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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g116560.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9MU52_POPTR)

Sequence

ATGTCTAAAACCCTTCTCTCCCGCATTAAACCCCTCCATAACCCAAAACCAAAACCCCCT
TCTTCTTCTTCCAACTTCCCGTTAACACGCCGCATCAAAGAAGTTGTTAACGAGGTCTGT
CAAATCCTCCATACCCAACAACAATGGGAAGACGCTGTCGAAATCCGTCTTTCACAGGAA
GAAATTGTCCCTCCTGACATTGCACACCTTGTGTTTGACAAACTTAAGGATGCTCATGTG
GGTCTCAAGTTCTTTGATTGGGTATCTCAAAGACCCGATGGTTGTCCCCTTGATCGTTTT
GCTTGTTCTTCTCTTTTGAAACTCTTGGCTAAGTTTAGAGTTTTTCCTGAAATTGATAGT
TTGTTGTCCAGCTTGACTACTTGTGAGGATAAGTTTCCTACTCTTGAAGCATTGGATGCT
GTAATTAAAGCTTATTCTGATTCTAATTTGGTTGATAAAGCTGTTGAATTGTATTATTTT
GTACTGAGGACTTATAATTTGGTTCCACATGTAGTTACTGTGAATTCTTTACTTCATGGT
CTTGTAAAACATGGTAAGATTAAAACTGCTAGAAGACTCTACGATGAGCTCGTTGAGAGA
AGTGGCGGTGTTGAGGATAAATTTTTGGATAATTTTAGCACTTGTATTATTGTTACAGGG
TTGAGTAAAGAAGGGAATGTGGAAGAAGGCAGGAAATTGATTGAGGATAGGTGGGGTAAA
GGTTGTGTACCAAATGTTGTTTTTTACAATACATTGATTGATGGCTACTGCAAGAAGGGT
GACATCAGAAGAGCATACGGGCTTTTCAATGAGTTGAAATTGAAGAGCTTTTTACCCACA
GTGGAGACTTATGGGGCACTGATAAATGGGTTTTGTAAAGATGGGCATTTTGAGAGAGTT
GATATGCTTGTGCAGGAGATGGTTGAGAGAGGTGTGATTGTCAATGCCCGAGTGTATAAT
ACCATCATTGATGCTAGGTGTAGGCATGGTTTTACTGTGGAAGCAATAGACACTGTAAGG
AAAATGGTTGAAGCTGGCAGTAAGCCAGATATCGTGACATATAACATATTGATCTCTTAT
TCATGCAAGGATGAGAAAATTCAGGAAGCTGAAAAGTTTCTAGATCAGGTTAAGAATATG
CGGCTGGTGCCTACCAAGTTTACTTATACTCCTTTGGTACATGCCTACTGCAAATTTGGT
GATTTTGAAAGGGCGTTAAGTTTGCTTGCTGAGATGACAGAGTATGGTGAAAAGCCCGAT
GTGTCAACTTATGGAGCTCTTGTCCATGGATTGGTGGTCTCTGGTGAAGTTGATGTTGCA
TTAGTCATTCGAGACAAGATGATTGAAAGGGGAGTATCACCTGATGCTGGAATTTATAAT
GTTCTGATGAGTGGGCTCTGCAAAAAATTGAAGCTTCCCGCCGCCAGGCAGCTCCTTGAT
GAGATGCTTGGCGGTGGTATATTGCCTGATGTATATGTTTATGCCACTTTAGTTGATGGA
TGTGTAAGAAATGGGGAATTTCAGGAAGCAAAGAAGCTATTTGAGCAGACAATTGAGATG
GGTATGGATCCTGGGCTTGTGGGGTACAATGCCATGATCAAAGGATACTGTAAGTTTGGA
TTGATGAAAGATGCAGTTGCTTGCATCAGTAGAATGAAAAAGTCAAAAATATCTCCAGAT
GCCTTTACTTATTCAACAGTAATTGATGGGTATGTAAAGCAAAATGATTTGCGCCGAGCA
TTAATGATACTCCCTCACATGGTAAAGCGCAACTGTATGCCAAATGTGGTAACATACAGC
TCTCTAATTTATGGATTTTGTCAGAATGGAGATCTAATGAGAGCTGAAAAGTTGTTCAAC
GGAATGCAATCGATTGGTATGATGCCTAATGTGATAACTTATAGTATATTAGTTGGTAGC
TTTTGTAAAGTGGGAAAACTTGCAAAAGCCGCTTCTATTTTTGAACAAATGCTCATGCAC
AAGTGCTATCCAACTGATGTCACATTCAATTATTTGGTCAATGGGTTTTCCCATTGCACG
CATACTATTTTCTCAAAAGAGAAAAATGATGAGAAGTGCTCTAAGTTTATGGCAATTTTT
AAAAGAATGATATCAGATGGTTGGCACCCGAGAAATGCTGCATACAATTCCATTATCACC
AGTCTCTGTTTACATAAAATGCTCAAAACTGCATTGCAATTACGTGACAAGATGATTAGT
AAAGGCTACACTACAGATTCAGTTACCTTCGCCGCCTTATTACATGGAATTTGCTTGAAT
GGAAAATCCAAGGAATGGAAAAGTATTATCTCCTGCAGCTTAAGTGCGACAGAACTGTCT
GTCGCTTTAAAGTATTCTTTGATATTTGACCAGTACCTGAGTCATGGATTCAACTCTGAG
GCTTCAGTAATTTTGCATACCTTGGGTAAAGGCCATGTCTCATAA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g116560.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9MU52_POPTR)

