Plant GARDEN How To ▶︎

JA

EN

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g116750.3.1

CDS Infomation

WD-repeat protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SMF9_RICCO)

Sequence

ATGACTTCTTTAAGCAGAGAGCTGGTGTTTTTGATACTCCAGTTCTTAGATGAAGAGAAG
TTCAAGGAAACTGTGCACAAGTTGGAGAAGGAGTCGGGTTTCTTCTTCAACATGAGGTAT
TTTGAGGATTCGGTTACTAATGGAGAGTGGGATGAGGTGGAGAAGTATTTATCTGGGTTT
ACTAAGGTAGATGATAATCGGTACTCAATGAAAATATTTTTTGAGATCCGAAAACAGAAG
TATCTGGAAGCACTTGATAGGCATGATCAGGCTAAGGCTGTGGAGATTCTAGTGAAAGAT
CTGAAAGTGTTTTCCACATTTAATGAAGAGTTGTTCAAGGAGATAACGCTCCTCTTGACA
TTGCAGAATTTTAGGGAGAATGAACAGCTTTCAAAGTATGGAGATACCAAGTCTGCTAGG
GCGATAATGCTTGTTGAGTTAAAAAAATTGATCGAGGCCAATCCTCTTTTCCGCGAGAAG
CTTCAGTTTCCTAGCTTAAAGAACTCAAGGCTGCGGACATTGATAAACCAGAGTTTAAAT
TGGCAGCATCAGCTATGCAAGAACCCAAAGCCCAATCCTGATATAAAAACACTCTTTGTT
GACCATGCTTGTGGGCAACCAAATGGTGCTCGGGCTCCTTCGCCAGTTGCTAATCCAATA
ATTGGTTCTATGCCTAAAGTAGGTGGTTTTCCACCTATAGGCGCCCATGGACCATTCCAG
CCAGCACAAGCACCTATTGCTTCGCTTGGAGGATGGATGACCAATCCTCCCTCTATGCCA
CACCAAGCTATTTCAGGAGGACCAATAGGCTTAAGCCCTCCTACTAATGCTGCATCCATG
CTAAAGCATCCTAGGACTCCTCCTGCTAGCAATGCTGCGTTGGACTACCAAACAGCCGAT
TCAGAGCATGTACTGAAGAGGCCAAGACCCTTTGGGATGTCAGAGGAGGTCAATAATCTC
CCCGTCAACATTTTCCCCGTCACATATCCTGGACAGAGCCATGCTCATAGCTTGCATTCT
TCTGATGACTTGCCCAAGACTGTTGTGGTGAACTTGAATCAAGGGTCTGCTGTTAAGAGC
ATGGATTTCCATCCTGTGCAACAAACTCTTCTTCTTGTTGGAACAAACATTGGTGACATT
GCTATATGGGAGATTGGTGGCAGGGAAAGGCTTGCATTTAAAAATTTTAAAGTTTGGGAG
ATAGGTAACTGTTCAATGACTTTGCAGGCTTCTTTAGCGAATGAATACACTGCAACAGTT
AACCGTGTGATGTGGAGTCCTGATGGGAACCTTCTTGGTGTTGCATATTCTAAGCACATA
GTTCATCTATACTCATACCATGGTGGTGATGATTTGAGGAACCACCTAGAGATTGATGCC
CATGTTGGCAATGTTAGTGATCTTGCTTTCTCTCATCCAAATAAACAATTATGCATAATA
ACTTGTGGAGAGGACAAGGCTATCAAGGTGTGGGATGCTGCCACTGGCTCTAAGCTGTAC
ACTTTTGAGGGCCATGAAGCACCTGTCTATTCTGTGTGTCCCCACTATAAGGAAAGCATT
CAGTTCATTTTTGCAACTGCTGTTGATGGGAAGATCAAGGCTTGGCTGTATGACAACATG
