Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g116620.3.1
CDS Infomation	Phospholipase D (AHRD V3.3 *** M0ZIV2_SOLTU)
Sequence	ATGGCTCCGATTCTGCTTCATGGTACTCTGCATGTCACCATACACGAGGTCGATAAGCTG CACGGGAAGCAAGGTCGCAACTTCTTCAGCAAGATTAAAGATTCTGTCGAGGAGAAGGTA GGTATGGGCAAAGGAGCTTCTAGAATTTATGCGACAGTTGATTTGGAAAAGGCAAGGGTT GGAAGAACCAGAGTTATTGAAAATGAACCAAACAATCCTAGGTGGTATGAGTCTTTCCAC ATCTATTGTGCTCATATGGCAAAAAATGTTATATTTACTGTCAAAGATAACAATTCCATT GGTGCAACCTTAATTGGAAGAGCTTATTTACCAGTTAATGACCTTTTGGAAGGGGAAGAG GTTGATGAGTGGATTGAGATACTGGATGAAGATGAGAATCCCGTTGAAGCAGGTTCTAAA ATCCATGTGACACTGCAGTATTTTGAAATCAGCCGTGATCGTAATTGGGGACGTGGAATA GGTACTTCTAAATATCCTGGTGTCCCTTATACTTTCTTCCCTCAGAGAACAGGATGTCGC GTTTCTTTGTATCACGATGCACATATCCCTGATAATTTTATTCCGAAAATCCCTCTGTCA GGGGGTAAGTATTATGAACCACATCGATGTTGGGAAGATATCTTTGATGCGATTTCTAAT GCAAAGCACATGATTTACATTACTGGCTGGTCTGTATATACTGAAATAACCTTAATGAGA GACTCCAGGAGGGAAAAGCCTGGAGGAGGCGACACAGTCGGAGAGCTGCTCAAGAAGAAG GCGAAGGAAGGTGTTAAAGTCCTCATGCTTGTATGGGATGACAGAACATCTGTACGTCTG CTGAAGAAAGACGGTCTCATGGCCACTCATGACGAAGAAACTGAGGAGTACTTTAAAGAT TCTGATGTGCATTGTGTCCTTTGCCCGCGGGATCCTGATGATGGTGGAAGCATAGTTAAA GATATACAGACTTCTACAATGTTTACTCATCACCAGAAAATCGTTATAGTGGACACTGTC ATGCCCAATGGAGAGTCAGAGACGAGGAGGCTTATGAGCTTCGTTGGTGGCCTTGATCTT TGTGATGGGAGATACGATACTCCTTTCCATTCACTTTTTAGGACGCTGGATACAGCACAT CATGATGATTTCCACCAACCTAATTTTGCTGAAGCTTCGATTGACAAAGGAGGGCCTAGA GAGCCCTGGCACGACATTCATTCTCGAGTTGAAGGACCAATTGCTTGGGATGTACTGTAT AATTTTGAGCAGAGATGGAAAAAACAGGGCGGAAAAGATATTCTTGTGGACGTAAGAGAG CTTGACAATGTTATCGTTCCACCATCTTCAGTTATGTACCATGATGATCCTGAATCATGG AATGTTCAATTATTCAGATCGATTGATGGTGGGGCAGCTTTCGGGTTTCCTGATACACCA GAAGAGTCGGTAAAGGCTGGTCTAGTGAGCGGGAAGAATAACATAGTCGATAGAAGTATC CAAGATGCTTACATCACTGCTATTCGTCGAGCAAAGAATTTCATCTACATTGAAAATCAG TATTTTCTCGGAAGCTGTTACGATTGGGAGGATGATGATGTGAAAGTGGAGGAGGTTGGT GCTTTGCATCTCATCCCAAAAGAACTTACATTGAAGATTGTTAGTAAAATTGAAGCTGGA GAAAGGTTTACTGTATATGTTCTGGTTCCAATGTGGCCAGAGGGAATTCCTGACAGTGCA TCTGTACAAGCAATATTATATTGGCAAAGGAGGACAATGGAAATGATGTATAAACATATA