Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g117280.3.1

CDS Infomation

transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT2G25270.1)

Sequence

ATGTCCTACACAAAAGTTAACTCAATTCCCCTTACTGTTGCATTTTCCTTGCTCTTAGTA
TCTGCACTATCACTTTCAAATGCTCTGGTTGATGATGTTGTGAGTGAGCCAACACATGGC
GTGGTTACATCAGTAAGTAAAAGGTTTCTGGCTGAGAACAGTGCTACTGGTAACTCATCT
CTGGTACTGGCTGCTGAAAGAACCCATAGAAGAGATCCACTTGAGGATCGGAGTTACTAT
ACTGGTGGATGGAACATCAGTAACGATCATTATTGGGCTAAATGGATTTCACTTAGAGAT
GAATTTCTCATTCTAAGGCCATTACGGCTCAATTTGCTTGTTAACTTCATTCAAACAAAA
TTGGTAGAATTTCTCAGGATGGTCTTTGATGTGTTTTCTGGTTGTCATCATAGATGCCAA
TATGCCATGTTTTCAGTCATCTCTTCAATATTTTTTGCTTATAGACTTGACGACCTATCA
GTTGCTTATACTGGTGCCCCTCTTTTCATCATTGCTCTATTCTGGTTTTTTGCTTGTGGC
ATTTCCTTGTTCCTAGTTTGTATCTGTTGTTGTTGCTGCCGGAGAGGACGTTATGGTTAT
TCTCGAGCTGCTTATGCACTTTCGCTTATTTTTCTCTCCGCGTTCACCATTGCTGCAATA
ATTGGTTCTATCTTTCTGTATACTGGACAAGGGAAATTTCATGACGGTACAAAAGATACA
TTGGATTATGTTGTGCAACAAGCAGGATCAACGGTTGACAATTTAAGGAATGTGTCAAAA
ATTCTGGCTGTTGCCAAGCATACTGGAATTAGTCAAATTTTTCTACCTCAAAATGTTCAA
AACAACATTGACAAGGTTGACACCAAGATCAGCTCGGCTGCTGAAACTCTTGAAACGGAA
ACTGAGAAGAACAAGAAGGATATTATGGTTGTCTTAGACTTGGTGAGGCGAATTCTCATC
ATTGTTGCTGCTGTAATGCTTGGCTTGGCTGCTCTTGGTTTCTGTACGTTCTATGCTCTT
TCAAATCTAGTCATTATAGGGTGGATCCTTGTTGCAGTCACATTTATCTTATGTGGTGCA
TTTCTTGTTCTTCACAATGCAACGGGAGACACATGTGTGGCCATGGATGATTGGGTAAAA
AACCCATCGGCTCATACAGCCCTTGATAAGATAATCCCTTGTGTGGACACTGCTACTGCC
CAAGAAACCTTGTCTCAGAGCAAAGAGGTCACCTACCAATTGGTTGGAGTCACTAACACT
ATCATCACCAATGTTTCAAACATCAATCTGCCTCCCGGTGTTTCTTACAACCAATCTGGT
CCACTGGTCCCTAATCTCTGTAATCCGTTTAATTCAGATAAGACAGACCGAAAATGTGCA
AGTGGTGAAGTGGAACTTAGCAATGCCACACAGGTTTGGAAGAATTACGTTTGTGAGGTT
TCAGCGAGTAATGTGTGCTCCACTGTGGGCCGTCTAACCCCTTCTATGTACGACCAAATG
ACTGCTGTAGTCAACGTTAGCAACGGCCTGTATCATTCTGGGCCATTCCTTAAGGAACTA
CTCGACTGTACTTTCCTCCGAGATACCTTCACTGTCATTCATGACGAACATTGTCCTGAT
TTGAGTCGATACAGCAAGTGGATCTACATCGGTTTAGCTCTGGTCTCAGTATCAGTAATG
CTCTCACTCGTTTGTTGGGTACTATACGCAAGAGAGAGACGTCACCGTAAGTATACCAAA
CTTGTTGATGCTACATCTGGTCAAGAATCTTTAGCAGGGAAAAGCCATGGTTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g117280.3.1

PEP Infomation

transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT2G25270.1)

Sequence

MSYTKVNSIPLTVAFSLLLVSALSLSNALVDDVVSEPTHGVVTSVSKRFLAENSATGNSS
LVLAAERTHRRDPLEDRSYYTGGWNISNDHYWAKWISLRDEFLILRPLRLNLLVNFIQTK
LVEFLRMVFDVFSGCHHRCQYAMFSVISSIFFAYRLDDLSVAYTGAPLFIIALFWFFACG
ISLFLVCICCCCCRRGRYGYSRAAYALSLIFLSAFTIAAIIGSIFLYTGQGKFHDGTKDT
LDYVVQQAGSTVDNLRNVSKILAVAKHTGISQIFLPQNVQNNIDKVDTKISSAAETLETE
TEKNKKDIMVVLDLVRRILIIVAAVMLGLAALGFCTFYALSNLVIIGWILVAVTFILCGA
FLVLHNATGDTCVAMDDWVKNPSAHTALDKIIPCVDTATAQETLSQSKEVTYQLVGVTNT
IITNVSNINLPPGVSYNQSGPLVPNLCNPFNSDKTDRKCASGEVELSNATQVWKNYVCEV
SASNVCSTVGRLTPSMYDQMTAVVNVSNGLYHSGPFLKELLDCTFLRDTFTVIHDEHCPD
LSRYSKWIYIGLALVSVSVMLSLVCWVLYARERRHRKYTKLVDATSGQESLAGKSHG*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g117280.3.1