GGATCCAGGGTTGATTATGATGCTCCAGGCCACTCATGTACTACAATGGCTTACAGTGCT
GATGGAGCAAGGCTCTTTTCTTGTGGCACCAGTAAAGATGGTGAATCATACCTTGTGGAG
TGGAATGAAAGTGAAGGTGCTGTTAAACGTACTTATGTTGGCCTTGGGAAAAGATCTGTT
GGGGTGGTGCAATTTGATACTACTAAAAACAGATTCTTGGCTGCTGGCGATGAGTTCATA
ATCAAATTCTGGGACATGGATAATACAAACCTCTTGACTACTGCAGATGCTGATGGTGGA
TTACCAGCATCTCCATGCATCCGATTTAGTAAAGAAGGCACACTTTTAGCTGTATCAACC
AGTGAAAATGGGGTTAAAATATTGGCAAATGCTGATGGTGTTCGGCTGATCCGTGCTCTT
GAAAGCCGTGCTCTTGATCCCTCCAGAGGTCCTCCTGGTGCTGTTGCCAAGGCACCCATG
ATCAGCACATATGGTGCTTCTAGTTCAACTGCTGGAACTAGCATCAGTATTGCGGATAGA
ACTGCGCCAGTGACGGCTATTGTTCAACTGAATGGAGATAACCGCAACCTGCAAGATACC
AAGCCTAGGATTCCTGATGAGCTGGAGAAATCCAAAATTTGGAAATTGACTGAAATTAGT
GAACCTGCTCAAGTTCGTTCCTCGAGGCTTCCAGATAATCAACTGTCCGTGAGGATCATT
AGATTAATGTACACAAATTCGGGAGGTGCAATTCTGGCTTTGGCATACAATGCCGTACAC
AAACTCTGGAAGTGGCAACGGAACGAGAGGAACGTGACAGGAAAGGCATCTACTGCTGTC
CCCCCTCAATTATGGCAACCTTCCAGTGGAATTCTGATGACAAATGATATAAGCGACACA
AACCCTGAAGAAGCTGTTCCATGCTTTGCACTTTCCAAGAATGACTCTTATGTTATGTCC
GCATCTGGTGGAAAAATTTCTTTGTTTAACATGATGACTTTTAAGACCATGACAACTTTC
ATGCCCCCTCCACCTGCAGCAACTTTTCTTGCTTTTCATCCACAGGATAATAACATTATT
GCTATCGGAATGGAGGACTCTTCTATACAAATATATAATGTTCGCGTTGATGAGGTGAAA
AGCAAACTCAAAGGTCATCAGAAGAGAGTAACTGGCTTGGCTTTCTCTAGCGTTTTGAAT
GTTCTGGTATCATCTGGTGCTGATGCTCAGCTATGTGTTTGGAGCATGGATGGATGGGAG
AAGAAAGCCAGCAAGTTTTTGCAGATCCCCTCTGGTAGAGCAATAAATCCTCTTGCTCAG
ACACGGGTTCAGTTCCATCAAGATCAGACGCATTTGTTGGTTGTTCATGAAACACAGATA
GCAATATATGAAGCATCAAAGCTTGAATGCGTGAAGCAGTGGGTTTCACCAAATTTTGCA
GTTACTGATGCGACGTATTCGTGTGATAGCCAATCAATTTTTGCAAGTTTTGATGATGGA
AGTGTGAGTATCTTTACCGCTGCAGCACTCAAGCTGAGGTGTCGGGTGAATCCTGCCGCC
TACTTGCCTTCTAACCCAAGCTCCAGAGTATATCCACTTGTCGTTGCTGCTCATCCATCT
GAATCAAACCAATGCGCAGTAGGACTTACTGATGGCGGAGTTTATGTGCTTGAGCCTCTA
GAGTCGGAAGGTAAATGGGGCACACCACCTCCAAATGAAAATGGTGTTGCCCCTGGCATG
AGCTCTGCTGCCACTGGTCTTGATCAAGCATCAAGGTAG