TTTAAGACTCTCAGAGATGCAGGTATCGATGATCACCCCAGGAATTATTTGACTTTTTTC TGTATTGGTAATCGAGAGGTGAAGAAGAGTGGAGAATATGAACCTTCACACGAGCCTGAA TCTGATACTGATTATAGACGAGCTCAGGAAGCTCGTCGCTTCATGATCTATGTTCATTCC AAGATGATGATTGTTGATGATGAGTACATCATAGTTGGATCAGCCAACATTAACCAGAGG TCAATGGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCAATTGGAGCATACCAGCCTCATAATTTA TCGACAAACAGGCAACCAGCAAGAGGTCAAATTCATGGGTTCCGAATGGCATTGTGGTAC GAGCATATGGGGATGCTCGATGACACGTTCCAACATCCAGAGAGCGAAGATTGTGTCAGG AAGGTGAATGGAATAGCTGATAAATACTGGGATCTCTACACAAGTGAGAGTCTAGAAACT GATCTGCCTGGTCACTTACTCCGATACCCCGTCGGACTTACCAACGACGGTGAGATCACA GATTTGCCTGGAAATGGAAATGAGTACTTCCCTGACACTAAGGCTAAGGTTATTGGTACT AAATCTGACCTCCTTCCTCCTATCCTCACTACCTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g116620.3.1
PEP Infomation	Phospholipase D (AHRD V3.3 *** M0ZIV2_SOLTU)
Sequence	MAPILLHGTLHVTIHEVDKLHGKQGRNFFSKIKDSVEEKVGMGKGASRIYATVDLEKARV GRTRVIENEPNNPRWYESFHIYCAHMAKNVIFTVKDNNSIGATLIGRAYLPVNDLLEGEE VDEWIEILDEDENPVEAGSKIHVTLQYFEISRDRNWGRGIGTSKYPGVPYTFFPQRTGCR VSLYHDAHIPDNFIPKIPLSGGKYYEPHRCWEDIFDAISNAKHMIYITGWSVYTEITLMR DSRREKPGGGDTVGELLKKKAKEGVKVLMLVWDDRTSVRLLKKDGLMATHDEETEEYFKD SDVHCVLCPRDPDDGGSIVKDIQTSTMFTHHQKIVIVDTVMPNGESETRRLMSFVGGLDL CDGRYDTPFHSLFRTLDTAHHDDFHQPNFAEASIDKGGPREPWHDIHSRVEGPIAWDVLY NFEQRWKKQGGKDILVDVRELDNVIVPPSSVMYHDDPESWNVQLFRSIDGGAAFGFPDTP EESVKAGLVSGKNNIVDRSIQDAYITAIRRAKNFIYIENQYFLGSCYDWEDDDVKVEEVG ALHLIPKELTLKIVSKIEAGERFTVYVLVPMWPEGIPDSASVQAILYWQRRTMEMMYKHI FKTLRDAGIDDHPRNYLTFFCIGNREVKKSGEYEPSHEPESDTDYRRAQEARRFMIYVHS KMMIVDDEYIIVGSANINQRSMDGARDSEIAIGAYQPHNLSTNRQPARGQIHGFRMALWY EHMGMLDDTFQHPESEDCVRKVNGIADKYWDLYTSESLETDLPGHLLRYPVGLTNDGEIT DLPGNGNEYFPDTKAKVIGTKSDLLPPILTT*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g116620.3.1
Transcript Infomation	Phospholipase D (AHRD V3.3 *** M0ZIV2_SOLTU)
