Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g117050.3.1
CDS Infomation	NOD26-like intrinsic protein 6.1
Sequence	ATGGACCCTGAAGAAGGTGTGTCAGCTCCTTCAACACCAGCAACTCCGGGGACTCCTGGT GCTCCTCTCTTTGGTGGATTGATCAAGCATGAGCGGAGAAACGGAGGGAATGGCAAAAAA TCTCTTCTTAAGAGCTGTAAATGCTTCGGTGTTGAACCGTGGGCCTCAGAAGAAGGAACG TTGCCTGCTGTTACATGCATGTTACCTCCTCCTCCTATTTCATTAGCTAGAAAGGTGGGA GCAGAGTTTATAGGTACTCTGATACTGATATTTGCAGGGACAGCCACAGCCATAGTGAAC CAGAAGACACAAGGCTCTGAAACATTAATTGGACTGGCAGCCTCGACAGGCCTCGCTGTA ATGATTGTGATTCTGTCAACTGGCCACATCTCTGGAGCCCATCTCAACCCTGCTGTGACT ATTGGTTTTGCTGCTCTCAATCATTTCCCCTGGAAACATGTTCCTGTGTACATTGGAGCA CAAATTATAGCATCATTTTGTGCTGCATTCACGTTAAAGGTAGTTTTGCACCCAATTATG GGCGGTGGAGTCACTGTTCCTTCTGGTAGTTATGTTCAAGCTTTTGCTTTGGAATTCATC ATCAGCTTCAATCTCATGTTCGTTGTCACTGCCGTGGCCACCGACACTAGAGCTGTAGGA GAGCTTGCGGGAATCGCTGTAGGAGCCACTGTCATGCTTAACATACTAATAGCTGGGGAG ACAACTGGGGCTTCAATGAATCCAGTGAGAACCCTCGGACCAGCAGTAGCAGTAGGAAAC TATAAAGCCATCTGGATCTACCTTACTGCTCCGATTCTTGGCGCTCTCATTGGGGCAGGC GTTTACTCTGCTGTCAAACTACCTGATGAAGACAGAGACAATCATCCAAAGCCTTCCCTG GAACATAGTTTCAGAAGATTAAACCATCTGGAGTACTTTAGCTTGAACAGATTGATCGGG TCTCCGGCGTATGAAGGATGA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g117050.3.1
PEP Infomation	NOD26-like intrinsic protein 6.1
Sequence	MDPEEGVSAPSTPATPGTPGAPLFGGLIKHERRNGGNGKKSLLKSCKCFGVEPWASEEGT LPAVTCMLPPPPISLARKVGAEFIGTLILIFAGTATAIVNQKTQGSETLIGLAASTGLAV MIVILSTGHISGAHLNPAVTIGFAALNHFPWKHVPVYIGAQIIASFCAAFTLKVVLHPIM GGGVTVPSGSYVQAFALEFIISFNLMFVVTAVATDTRAVGELAGIAVGATVMLNILIAGE TTGASMNPVRTLGPAVAVGNYKAIWIYLTAPILGALIGAGVYSAVKLPDEDRDNHPKPSL EHSFRRLNHLEYFSLNRLIGSPAYEG*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g117050.3.1
Transcript Infomation	NOD26-like intrinsic protein 6.1
Sequence	ATTCTGGTCCTAACAGTCATCTTCTAATATAATGTTAAAAAAATGAATATTTCTTTTCCA AACGCTAGCTCAAGACGTGACATCCATGATTTGGTATCGACTTTAGGCCCAAACTAACAA AGCCAGAAGTCATAATATATAGAAATGTAGAGAATTCAAAGTGGAAAATTGCCAAATGAC TTGTTCCAGCTTGATGTAGCACTTTGAATTGTTAACAAAGACCTCTTTTGATTAAAATTT GTAGCTAGAATACTACTCTATATGCATGACAAATAAATTTTAGTTTTAGGAAATTTTAAT TTAGAAAGTTAATAGAGAAATGGACTCATCCACATGTTTTAAAAGTAAATGGAAGGTAGT AGAATAAGCATGGTCGACCTGGTGTTGAGATTTTCTTTTTCTTTTCTCCTAACAATCATG ACAATATTAATCAAAAAAAATTTACTTTATTAAAGGAAGATGATTATATAAATTGATTTT TGCCCACTTCTAAGAAATTCACCTACCATGATTCTTCCCCTCCTGTTTATTTTTTCATCA AAAGATAGCAGCATGGATAACTAAACACCGTGTGTGCAAAGACTTTATTTCAATGACAAT AATAACATTTTAGTGTATTCTTATCGACTGTTTTCAATAGACCTTAAATTCAATAGCAAA AATATATTCTTACAGAGGGAGAGACTGATTTCAATCGATAACAAAACACTGCGTGTTCAA