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Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID

Solyc03g115570.1.1

CDS Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199USG1_ANACO)

Sequence

ATGAAAGCATCACTGAAGACTTCTACACAGTTTTCATCCATCTATGGTTTCCGCCGGGCT
TATACAATCTCAGCTTCAGTCGATTTGCCAATGTGTGAAGTCCCTGACCAAAGGCACATG
AATCGACAGAGAGCCTCCGGTAAACCAATCGACCAATTCTCGCTTATGAAATTGATTGAT
TCTTCCATTTCTTCAAATGGGTTTGCTCCTACTTCTCTTCTATTCCACGAGTTCTCTCGT
TCCATTGATGTTAATTTATGTAATACACTTATCAGACGCTATACGGATTCAAAAAATCAC
TCGCGTGCAGTTTCCGTTTACGCCCAAATGCGTAAACTGAATATCCTTCCAGATTCCTCT
ACATTCCCGAGCGTTCTCAAGTCTGTTGCTCTGTTATGGTGTGGAGAAGTTGGGAAATCC
ATCCACTGTAATGCAATTCAGTTGGGTTTCACTTCTGATGTATATACAAACACTGCTCTG
GTCCACATGTATGGCATATGTGGACAACCAGATGATGCTCATCAACTGTTTGATGAAATT
CCTGACCGGAATGTAGTTACGTGGAATTCGTTGATCACGAGTTATACGCATAATAGGATG
TTCAGAGAAGCAATTGATGTGTTCAGGGAGATGCTAGCTTCTGGGGTTACACCAGTTGAG
GTCACTATGGTTGGAGTTTTATCAGCTTGTTCTCATTTAGGAGCTCTGGGTCAAGGGAAG
TGGATCCATGATTATATTGTCAAGAATCGGTTGAGAGTGAATGTATATGTCGGTACTGCG
TTAATTGATATGTATGCTAAATGTGGAGACATTGATGAGGCAAAAAAGGTTTTTGAAACT
ATGGGGTTAAAAAATATTTATACATGGAATGTATTGATTTCGGCATATGCCATGAATGGA
CAAGGTGAGGCTGCATTGCGGACTTTTGATAGGATGATTGAAAAAGACTTAAAGCCTGAT
CATGTTACTCTCCTTGGTGTTTTATGCGCTTGCTGTCACCAAGGTTTTGTGGAGGAAGGT
AGAAGGCTGTTCTCAAGCATGATAAATCAGTTTGGATTGCAGCCAAAGATTGTGCATTAT
GGGTGTATGATTGATTTACTTGGACGTGGTGGGTTCTTGGATGAAGCTATGGAAATTATT
CATTCTATGAAACTAAAGCCAGATGCAATAATATGGAGGACACTACTTGGTGCATGCAGA
TTTCATGGAAGAGAAGAACTTGGTGAATTTGCTTTCCATAAGCTTCTGGAGCTGGAACCA
ACGAATGGGGAAAACTACGTGTTAATATCAAATGTTCATACTCAAAAAAAGAAATGGACT
GAAGTTGGAGAAGTCAGGGAGCTGATGGACAGCAGTGGTATTAAAAAGATTCCTGGATGC
AGTTCAATTGAACTAGAAAATGCAGTTTATGAGTTTAAGGCATCTGATCCACTTAAAACA
GGGAATGAAGAAATACATAAGATGTTGCAAGACATGAAAAATCAGTTGAAGTTAGCTGGT
TATGTGCCTGAAACAGAGATAGCTCTGTATGATATTAATGAAGAGGAAAAGGAGCATAAT
CTGATATTCCACAGTGAAAAGCTTGCTCTGGCATTTGGGCTGCTACACTCATCTGAGCCT
ACATTAAGGATAATGAAGAATTTAAGGATTTGTCAGGACTGCCACCAATTCTTTAAGCTT
GCTTCAGCAGTTTATAAAAGAAATATTGTTGTTAGAGATATAAAGCGCTTCCATCATTTC
ACTGGAGGTCTTTGTTCATGCAAAGATTATTGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID

Solyc03g115570.1.1

PEP Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199USG1_ANACO)

Sequence

MKASLKTSTQFSSIYGFRRAYTISASVDLPMCEVPDQRHMNRQRASGKPIDQFSLMKLID
SSISSNGFAPTSLLFHEFSRSIDVNLCNTLIRRYTDSKNHSRAVSVYAQMRKLNILPDSS
TFPSVLKSVALLWCGEVGKSIHCNAIQLGFTSDVYTNTALVHMYGICGQPDDAHQLFDEI
PDRNVVTWNSLITSYTHNRMFREAIDVFREMLASGVTPVEVTMVGVLSACSHLGALGQGK
WIHDYIVKNRLRVNVYVGTALIDMYAKCGDIDEAKKVFETMGLKNIYTWNVLISAYAMNG
QGEAALRTFDRMIEKDLKPDHVTLLGVLCACCHQGFVEEGRRLFSSMINQFGLQPKIVHY
GCMIDLLGRGGFLDEAMEIIHSMKLKPDAIIWRTLLGACRFHGREELGEFAFHKLLELEP
TNGENYVLISNVHTQKKKWTEVGEVRELMDSSGIKKIPGCSSIELENAVYEFKASDPLKT
GNEEIHKMLQDMKNQLKLAGYVPETEIALYDINEEEKEHNLIFHSEKLALAFGLLHSSEP
TLRIMKNLRICQDCHQFFKLASAVYKRNIVVRDIKRFHHFTGGLCSCKDYW*