Sequence	ACATTTTCCCTTTGTTCTATATCAAAGATATCTCGATCTACCTTTTATTACTTGAAGTAT TAAAAGATAAAAATTAAAAATCTATCTATTTGGAATTGTATACCTAATAAGTCAATATTC TTGAATAGGAAACTTAACAACTTTTAATAATTCTGAAAGTATTCAATTCTATAATACAAG TACCGTGAAATTTTGATGATTCTAGTTTATTATTTCCTTTAGTTTATTTAAATTAAATTT TTATTATCTAATTTAATTATTTTGCACATAAAAATCAGGTCCTCAAAAAGGCAAATTAAA TTAGAGTTTAGTAACCTCTGTTTACTCAGTCAACCTTTTAACATTCCGCTATGTCTATGG GGCAATTTCTATAACCGCACAGCTTTATCGCCTATCGAATCGCCACATCACTCCTTTTTA CAGCAAACATCTTTAATTTTCCTTTTGTTGGAGTGACATTTCAGGTCTAAATGCACTAAT CGTTTTTTTTTTGTTTGCATGCACTGATTGTTTTCCCCTAATTTGACGTGAAAAAATGGC TCCGATTCTGCTTCATGGTACTCTGCATGTCACCATACACGAGGTCGATAAGCTGCACGG GAAGCAAGGTCGCAACTTCTTCAGCAAGATTAAAGATTCTGTCGAGGAGAAGGTAGGTAT GGGCAAAGGAGCTTCTAGAATTTATGCGACAGTTGATTTGGAAAAGGCAAGGGTTGGAAG AACCAGAGTTATTGAAAATGAACCAAACAATCCTAGGTGGTATGAGTCTTTCCACATCTA TTGTGCTCATATGGCAAAAAATGTTATATTTACTGTCAAAGATAACAATTCCATTGGTGC AACCTTAATTGGAAGAGCTTATTTACCAGTTAATGACCTTTTGGAAGGGGAAGAGGTTGA TGAGTGGATTGAGATACTGGATGAAGATGAGAATCCCGTTGAAGCAGGTTCTAAAATCCA TGTGACACTGCAGTATTTTGAAATCAGCCGTGATCGTAATTGGGGACGTGGAATAGGTAC TTCTAAATATCCTGGTGTCCCTTATACTTTCTTCCCTCAGAGAACAGGATGTCGCGTTTC TTTGTATCACGATGCACATATCCCTGATAATTTTATTCCGAAAATCCCTCTGTCAGGGGG TAAGTATTATGAACCACATCGATGTTGGGAAGATATCTTTGATGCGATTTCTAATGCAAA GCACATGATTTACATTACTGGCTGGTCTGTATATACTGAAATAACCTTAATGAGAGACTC CAGGAGGGAAAAGCCTGGAGGAGGCGACACAGTCGGAGAGCTGCTCAAGAAGAAGGCGAA GGAAGGTGTTAAAGTCCTCATGCTTGTATGGGATGACAGAACATCTGTACGTCTGCTGAA GAAAGACGGTCTCATGGCCACTCATGACGAAGAAACTGAGGAGTACTTTAAAGATTCTGA TGTGCATTGTGTCCTTTGCCCGCGGGATCCTGATGATGGTGGAAGCATAGTTAAAGATAT ACAGACTTCTACAATGTTTACTCATCACCAGAAAATCGTTATAGTGGACACTGTCATGCC CAATGGAGAGTCAGAGACGAGGAGGCTTATGAGCTTCGTTGGTGGCCTTGATCTTTGTGA TGGGAGATACGATACTCCTTTCCATTCACTTTTTAGGACGCTGGATACAGCACATCATGA TGATTTCCACCAACCTAATTTTGCTGAAGCTTCGATTGACAAAGGAGGGCCTAGAGAGCC CTGGCACGACATTCATTCTCGAGTTGAAGGACCAATTGCTTGGGATGTACTGTATAATTT TGAGCAGAGATGGAAAAAACAGGGCGGAAAAGATATTCTTGTGGACGTAAGAGAGCTTGA CAATGTTATCGTTCCACCATCTTCAGTTATGTACCATGATGATCCTGAATCATGGAATGT TCAATTATTCAGATCGATTGATGGTGGGGCAGCTTTCGGGTTTCCTGATACACCAGAAGA GTCGGTAAAGGCTGGTCTAGTGAGCGGGAAGAATAACATAGTCGATAGAAGTATCCAAGA