Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc03g115230.3.1
CDS Infomation	Solanum lycopersicum heat shock protein
Sequence	ATGAATCCTGAAAAATTTACTCACAAGACAAATGAGGCTATTGCTGAGGCACATGAACTG GCTGTATCAGCAGGGCATGCTCAGTTGACACCTCTGCATATGGCTTTGGCTTTATTATCT GATCACAGTGGTATATTCTGGCAAGCAATTGTCAATGCTGCTGGTAGTGAAGAGACTGCC AATGGTGTTGAAAGAGTGTTCAATCAAGCTAAGAAGAAAATTCCTTCTCAGTCACCAGCA CCTGATCAAGTTCCAGCAAGTACTTCGCTTATTAAGGTGCTACGACGAGCACAGTCGTTG CAGAAGTCTCGTGGTGACAGCCATTTGGCGGTTGATCTGTTGATTTTAGGCCTTCTGGAA GATTCCCAAATTGCAGATCTTTTGAAAGATTCTGGTCTTAGTGCAGCAAGAGTGAAATCA GAAGTTGAGAAACTTAGAGGAAAAGATGGAAAGAAAGTGGAAAGTGCTACAGGGGATACT ACATTTCAAGCACTTAAGACCTATGGTCGTGATCTTGTGGAACAGGCAGGAAAACTTGAT CCTGTGATTGGTAGGGATGAAGAAATTCGAAGAGTAATTCGGATTCTTTCGAGGAGGACA AAGAACAATCCGGTGCTTATTGGTGAGCCTGGTGTTGGTAAAACAGCTGTAGTTGAAGGG CTAGCACAAAGGATAGTTCGAGGGGATGTTCCAAGCAATTTGGCTGATGTTAGGCTTATA GCATTGGATATGGGAGCACTCATTGCTGGAGCAAAGTACAGAGGTGAATTTGAAGAGAGA TTGAAGGCTGTTCTGAAGGAAGTGGAAGATGCAGAAGGGAAAGTAATTCTCTTCATTGAT GAGATCCACTTGGTTTTAGGTGCTGGTAGGACTGAAGGATCAATGGATGCTGCCAATTTG TTCAAACCGATGCTTGCTCGGGGCCAATTAAGGTGCATTGGTGCAACAACCCTGGAAGAG TACAGGAAGTATGTGGAGAAAGATGCTGCATTCGAAAGGCGTTTCCAGCAGGTATATGTC GCTGAGCCTAGCGTTCCCGACACTATAAGTATCCTTCGAGGGTTGAAGGAGAAGTATGAA GGCCATCATGGTGTCAAGATTCAGGATAGGGCTCTCGTTATTGCAGCCCAGCTTTCAGCT CGATACATTACAGGTCGACATTTGCCTGATAAGGCTATTGACTTAGTTGATGAGGCTTGT GCAAATGTGAGGGTGCAACTTGATAGCCAGCCAGAAGAAATTGATAATCTTGAAAGGAAG AGGATTCAGCTAGAAGTTGAACATCATGCTCTTGAAAAGGAAAAAGACAAGGCTAGCAAG GCTCGACTTGTTGAAGTGAGGAAAGAGCTCGATGACTTGAGGGACAAACTCCAACCTTTG ATGATGAGGTATAAGAAAGAGAAGGAACGGGTTGATGAGCTTCGAAGGCTTAAGCAAAAG CGCGATGAACTTACATATGCTTTACAAGAAGCTGAAAGGAGATATGATCTTGCTAGAGCA GCAGATCTTAGATACGGTGCCATCCAAGAAGTAGAATCTGCAATAGCAAATCTTGAGAGT AGCACAGATGAGAGTACAATGTTGACAGAGACTGTCGGACCCGATCAGATTGCGGAAGTA GTTAGTCGCTGGACTGGAATTCCTGTCTCTAGGCTTGGCCAGAATGAGAAGGAGAAATTG