ACACAAATCTATATCAATCTTTAAATATCAACCAATTCATGTCCAAACGTCTGCCTGCGA TGTTGCTGGATAAAAATAGTCTCAGCTCCATGATTATATTTGTATAGTTAAATGGATCTT GTGTTCAATAAGTAGATCAAGTGGAAACACATGACAGATGTCCAGAGTTTCAATGCTTTG TTCTTTTAAATTTTTCCAAATACAAAGGATTTTGATTCTTGCCCCACTTTCCACTACCAA AAATCCCACTTCCCTTTTCTATCTTTCAATTCTATCCACAAACTTTTTCTCCAAGTCAAA CATTCTTCATGGTTAATGATGCAAAATAGAACTATAAATAGTATTCACTGGCCAGGCTCA CTGTCAGTATACACAAGGACAAAGTAGAGTTAACTCAACTTTGTCTAGCTATTAATACAT TGTGAGAGTATTTGTGTAATTCAGACCCTGACTTCAATTACAAACTCTTATTTCTCCGTC TTAACTTGATAATCTTCGAGTAATAGGCTTTTTTTCGAAATTAATCTCATAGGAACAAGT GTTGAGAGATCAATAGACACGATGGACCCTGAAGAAGGTGTGTCAGCTCCTTCAACACCA GCAACTCCGGGGACTCCTGGTGCTCCTCTCTTTGGTGGATTGATCAAGCATGAGCGGAGA AACGGAGGGAATGGCAAAAAATCTCTTCTTAAGAGCTGTAAATGCTTCGGTGTTGAACCG TGGGCCTCAGAAGAAGGAACGTTGCCTGCTGTTACATGCATGTTACCTCCTCCTCCTATT TCATTAGCTAGAAAGGTGGGAGCAGAGTTTATAGGTACTCTGATACTGATATTTGCAGGG ACAGCCACAGCCATAGTGAACCAGAAGACACAAGGCTCTGAAACATTAATTGGACTGGCA GCCTCGACAGGCCTCGCTGTAATGATTGTGATTCTGTCAACTGGCCACATCTCTGGAGCC CATCTCAACCCTGCTGTGACTATTGGTTTTGCTGCTCTCAATCATTTCCCCTGGAAACAT GTTCCTGTGTACATTGGAGCACAAATTATAGCATCATTTTGTGCTGCATTCACGTTAAAG GTAGTTTTGCACCCAATTATGGGCGGTGGAGTCACTGTTCCTTCTGGTAGTTATGTTCAA GCTTTTGCTTTGGAATTCATCATCAGCTTCAATCTCATGTTCGTTGTCACTGCCGTGGCC ACCGACACTAGAGCTGTAGGAGAGCTTGCGGGAATCGCTGTAGGAGCCACTGTCATGCTT AACATACTAATAGCTGGGGAGACAACTGGGGCTTCAATGAATCCAGTGAGAACCCTCGGA CCAGCAGTAGCAGTAGGAAACTATAAAGCCATCTGGATCTACCTTACTGCTCCGATTCTT GGCGCTCTCATTGGGGCAGGCGTTTACTCTGCTGTCAAACTACCTGATGAAGACAGAGAC AATCATCCAAAGCCTTCCCTGGAACATAGTTTCAGAAGATTAAACCATCTGGAGTACTTT AGCTTGAACAGATTGATCGGGTCTCCGGCGTATGAAGGATGATTTGTACAGAGAAAATGC GAGAGCAGCGATAAGAGTACCAAAGACGTCGGCAACAGCGTCCTTGGTAGATGCACCTGC TGACCTGAAAAAACCCAGTTCGTCGGCAACCTCCTTAGCGGCGCCGGCAGCGAGTGAAAC AATAGATCCGACCCAGATGCTCCGGCGGCGGATGAAAGAGTAGCGAGTTCTTTCCGCGAG AAAAGATGAAATGATAGCAATGAAGAAGCAGAAGAGTATGTGGTAGAGCTTATCAGGGGC TGTCCAATCATCTCCTTCCTCCATTCCTTCTTTCAGGAATTGGTTATAAGAGCCACGCCA TTAGATCTTCAGTCTATAAAAATCTACTATTATATTAATTTGTTAATATTATAGCATATG CATCACTAGTGCAATTTGCAATTTCAATCATCATTTTTTTTTTTTTAAAGATAATTATTT GTAATGTTCGAACCAACTTTCACACGCTCTTATTTATCAATTTGGGGTTAGGTATTTGTA ATGTCCGAACCAACTTTCATGCCCTTGTTTATCAAGGTGGGATCGGGTTATTTGTGTTTA AATGGACCTGAGCAACCCCGGGCTCACTCCAATTTGTTCTCACTTCATCTTCTCAACGAT AGGATTAGTGCTAAAGCTTTCAACAGTTGCATAGTAAAATATCTGTACACAAAAAAGCCG GATACAGTTGAATGGATTTGGCTTCAAGGTACAAATAAGAAACAACCCACAAAGAGGCTA CTGAGATCAGTGGACGGTGAAAATTATGAATATAATATTAGGTATCATAACTACAATTCT TCTGCATCATCCGACAAAGTTTTAAGTGCTACATACCTAAATGACATTATCACAAACAAT GATTACAGCTAACAAATAGACCAGCTTGAATATGCTGCTAATTCATCTTGCTGACCAGCT