TGCTTACATCACTGCTATTCGTCGAGCAAAGAATTTCATCTACATTGAAAATCAGTATTT TCTCGGAAGCTGTTACGATTGGGAGGATGATGATGTGAAAGTGGAGGAGGTTGGTGCTTT GCATCTCATCCCAAAAGAACTTACATTGAAGATTGTTAGTAAAATTGAAGCTGGAGAAAG GTTTACTGTATATGTTCTGGTTCCAATGTGGCCAGAGGGAATTCCTGACAGTGCATCTGT ACAAGCAATATTATATTGGCAAAGGAGGACAATGGAAATGATGTATAAACATATATTTAA GACTCTCAGAGATGCAGGTATCGATGATCACCCCAGGAATTATTTGACTTTTTTCTGTAT TGGTAATCGAGAGGTGAAGAAGAGTGGAGAATATGAACCTTCACACGAGCCTGAATCTGA TACTGATTATAGACGAGCTCAGGAAGCTCGTCGCTTCATGATCTATGTTCATTCCAAGAT GATGATTGTTGATGATGAGTACATCATAGTTGGATCAGCCAACATTAACCAGAGGTCAAT GGATGGTGCAAGAGACTCAGAGATAGCAATTGGAGCATACCAGCCTCATAATTTATCGAC AAACAGGCAACCAGCAAGAGGTCAAATTCATGGGTTCCGAATGGCATTGTGGTACGAGCA TATGGGGATGCTCGATGACACGTTCCAACATCCAGAGAGCGAAGATTGTGTCAGGAAGGT GAATGGAATAGCTGATAAATACTGGGATCTCTACACAAGTGAGAGTCTAGAAACTGATCT GCCTGGTCACTTACTCCGATACCCCGTCGGACTTACCAACGACGGTGAGATCACAGATTT GCCTGGAAATGGAAATGAGTACTTCCCTGACACTAAGGCTAAGGTTATTGGTACTAAATC TGACCTCCTTCCTCCTATCCTCACTACCTAAGTTTAATAAAACTTGTAGACTTGTTATGT TAACAAAATAACAAATTCCTAGCTAAGTCATTGTTGTTTTTTGTTACAACTTTTTTATTT TTTTCAGATTTATTTTCATACATGTTCTGAACGGATACTAGTATTGGATTCTTTGAAAAT TTAACACTTTGTTATTTTCTTGTTGATCCCATTGTCTCATTAATTAATAATGATACTAGG AGCACTATATTGCATCAATCTTTTTACGGAATTTTTCATAAACAAGTTGGCTATATGAAT TGTGATCGACATATCATTACACTCCAATCTAATTAAGCTAATATTTCGTAATTTTACTTC TTTTTTTTTTATACATTTGGTATTTGAGACAATGGGTCGCAGGTTGGATTTAATTTAGAA TTCATTCTAAATAGGTTACTTGGATTGAAATTAGAGGTTTGAGATCAATTTTAGGGGAAC TTGTTAGAAGGATATGAATGACACGTATATAGACAGTGAGTATAAATGACCACATAATAT AACTCGAGGATTAAGAGTAATTTCAACCCTTTTCTCTAATTTAATTCTAAAATTTATTAG TTCAACCTAATTCCTTGAACTAAATGCACATATGGGATAAGCAAAGTTTGTTGAAAGTAT GTGACATGTAAGAGATGCAGAGATTTGAAGTTGCATACAATGAAATGGTGTTGAAACTAA CCAGACAAGTGGCAAAATCCCAAATATCAGAAGATTCCATTTGCAATTTGTCCACTTGGG TGATTTTTGGTCTATCCTCATTTTTCATTATTGTTTTGAATAAATTAGACTGTAACGTAT CTATTGGTCCTTATTATTTATCAATACCTAATCCTACTTTTGCCTAATCCAATCAACCGT GACATTTGGATCAAATCATCCATACTTCGACACGTGCCACGTACTGTTGTAAAAACTGCA AGATTTTTTTGTTTTGTTTTTTCTATAAATGTTCAAGTCTCCGATAAAAGATAA