Transcript Infomation

transmembrane protein (AHRD V3.3 *** AT2G25270.1)

Sequence

AAACCAAAATACCGAATCGAACAAGTCCACCACCATGCTTCTCTTCTCACACGTCTTTGC
AGTTTGCACTATGTTTTTTAGTATAAAAATTAATGTCTTATTACTATAATATATAAACTA
TATGCTATAAACCAAGAAAGAAGACAAGGTGTATGATTACCCGTTCAGCTTCCTTCCCTA
AAAACCACCTTCTTGTACAACTGGATATTTGTTTGGTGGATAACCACACAAAAAACTCAA
AACCCCAACAAGAATTCTCTAAAGTTGAAAACTTGCTACTCCCACAAAAATTAAGACAGT
CATGTCCTACACAAAAGTTAACTCAATTCCCCTTACTGTTGCATTTTCCTTGCTCTTAGT
ATCTGCACTATCACTTTCAAATGCTCTGGTTGATGATGTTGTGAGTGAGCCAACACATGG
CGTGGTTACATCAGTAAGTAAAAGGTTTCTGGCTGAGAACAGTGCTACTGGTAACTCATC
TCTGGTACTGGCTGCTGAAAGAACCCATAGAAGAGATCCACTTGAGGATCGGAGTTACTA
TACTGGTGGATGGAACATCAGTAACGATCATTATTGGGCTAAATGGATTTCACTTAGAGA
TGAATTTCTCATTCTAAGGCCATTACGGCTCAATTTGCTTGTTAACTTCATTCAAACAAA
ATTGGTAGAATTTCTCAGGATGGTCTTTGATGTGTTTTCTGGTTGTCATCATAGATGCCA
ATATGCCATGTTTTCAGTCATCTCTTCAATATTTTTTGCTTATAGACTTGACGACCTATC
AGTTGCTTATACTGGTGCCCCTCTTTTCATCATTGCTCTATTCTGGTTTTTTGCTTGTGG
CATTTCCTTGTTCCTAGTTTGTATCTGTTGTTGTTGCTGCCGGAGAGGACGTTATGGTTA
TTCTCGAGCTGCTTATGCACTTTCGCTTATTTTTCTCTCCGCGTTCACCATTGCTGCAAT
AATTGGTTCTATCTTTCTGTATACTGGACAAGGGAAATTTCATGACGGTACAAAAGATAC
ATTGGATTATGTTGTGCAACAAGCAGGATCAACGGTTGACAATTTAAGGAATGTGTCAAA
AATTCTGGCTGTTGCCAAGCATACTGGAATTAGTCAAATTTTTCTACCTCAAAATGTTCA
AAACAACATTGACAAGGTTGACACCAAGATCAGCTCGGCTGCTGAAACTCTTGAAACGGA
AACTGAGAAGAACAAGAAGGATATTATGGTTGTCTTAGACTTGGTGAGGCGAATTCTCAT
CATTGTTGCTGCTGTAATGCTTGGCTTGGCTGCTCTTGGTTTCTGTACGTTCTATGCTCT
TTCAAATCTAGTCATTATAGGGTGGATCCTTGTTGCAGTCACATTTATCTTATGTGGTGC
ATTTCTTGTTCTTCACAATGCAACGGGAGACACATGTGTGGCCATGGATGATTGGGTAAA
AAACCCATCGGCTCATACAGCCCTTGATAAGATAATCCCTTGTGTGGACACTGCTACTGC
CCAAGAAACCTTGTCTCAGAGCAAAGAGGTCACCTACCAATTGGTTGGAGTCACTAACAC
TATCATCACCAATGTTTCAAACATCAATCTGCCTCCCGGTGTTTCTTACAACCAATCTGG
TCCACTGGTCCCTAATCTCTGTAATCCGTTTAATTCAGATAAGACAGACCGAAAATGTGC
AAGTGGTGAAGTGGAACTTAGCAATGCCACACAGGTTTGGAAGAATTACGTTTGTGAGGT
TTCAGCGAGTAATGTGTGCTCCACTGTGGGCCGTCTAACCCCTTCTATGTACGACCAAAT
GACTGCTGTAGTCAACGTTAGCAACGGCCTGTATCATTCTGGGCCATTCCTTAAGGAACT
ACTCGACTGTACTTTCCTCCGAGATACCTTCACTGTCATTCATGACGAACATTGTCCTGA
TTTGAGTCGATACAGCAAGTGGATCTACATCGGTTTAGCTCTGGTCTCAGTATCAGTAAT
GCTCTCACTCGTTTGTTGGGTACTATACGCAAGAGAGAGACGTCACCGTAAGTATACCAA
ACTTGTTGATGCTACATCTGGTCAAGAATCTTTAGCAGGGAAAAGCCATGGTTGAGTTTT
CAAATAATTTTGGACCTCGTAGTTATCGACAAAACGTTCATATATTTTCTTAGGTATATA
TAGTATGTTATATGGTTTCTAATATTAACGTTTGTTTATTACAATACAAGTCGATTAGGG
ACTTGTAGGGATTGTTAGATGTTGTTCATACACTATTCAATCTAGGATTGTTGTGTATAC
AGGACATGTATATCAAATTGTGTGTTTTTATTATGTCCCTCGCGTTTTTATCAAATTGAA
TTTCAGACTAAAAATAATGTCACATAAATTATGAAATAAAGAAAATGTATTTG