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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g116500.3.1
CDS Infomation

polygalacturonase (XOPG1)
Sequence

ATGGGGAAGATGGCATCCTCCTCCATTTCTTCCTTTAATTTCTCGTCCTATTCCAAATCT
GTTGCTCTGTTTCTGTCACTCTACAGTCTCTATTTCCTCTTGATTTCTGCAAATGTAAGT
GGATTTGAGTCACTCTTACAGCTACTTCCAGCATCTGCTTCTTTGAGGACCAAATCGGAA
TCCCTTTTTCGAGTCAACGATTTTGGAGCTACCGGAGATGGGATTACCGATGACACTAAG
TCTTTTAAAGATGTTTGGGATATGGCCTGCTCGTCACCATCACATGCAAAGATTGTTATC
CCTGCTGGTTATTCTTTCTTAGTCCGACAAATTAATTTTGCTGGTCCTTGTCGGTCAAAG
GTGTCTATACGGATTGCAGGTACTATTTTAGCACCAAAGGATCCTGACGTCTGGGATGAC
TTGAATCCACGAAAATGGATCTATTTCTTTAAAGTAAAACACCTGACAGTAGAAGGAGGA
GGAATTATAGATGGTATGGGCCAGGAGTGGTGGGCTCGGTCATGCAAGGTCAACAGAACA
AATGTAATTCTCTTCGCCATTGTTAACATCGTGCTTTATGCTTTAACTTTCCACAAATGC
AACAACCTGAAGGTCAAGAACATAAAGATCTTTAATAGTCAACAAATGCATTTAGCATTT
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TGGATGGAAAATGTCTCAAATCCTATCATAATCGACCAATATTATTGTGATTCTAGGAAA
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GGAACTTCAGCTACAGAAAGGGCAATAACACTAGCCTGTAGCGACAGCTTCCCCTGCAGA
AGGTTGTACTTGGAAGATATTCAACTTACTTCATCTTCTGGGGATCCTACAACATTTTTT
TGCTGGCAGGCATATGGCACAACCTCAGGTTTAAATTATCCCCCTCCTTGCTTTCCTTGT
AATGACGGCATTCTTCAGCCAAAATTTTTATCTAACTGGAGTCAATCGATATGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g116500.3.1
PEP Infomation

polygalacturonase (XOPG1)
Sequence

MGKMASSSISSFNFSSYSKSVALFLSLYSLYFLLISANVSGFESLLQLLPASASLRTKSE
SLFRVNDFGATGDGITDDTKSFKDVWDMACSSPSHAKIVIPAGYSFLVRQINFAGPCRSK
VSIRIAGTILAPKDPDVWDDLNPRKWIYFFKVKHLTVEGGGIIDGMGQEWWARSCKVNRT
NVILFAIVNIVLYALTFHKCNNLKVKNIKIFNSQQMHLAFTGCKHVTISQLVVKAPGDSP
NTDAIHISSSTQVNVKDCIIGTGDDCISIVGNSSRIKVKDIVCGPGHGISIGSLGKSNSF
SQVYNVHVNGASISNTENGVRIKTWQGGSGFVKKVSFENVWMENVSNPIIIDQYYCDSRK
PCSNKTSNIHIDNISFMGIKGTSATERAITLACSDSFPCRRLYLEDIQLTSSSGDPTTFF
CWQAYGTTSGLNYPPPCFPCNDGILQPKFLSNWSQSI*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g116500.3.1
Transcript Infomation

polygalacturonase (XOPG1)
Sequence

AGAATTTTTCTATTCATAATGTCTAATTACTAATTCTCATACTAATAAGTGCTTGTATAA
TTTTAATCAATTATGAACCGCTTTTAAATCTAAATTTGTTACTATCTACTAAAGGCCGGT
AAAAAAATTAAGTATCGATTCCCACCTGGAAAAAATCACATGATTATACGCTTTTCGAAA
TCATTTTTTGAGTCAGTTTAGATGATGTTTATTTTAAGTGTAAATTGAAGGCTAAAACTT
TTCAAATTAAAAGTCAAAAGTACATCTATGTATGTAATTTTCTCTCATTAAATAGGCTTG
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TCACTCTACAGTCTCTATTTCCTCTTGATTTCTGCAAATGTAAGTGGATTTGAGTCACTC
TTACAGCTACTTCCAGCATCTGCTTCTTTGAGGACCAAATCGGAATCCCTTTTTCGAGTC
AACGATTTTGGAGCTACCGGAGATGGGATTACCGATGACACTAAGTCTTTTAAAGATGTT
TGGGATATGGCCTGCTCGTCACCATCACATGCAAAGATTGTTATCCCTGCTGGTTATTCT
TTCTTAGTCCGACAAATTAATTTTGCTGGTCCTTGTCGGTCAAAGGTGTCTATACGGATT
GCAGGTACTATTTTAGCACCAAAGGATCCTGACGTCTGGGATGACTTGAATCCACGAAAA
TGGATCTATTTCTTTAAAGTAAAACACCTGACAGTAGAAGGAGGAGGAATTATAGATGGT
ATGGGCCAGGAGTGGTGGGCTCGGTCATGCAAGGTCAACAGAACAAATGTAATTCTCTTC
GCCATTGTTAACATCGTGCTTTATGCTTTAACTTTCCACAAATGCAACAACCTGAAGGTC
AAGAACATAAAGATCTTTAATAGTCAACAAATGCATTTAGCATTTACTGGTTGCAAACAT
GTTACAATATCACAACTCGTAGTCAAAGCCCCAGGTGATAGCCCTAACACCGATGCAATC
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GATATTCAACTTACTTCATCTTCTGGGGATCCTACAACATTTTTTTGCTGGCAGGCATAT
GGCACAACCTCAGGTTTAAATTATCCCCCTCCTTGCTTTCCTTGTAATGACGGCATTCTT
CAGCCAAAATTTTTATCTAACTGGAGTCAATCGATATGATGTCTTCTATTGTAAGTGTAC
AAATGTCTCCACCATATATCATCGAAAGCTGCTAAATTCGTTGTCATTGATATTCATTTT
CCTGAGCGAAGCTAGTTAACTTATCCAGAGGAACAGTATAGTCCATGACGTACTGATGAG
TAGCTTGTCCAAGTACTAATGTTTATGGAAGAAAATCTGAGTGTTGATTAATGGATTGTT
ATTGCTTCATTCATCTCTAAATAAAGTGCTTATTCCTTTTCATGTATCTTCATGAAAAAA
GAGAGTACGCTATCTAAGTAATTGGATGACAAAACAGGAAATGCTTCGTACATGTATGTA
TGCTGTGAAGTTGATGCATCTCGATTTACTGATATTGCTAGATCAGATAAGTATTTTTTT
TATTAGTAAATGTCCTTGAAACGATAAACGCTGTGAGACTTACGAAGTATAGCTATGGCC
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