ATTGGTCTTGCTGATAGATTGCACCTAAGAGTTGTCGGGCAAGATCAAGCTGTTAAAGCT GTTGCTGAGGCTGTGTTGAGGTCTAGAGCTGGATTAGGAAGGCCACAGCAACCAACTGGT TCATTCCTTTTCTTGGGGCCAACTGGTGTTGGAAAGACTGAACTTGCTAAAGCTCTTGCT GAGCAGCTATTTGATGATGACAAATTGATGGTCAGAATTGACATGTCCGAATACATGGAA CAACATTCTGTTGCCCGGTTGATTGGTGCTCCACCAGGTTATGTTGGACATGAGGAAGGA GGGCAACTTACGGAAGCTGTAAGGAGGCGCCCTTACAGTGTTGTGCTATTTGACGAAGTG GAAAAAGCTCACCCTGCAGTGTTTAATGCCTTGCTTCAAGTGTTGGATGATGGAAGATTA ACTGATGGTCAAGGTCGTACTGTTGATTTCACCAACACTGTGATCATTATGACCTCAAAT TTGGGAGCAGAGTATCTCTTGTCAGGATTAAGTGGCAAGTGTACCATGGAGAAGGCCCGT GAAATGGTCATGCAGGAGGTGAGGAAGCAATTTAAGCCCGAGTTACTCAACAGGCTCGAT GAGATTGTGGTGTTCGATCCTTTATCACACGAGCAGTTGAGGCAAGTCTGCCGTCACCAA CTGAAAGATGTGGCAAGCCGTTTAGCTGAGAGGGGTATTGCTTTGGGTGTTACAGAGGCC GCCTTAGATGTCATACTTGCTCAGAGTTATGATCCGGTGTATGGTGCAAGGCCTATTAGG AGGTGGTTGGAGAAGAAAGTTGTAACGGAGTTATCAAAGATGCTTGTGAAGGAGGAGATT GATGAGAATTCGACCGTGTACATAGATGCTGGACGTGGCGGAAAAGATCTAACATATAGG GTGGAGAATAATGGAGGGCTTGTGAATGCTGCTACTGGTCAAAAATCTGATGTACTGATT CAGCTACCTAATGGGCCAAGGAATGATGCTGCTCAAGCAGTGAAGAAAATGAGGATTGAA GAAATAGATGACGAAGATGATGAAATGGCAGATTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc03g115230.3.1
PEP Infomation	Solanum lycopersicum heat shock protein
Sequence	MNPEKFTHKTNEAIAEAHELAVSAGHAQLTPLHMALALLSDHSGIFWQAIVNAAGSEETA NGVERVFNQAKKKIPSQSPAPDQVPASTSLIKVLRRAQSLQKSRGDSHLAVDLLILGLLE DSQIADLLKDSGLSAARVKSEVEKLRGKDGKKVESATGDTTFQALKTYGRDLVEQAGKLD PVIGRDEEIRRVIRILSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAVVEGLAQRIVRGDVPSNLADVRLI ALDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLKEVEDAEGKVILFIDEIHLVLGAGRTEGSMDAANL FKPMLARGQLRCIGATTLEEYRKYVEKDAAFERRFQQVYVAEPSVPDTISILRGLKEKYE GHHGVKIQDRALVIAAQLSARYITGRHLPDKAIDLVDEACANVRVQLDSQPEEIDNLERK RIQLEVEHHALEKEKDKASKARLVEVRKELDDLRDKLQPLMMRYKKEKERVDELRRLKQK RDELTYALQEAERRYDLARAADLRYGAIQEVESAIANLESSTDESTMLTETVGPDQIAEV VSRWTGIPVSRLGQNEKEKLIGLADRLHLRVVGQDQAVKAVAEAVLRSRAGLGRPQQPTG