEGVMSEFPLSLKEGKVVKNTKLMKRKPVSGPLKWKLKWFSEESLFKFVALL KALRSETTTSGLLVYCH*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g118620.3.1
Transcript Infomation	Outer arm dynein light chain 1 (AHRD V3.3 *** G7LE75_MEDTR)
Sequence	CGGATCCCTTTCGTCATTCTTTCTTAGCGACTTGAACAGCAATGGCCGTTTCTCTCCCTT CGATTCCTCCAAAACCTCCGTTTCTCTCCCTAATTTGAAACGCTCTAATTGTTACCGGAA ACCTAATTTACACGATGGTGCTTGTTACCGGAGATAGATACTTAGATTCACTTGTGAAAT TTGTGGAGAACAATGTAGAGTCATTGATCGAAGGGACGTTGGTGTTGAAATTGAATCCAA TTGGGCTTCACTACGTGCACTCCAGGCTTGAATCCTTGTTGGAGCTTGAGAGTCTTATTT CAGGTGCACCTGTTGATTATTTGCGTGCTTATGTATCTGATTTGGGTGACCATCGTGCGC TTGAGCGGCTTCGACGGATTCTTCGTCTCCTTGCCTCGCTCAAGGTGGTATCTGTGCTTC CTCCTCCTGGAAGGGATCCTACGCCGTTGTCGCTTTTGCCTTTTGGTAGACTCAAGGTTT TGGAGCTTAGAGGATGTGATCTGTCAACCTCCGCTGCTAGAGGACTTTTGGAATTAAGGC ATACCTTGGAAAAGTTGATATGTCATAATTCTACAGATGCTCTTAAGCATGTATTTGCTA GTAGAATTGCTGATATAAGAAATTCTCCGCACTGGAATCGGTTATCGTTTATATCATGTG CCTGCAATGGCTTGGTTCTGATGGACGAGTCCTTGCAACTTCTTCCTGCTGTTGAGACTC TTGATTTGAGCAGAAACAAGTTTGCCAAGTTGGATAATCTGCGGAAGTGCACCAAATTGA AGCACCTGGATCTTGGCTTCAACCACCTCAGAAATATCGTTTCCTTTAGTGGGGTCTCAT GTCATATTGTTAAGCTTGTTTTGAGGAACAATGCTCTCACATCTTTGCGTGGAATTGAAA GTTTGAAGTCACTTCAGGGGCTTGATGTTTCGTACAATATAATCTCCAACCTCTTAGAGA TGGAAATTCTTGTTGGTCTATCCTCTCTTCAAAGCTTGTGGCTTGAGGGGAATCCTCTAT GCTACTCTCGTTGGTATAGAGCTCAAGTCTTCAGTTTCTTTCCTAGTCCAGAGAAGATTG AGCTTGATGAAAAGAAAATCTGTAGAAGTGAGTCATGGCAGCGGCAGATTATAATTGCCA GTAGGCAAAAGCGGCCTGCTAGCTTTGGATTTTATTCACCAGCAAGAGATGGGGCCAAAC TAGAAGGAAGTATTAATACAAAAAGGAAGAGGCTCTCACGTGTGGTTAGTATTGAGACTG AAGAACAGAACACCTCCATTTGCTCCGATATAGAATCTGTGTCTGTTGATATCGACAATC AAACCAAGGAGGAGAATGCCCTTTCTGACGAGGAAGCTGAAATAGTTGAGTTGATGAACC GCATTGAAAATATGAAGAAGGAAAGGTCTGATGAATGGCTGCGGGAGTTCAAAGATTGGA TAAATGACTCTTCTGACAATTTTATTGGAGTTGCTAGAGGCAAAGAGAATGTTTCCAGTA ACTACAGAGCTGATGAAGTTAAGAATCAGACTAGAGACAAACAGCTAGGTGAGACCTCAA AATATTTATCCGACTCAATGCTGGTTTCTGGAGATGACACCAGCACAAATATACTAGAAT CTGACAACTCATTTGCAGAGACGTCCACTAATATCAGTATGTTTCATTACCCCAACCAAA TTGGTGAAGCAGCTTCCATATTTCCTCGCAATCACACAGGAGACTCAATTCAGATAACTA