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g116750.3.1

PEP Infomation

WD-repeat protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SMF9_RICCO)

Sequence

MTSLSRELVFLILQFLDEEKFKETVHKLEKESGFFFNMRYFEDSVTNGEWDEVEKYLSGF
TKVDDNRYSMKIFFEIRKQKYLEALDRHDQAKAVEILVKDLKVFSTFNEELFKEITLLLT
LQNFRENEQLSKYGDTKSARAIMLVELKKLIEANPLFREKLQFPSLKNSRLRTLINQSLN
WQHQLCKNPKPNPDIKTLFVDHACGQPNGARAPSPVANPIIGSMPKVGGFPPIGAHGPFQ
PAQAPIASLGGWMTNPPSMPHQAISGGPIGLSPPTNAASMLKHPRTPPASNAALDYQTAD
SEHVLKRPRPFGMSEEVNNLPVNIFPVTYPGQSHAHSLHSSDDLPKTVVVNLNQGSAVKS
MDFHPVQQTLLLVGTNIGDIAIWEIGGRERLAFKNFKVWEIGNCSMTLQASLANEYTATV
NRVMWSPDGNLLGVAYSKHIVHLYSYHGGDDLRNHLEIDAHVGNVSDLAFSHPNKQLCII
TCGEDKAIKVWDAATGSKLYTFEGHEAPVYSVCPHYKESIQFIFATAVDGKIKAWLYDNM
GSRVDYDAPGHSCTTMAYSADGARLFSCGTSKDGESYLVEWNESEGAVKRTYVGLGKRSV
GVVQFDTTKNRFLAAGDEFIIKFWDMDNTNLLTTADADGGLPASPCIRFSKEGTLLAVST
SENGVKILANADGVRLIRALESRALDPSRGPPGAVAKAPMISTYGASSSTAGTSISIADR
TAPVTAIVQLNGDNRNLQDTKPRIPDELEKSKIWKLTEISEPAQVRSSRLPDNQLSVRII
RLMYTNSGGAILALAYNAVHKLWKWQRNERNVTGKASTAVPPQLWQPSSGILMTNDISDT
NPEEAVPCFALSKNDSYVMSASGGKISLFNMMTFKTMTTFMPPPPAATFLAFHPQDNNII
AIGMEDSSIQIYNVRVDEVKSKLKGHQKRVTGLAFSSVLNVLVSSGADAQLCVWSMDGWE
KKASKFLQIPSGRAINPLAQTRVQFHQDQTHLLVVHETQIAIYEASKLECVKQWVSPNFA
VTDATYSCDSQSIFASFDDGSVSIFTAAALKLRCRVNPAAYLPSNPSSRVYPLVVAAHPS
ESNQCAVGLTDGGVYVLEPLESEGKWGTPPPNENGVAPGMSSAATGLDQASR*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g116750.3.1

Transcript Infomation

WD-repeat protein, putative (AHRD V3.3 *** B9SMF9_RICCO)