SFLFLGPTGVGKTELAKALAEQLFDDDKLMVRIDMSEYMEQHSVARLIGAPPGYVGHEEG GQLTEAVRRRPYSVVLFDEVEKAHPAVFNALLQVLDDGRLTDGQGRTVDFTNTVIIMTSN LGAEYLLSGLSGKCTMEKAREMVMQEVRKQFKPELLNRLDEIVVFDPLSHEQLRQVCRHQ LKDVASRLAERGIALGVTEAALDVILAQSYDPVYGARPIRRWLEKKVVTELSKMLVKEEI DENSTVYIDAGRGGKDLTYRVENNGGLVNAATGQKSDVLIQLPNGPRNDAAQAVKKMRIE EIDDEDDEMAD*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc03g115230.3.1
Transcript Infomation	Solanum lycopersicum heat shock protein
Sequence	ATGAATCCTGAAAAATTTACTCACAAGACAAATGAGGCTATTGCTGAGGCACATGAACTG GCTGTATCAGCAGGGCATGCTCAGTTGACACCTCTGCATATGGCTTTGGCTTTATTATCT GATCACAGTGGTATATTCTGGCAAGCAATTGTCAATGCTGCTGGTAGTGAAGAGACTGCC AATGGTGTTGAAAGAGTGTTCAATCAAGCTAAGAAGAAAATTCCTTCTCAGTCACCAGCA CCTGATCAAGTTCCAGCAAGTACTTCGCTTATTAAGGTGCTACGACGAGCACAGTCGTTG CAGAAGTCTCGTGGTGACAGCCATTTGGCGGTTGATCTGTTGATTTTAGGCCTTCTGGAA GATTCCCAAATTGCAGATCTTTTGAAAGATTCTGGTCTTAGTGCAGCAAGAGTGAAATCA GAAGTTGAGAAACTTAGAGGAAAAGATGGAAAGAAAGTGGAAAGTGCTACAGGGGATACT ACATTTCAAGCACTTAAGACCTATGGTCGTGATCTTGTGGAACAGGCAGGAAAACTTGAT CCTGTGATTGGTAGGGATGAAGAAATTCGAAGAGTAATTCGGATTCTTTCGAGGAGGACA AAGAACAATCCGGTGCTTATTGGTGAGCCTGGTGTTGGTAAAACAGCTGTAGTTGAAGGG CTAGCACAAAGGATAGTTCGAGGGGATGTTCCAAGCAATTTGGCTGATGTTAGGCTTATA GCATTGGATATGGGAGCACTCATTGCTGGAGCAAAGTACAGAGGTGAATTTGAAGAGAGA TTGAAGGCTGTTCTGAAGGAAGTGGAAGATGCAGAAGGGAAAGTAATTCTCTTCATTGAT GAGATCCACTTGGTTTTAGGTGCTGGTAGGACTGAAGGATCAATGGATGCTGCCAATTTG TTCAAACCGATGCTTGCTCGGGGCCAATTAAGGTGCATTGGTGCAACAACCCTGGAAGAG TACAGGAAGTATGTGGAGAAAGATGCTGCATTCGAAAGGCGTTTCCAGCAGGTATATGTC GCTGAGCCTAGCGTTCCCGACACTATAAGTATCCTTCGAGGGTTGAAGGAGAAGTATGAA GGCCATCATGGTGTCAAGATTCAGGATAGGGCTCTCGTTATTGCAGCCCAGCTTTCAGCT CGATACATTACAGGTCGACATTTGCCTGATAAGGCTATTGACTTAGTTGATGAGGCTTGT GCAAATGTGAGGGTGCAACTTGATAGCCAGCCAGAAGAAATTGATAATCTTGAAAGGAAG AGGATTCAGCTAGAAGTTGAACATCATGCTCTTGAAAAGGAAAAAGACAAGGCTAGCAAG GCTCGACTTGTTGAAGTGAGGAAAGAGCTCGATGACTTGAGGGACAAACTCCAACCTTTG