Transcript Sequence

Transcript ID

Solyc03g115570.1.1

Transcript Infomation

Pentatricopeptide repeat-containing protein (AHRD V3.3 *** A0A199USG1_ANACO)

Sequence

ATGAAAGCATCACTGAAGACTTCTACACAGTTTTCATCCATCTATGGTTTCCGCCGGGCT
TATACAATCTCAGCTTCAGTCGATTTGCCAATGTGTGAAGTCCCTGACCAAAGGCACATG
AATCGACAGAGAGCCTCCGGTAAACCAATCGACCAATTCTCGCTTATGAAATTGATTGAT
TCTTCCATTTCTTCAAATGGGTTTGCTCCTACTTCTCTTCTATTCCACGAGTTCTCTCGT
TCCATTGATGTTAATTTATGTAATACACTTATCAGACGCTATACGGATTCAAAAAATCAC
TCGCGTGCAGTTTCCGTTTACGCCCAAATGCGTAAACTGAATATCCTTCCAGATTCCTCT
ACATTCCCGAGCGTTCTCAAGTCTGTTGCTCTGTTATGGTGTGGAGAAGTTGGGAAATCC
ATCCACTGTAATGCAATTCAGTTGGGTTTCACTTCTGATGTATATACAAACACTGCTCTG
GTCCACATGTATGGCATATGTGGACAACCAGATGATGCTCATCAACTGTTTGATGAAATT
CCTGACCGGAATGTAGTTACGTGGAATTCGTTGATCACGAGTTATACGCATAATAGGATG
TTCAGAGAAGCAATTGATGTGTTCAGGGAGATGCTAGCTTCTGGGGTTACACCAGTTGAG
GTCACTATGGTTGGAGTTTTATCAGCTTGTTCTCATTTAGGAGCTCTGGGTCAAGGGAAG
TGGATCCATGATTATATTGTCAAGAATCGGTTGAGAGTGAATGTATATGTCGGTACTGCG
TTAATTGATATGTATGCTAAATGTGGAGACATTGATGAGGCAAAAAAGGTTTTTGAAACT
ATGGGGTTAAAAAATATTTATACATGGAATGTATTGATTTCGGCATATGCCATGAATGGA
CAAGGTGAGGCTGCATTGCGGACTTTTGATAGGATGATTGAAAAAGACTTAAAGCCTGAT
CATGTTACTCTCCTTGGTGTTTTATGCGCTTGCTGTCACCAAGGTTTTGTGGAGGAAGGT
AGAAGGCTGTTCTCAAGCATGATAAATCAGTTTGGATTGCAGCCAAAGATTGTGCATTAT
GGGTGTATGATTGATTTACTTGGACGTGGTGGGTTCTTGGATGAAGCTATGGAAATTATT
CATTCTATGAAACTAAAGCCAGATGCAATAATATGGAGGACACTACTTGGTGCATGCAGA
TTTCATGGAAGAGAAGAACTTGGTGAATTTGCTTTCCATAAGCTTCTGGAGCTGGAACCA
ACGAATGGGGAAAACTACGTGTTAATATCAAATGTTCATACTCAAAAAAAGAAATGGACT
GAAGTTGGAGAAGTCAGGGAGCTGATGGACAGCAGTGGTATTAAAAAGATTCCTGGATGC
AGTTCAATTGAACTAGAAAATGCAGTTTATGAGTTTAAGGCATCTGATCCACTTAAAACA
GGGAATGAAGAAATACATAAGATGTTGCAAGACATGAAAAATCAGTTGAAGTTAGCTGGT
TATGTGCCTGAAACAGAGATAGCTCTGTATGATATTAATGAAGAGGAAAAGGAGCATAAT
CTGATATTCCACAGTGAAAAGCTTGCTCTGGCATTTGGGCTGCTACACTCATCTGAGCCT
ACATTAAGGATAATGAAGAATTTAAGGATTTGTCAGGACTGCCACCAATTCTTTAAGCTT
GCTTCAGCAGTTTATAAAAGAAATATTGTTGTTAGAGATATAAAGCGCTTCCATCATTTC
ACTGGAGGTCTTTGTTCATGCAAAGATTATTGGTGA