Sequence

TATATTTAGACCTCATACGTGTAATTTTACCATCATCACTTGATTATTATTAGAATTATT
ATATGCTTATTACATGTGTTTTTTTGTATAGCAAATTTGTCAGAGGTTAATAGATATGTT
CATGGAAATAGCCATGTTATGAATTTCGATATTCGGGTATAACCCTACTGAAATGATAAA
AAAAGCATTTGATAGTTGTTGAGTAGAAAGAACTAATGTAATACAAAGCAATCGTGTTAC
CGAGCTCGTCCGCATCATTTGAAAGAGACCAAGCAAATCATTAAATAGTGGCTTCCAGAA
AATTGGTCATGCCCGAAGTAGCTAAGTTTCTATCTAGAGTTTTGATGGAACCTTTTATTA
GATGAATTCTTGTTAATTTTTTACATAACTGAGTCATTCTTATATCTCTAATTGTTGAAC
GACGTAATGATTGTAGTTAATTGACTGACAAGCAATTAACGATGTCATTGTTGTTCTCGA
GAGATTATGAAATTACCTTTTAATTAAATAATGTCCCTTCGAAGCATTACCATATTAAAA
GGTGAGATTTGAAAGTGAAATTTACAGATAACAAAACTTTGATGCAGTTTAAATGAATAG
ATTAATCGACTAACTACAATTCATTCGAGAAAATAATGATAGAAAATTATTGCACTTAAT
CGAAAGAAATTTATGGTTGATATTATAGAATCTGACAATTGAGGAAATCGCAACTCTATG
GCTCCTTAATCTTGAAGTCAACCCGTTCTTACTAGTTGATAATTTTTATTGCTTAATCAA
TATTTGTTAGAATTAAGAAATTCAATAATGAAATTAAATAATTGTTCAAATCTATTTTTA
TAGTGATACTCAATAGTCATAATTAACTCTTAGTTCTCTGTTCAACTCGAATCTAGACTT
AAAAATCAGATAATATTTACAGCGACCACCTATCCTTTTCAAACCTATTTTAGGTGTAAT
CACAACGCTACTCTCAGAATAAACCTCGTTCAAATTAAGTATGGACTGTAACAAGATAAC
AAACATTGTACAATAAACCTCAACTAATTAGAAATTATTATTTTAAAATTTTAAAACTCA
TAAAATTAAAATTTCGATTTCTCGCAAGATGTACTATTGCTTTTACCAACTATAATGTAA
AAAACATTTATTTGTTTAAAAATAATAATTCAAATACTTGTATGTTAATCTATGGTCTAT
ATACATAGTAAATCATCCTTAAATAGAAGCTAATAATTGAAGAAAAGCAGGGACCACCTA
TTTATTAGTAGATCGAATTATTAAAGCACATTTAAGAATGGTGCTTTGGTCGCTGTACCT
TATTCTTTCTCTCTAACACGCAAAACTTACAACTGATAAGTAGAATTACTTATCATCAGT
ATCCACTTATCGTATAATGGAATCCAATTCTGATAAGCCAACTAACTTATCATTATGATT
ATGACTCCTCTACTTATCACCACTTTCGTAATGCGACGTGGCGATGTGTTGCATTTGATC
AAAAGTCGACGCGTTTAATGGACCAAAATTTATAGTGAGATCGTGTAGTTCACGACTCAA
GGAGGCGCGTAAGGAACATTCTCGTCATGCTTTTTCCATTTTCTTTTTCCTTTTTTTGGT
TGTATAAATAAATGCAGTGGGGAGAGTGAAAGAAGAAGCACAAAATTAGATTAGAAAGAG
AAAGAGAGAAAGCAGAGGGGAAGGAAAAAGACGGAGGCCCACCGCAAAAGCCCAAAAGGA
CCTCACCTTCTTCATCGTCTTCGTTGTTTATGTTCATCTCGATCGGTTGTGAAAACCCTA
AATTAAGGTCGGCGATTGTAGGATTGTGGTGGATCTGTTTTGATCAGTCAACGTGATGAC
TTCTTTAAGCAGAGAGCTGGTGTTTTTGATACTCCAGTTCTTAGATGAAGAGAAGTTCAA