ATGATGAGGTATAAGAAAGAGAAGGAACGGGTTGATGAGCTTCGAAGGCTTAAGCAAAAG CGCGATGAACTTACATATGCTTTACAAGAAGCTGAAAGGAGATATGATCTTGCTAGAGCA GCAGATCTTAGATACGGTGCCATCCAAGAAGTAGAATCTGCAATAGCAAATCTTGAGAGT AGCACAGATGAGAGTACAATGTTGACAGAGACTGTCGGACCCGATCAGATTGCGGAAGTA GTTAGTCGCTGGACTGGAATTCCTGTCTCTAGGCTTGGCCAGAATGAGAAGGAGAAATTG ATTGGTCTTGCTGATAGATTGCACCTAAGAGTTGTCGGGCAAGATCAAGCTGTTAAAGCT GTTGCTGAGGCTGTGTTGAGGTCTAGAGCTGGATTAGGAAGGCCACAGCAACCAACTGGT TCATTCCTTTTCTTGGGGCCAACTGGTGTTGGAAAGACTGAACTTGCTAAAGCTCTTGCT GAGCAGCTATTTGATGATGACAAATTGATGGTCAGAATTGACATGTCCGAATACATGGAA CAACATTCTGTTGCCCGGTTGATTGGTGCTCCACCAGGTTATGTTGGACATGAGGAAGGA GGGCAACTTACGGAAGCTGTAAGGAGGCGCCCTTACAGTGTTGTGCTATTTGACGAAGTG GAAAAAGCTCACCCTGCAGTGTTTAATGCCTTGCTTCAAGTGTTGGATGATGGAAGATTA ACTGATGGTCAAGGTCGTACTGTTGATTTCACCAACACTGTGATCATTATGACCTCAAAT TTGGGAGCAGAGTATCTCTTGTCAGGATTAAGTGGCAAGTGTACCATGGAGAAGGCCCGT GAAATGGTCATGCAGGAGGTGAGGAAGCAATTTAAGCCCGAGTTACTCAACAGGCTCGAT GAGATTGTGGTGTTCGATCCTTTATCACACGAGCAGTTGAGGCAAGTCTGCCGTCACCAA CTGAAAGATGTGGCAAGCCGTTTAGCTGAGAGGGGTATTGCTTTGGGTGTTACAGAGGCC GCCTTAGATGTCATACTTGCTCAGAGTTATGATCCGGTGTATGGTGCAAGGCCTATTAGG AGGTGGTTGGAGAAGAAAGTTGTAACGGAGTTATCAAAGATGCTTGTGAAGGAGGAGATT GATGAGAATTCGACCGTGTACATAGATGCTGGACGTGGCGGAAAAGATCTAACATATAGG GTGGAGAATAATGGAGGGCTTGTGAATGCTGCTACTGGTCAAAAATCTGATGTACTGATT CAGCTACCTAATGGGCCAAGGAATGATGCTGCTCAAGCAGTGAAGAAAATGAGGATTGAA GAAATAGATGACGAAGATGATGAAATGGCAGATTAAAGAGAGGTTGAAAATAACACCATG AAAGTTGAAGATATATGAATTATTACTTTTTGTTTAAAATACCCTGTATAGGGTTAGTCC AATTTTACATCATTAAGAAGTGAACGTTCACAAGTTCTCTGTTGATTTTGTTGTGTTGTT TCTTTATGCAGCTTGAAAATGTCTAAATAGTAAATTGTATTTCTCTGATTTTCTGAAAAA TAATCTTTTCTCCATCTTTGTGTTCTGATTTTCTTCAAATTTGAGCGGAAAAAGTTCAAA ATCAACTCAATATTGTAACAATGATTAACAATTTGTGTGAATTGACCGATTCTAGTTGTG TTGTATTCATTGCTTTTAAATATTCTTTTAGGATTTGGAATACTAATTTAGATTTAGAGT TGGTTTGTTTGGATAGTTTAAAAGCTGTTTGAATTAATTTTTCGAAAGTTAAAAGTTAGG TGAGGAATGTTATTTTTTGCCCTTTAGTTCTT