Sequence

MSKTLLSRIKPLHNPKPKPPSSSSNFPLTRRIKEVVNEVCQILHTQQQWEDAVEIRLSQE
EIVPPDIAHLVFDKLKDAHVGLKFFDWVSQRPDGCPLDRFACSSLLKLLAKFRVFPEIDS
LLSSLTTCEDKFPTLEALDAVIKAYSDSNLVDKAVELYYFVLRTYNLVPHVVTVNSLLHG
LVKHGKIKTARRLYDELVERSGGVEDKFLDNFSTCIIVTGLSKEGNVEEGRKLIEDRWGK
GCVPNVVFYNTLIDGYCKKGDIRRAYGLFNELKLKSFLPTVETYGALINGFCKDGHFERV
DMLVQEMVERGVIVNARVYNTIIDARCRHGFTVEAIDTVRKMVEAGSKPDIVTYNILISY
SCKDEKIQEAEKFLDQVKNMRLVPTKFTYTPLVHAYCKFGDFERALSLLAEMTEYGEKPD
VSTYGALVHGLVVSGEVDVALVIRDKMIERGVSPDAGIYNVLMSGLCKKLKLPAARQLLD
EMLGGGILPDVYVYATLVDGCVRNGEFQEAKKLFEQTIEMGMDPGLVGYNAMIKGYCKFG
LMKDAVACISRMKKSKISPDAFTYSTVIDGYVKQNDLRRALMILPHMVKRNCMPNVVTYS
SLIYGFCQNGDLMRAEKLFNGMQSIGMMPNVITYSILVGSFCKVGKLAKAASIFEQMLMH
KCYPTDVTFNYLVNGFSHCTHTIFSKEKNDEKCSKFMAIFKRMISDGWHPRNAAYNSIIT
SLCLHKMLKTALQLRDKMISKGYTTDSVTFAALLHGICLNGKSKEWKSIISCSLSATELS
VALKYSLIFDQYLSHGFNSEASVILHTLGKGHVS*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g116560.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing family protein (AHRD V3.3 *** B9MU52_POPTR)