GAAGCCAACGTCAGGATAAATTTAGCCCTCTAAATAATGAGGTGCTTCTACATCCAAATA CGATGTCCCCTCAGTCTGAATCCTTCTCAATCCAAAGGAGTCTTAAAATGAGTGCTAAAA TCAATATTCCACCCGCTACTGGTGCTGATAATATTTTGGATTCTCGATCATCCTTGGCTA GCACAGGATCACCTCCTCACTACAAGGAGGACATTCTGCACAGACGCCAAAACTTGGAAG AAGAACTCCTGCAGATGTCTGCTGACTCCTTCTCAGTTGCATCTTCAGATAGTGATACAA GCTGTAGTGACGACGATTGCCTTGATTTGACCTCAATGCATCTGGTTGATAAGTCTCTTG TCGACAGTGTCTCAGAAATGAGTGTGGAAAGCCCCTCACCAGTGCTTCTTTCCATGGATG TATGCCATGAATTGTATCCGATAAAAATAAATTGTAGATTCCCAGCACGTTTAGGCACTA AGGGAACCTCTAATTGCACGGTGGTCAGAGAATCAGGCACTTCCTCCCAGCAAGGGCATT TTTCTACTGAAAATGTAAGTGTAGACAGTGTACAAGTTGTGAAGCAGGACCCTGATTGGT TGGAAAAGAAGAAACGTCGTAGGAAACCTGCAAGGAGAATAATCTCATTGTCTGAAGAAC ATATGGAAGCAGAACCTAAAAAATCAAATGTGGATACAAATGGTATTCAAGACAGGGGGA TTGGAACATTTAGCCGAAGTGAGATGAGAAAATCCCTTGACAGTTGTGGGGCTGAGGAGC TAATTAAGAATTACTTTAACAATAAAGCTGCTGATTCTGGAATTTATGAATCTTGTCAGA GATACATTTTATGCAACTGTTTGCTTGAGAAGGACTCTCAGTTCAGTGAAAGCAAGGTAG CTGTAACCTTGAGCAGTGAGCATAAGTTACATTTGCTACTCCTTGAAAACTCATGTGATG GGTCAGGTTCAAGATTAAAATTGGTTGGCTGTCATGGTACACAACAGACTAGAGAGATTT TTGTGGGTTTGGGACTTCAGATTGTAAGAGTGTGCTTTGAACGGGACACAACCTACCTCT TCGTGACAAGAAATATAGACGTATCCAGAGAACTATTATCGATATTAGGGTTTACTGATT CACATGTGATGGAAAATAACTGTTCTCTGCGAAGTTTGGAAAAGGTTCAGGCGGATCTGT TCGAAAGGCATGTCTGTGGAGGTTTGAAGATGAACATTCTTCAGTATGCAATGGTGATGT TCTGGTGCAACTATTCGAAAGAGGATTCATGGATGGGTAGATCACTATTTGTGCTTGGGA GGCATCTACTTCTGTGCAGGGAAGATGTAATCCTGCTTGGTTCCCTTTCTGAGAGTGCAT CTTGCTCCTCCTATTTCTCGTTGGACTGTTGTTGTTCCATTGTCAGCGTGTCAGAAGTGG TAATCGAAACCGCAGATTGCTATTGCGTGAGCCTGACTTTGGAAGGTGTCATGTCAGAGT TCCCCCTTTCATTGAAGGAGGGCAAGGTAGTCAAAAATACTAAACTCATGAAGAGAAAAC CTGTGTCAGGTCCCCTGAAATGGAAGCTAAAATGGTTTTCAGAAGAAAGTCTCTTCAAAT TTGTGGCTTTATTGAAAGCGTTACGTAGTGAAACAACCACAAGTGGCCTACTTGTATACT GTCATTAAAGCGAGCGAAATCTGTTTTGTTTTTTCATTTCTCAGTTCTACTTCATATTCA TTTCATTCTTTGGTTCTGATAATACTCAACTCTTCCTGTTCCCTTAGGTAGTGTTGTAGT TGCTTTCCTTTTCTTTCGATTGATGTGTTCTCCATTCTTTGATTTATTGTGTAGGCAGTG ATTTGTTGTAAAAAGCATATGGAAAGGGAATTTAGTGTATTTAATGTAAGTTTGTTTTGG AGATCTAAGTTTCACGGTTTAGTTTTACCATTGTTAAAAAGAGACTTGGTTTTTACTAAA TCAATCCTTGTG