CATTGATGTGATCCTCACAATTGCCTGAATCGCCCCCATCTGAAAATCGTTTTTTCTTAC CCTGCAATGCCTTTTCTGGCTTGTTGAGAGCAAAGGGACACAGGAAACTAGTGACCTCTT TGAAATGTGGACCAACGTTGGCAATCTCAGTCACTACGTCTTCTAAACATAAAATACCAT TTTGACCCAATGCTGTTCGACAACTTCGTTGCTGTTTAAAGAAAAAAACAGTAGACTGCA TGCAAACAAAATAGATGAAATCTCGTAGATAATATTTCATATGATCATTTAATTATATAA ATTATTTTTTTCCTTAAAGAGTCACTTAACTATATTTTTTTTAAAAGTCAATAAATTACG AATATTAATTCAAAAATCACTCAATTATCGATATTTAACTTACACAATCACAATCATTCA ACAAAATTTTGGACAAATTAAAGTTTTCGAAGATTAGTGAAGAATGACACATGGCCACAT GGGTATGTCGAATATCAATAAACAAAGCATATAAAGTTAACTTAATTATATAAACACCAC TTAGTTCATTCCTTCATTAATTAGTCTAATTCTATTTCCTAAGCATGGTGCATATTTGGT CAGACTCTTACTCTTATCGTTTGGATATGCCTAGTTCAGTTGAGACACATCCAAAAAATA AAAACACTAACGACTTGTTAGTCAAACAAATATGTACTTGGCCATAATTTTGAGAAAAGA AAAGAAAAAGTAATTCTCCACGTACCATTATTATAAGATATGACTAGTTATTCAAATCAC GTCTAATAAAAAATGAGTCATACATTCATTACAATAACAACATATCCAACGGAAAGGTCT TACATGCATTAGTAACCATCAAAATTTGGTGTCATTTTCAAATGTCAAATACTTCACTAC ACGTACTAGTAGATATATATAGACCAATGAACTTAGTCAATTAATTAGGCGTTTGGAGTT AACTTTTTGTCATCAAAAGTATGTATCCCATGAACGAAGATATGTTGATCATAATCCTAT ATGGACATGTGTTACTTTTACTAAAAGCAGCTTTTAGAGTAAACCGAAAGCCAGAAGTAA CGACAAGGAATATCAATAGATGGCGCATAAAATGTTTATAATATCTCGTTCTTTTTTACT CGTTCATATATTTTACATACACATTAAAACATAATAAATAAGATGTACATTTTATTATAA TACTTATAATAATTGGTCTATAAGCTTTTGTTAACTTGAAGATGAATTTAGAATGAATAG TTAATTTTAAGGATAAAAACAAAAAAAAAGGTTATTTTATATTAAAATAAACAGGTAAAA ATTAAAAAAAAAAGAGGTTATTTTAATATAATCAACAACTTCATGAGTATGTAATAGGTG GATAGCACTTAATTTGGGCAGGTTAAAATGACTAATGACAAATCAAAAGTTTTGAATTTA TAGATTTTGAACTTTAGAAAAAATAATTAACTTGACTCCATTATAAAGTATTTAGACATA TAATTAGCTATGAATTTATTCATATAAGTATATGATTTTAATCAATAATATTGAATATTT ATATTAAATTTGCACGTAATTGAAATTTTACCTCCGCCTCGAAAAGACAAAAAAAAAAAA GCAGCTTTCCCTTTCAATATGTTTTCTTTAGTCCTCTCTTTAATTTCCCAAAACATTTGG ATTGTACAAAGATACACGGACAAACAAATCTAACACATGAGTTGAGAGAAGTTTGGGTCC CAATTCTTTTACTTTGATTAGACAAAGCAAACTCCTTAACCACACGCAAAATCTTTAAGA ATCCTCTCATTTCAGCATTGAGACAAAAAAAAAAACTAAGATGTCCATTACAATAGCAAA CTCTCATTTTGGATCAATCCTAAAAATACCATATCTTTTTTTTGATTTCAAACAACTATA TTGTATGATTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATGTTCAATGTTAAAT ATAGCATGTATGCCTAGGCAAACACTAATAACTCCTTTGCACATTATATATGAGGGGCCC TGTATCTCCATCTGCTTCCTATCTAATTGTCGGCCATTTGTAATGCATCAAGACAATTTC CACACCAAGCAACATATATATACTACTAGTATTAGTAGTACTGTTTAGGACTTTTATTCA AATTATCTTGAGATTTGGTATACACTACAGTAACCATAATAACATATATCTAATGAAAAT TCAAATCCCGCGTTATAATTAAGGGGAGGATTATCCAAGTCCATATAAAAAGACTAAATT TTCATCCTTTTTTGATGTGGGAATTCTCCACACTCTCCCCCACACCCAACTATAATACGG GGCTCAACATCGATAAACAAGTAAACGGGATGAGCCTAGCTCTAATACCATAAA