GGAAACTGTGCACAAGTTGGAGAAGGAGTCGGGTTTCTTCTTCAACATGAGGTATTTTGA
GGATTCGGTTACTAATGGAGAGTGGGATGAGGTGGAGAAGTATTTATCTGGGTTTACTAA
GGTAGATGATAATCGGTACTCAATGAAAATATTTTTTGAGATCCGAAAACAGAAGTATCT
GGAAGCACTTGATAGGCATGATCAGGCTAAGGCTGTGGAGATTCTAGTGAAAGATCTGAA
AGTGTTTTCCACATTTAATGAAGAGTTGTTCAAGGAGATAACGCTCCTCTTGACATTGCA
GAATTTTAGGGAGAATGAACAGCTTTCAAAGTATGGAGATACCAAGTCTGCTAGGGCGAT
AATGCTTGTTGAGTTAAAAAAATTGATCGAGGCCAATCCTCTTTTCCGCGAGAAGCTTCA
GTTTCCTAGCTTAAAGAACTCAAGGCTGCGGACATTGATAAACCAGAGTTTAAATTGGCA
GCATCAGCTATGCAAGAACCCAAAGCCCAATCCTGATATAAAAACACTCTTTGTTGACCA
TGCTTGTGGGCAACCAAATGGTGCTCGGGCTCCTTCGCCAGTTGCTAATCCAATAATTGG
TTCTATGCCTAAAGTAGGTGGTTTTCCACCTATAGGCGCCCATGGACCATTCCAGCCAGC
ACAAGCACCTATTGCTTCGCTTGGAGGATGGATGACCAATCCTCCCTCTATGCCACACCA
AGCTATTTCAGGAGGACCAATAGGCTTAAGCCCTCCTACTAATGCTGCATCCATGCTAAA
GCATCCTAGGACTCCTCCTGCTAGCAATGCTGCGTTGGACTACCAAACAGCCGATTCAGA
GCATGTACTGAAGAGGCCAAGACCCTTTGGGATGTCAGAGGAGGTCAATAATCTCCCCGT
CAACATTTTCCCCGTCACATATCCTGGACAGAGCCATGCTCATAGCTTGCATTCTTCTGA
TGACTTGCCCAAGACTGTTGTGGTGAACTTGAATCAAGGGTCTGCTGTTAAGAGCATGGA
TTTCCATCCTGTGCAACAAACTCTTCTTCTTGTTGGAACAAACATTGGTGACATTGCTAT
ATGGGAGATTGGTGGCAGGGAAAGGCTTGCATTTAAAAATTTTAAAGTTTGGGAGATAGG
TAACTGTTCAATGACTTTGCAGGCTTCTTTAGCGAATGAATACACTGCAACAGTTAACCG
TGTGATGTGGAGTCCTGATGGGAACCTTCTTGGTGTTGCATATTCTAAGCACATAGTTCA
TCTATACTCATACCATGGTGGTGATGATTTGAGGAACCACCTAGAGATTGATGCCCATGT
TGGCAATGTTAGTGATCTTGCTTTCTCTCATCCAAATAAACAATTATGCATAATAACTTG
TGGAGAGGACAAGGCTATCAAGGTGTGGGATGCTGCCACTGGCTCTAAGCTGTACACTTT
TGAGGGCCATGAAGCACCTGTCTATTCTGTGTGTCCCCACTATAAGGAAAGCATTCAGTT
CATTTTTGCAACTGCTGTTGATGGGAAGATCAAGGCTTGGCTGTATGACAACATGGGATC
CAGGGTTGATTATGATGCTCCAGGCCACTCATGTACTACAATGGCTTACAGTGCTGATGG
AGCAAGGCTCTTTTCTTGTGGCACCAGTAAAGATGGTGAATCATACCTTGTGGAGTGGAA
TGAAAGTGAAGGTGCTGTTAAACGTACTTATGTTGGCCTTGGGAAAAGATCTGTTGGGGT
GGTGCAATTTGATACTACTAAAAACAGATTCTTGGCTGCTGGCGATGAGTTCATAATCAA
ATTCTGGGACATGGATAATACAAACCTCTTGACTACTGCAGATGCTGATGGTGGATTACC
AGCATCTCCATGCATCCGATTTAGTAAAGAAGGCACACTTTTAGCTGTATCAACCAGTGA