Sequence

ATGTCTAAAACCCTTCTCTCCCGCATTAAACCCCTCCATAACCCAAAACCAAAACCCCCT
TCTTCTTCTTCCAACTTCCCGTTAACACGCCGCATCAAAGAAGTTGTTAACGAGGTCTGT
CAAATCCTCCATACCCAACAACAATGGGAAGACGCTGTCGAAATCCGTCTTTCACAGGAA
GAAATTGTCCCTCCTGACATTGCACACCTTGTGTTTGACAAACTTAAGGATGCTCATGTG
GGTCTCAAGTTCTTTGATTGGGTATCTCAAAGACCCGATGGTTGTCCCCTTGATCGTTTT
GCTTGTTCTTCTCTTTTGAAACTCTTGGCTAAGTTTAGAGTTTTTCCTGAAATTGATAGT
TTGTTGTCCAGCTTGACTACTTGTGAGGATAAGTTTCCTACTCTTGAAGCATTGGATGCT
GTAATTAAAGCTTATTCTGATTCTAATTTGGTTGATAAAGCTGTTGAATTGTATTATTTT
GTACTGAGGACTTATAATTTGGTTCCACATGTAGTTACTGTGAATTCTTTACTTCATGGT
CTTGTAAAACATGGTAAGATTAAAACTGCTAGAAGACTCTACGATGAGCTCGTTGAGAGA
AGTGGCGGTGTTGAGGATAAATTTTTGGATAATTTTAGCACTTGTATTATTGTTACAGGG
TTGAGTAAAGAAGGGAATGTGGAAGAAGGCAGGAAATTGATTGAGGATAGGTGGGGTAAA
GGTTGTGTACCAAATGTTGTTTTTTACAATACATTGATTGATGGCTACTGCAAGAAGGGT
GACATCAGAAGAGCATACGGGCTTTTCAATGAGTTGAAATTGAAGAGCTTTTTACCCACA
GTGGAGACTTATGGGGCACTGATAAATGGGTTTTGTAAAGATGGGCATTTTGAGAGAGTT
GATATGCTTGTGCAGGAGATGGTTGAGAGAGGTGTGATTGTCAATGCCCGAGTGTATAAT
ACCATCATTGATGCTAGGTGTAGGCATGGTTTTACTGTGGAAGCAATAGACACTGTAAGG
AAAATGGTTGAAGCTGGCAGTAAGCCAGATATCGTGACATATAACATATTGATCTCTTAT
TCATGCAAGGATGAGAAAATTCAGGAAGCTGAAAAGTTTCTAGATCAGGTTAAGAATATG
CGGCTGGTGCCTACCAAGTTTACTTATACTCCTTTGGTACATGCCTACTGCAAATTTGGT
GATTTTGAAAGGGCGTTAAGTTTGCTTGCTGAGATGACAGAGTATGGTGAAAAGCCCGAT
GTGTCAACTTATGGAGCTCTTGTCCATGGATTGGTGGTCTCTGGTGAAGTTGATGTTGCA
TTAGTCATTCGAGACAAGATGATTGAAAGGGGAGTATCACCTGATGCTGGAATTTATAAT
GTTCTGATGAGTGGGCTCTGCAAAAAATTGAAGCTTCCCGCCGCCAGGCAGCTCCTTGAT
GAGATGCTTGGCGGTGGTATATTGCCTGATGTATATGTTTATGCCACTTTAGTTGATGGA
TGTGTAAGAAATGGGGAATTTCAGGAAGCAAAGAAGCTATTTGAGCAGACAATTGAGATG
GGTATGGATCCTGGGCTTGTGGGGTACAATGCCATGATCAAAGGATACTGTAAGTTTGGA
TTGATGAAAGATGCAGTTGCTTGCATCAGTAGAATGAAAAAGTCAAAAATATCTCCAGAT
GCCTTTACTTATTCAACAGTAATTGATGGGTATGTAAAGCAAAATGATTTGCGCCGAGCA
TTAATGATACTCCCTCACATGGTAAAGCGCAACTGTATGCCAAATGTGGTAACATACAGC
TCTCTAATTTATGGATTTTGTCAGAATGGAGATCTAATGAGAGCTGAAAAGTTGTTCAAC
GGAATGCAATCGATTGGTATGATGCCTAATGTGATAACTTATAGTATATTAGTTGGTAGC
TTTTGTAAAGTGGGAAAACTTGCAAAAGCCGCTTCTATTTTTGAACAAATGCTCATGCAC
AAGTGCTATCCAACTGATGTCACATTCAATTATTTGGTCAATGGGTTTTCCCATTGCACG
CATACTATTTTCTCAAAAGAGAAAAATGATGAGAAGTGCTCTAAGTTTATGGCAATTTTT
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AGTCTCTGTTTACATAAAATGCTCAAAACTGCATTGCAATTACGTGACAAGATGATTAGT
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GGAAAATCCAAGGAATGGAAAAGTATTATCTCCTGCAGCTTAAGTGCGACAGAACTGTCT
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GCTTCAGTAATTTTGCATACCTTGGGTAAAGGCCATGTCTCATAA