AAATGGGGTTAAAATATTGGCAAATGCTGATGGTGTTCGGCTGATCCGTGCTCTTGAAAG
CCGTGCTCTTGATCCCTCCAGAGGTCCTCCTGGTGCTGTTGCCAAGGCACCCATGATCAG
CACATATGGTGCTTCTAGTTCAACTGCTGGAACTAGCATCAGTATTGCGGATAGAACTGC
GCCAGTGACGGCTATTGTTCAACTGAATGGAGATAACCGCAACCTGCAAGATACCAAGCC
TAGGATTCCTGATGAGCTGGAGAAATCCAAAATTTGGAAATTGACTGAAATTAGTGAACC
TGCTCAAGTTCGTTCCTCGAGGCTTCCAGATAATCAACTGTCCGTGAGGATCATTAGATT
AATGTACACAAATTCGGGAGGTGCAATTCTGGCTTTGGCATACAATGCCGTACACAAACT
CTGGAAGTGGCAACGGAACGAGAGGAACGTGACAGGAAAGGCATCTACTGCTGTCCCCCC
TCAATTATGGCAACCTTCCAGTGGAATTCTGATGACAAATGATATAAGCGACACAAACCC
TGAAGAAGCTGTTCCATGCTTTGCACTTTCCAAGAATGACTCTTATGTTATGTCCGCATC
TGGTGGAAAAATTTCTTTGTTTAACATGATGACTTTTAAGACCATGACAACTTTCATGCC
CCCTCCACCTGCAGCAACTTTTCTTGCTTTTCATCCACAGGATAATAACATTATTGCTAT
CGGAATGGAGGACTCTTCTATACAAATATATAATGTTCGCGTTGATGAGGTGAAAAGCAA
ACTCAAAGGTCATCAGAAGAGAGTAACTGGCTTGGCTTTCTCTAGCGTTTTGAATGTTCT
GGTATCATCTGGTGCTGATGCTCAGCTATGTGTTTGGAGCATGGATGGATGGGAGAAGAA
AGCCAGCAAGTTTTTGCAGATCCCCTCTGGTAGAGCAATAAATCCTCTTGCTCAGACACG
GGTTCAGTTCCATCAAGATCAGACGCATTTGTTGGTTGTTCATGAAACACAGATAGCAAT
ATATGAAGCATCAAAGCTTGAATGCGTGAAGCAGTGGGTTTCACCAAATTTTGCAGTTAC
TGATGCGACGTATTCGTGTGATAGCCAATCAATTTTTGCAAGTTTTGATGATGGAAGTGT
GAGTATCTTTACCGCTGCAGCACTCAAGCTGAGGTGTCGGGTGAATCCTGCCGCCTACTT
GCCTTCTAACCCAAGCTCCAGAGTATATCCACTTGTCGTTGCTGCTCATCCATCTGAATC
AAACCAATGCGCAGTAGGACTTACTGATGGCGGAGTTTATGTGCTTGAGCCTCTAGAGTC
GGAAGGTAAATGGGGCACACCACCTCCAAATGAAAATGGTGTTGCCCCTGGCATGAGCTC
TGCTGCCACTGGTCTTGATCAAGCATCAAGGTAGCGGCAGTGGTCTCTCTGATGCAAATG
CTCCTGTGCTATATTTTCGGGGGAGCTGTAGATTTTCAGATCTAGGATACAACCTCTTGA
CGTCAGTGATAAGAAGTGGCAGTGTCTCCTGTGGAAGCTGAGACGGTATGGAAGATCAGT
TATTCAGTTAAAGGAAGGATTCAAAGAAAAAGACAAAATGTTGATAATTATAGGTAGATT
AGGGATTCAGTTCAACCTCTTGAGAAATTTTGCCTGTTTTAAGTTGTTTCTGTCCAAGCA
CTAAACTATGGCAGTGTAATTATCGAAAGCTCAAGCAAGCCAGTTGATTTTACTCTCTCT
CTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGCGCGCACACGTGCTAACGAAACAATGATCTGATC
AAAGCTAATGGGAGACTTGTTATTTATAGGCTGTATTTTTGTTCTTCCTTGTAGATGAGT
AGATGACCCTTACAATTATGAGCAGAAGTTCTTCCGACTCTTATACATATCGTAAGATGT
ACGCATATATGCTCGAGT